Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00309875

Standard Name

TPB1 (Tetrahymena PiggyBac transposase 1)

Aliases

TTHERM_000309879

Description

TPB1 PiggyBac-like protein; PiggyBac-like protein; involved in DNA cleavage step of programmed DNA deletion; participates in internal elimination sequence incision; Ku, C-terminal

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:28087716: Cheng CY, Young JM, Lin CG, Chao JL, Malik HS, Yao MC (2016) The piggyBac transposon-derived genes TPB1 and TPB6 mediate essential transposon-like excision during the developmental rearrangement of key genes in Tetrahymena thermophila. Genes & development 30(24):2724-2736
  2. Ref:20357003: Cheng CY, Vogt A, Mochizuki K, Yao MC (2010) A domesticated piggyBac transposase plays key roles in heterochromatin dynamics and DNA cleavage during programmed DNA deletion in Tetrahymena thermophila. Molecular biology of the cell 21(10):1753-62

Sequences

>TTHERM_00309875(coding)
ATGAAAAATTTAAGAGAAGATTCAGTAACAGATTGGAAGGATAATTAAAATATAGAATTT
CTTATTAAATTGAAGAACCAAATTTCGAAAAAAAATATTCAATTTCTAACATCAGAAGAA
GCTTTATAGATATCACTCAGGATAAAACCTAAGCAGATTCTCTAGAGACCTAAATATAAT
GGCACATTTTAAATCAGAAATGAATTAACTGCTGATGTAGTAGTTTTTACTAAAACATTG
GAAAAGCATTTATTAAATTTGAAGACCTATTCCAATATAACAGAATGGAATCCAAGTACT
TAAAGATAAATGGTTGAATAATAAATATAATATTATTAGGTAGATGATATATTACTTGAA
AATCCTGTGTAGGACATATCTAAATACTATAAATATGGAAATTAACTTGTTAAAATGAGT
GAATTATTTTTGAATTAAATAAATCTCTTTACACTAAAGGAAATTAAGTTAATTGGATCA
GTTTAAAAGTCGTCGATACCAAGATAATCATTTATGTCTGGCTGTGATATTTTATTTGCT
AAGCAAGATTCAAAACGATCTAGATATATAATTGCAAGTTTAATAAAAGCATGCTTTGAA
GAATAAAGGTATCTTGTAGCTAGATTTGTTCTAAGGTAGAACAGCATTCCAAAGCTAGTA
GTTTTGATTCCACATCTTAAAAAAAACTGTGAGTATTTTTATATCATAGAATTGCCAACT
GTAGAATCTATTAGAGATTATTCCTTTAACAGTCTAATAAGATCTACTCCAGAACAATAA
AAACTTATGAGCTAATTGATAGACGAATTAGATTTAGATTAGGATGAAAAAAACTAAAAT
TAATTTAAGATCGGATCACAACCAAATGAGACCATTGCTAAAATTAATGATCTAATATTG
ATGAGAGGAATGAATGTGAATGAAGAAGAAATTAATAAAAAGTTATTTACAAAAGAATAT
TAACAAACATTTAAATCAGCTAGTTAAAAACTTCTGAGTAATATTAATGAATAATTTAAT
TTAAAAATCATTAATTAGTAATTGTATCATGATAGTTTTAACTAAAAGATTTATTGGAAA
AATTTAATAAGTTAAAAAGATGATAAATTATTTAATGATTTAAAAGATATATTTGGCTCA
ATCGAAAAATAGAATTATAAAGATTTAACAAAAAAAGCATATTAATAAATTGATTTTAGT
ATGCCATAGTCAAAAATTATTTCAATTCTATCTTAACCTCTATTTGATATTAGAGAATTT
TAAGAATATATTCAAATTGTGTAAAATTTAATATACAAAACTATGGATACATTTATAAAA
