Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00320020Standard Name
ABC10 (ABC transporter 10)Aliases
PreTt15921 | 32.m00165 | ABCC10Description
ABC transporter C family proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- integral component of membrane (IEA) | GO:0016021
Molecular Function
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
- ATP hydrolysis activity (IEA) | GO:0016887
- ATPase-coupled transmembrane transporter activity (IEA) | GO:0042626
Biological Process
- transport (IEA) | GO:0006810
Domains
- ( PF00005 ) ABC transporter
- ( PF00664 ) ABC transporter transmembrane region
- ( PF02141 ) DENN (AEX-3) domain
- ( PF02463 ) RecF/RecN/SMC N terminal domain
- ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
- ( PF05662 ) Coiled stalk of trimeric autotransporter adhesin
- ( PF06341 ) Protein of unknown function (DUF1056)
- ( PF07782 ) DC-STAMP-like protein
- ( TIGR00954 ) Peroxysomal long chain fatty acyl
- ( TIGR00955 ) pigment precursor permease
- ( TIGR00957 ) multi drug resistance-associated protein (MRP)
- ( TIGR00958 ) antigen peptide transporter 2
- ( TIGR00960 ) Type II (General) Secretory Pathway
- ( TIGR00968 ) sulfate ABC transporter, ATP-binding protein
- ( TIGR00972 ) phosphate ABC transporter, ATP-binding protein
- ( TIGR01166 ) cobalt ABC transporter, ATP-binding protein
- ( TIGR01184 ) nitrate ABC transporter, ATP-binding proteins
- ( TIGR01186 ) glycine betaine/L-proline transport ATP binding
- ( TIGR01187 ) polyamine ABC transporter, ATP-binding protein
- ( TIGR01188 ) daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding
- ( TIGR01189 ) heme ABC exporter, ATP-binding protein
- ( TIGR01192 ) glucan exporter ATP-binding protein
- ( TIGR01193 ) ABC-type bacteriocin transporter
- ( TIGR01194 ) cyclic peptide transporter
- ( TIGR01271 ) cystic fibrosis transmembrane conductor regulator
- ( TIGR01277 ) thiamine ABC transporter, ATP-binding protein
- ( TIGR01288 ) nodulation ABC transporter NodI
- ( TIGR01842 ) type I secretion system ATPase
- ( TIGR01846 ) type I secretion system ATPase
- ( TIGR01978 ) FeS assembly ATPase SufC
- ( TIGR02203 ) lipid A export permease/ATP-binding protein
- ( TIGR02204 ) ABC transporter, permease/ATP-binding protein
- ( TIGR02211 ) lipoprotein releasing system, ATP-binding protein
- ( TIGR02314 ) D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein
- ( TIGR02315 ) phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein
- ( TIGR02323 ) phosphonate C-P lyase system protein
- ( TIGR02324 ) phosphonate C-P lyase system protein
- ( TIGR02633 ) D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein
- ( TIGR02673 ) cell division ATP-binding protein FtsE
- ( TIGR02769 ) nickel import ATP-binding protein NikE
- ( TIGR02770 ) nickel import ATP-binding protein NikD
- ( TIGR02857 ) thiol reductant ABC exporter, CydD
- ( TIGR02868 ) thiol reductant ABC exporter, CydC
- ( TIGR02872 ) sporulation integral membrane protein YtvI
- ( TIGR02982 ) ABC exporter ATP-binding subunit, DevA
- ( TIGR03005 ) ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein
- ( TIGR03269 ) methyl coenzyme M reductase system,
- ( TIGR03375 ) type I secretion system ATPase
- ( TIGR03410 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
