Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00302060

Standard Name

DRH34 (DExD/H box RNA helicase 34)

Aliases

PreTt19398 | 28.m00357 | 3691.m00174

Description

DRH34 small nuclear ribonucleoprotein helicase

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
  • ( PF00580 ) UvrD/REP helicase N-terminal domain
  • ( PF02889 ) Sec63 Brl domain
  • ( PF04851 ) Type III restriction enzyme, res subunit
  • ( PF05707 ) Zonular occludens toxin (Zot)
  • ( TIGR00614 ) ATP-dependent DNA helicase, RecQ family
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
  • ( TIGR01257 ) rim ABC transporter
  • ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_3155 0
Description: None
WormBase WBGene00012896 9.997093137033517e-262
Description: locus:snrp-200 Putative U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase status:Partially_confirmed UniProt:Q9U2G0 protein_id:CAB60351.1
Tetrahymena borealis EI9_07732.1 9.997093137033517e-262
Description: type III restriction enzyme, res subunit protein (2209 aa)
DictyBase DDB_G0270042 9.997093137033517e-262
Description: ascc3l on chromosome: 1 position 4082408 to 4089294
Oxytricha Contig18508.0.g43 9.997093137033517e-262
Description: Sec63 Brl domain
SGD YER172C 9.997093137033517e-262
Description: BRR2 RNA-dependent ATPase RNA helicase (DEIH box); required for disruption of U4/U6 base-pairing in native snRNPs to activate the spliceosome for catalysis; homologous to human U5-200kD
WormBase WBGene00006830 9.997093137033517e-262
Description: locus:unc-103 status:Partially_confirmed UniProt:M1Z8A0 protein_id:CCU83368.1
WormBase WBGene00014028 9.997093137033517e-262
Description: locus:trxr-2 Probable glutathione reductase 2 status:Partially_confirmed UniProt:P30635 protein_id:CAA77459.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00302060(coding)
ATGGCCGATTAGCGTTAGGTTATTGATCAATTCAACACACAAGCAAATGAAGTTATTTAA
GGAGAAAGATAAAGAGGAGATGAGAATACTGGTGAGCCTATTTCATTAGTAGGTCATTTA
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GAAAATTTATTCTTCTAAAATCGTTATTAAAAGACAATTAAAGTTTTAGTTTGCACAGCC
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TATTCTCCTGAACTTGGTAAATGGACTGAATTGAGCCCTCAAGATATGATCTAGATGGTT
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AAGGTTTATCATATTTCAGATGAAGAATATGAAAATGATAGACTCCTAGTAAAGCATAGA
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TTACTTAAGGTTTTCTCTCTTTCTAATGAATTTAAATACATTCCTATTAGAGAAGAAGAA
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GAACCTTCTTCTAAAATAAATGTTCTTTTATAGGCTTACATTGGTAAATTACCTATGGAA
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GCTATATTTGAGATTTCATTAAAGAGAGGATGGGCTTATGTTGCTGAAAATGCATTAAAT
CTTTGTAAAATGATTGATAAGTAAATGTGGAGCTGCATGACACCTATCAGATAGTTTAGA
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ATAGAATAAATGACATTTAATCGTCTAAAAGCCATGAATGAATAATAATTAATGGAACTT
TTGAAAACAGGTGATACTAAAAATAATAAGCTTGGTGCCATTCTTAAAAATAGAATTCGT
ATGATGCCAGAACTTAAAATAACTGTAGATAAGATTCCTATCACAAGAAGTTGTTTACAA