GGATATACTAGTAATATTATTATTGAACTAATTCTTTTAATCAGAAATAAATCTATCTAG
TTTGAATAATATGAGGCATTTAATTAGTTTTTACTCAAATTTTATGAGAAGTTTCAAAAT
GATTAATTTATTTCAGAGATTGTTAGTAGTGAGATAAACTTAATTTCAACAGAAAACCAT
TAAAATTCAGTCATATTGACTTAAATCGAAGAGGAATTTTTAAGATAAAATCTCTTATAA
AAGGAAATGTCATCACTCAGAGTATCAAGTAAAAATTAAGAGAATATATGCCAAAATTAA
ACTTCTAAGATGAAAAAAATTTTAGTGAATAGCTTAAAAAATAATCAAAATAATGATGAA
GAGATATATTATTCTGATGAATCAGAAACAAATCAAGCAAGAAGGCAAAAAGAAAATGAT
AATTCTCTTCCATAGGATAATCATGAAAATTAATAAAATTTTAATACTTAATAATAAAAG
AAATAAAATAAATAATTAGTTTCATTCACTTAATTAAGCAGCTATAATTCAATTTATTCA
GAATCTGAGACTTCTTAGCATGAAGATTAAATCATTTAAAATAATTAAGATCTAAATTCT
TCTATTGAAGAATCAGGAGAAGAAGAATAAAAATAAGACTTAAAAAGAAACAAAGGAAAT
TTTTCCAAAAAGCTTAATTTAAATGATGTTAATTTTAAACTATGCTCAGATAATAAACTT
TTAAAAGAAACTCTCATAAATATCGACCTCACATATAGAAAACCTTAAGTAAAAAATATA
CCTTTAGAGTCAACTCCAGTTTAAATTTTTCAAAAATTGTGGTCTGATGAAATTTGGAAA
TTAATTACAGATGAGACAAATAAATATTCTAAACAAAGCTTTGATTTAAATTAATACAAT
TTAGACAGTTAAAGTCTAAAAAAATAAAAAATTTGCTTTTTTAGTTAAGACTAAATAAAA
AGATTTATAATTTGTGAGATTCTAATGGGAATATAAAGACTTCCCAGCTTTAGTGACTAT
TTTAGTTCAGACCCATTATTGTCTGGAGGTTTGAACAGGATTTTAGGAAGAGAAAATTAT
TAACTGCTGACTAGATATTTGCATATTTCTGATAATTAAAGTAGAATGGTTCATGTAGAT
GATCATACAAAATTTAAATAGTTTTAATCGATTTTAAATCGAAACTATTAATAATTTTAT
GTTCCTTCAAACTATCTTGCAATAGATGAGGGCATTATACCATTTAAAGGAAAAACAAAA
TTTAAAGTGTATTGTCCCTAAAAGCCTGTTAAATTTGGAATTAAAGAGTATTTATTTTGT
GATTACAGTGGTTACACTCTCAACTTAATAATTCATTCACCTCATGAAAAATAAAATATC
AGAGACATTTATCAACCCTAAACTCTTTAAACTCAAGACATTGTAAATGAGTTGATCAAA
GACTATTAGCCACTTTCTGGAAGTATTTTAATCATGGATAATTATTATAATTCATTAAAT
TTAATACATGATCTTAACTAACAAAATATCGGAGTCCTAGGAACTGTTAGGCCGGATAGA
ATGAATTTTACTGAAGAATAAAAAAAAATGATGAAAATTTAAAATTTTAACAAAGGAGAG
ACAAAATCTTTAACTAAGGATAACATTCATATATTCCTTTGGAGAGATAAAGATAAGCTT
GTTAAAATGATTACTAACTTTTTAGATAATAGAAAAATTGTGAAAAGTATGAAAAAAACA
GGCTAAATTAAGACTATTCCTTTAATGGTTGATATTTACAATAAATATGCCCACTCGGTA
GACAAGAGAAACTAAATATGCTAAAATTATAGAATACACAAAAGATCCTAAAAGTGGTGG
AAATGTGTTTTTTATCGTTTATTAGATACAACACTTTGCAATGCTTACATAATTTATAAG
ATATTAAATGAAGGAAAAAAGAGCCTCTTAACACATAAAGACTTTAGAATTAAAATAGTA
GAAGAGTTAATTCAAAGTTTAAATGAATCAACAGCTCAACTCACTAAATCTTTATCCCAT
AATAGAGGTATTATCTACTCTCTAATCGATATAAATAAAGTTAGAAAGTAAGGTGTACAA
CAAGAAATTATAGCTCATTTTCTAGAAAGGTAAAACTAAGTCGGATTATGCTCACTTTGC
AAACAAGCTACTTTTTTTACCTGTGAATCATGTAATTACGGTAATAAAAAGATTGCCTTA
TGCCCTGTGAATTGTCATAAAGAACATATGAAAAAAGTTTATAATCTTATAGATAAGTGA



