Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00312230

Standard Name

ELP2 (ELongation Protein 2)

Aliases

PreTt03411 | 30.m00220 | 3810.m01836

Description

ELP2 elongator complex protein; RNA polymerase II elongator complex subunit

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

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Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_03238.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (847 aa)
Tetrahymena borealis EI9_17534.2 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (286 aa)
Oxytricha Contig19993.0.g37 8.001903776189462e-102
Description: WD domain, G-beta repeat
DictyBase DDB_G0275651 2.998893725394183e-91
Description: elp2 on chromosome: 2 position 5847867 to 5850695
SGD YGR200C 3.0005221502158484e-68
Description: ELP2 Subunit of Elongator complex, which is required for modification of wobble nucleosides in tRNA; target of Kluyveromyces lactis zymocin
WormBase WBGene00013738 5.9995872346509964e-61
Description: locus:elpc-2 status:Partially_confirmed UniProt:Q9NEW7 protein_id:CAC35846.4
Tetrahymena borealis EI9_01462.1 5.9995872346509964e-61
Description: hypothetical protein (249 aa)
Stentor Coeruleus SteCoe_11397 2.4426007377405277e-36
Description: None

General Information

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Associated Literature

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Sequences 

>TTHERM_00312230(coding)
ATGAGTCAATTAGAATTAAGCTGCGTTTAAGGAGGTGTTAACCCCCTTTATAAATGTTTT
GCCTTAGGCAAAGCTGTTAAGGAAGCTTGCTTTTATGCTTGCTCCAATAGCATTATTGTG
AACAATATCAATAAGGTTACTAATTATTTTACTTTAAGTGGACATTCAGATCGCGTTAAC
TTTGTAAAAACTATAAATAATTTTTCTGAGCGTTAGCTTATTGTTTCAGGAAGCAGTGAT
TCCAATTTAATAATTTGGGAAGGTAAACTTTCTAACCTATTTATCAAGGAAAATTGGTCT
ATTAAGCATAAATTTAATCTCAATCACTCTGTTTCATTTGCCACTGTTTTAGAATACTCT
CCTAATCTTGCATATGTCGTAGCTGGTAATATTATGGGTGATGTCTATATTATAAAGATA
AGCGATGAATCTAATCAAAGTTTAATTATGGATAGCATCACATTTGGACATCATTTTACA
TAAGAATGCACTGCACTTATCCGCCACAATCCTAATAAAGATGAATTTTTGATAGCTTTA
GGAGGTTTAGACTTCACTGTTCATATCTATCACACTGATTTAAAGAAATATACAGCTCCA
GTAGATGGTAAAAATACTATGGAAAGAGGTACTTTGTTTGAATACAAAGTTAGTCTTAAA
GGACATGAAAATGCAATTACTGATTTGTAGGTCTTAAAACAAAAAAAAGACACTCATGAA
GAATGGATTATTGCCAGCTCTTCTAAAGATACTTATGTTCGTTTATGGAGATTTAGTGAG
CTCTTAGAAGATGAGACTATTAAGTAAATTTCTGAATTCTAAAATAAGCAAACTTAAAGA
TTCGTTTTAGGCGATAAGAAGTATTTTATCACTTTAGAAAGTGTTTTGAGCGGACACGGT
GAAGCAGTAGTCTGTCTTGACTGGGGTTTGTACAAAGGAGAAACTGCACTTATCTCTGCA
TCATTTGATTTTAACATTATATTATGGACCAAGGATAAAGACACAGATATTTGGTTAACC
TCATACAGATTAGGTTAGGTAACAGGAAGCAAGTATGCCTTTTTCCAAGCTACCTTTAAT
GCTGATTACACATAGATTTTTTCTTACACATACACAGGTTCATTTTACTTATGGGAATAC
AATTAAGAAAAGGGAATTTGGGATTCTAAACCAACTGTTAGTGGCCACTTCAATTAGGTA
TTTGATTTGGATTGGAGCACTAAAGGAGATTTCTTAGTATCTTGTGGTTTAGATTAAACA
ACAAGAATTATCACTTAATCTTCTTAAACTCAATCCTGGCATGAAATTTCTCGTGCATAA
ATTCACGGTTACGATATCAATAGCATTAAATGCTATCCTGTTTAACTTGAAAATAAAAAT
ATTTGTGACACTCTTATTTGCGGAGCTGACGAAAAAGTTGTTAGATTATTTGAACCTCCT
GCAGCTTTTGTGAATGCAGTTAATCAAATGTCCAACACAGATTTACATTTATACTTCTAA
GACGATAATCAAGAAAAGAAATATTTGGATTAAAAGCAGTTAGAAAAGGGTATCTTTGAA
TACCAAGTTTCCTAAGAAGGTGGTGCTCAAGTTCTCGGTCTTATGATTAAAGCTATTAAA
CTTGAACCAGATTTTGACCCTTCTAAATACGTAGATCCTGAAGATGAAGGTGGTTTGATT
TCAGATAAAATTTAATCTATTGAAGATAAAAAGAAAGAAGAAGAACTTTTTTCTTAGAAG
CACGATTTTACTCAACCTCCTATTGAAGATTACTTGATAAAGCATACCTTATGGCCTGAA
TTGAATAAGTTATATGGACATGGTTATGAATTAAAGTGTGTCAGCTGCAGCAATGATGGC
AAATTAATTGCAAGTTGCTCAAAATCTTAAACAAAAGAAAATGCATGTGTGATTTTCTGG
AATCCTACTAACTATTAAATTTATTCCAAGTTAGAATATCACAATTTCACTATTAACCAG
ATGGAATTCTCACCCAGTGATGAATACTTTGCAACTGTTTCCAAAGATAGATCTTTAGCA
TTATTTAAAAAGAATTATCTTGACGAAGCTAAAAAGGAATTAAACTTCAAAGAACCTTAC
GCTCTATACTATAATGATAAATCCCATACAAGAATTATTTATAGCGCAGCTTTCTCACAT
GATGAGAAATTTATTGCCACAGGTGCAAGAGATAAGAGAATCAAAATTCACTCAATATTA
GATAAAAAGGTTATATTTAATAAAGTATTAAGTAGCACTATTACTGCATTAGCATTTGCT
CCTATATCATATAAAAATGAAAACTCATACCTTATTATTGTTGGCTACGAAGAAGGAGGA
ATGGAATTATATGAATTCGAAAGTAACACTAATCAACTCAATCTGATTGATAAGCCACAC
GAGTTTATCGGACATACAAATACAATCAGTAGGATTAAATTCAGAAAGAATTATAAGCCT
AACATTAACAGCAAAATTCTTCAATTTGCTACTTGTTCACTTGATCACACAGTCCGTGTT
TTCAATTTCAAGATTAATTGA