GTTACTATTACTATCGATAAAGGAGATTTCTAGTGGGAAGACTCTTTCCATGGTGATTCA
GAGCCATTTTGGATATTGGTAACTGACTGTGATGAAGAGGAATTACTTTACCATGAATAT
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GTTTTCTAATTTATTGTAAGTCTATTTGAAAACTTGCATCCTGTATACTATATCAAAGTT
ATTTCTGACAGATGGATTTAGTGTGAGACTATTGAACCTCTTTTCTTTAAAGATTTAATC
CTCCCTGAGTAATTCAGTGCTCCTACTAAATTGTTAGAATTCTAGTTAGTACCCACATCA
GAATTAAGATTCCCTGAAGGAGAGGCTGTTCTAAAAGAATTAGGAATTACTACCTTCAAC
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GCTCCTACTGGCTCAGGAAAAACAGCTTGCATTATTGTTGCTATGCTAAGAATTTTTAAA
ACATACTATGAAAATAAAAAAGTAATTTATGTGGCACCTTTTGAATCTATTTGCCAAAAT
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GAAAACTGGGATATAAACACTAGAAAATGGAAAAAAACACAATAAATCATTAACAAAAAT
ATAAAACTTTTCATTGCTGACGAACTCCATATGCTTAATGAATGTAATTCAACTTATGAA
GTTATTGTTTCTCGTATGAGATAGTTCTCTTCATTGCTTTCTTCTAAATCAGAAGGCAAA
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GCTGACTATAAAGAAATGGCATCATGGATTGGTGCTAATCCTAGCAATACCTTTAATTTC
AGTCCTGATGTTAGACCTTACCCTGTAGATTTACATATTACTGGTTTTGAATAGCATCAC
AGAAAGGCTCGTTTAATTTCTATGCAAAAGCACATGTATTAAGGTCTCAAATTATTCTTA
AAATCACCTCAATAGTAAGGCATAATTTTTGTTTCTGATAGAAAGTAAGCTAAAATCACT
GCTATTGATTTGTAAACTTTAGCCGCAGGTGACAATAATCCTTAGAAATTCTTGAAGGTT
CCATATGATAGTATTTAAGAAATAGTCGAGTCATTAAGAGATCTCTCTTTGAGATAATCA
TTAAAATATGGTGTCGGATTTATCTATGAAGGTATGAGTGAATAGGAAAGAGAAGTTGTT
GAGTCACTATACTAATCTGGAGCTATTTAAGTTCTAATCTCAACATACAAATTATGCTGG
GAGCTCAATCTTCACTCTTAAGTTGTTATCATCCTTGACAATCAAAGATATGATGGTCGT
GAAAAGAGATATATTGATTATACCATTCCTGATATGCTTTAAATGATAGCTTATGCTAAG
AGTAAAAACGCAAGTGCACAAAACGCTTAAGCAGCTAAGTGTTTAGTCTTTTGCCATTCT
CCAAAGAAAGAATATTATAAGAAATTCTTATTTGAACCTTTCCCTGTAGAATCAATCTTA
TCAGAAAACATAACTAATCACATTTGTGGTGAAATTTATGCTGAAAGAATTACTTCTTTA
CCAGCTTGTATTGACTGGAGCACTTGGACATTTATGTATAGAAGATTATCTTAAAATCCT
TACTTCTATGGACTCAGAGAAGTTTCAGGACCTGCCATTAATGATTTCTTGTGTGATCTA
TTTGAAAAAGCTATTGAATATTTAATAGAATATAAGTGTGTTAAAGAATTAGAATAGCAC
AATTTAGCTCTTTTAAGTTTAGGTTCTATTGCAGGATATTACTATATTGATGTATAAACA
ATATAAATGTTTAATGAGAGAATAAAGCCAGACTAATCAACAAAGCATTTGATTAACATC
ATCTGCTCTGCAAATGAATTCTTGGATATCCCTGTTCGTCACTAAGAAGAAAACCTATTA
AAGTAATTGAATCAATAAATTATGTATCCTGTAGATAGTAGCATTGAAGTTTTCAATGAT
CCAAATGTGAAAGCATATATTTTACTTTAAGCTTATTTCTCACGCTTGAACCTTTCTGCA
GATTTCTCTTATGACTAAAAGCTAGTTTTAGACAAGGCAGTTAACTTAACACACGGATTA
ATTGAAGTTATAAACTCAAATGGCTTACCAAAAGAGGCTATAAAAGCAATGAGATTCTCT
CATATGATAGTGCAAGCAGTCTGGACTGATAGCTCTCCACTTTTATAACTTCCTCACTTT
AACGAGAAAATAGTTAAAGCTCTAGCAGATCTTGATGTCAAATCAATTAATGATCTTCTT
AATAATGATGAAGCTAGAGATTAAGTTTTCGAATAGTTTAAATTCTCTGAATCAGAAATC
GAAGAAATTGCTAATGCAGCAAACAGATATCCTGATATTAACTTTACATATAGCATTTAG
AATGTAAATAGCATTTATGAAGGAGATGATAAGGTTAATATGAAAATATCAATCACAAGA
GAAGGTGAAGATTATACTGATTTTGTTGTTGCACCTTACTATCCCAAGTAAAAAGAAGAA
TTGTGGTGGGTAATGGTTGCAGATACCAATAAAAATATACTTCGTTGCATAAAAAAGCTT
GGTTTTAAGTAAAAGGCAGATGTTGACTTCTAATTTGATGTACCTGAAGCTGGTTCTCAT
GAACTAAGAATAATTTTAATGTGTGATTCTTATCTTGGCTGTGATACAGGAAAACAATTC
ACTTTGAATGTAAAACGTAGAGGTGCTAATGGAAGTATGGAAGACGAGTGA