>TTHERM_00309875(gene)
GTATTTTAATTGTGTTAAATCAATAAGCTTCTTAAAGAATGAAAGCTTAATTCATAGAGT
CTGTTAGTTTAATATTAAAAAACTTAATGTTTAACTAGTAATAATCAGTACATTAAATTT
TATTTATTCCTGATTAATATGAAAAACATTTTAGTTAGAAAACAAGTGAACCAAATTTTA
CCTAAGTATTATTCAAGGACATTAGAAATTTTCAGGATAAAGCGAAAGAATTCATTGAAA
ATGTTGATGTTTAGGAAAAAATAAGTTTTATAGAAGTACTTTATAATTCTAGAAATGAAT
TAACTGCCTTTGCAAAATACAAGCAATTGAATAAAAAATTATTTTTTTTTATGGGAGAAA
CTGAATCCTTTTTCTTTGGTTAAAGCAAAATGTTTTAACTTTAGGAATTCATTATGCACC
TTAAAAGAGTAAGAAAATAAATATTTTTGCATTTGAAAATTATTTTAATAGTTTTATTTG
TAATAATAGGACTAAATTAAAATAACTCTTATAGGAGAAGAAATAATGAAAAATTTAAGA
GAAGATTCAGTAACAGATTGGAAGGATAATTAAAATATAGAATTTCTTATTAAATTGAAG
AACCAAATTTCGAAAAAAAATATTCAATTTCTAACATCAGAAGAAGCTTTATAGATATCA
CTCAGGATAAAACCTAAGCAGATTCTCTAGAGACCTAAATATAATGGCACATTTTAAATC
AGAAATGAATTAACTGCTGATGTAGTAGTTTTTACTAAAACATTGGAAAAGCATTTATTA
AATTTGAAGACCTATTCCAATATAACAGAATGGAATCCAAGTACTTAAAGATAAATGGTT
GAATAATAAATATAATATTATTAGGTAGATGATATATTACTTGAAAATCCTGTGTAGGAC
ATATCTAAATACTATAAATATGGAAATTAACTTGTTAAAATGAGTGAATTATTTTTGAAT
TAAATAAATCTCTTTACACTAAAGGAAATTAAGTTAATTGGATCAGTTTAAAAGTCGTCG
ATACCAAGATAATCATTTATGTCTGGCTGTGATATTTTATTTGCTAAGCAAGATTCAAAA
CGATCTAGATATATAATTGCAAGTTTAATAAAAGCATGCTTTGAAGAATAAAGGTATCTT
GTAGCTAGATTTGTTCTAAGGTAGAACAGCATTCCAAAGCTAGTAGTTTTGATTCCACAT
CTTAAAAAAAACTGTGAGTATTTTTATATCATAGAATTGCCAACTGTAGAATCTATTAGA
GATTATTCCTTTAACAGTCTAATAAGATCTACTCCAGAACAATAAAAACTTATGAGCTAA
TTGATAGACGAATTAGATTTAGATTAGGATGAAAAAAACTAAAATTAATTTAAGATCGGA
TCACAACCAAATGAGACCATTGCTAAAATTAATGATCTAATATTGATGAGAGGAATGAAT
GTGAATGAAGAAGAAATTAATAAAAAGTTATTTACAAAAGAATATTAACAAACATTTAAA
TCAGCTAGTTAAAAACTTCTGAGTAATATTAATGAATAATTTAATTTAAAAATCATTAAT
TAGTAATTGTATCATGATAGTTTTAACTAAAAGATTTATTGGAAAAATTTAATAAGTTAA
AAAGATGATAAATTATTTAATGATTTAAAAGATATATTTGGCTCAATCGAAAAATAGAAT
TATAAAGATTTAACAAAAAAAGCATATTAATAAATTGATTTTAGTATGCCATAGTCAAAA
ATTATTTCAATTCTATCTTAACCTCTATTTGATATTAGAGAATTTTAAGAATATATTCAA
ATTGTGTAAAATTTAATATACAAAACTATGGATACATTTATAAAAGGATATACTAGTAAT
ATTATTATTGAACTAATTCTTTTAATCAGAAATAAATCTATCTAGTTTGAATAATATGAG
GCATTTAATTAGTTTTTACTCAAATTTTATGAGAAGTTTCAAAATGATTAATTTATTTCA
GAGATTGTTAGTAGTGAGATAAACTTAATTTCAACAGAAAACCATTAAAATTCAGTCATA