>TTHERM_00312230(gene)
ATGAGTCAATTAGAATTAAGCTGCGTTTAAGGAGGTGTTAACCCCCTTTATAAATGTTTT
GCCTTAGGCAAAGCTGTTAAGGAAGCTTGCTTTTATGCTTGCTCCAATAGCATTATTGTG
AACAATATCAATAAGGTTACTAATTATTTTACTTTAAGTGGACATTCAGATCGCGTTAAC
TTTGTAAAAACTATAAATAATTTTTCTGAGCGTTAGCTTATTGTTTCAGGAAGCAGTGAT
TCCAATTTAATAATTTGGGAAGGTAAACTTTCTAACCTATTTATCAAGGAAAATTGGTCT
ATTAAGCATAAATTTAATCTCAATCACTCTGTTTCATTTGCCACTGTTTTAGAATACTCT
CCTAATCTTGCATATGTCGTAGCTGGTAATATTATGGGTGATGTCTATATTATAAAGATA
AGCGATGAATCTAATCAAAGTTTAATTATGGATAGCATCACATTTGGACATCATTTTACA
TAAGAATGCACTGCACTTATCCGCCACAATCCTAATAAAGATGAATTTTTGATAGCTTTA
GGAGGTTTAGACTTCACTGTTCATATCTATCACACTGATTTAAAGAAATATACAGCTCCA
GTAGATGGTAAAAATACTATGGAAAGAGGTACTTTGTTTGAATACAAAGTTAGTCTTAAA
GGACATGAAAATGCAATTACTGATTTGTAGGTCTTAAAACAAAAAAAAGACACTCATGAA
GAATGGATTATTGCCAGCTCTTCTAAAGATACTTATGTTCGTTTATGGAGATTTAGTGAG
CTCTTAGAAGATGAGACTATTAAGTAAATTTCTGAATTCTAAAATAAGCAAACTTAAAGA
TTCGTTTTAGGCGATAAGAAGTATTTTATCACTTTAGAAAGTGTTTTGAGCGGACACGGT
GAAGCAGTAGTCTGTCTTGACTGGGGTTTGTACAAAGGAGAAACTGCACTTATCTCTGCA
TCATTTGATTTTAACATTATATTATGGACCAAGGATAAAGACACAGGTAATAAAATAATT
CATCAATAAATAACCTTTTTATCATAAAAACAATGAATACATTTTATCCACACTATAATT
TTTATTTTAATTAAATTATTGAAAAATAAAATAGAATAATTATATATTTTTTCTATTTAT
AGATATTTGGTTAACCTCATACAGATTAGGTTAGGTAACAGGAAGCAAGTATGCCTTTTT
CCAAGCTACCTTTAATGCTGATTACACATAGATTTTTTCTTACACATACACAGGTTCATT
TTACTTATGGGAATACAATTAAGAAAAGGGAATTTGGGATTCTAAACCAACTGTTAGTGG
CCACTTCAATTAGGTATTTGATTTGGATTGGAGCACTAAAGGAGATTTCTTAGTATCTTG
TGGTTTAGATTAAACAACAAGAATTATCACTTAATCTTCTTAAACTCAATCCTGGCATGA
AATTTCTCGTGCATAAGTAAGTTTATTAAAATTGTAAAATAAATTAATCTAATAAATAAC
CCTTATTTAAAAGATTCACGGTTACGATATCAATAGCATTAAATGCTATCCTGTTTAACT
TGAAAATAAAAATATTTGTGACACTCTTATTTGCGGAGCTGACGAAAAAGTTGTTAGATT
ATTTGAACCTCCTGCAGCTTTTGTGAATGCAGTTAATCAAATGTCCAACACAGATTTACA
TTTATACTTCTAAGACGATAATCAAGAAAAGAAATATTTGGATTAAAAGCAGTTAGAAAA
GGGTATCTTTGAATACCAAGTTTCCTAAGAAGGTAAATTATTAATTCATTTTCATTTATT
TTTATATTTGAATAAAATTTTTTTAATCATTGATATGATTTTATCATTCACAAATTATTT
AAATTAATTTTACTTTTTAAATCTTATTTTAGGTGGTGCTCAAGTTCTCGGTCTTATGAT
TAAAGCTATTAAACTTGAACCAGATTTTGACCCTTCTAAATACGTAGATCCTGAAGATGA
AGGTGGTTTGATTTCAGATAAAATTTAATCTATTGAAGATAAAAAGAAAGAAGAAGAACT
TTTTTCTTAGAAGGTAAAAAATAATTTTTTTAATAAAAAAAATATTAATAATTGAAATAA
TAATTATAATTAATAAATTATAGCACGATTTTACTCAACCTCCTATTGAAGATTACTTGA
TAAAGCATACCTTATGGCCTGAATTGAATAAGTTATATGGACATGGTTATGAATTAAAGT
GTGTCAGCTGCAGCAATGATGGCAAATTAATTGCAAGTTGCTCAAAATCTTAAACAAAAG
AAAATGCATGTGTGATTTTCTGGAATCCTACTAACTATTAAATTTATTCCAAGTTAGAAT
ATCACAATTTCACTATTAACCAGATGGAATTCTCACCCAGTGATGAATACTTTGCAACTG
TTTCCAAAGATAGATCTTTAGCATTATTTAAAAAGAATTATCTTGACGAAGCTAAAAAGG
AATTAAACTTCAAAGAACCTTACGCTCTATACTATAATGATAAATCCCATACAAGAATTA
TTTATAGCGCAGCTTTCTCACATGATGAGAAATTTATTGCCACAGGTGCAAGAGATAAGA
GAATCAAAATTCACTCAATATTAGATAAAAAGGTTATATTTAATAAAGTATTAAGTAGCA
CTATTACTGCATTAGCATTTGCTCCTATATCATATAAAAATGAAAACTCATACCTTATTA
TTGTTGGCTACGAAGAAGGAGGAATGGAATTATATGAATTCGAAAGTAACACTAATCAAC
TCAATCTGATTGATAAGCCACACGAGTTTATCGGACATACAAATACAATCAGTAGGATTA
AATTCAGAAAGAATTATAAGCCTAACATTAACAGCAAAATTCTTCAATTTGCTACTTGTT
CACTTGATCACACAGTCCGTGTTTTCAATTTCAAGATTAATTGA