>TTHERM_00302060(gene)
ATGGCCGATTAGCGTTAGGTTATTGATCAATTCAACACAGTAAATATATTTACATTATCA
TAAAAAAAATATCAAATCTAAGATATATTCTGAAAATGAATATGCAATTAACATTATTTC
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GTCAGATAAAATCCTAAAAAGATTTTAGATATGATGAAAAAGAATGAAGACTCAAAGCTC
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GATCAAAATTATTAACTAAATTAGCAAGTTAAATTAAAATATTTTTTCAATTTAAAAAAA
TAGAAAATTGAAAAGAAAGATATTTTGAATGCTGAAATTGACCCTTCAATTTTATATAAG
GTAAGATTTATACAAAAAAATATTCTCGTTATCTATTTATTTATATGCATGTTTATTTAT
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ATATTCTTGCTACCTTGAAAAATGATAATTAGAGAGATAAGGAGAAAAAAAAAGAAATTG
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TGCAAATCAATGATTACAATTAATCTTATGAATAAAATGAATAAAAGTATGGCAATGATG
AAGATCAAGATATGGGTATTGATGAAGAAGATGATGAAGATGATAATGATGATGATTAAA
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ATGAAAAGAATGATCCTAACAATATTGATGTTAGAGCTATTGATGCATATTGGCTTTAAA
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TTGAAAATTTACTATGAATAGATTTATAACGACCCCATGTAAGCTTAGAAAAAAGATAAA
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GGGTAAAGAAATGGATATTGAAGAGCTTATTACTGCAAACAAGATTACAGATGAAGTAAT
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AATAAAATCAGTAAGAAAATACTTGACTTAGAAAGTTTAGTTTTCTAAGAAGGTTCTCAC
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TTACCTGAATGGGCCCAAAAGCCTTTCGTAGATAAAGAAGTTAATATAAAAGAATTCAAT
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TTAATTAAACAAATTATATTCACTCATTCTTTCCAATAAATAGATTTTCTAAATATCTCA
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CTGACAGATGGATTTAGTGTGAGACTATTGAACCTCTTTTCTTTAAAGATTTAATCCTCC
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TAAGATTCCCTGAAGGAGAGGCTGTTCTAAAAGAATTAGGTATATTATTGATTCATTCAT
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ATTATTGTTGCTATGCTAAGAATTTTTAAAACATACTATGAAAATAAAAAAGTAATTTAT
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CATCTTGGCAAAAAGGTTGCCATATTGACTGGTTAAACTAAAACAGACAACCAAATTTTT
ACCAAGTATGATATTATTATATCTACACCTGAAAACTGGGATATAAACACTAGAAAATGG
AAAAAAACACAATAAATCATTAACAAAAATATAAAACTTTTCATTGCTGACGAACTCCAT
ATGCTTAATGAATGTAATTCAACTTATGAAGTTATTGTTTCTCGTATGAGATAGTTCTCT
TCATTGCTTTCTTCTAAATCAGAAGGCAAATAAGAAGGCAAGAAAGAAGTTAATCATAAT
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TCCTTGACAATCAAAGATATGATGGTCGTGAAAAGAGATATATTGATTATACCATTCCTG
ATATGCTTTAAATGATAGGTAAATTTCATTTTATTTGGATTTAAATTAATTTTTTATACT
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AGTGTTTAGTCTTTTGCCATTCTCCAAAGAAAGAATATTATAAGAAATTCTTATTTGAAC
CTTTCCCTGTAGAATCAATCTTATCAGAAAACATAACTAATCACATTTGTGGTGAAATTT
ATGCTGAAAGAATTACTTCTTTACCAGCTTGTATTGACTGGAGCACTTGGACATTTATGT
ATAGAAGATTATCTTAAAATCCTTACTTCTATGGACTCAGAGAAGTTTCAGGACCTGCCA
TTAATGATTTCTTGTGTGATCTATTTGAAAAAGCTATTGAATATTTAATAGAATATAAGT
GTGTTAAAGAATTAGAATAGCACAATTTAGCTCTTTTAAGTTTAGGTTCTATTGCAGGAT
ATTACTATATTGATGTATAAACAATATAAATGTTTAATGAGAGAATAAAGCCAGGTAATT
TTACTTTGTAATTTAATTTTTATTTCTTATTTTTTTTCTTTTACATTCTTAGACTAATCA
ACAAAGCATTTGATTAACATCATCTGCTCTGCAAATGAATTCTTGGATATCCCTGTTCGT
CACTAAGAAGAAAACCTATTAAAGTAATTGAATCAATAAATTATGTATCCTGTAGATAGT
AGCATTGAAGTTTTCAATGATCCAAATGTGAAAGCATATATTTTACTTTAAGCTTATTTC
TCACGCTTGAACCTTTCTGCAGATTTCTCTTATGACTAAAAGCTAGTTTTAGACAAGGCA
GTTAACTTAACACACGGATTAATTGAAGTTATAAACTCAAATGGCTTACCAAAAGAGGTA
AATTATATAAAATTTTATTATTAGCTTATATTGATGAATTTAATTAGGCTATAAAAGCAA
TGAGATTCTCTCATATGATAGTGCAAGCAGTCTGGACTGATAGCTCTCCACTTTTATAAC
TTCCTCACTTTAACGAGAAAATAGTTAAAGCTCTAGCAGATCTTGATGTCAAATCAATTA
ATGATCTTCTTAATAATGATGAAGCTAGAGATTAAGTTTTCGAATAGTTTAAATTCTCTG
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ATAGCATTTAGAATGTAAATAGCATTTATGAAGGAGATGATAAGGTTAATATGAAAATAT
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TTCTCATGAACTAAGAATAATTTTAATGTGTGATTCTTATCTTGGCTGTGATACAGTAAA
TAAAAAAAATTAATTTATTTAAACAAAAATTCTAATATTTAATTTTAAAAATAGGGAAAA
CAATTCACTTTGAATGTAAAACGTAGAGGTGCTAATGGAAGTATGGAAGACGAGTGA