TTGACTTAAATCGAAGAGGAATTTTTAAGATAAAATCTCTTATAAAAGGAAATGTCATCA
CTCAGAGTATCAAGTAAAAATTAAGAGAATATATGCCAAAATTAAACTTCTAAGATGAAA
AAAATTTTAGTGAATAGCTTAAAAAATAATCAAAATAATGATGAAGAGATATATTATTCT
GATGAATCAGAAACAAATCAAGCAAGAAGGCAAAAAGAAAATGATAATTCTCTTCCATAG
GATAATCATGAAAATTAATAAAATTTTAATACTTAATAATAAAAGAAATAAAATAAATAA
TTAGTTTCATTCACTTAATTAAGCAGCTATAATTCAATTTATTCAGAATCTGAGACTTCT
TAGCATGAAGATTAAATCATTTAAAATAATTAAGATCTAAATTCTTCTATTGAAGAATCA
GGAGAAGAAGAATAAAAATAAGACTTAAAAAGAAACAAAGGAAATTTTTCCAAAAAGCTT
AATTTAAATGATGTTAATTTTAAACTATGCTCAGATAATAAACTTTTAAAAGAAACTCTC
ATAAATATCGACCTCACATATAGAAAACCTTAAGTAAAAAATATACCTTTAGAGTCAACT
CCAGTTTAAATTTTTCAAAAATTGTGGTCTGATGAAATTTGGAAATTAATTACAGATGAG
ACAAATAAATATTCTAAACAAAGCTTTGATTTAAATTAATACAATTTAGACAGTTAAAGT
CTAAAAAAATAAAAAATTTGCTTTTTTAGTTAAGACTAAATAAAAAGATTTATAATTTGT
GAGATTCTAATGGGAATATAAAGACTTCCCAGCTTTAGTGACTATTTTAGTTCAGACCCA
TTATTGTCTGGAGGTTTGAACAGGATTTTAGGAAGAGAAAATTATTAACTGCTGACTAGA
TATTTGCATATTTCTGATAATTAAAGTAGAATGGTTCATGTAGATGATCATACAAAATTT
AAATAGTTTTAATCGATTTTAAATCGAAACTATTAATAATTTTATGTTCCTTCAAACTAT
CTTGCAATAGATGAGGGCATTATACCATTTAAAGGAAAAACAAAATTTAAAGTGTATTGT
CCCTAAAAGCCTGTTAAATTTGGAATTAAAGAGTATTTATTTTGTGATTACAGTGGTTAC
ACTCTCAACTTAATAATTCATTCACCTCATGAAAAATAAAATATCAGAGACATTTATCAA
CCCTAAACTCTTTAAACTCAAGACATTGTAAATGAGTTGATCAAAGACTATTAGCCACTT
TCTGGAAGTATTTTAATCATGGATAATTATTATAATTCATTAAATTTAATACATGATCTT
AACTAACAAAATATCGGAGTCCTAGGAACTGTTAGGCCGGATAGAATGAATTTTACTGAA
GAATAAAAAAAAATGATGAAAATTTAAAATTTTAACAAAGGAGAGACAAAATCTTTAACT
AAGGATAACATTCATATATTCCTTTGGAGAGATAAAGATAAGCTTGTTAAAATGATTACT
AACTTTTTAGATAATAGAAAAATTGTGAAAAGTATGAAAAAAACAGGCTAAATTAAGACT
ATTCCTTTAATGGTTGATATTTACAATAAATATGCCCACTCGGTAGACAAGAGAAACTAA
ATATGCTAAAATTATAGAATACACAAAAGATCCTAAAAGTGGTGGAAATGTGTTTTTTAT
CGTTTATTAGATACAACACTTTGCAATGCTTACATAATTTATAAGATATTAAATGAAGGA
AAAAAGAGCCTCTTAACACATAAAGACTTTAGAATTAAAATAGTAGAAGAGTTAATTCAA
AGTTTAAATGAATCAACAGCTCAACTCACTAAATCTTTATCCCATAATAGAGGTATTATC
TACTCTCTAATCGATATAAATAAAGTTAGAAAGTAAGGTGTACAACAAGAAATTATAGCT
CATTTTCTAGAAAGGTAAAACTAAGTCGGATTATGCTCACTTTGCAAACAAGCTACTTTT
TTTACCTGTGAATCATGTAATTACGGTAATAAAAAGATTGCCTTATGCCCTGTGAATTGT
CATAAAGAACATATGAAAAAAGTTTATAATCTTATAGATAAGTGATATTAATAGAAAATA