>TTHERM_00312230(protein)
MSQLELSCVQGGVNPLYKCFALGKAVKEACFYACSNSIIVNNINKVTNYFTLSGHSDRVN
FVKTINNFSERQLIVSGSSDSNLIIWEGKLSNLFIKENWSIKHKFNLNHSVSFATVLEYS
PNLAYVVAGNIMGDVYIIKISDESNQSLIMDSITFGHHFTQECTALIRHNPNKDEFLIAL
GGLDFTVHIYHTDLKKYTAPVDGKNTMERGTLFEYKVSLKGHENAITDLQVLKQKKDTHE
EWIIASSSKDTYVRLWRFSELLEDETIKQISEFQNKQTQRFVLGDKKYFITLESVLSGHG
EAVVCLDWGLYKGETALISASFDFNIILWTKDKDTDIWLTSYRLGQVTGSKYAFFQATFN
ADYTQIFSYTYTGSFYLWEYNQEKGIWDSKPTVSGHFNQVFDLDWSTKGDFLVSCGLDQT
TRIITQSSQTQSWHEISRAQIHGYDINSIKCYPVQLENKNICDTLICGADEKVVRLFEPP
AAFVNAVNQMSNTDLHLYFQDDNQEKKYLDQKQLEKGIFEYQVSQEGGAQVLGLMIKAIK
LEPDFDPSKYVDPEDEGGLISDKIQSIEDKKKEEELFSQKHDFTQPPIEDYLIKHTLWPE
LNKLYGHGYELKCVSCSNDGKLIASCSKSQTKENACVIFWNPTNYQIYSKLEYHNFTINQ
MEFSPSDEYFATVSKDRSLALFKKNYLDEAKKELNFKEPYALYYNDKSHTRIIYSAAFSH
DEKFIATGARDKRIKIHSILDKKVIFNKVLSSTITALAFAPISYKNENSYLIIVGYEEGG
MELYEFESNTNQLNLIDKPHEFIGHTNTISRIKFRKNYKPNINSKILQFATCSLDHTVRV
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