>TTHERM_00302060(protein)
MADQRQVIDQFNTQANEVIQGERQRGDENTGEPISLVGHLDSLKMGEYAVRQNPKKILDM
MKKNEDSKLKKKKADNLVQPKKKTKIKIEKKDILNAEIDPSILYKPKTNENRILYESILS
KVNKILTDQPRDVLISVTDNILATLKNDNQRDKEKKKEIDQLIQTEIPQEIFDSLLTTAM
QINDYNQSYEQNEQKYGNDEDQDMGIDEEDDEDDNDDDQIQAQVQDQQDIDEESDQEDED
QEQNQQIKALNGDNFSNQNEKNDPNNIDVRAIDAYWLQTKLNDIYNDPMQAQKKDKEILS
VLNEQNNIICQSQLIKILGYDQFDLISLLEKNRHKIYFCTLLQRAEKQQEKDQIIEQMRS
TEAGERVWEQLQNIDKKYKSDHLNKFDSKSKMANLKGKEMDIEELITANKITDEEFNKIS
KKILDLESLVFQEGSHFMSTQQFTAPERATNCSYKGYEETIINATQIKINAELKQVTALP
EWAQKPFVDKEVNIKEFNPIQSAVFDCAFNRTENMLVCAPTGAGKTNIALLAILNVIGKY
IDRRGVVNLNKFKIVYLAPMKALVGEMVLTFTQRLKYYGITVRELTGDSQLSKEQIDSTQ
LIIATPEKWDIITRKAGDRTYTELVRLLIIDEIHLLHDQRGPVLEALVARTIRMTEQTQE
NVRIVGLSATLPNFADVQNFLRVKPLNKKENTGGMFFFDHTYRPVPLQQSFIGISEKKAA
KRMLLTNEILYQKVEQRASKDQPLFIFVHSRRDTVKTANFLRQQAYQMNELNKFVEEGSN
AEEILKKAAENIQNKDLKEMIVQGFAVHHAGLSRDDRDIVENLFFQNRYQKTIKVLVCTA
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