Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00302060Standard Name
DRH34 (DExD/H box RNA helicase 34)Aliases
PreTt19398 | 28.m00357 | 3691.m00174Description
DRH34 small nuclear ribonucleoprotein helicaseGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
- ATP-dependent helicase activity (IEA) | GO:0008026
- DNA binding (IEA) | GO:0003677
- helicase activity (IEA) | GO:0004386
- hydrolase activity (IEA) | GO:0016787
- nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
Domains
- ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
- ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
- ( PF00580 ) UvrD/REP helicase N-terminal domain
- ( PF02889 ) Sec63 Brl domain
- ( PF04851 ) Type III restriction enzyme, res subunit
- ( PF05707 ) Zonular occludens toxin (Zot)
- ( TIGR00614 ) ATP-dependent DNA helicase, RecQ family
- ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
- ( TIGR01257 ) rim ABC transporter
- ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
- ( TIGR01612 ) rhoptry protein
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Stentor Coeruleus SteCoe_3155 0 Description: None WormBase WBGene00012896 9.997093137033517e-262 Description: locus:snrp-200 Putative U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase status:Partially_confirmed UniProt:Q9U2G0 protein_id:CAB60351.1 Tetrahymena borealis EI9_07732.1 9.997093137033517e-262 Description: type III restriction enzyme, res subunit protein (2209 aa) DictyBase DDB_G0270042 9.997093137033517e-262 Description: ascc3l on chromosome: 1 position 4082408 to 4089294 Oxytricha Contig18508.0.g43 9.997093137033517e-262 Description: Sec63 Brl domain SGD YER172C 9.997093137033517e-262 Description: BRR2 RNA-dependent ATPase RNA helicase (DEIH box); required for disruption of U4/U6 base-pairing in native snRNPs to activate the spliceosome for catalysis; homologous to human U5-200kD WormBase WBGene00006830 9.997093137033517e-262 Description: locus:unc-103 status:Partially_confirmed UniProt:M1Z8A0 protein_id:CCU83368.1 WormBase WBGene00014028 9.997093137033517e-262 Description: locus:trxr-2 Probable glutathione reductase 2 status:Partially_confirmed UniProt:P30635 protein_id:CAA77459.1
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00302060(coding)
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GAAAACTGGGATATAAACACTAGAAAATGGAAAAAAACACAATAAATCATTAACAAAAAT
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GCTATTGATTTGTAAACTTTAGCCGCAGGTGACAATAATCCTTAGAAATTCTTGAAGGTT
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GAGCTCAATCTTCACTCTTAAGTTGTTATCATCCTTGACAATCAAAGATATGATGGTCGT
GAAAAGAGATATATTGATTATACCATTCCTGATATGCTTTAAATGATAGCTTATGCTAAG
AGTAAAAACGCAAGTGCACAAAACGCTTAAGCAGCTAAGTGTTTAGTCTTTTGCCATTCT
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TCAGAAAACATAACTAATCACATTTGTGGTGAAATTTATGCTGAAAGAATTACTTCTTTA
CCAGCTTGTATTGACTGGAGCACTTGGACATTTATGTATAGAAGATTATCTTAAAATCCT
TACTTCTATGGACTCAGAGAAGTTTCAGGACCTGCCATTAATGATTTCTTGTGTGATCTA
TTTGAAAAAGCTATTGAATATTTAATAGAATATAAGTGTGTTAAAGAATTAGAATAGCAC
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ATATAAATGTTTAATGAGAGAATAAAGCCAGACTAATCAACAAAGCATTTGATTAACATC
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CCAAATGTGAAAGCATATATTTTACTTTAAGCTTATTTCTCACGCTTGAACCTTTCTGCA
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GGTTTTAAGTAAAAGGCAGATGTTGACTTCTAATTTGATGTACCTGAAGCTGGTTCTCAT
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ATATGCTTTAAATGATAGGTAAATTTCATTTTATTTGGATTTAAATTAATTTTTTATACT
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