>TTHERM_00309875(protein)
MKNLREDSVTDWKDNQNIEFLIKLKNQISKKNIQFLTSEEALQISLRIKPKQILQRPKYN
GTFQIRNELTADVVVFTKTLEKHLLNLKTYSNITEWNPSTQRQMVEQQIQYYQVDDILLE
NPVQDISKYYKYGNQLVKMSELFLNQINLFTLKEIKLIGSVQKSSIPRQSFMSGCDILFA
KQDSKRSRYIIASLIKACFEEQRYLVARFVLRQNSIPKLVVLIPHLKKNCEYFYIIELPT
VESIRDYSFNSLIRSTPEQQKLMSQLIDELDLDQDEKNQNQFKIGSQPNETIAKINDLIL
MRGMNVNEEEINKKLFTKEYQQTFKSASQKLLSNINEQFNLKIINQQLYHDSFNQKIYWK
NLISQKDDKLFNDLKDIFGSIEKQNYKDLTKKAYQQIDFSMPQSKIISILSQPLFDIREF
QEYIQIVQNLIYKTMDTFIKGYTSNIIIELILLIRNKSIQFEQYEAFNQFLLKFYEKFQN
DQFISEIVSSEINLISTENHQNSVILTQIEEEFLRQNLLQKEMSSLRVSSKNQENICQNQ
TSKMKKILVNSLKNNQNNDEEIYYSDESETNQARRQKENDNSLPQDNHENQQNFNTQQQK
KQNKQLVSFTQLSSYNSIYSESETSQHEDQIIQNNQDLNSSIEESGEEEQKQDLKRNKGN
FSKKLNLNDVNFKLCSDNKLLKETLINIDLTYRKPQVKNIPLESTPVQIFQKLWSDEIWK
LITDETNKYSKQSFDLNQYNLDSQSLKKQKICFFSQDQIKRFIICEILMGIQRLPSFSDY
FSSDPLLSGGLNRILGRENYQLLTRYLHISDNQSRMVHVDDHTKFKQFQSILNRNYQQFY
VPSNYLAIDEGIIPFKGKTKFKVYCPQKPVKFGIKEYLFCDYSGYTLNLIIHSPHEKQNI
RDIYQPQTLQTQDIVNELIKDYQPLSGSILIMDNYYNSLNLIHDLNQQNIGVLGTVRPDR
MNFTEEQKKMMKIQNFNKGETKSLTKDNIHIFLWRDKDKLVKMITNFLDNRKIVKSMKKT
GQIKTIPLMVDIYNKYAHSVDKRNQICQNYRIHKRSQKWWKCVFYRLLDTTLCNAYIIYK
ILNEGKKSLLTHKDFRIKIVEELIQSLNESTAQLTKSLSHNRGIIYSLIDINKVRKQGVQ
QEIIAHFLERQNQVGLCSLCKQATFFTCESCNYGNKKIALCPVNCHKEHMKKVYNLIDK