- ( TIGR03411 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_19041.1 9.997093137033517e-262 Description: ABC transporter (5234 aa) Tetrahymena borealis EI9_06008.1 9.997093137033517e-262 Description: hypothetical protein (954 aa) DictyBase DDB_G0287691 5.997858334163121e-134 Description: abcC3 on chromosome: 5 position 792495 to 797051 SGD YLL015W 1.0003814179949055e-122 Description: BPT1 ABC type transmembrane transporter of MRP/CFTR family, found in vacuolar membrane, involved in the transport of unconjugated bilirubin and in heavy metal detoxification via glutathione conjugates, along with Ycf1p WormBase WBGene00003413 3.000551941601253e-121 Description: locus:mrp-7 status:Partially_confirmed UniProt:Q9U2G5 protein_id:CAA21622.4 WormBase WBGene00000552 3.000551941601253e-121 Description: locus:cmd-1 Calmodulin status:Confirmed UniProt:O16305 protein_id:CCD69969.1 Oxytricha Contig841.0.g97 4.001540793770557e-102 Description: ABC transporter transmembrane region Stentor Coeruleus SteCoe_16534 2.2856936767186716e-49 Description: None
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:22184018: Lu XY, Xiong J, Yuan DX, Miao W (2011) [Alternative splicing of an ATP-binding cassette transporter ABCC10 in Tetrahymena thermophila]. Dong wu xue yan jiu = Zoological research 32(6):605-10
Sequences
>TTHERM_00320020(coding)
ATGGAGTTAAAACAATCTCTTTTAGAATCAACTTCAAGGGAAGATGCCAATAAAAAATAT
TTTAAGACTCACAACATTTTATTTACAAAAATAACTTAGTTTGTTAAAAGCCTTAAAACA
TAATCAAAAGATCAACAGCTCAATAATAAATAAATAGATCCTTTTATAGCCTAAAGTACT
AGTGTAGATGTTTAATTAGAAAAACTAGAAAAATACATTTAGGAAAACCAATAACATTTC
TAATCTACCAATTTTAACTTATTCAAAATTTACAAACAAATGACAGGCCTTACTCTTTTA
AAAGGCTTCTTCTTATCTGTTTCAAATGAACTTTTATCAGCATCAGGTATTTTTATGCTG
GACTTTGTCACTGATCAAATGAAAGATTTCACAGGATTGTCTAGTTAAAAGGCTTTAATT
TCAATAATATTCCTAGGGATAGTGATAAACTATACTATAAAAAACTTTGTGTGGACGAAT
TATCAATGGATGAATTACAGATGGTAGGCTTTGTGTAAAACTACACTCTAATATATCATT
TATAAAAAATCCTTAAAAGTTAAGAATTATTCAAAATAGAATAATAGTGTTGAGCCAAAA
ATTTAAAAATTAGAAAACTAAGCTGAAGGACAAGGAGATGAAAAGTTAGACATAACTTCT
TTTTAAAAAGTTAATCCCGATATAAATAACTTATTAACTGTAGATGTAGAAGAATCGATG
CAGTTATTTTGGGGAATAAACTAATTAGTTGCTAGCTTAGCTGTAATAATAATCACGTTT
GCTATCATTTATTATAAAATCGGTAAGTCGATTGTAAATGGACTTTATTTAATGGCAGGA
GCAATGGCAGTAAGTTTTCTTTCTGGATTTTTCATGAATATCTTTTATGACAGAATATAC
AGCCATAAAGATAGCAGAATTTCTCTTTGCAAAGATGTGATAGAAGGGATGAAGAGTATA
AAATACTTAGGATGGGAAAATATATTTTCTAATAAAATCAAAGACTTGAGACAAAAAGAA
TTTTTTAATGTAGCTGCTATGAGGTCAATTGATGGAATCTTTAGTACTTTTATAGTATGT
TCAAATTATTTTCTCTTGTATTGCTTTATTGTATCATATATAAACGATGGAAACGAGCTG
ATCAATTCTAATGTCTTTACTATTATAGCCCTTTTTGGTAATTTAGCTTTTCCAATTGGA
ATGATACCCTTTTCTCTTAAGTGCATGACAAAAGCAAGAATTTCTTTCTTTAGAATCAAA
AGCTTCTTAAACATTGATGAAATTGATGAATCTCAAATTATTTAGACAAGTGAAAATCAA
TCCTAAGTAGCTGTTCAAATTCAAAATTAATATTTCTCTTGGCCTAACAAAGAATTAAAT
GAAGAATAAAATATAAAATAGAGACAGTAAAAGCAAGATATTTCAGATTCAGAAAGCCAA
TTTGAAGACTAAGAAAATAGCGTTTCTAAAAATAGCTCAGAATTTAATTTGTTTATTGAT
AACATTTAAATCTAAAAAAATTCTCTGAATTTTGTAATCGGAAAAGTTGGATGTGGAAAA
ACATTATTTTTACTCTCAATCATGAATGAGATGGAAAAAAGGTCTTAAAATTTTGACCAA
TCTATTATTAAAGATGACCTTAAATAAGTAAATACCTTAAAAATGACAAATTATGAAAAT
AAAATCATAGTGAATGGTAATGTGGCATATGTCAGTTAGAATCATTGGCTTTAATCAAAA
ACAATCAAAGAAAATATACTTTTAGGAAAAAAATATGATCAAGACCTTTATTTGAAATGT
CTTGAAATAAGCTAGCTAAAGACTGATTTATCTCAATTCTCAAAGGGAGATTAAAAAATT
ATTTCTTCAGATGGAAATAATTTAAGTGGAGGTCAGAGATAAAGAATTTCATTGTGTAGA
GCACTCTACTAAGATAAAGAAATCTACTTATTAGATGATATATTTAGTTCGCTAGATGCT
CATGTGGCAGAATACATTTATAAGAATGCTATATTAGATTACTTAATCAAATAAAAAAAT
AAAACAGTTATTTTAGTAACTAGTAATTATGAGTTTTTAAGCAATGAGAGTATTCAAAAT
ATAATTTATTTGAGAAATGGGAGGATTATTAATGACTAAGAAGAAATATAAAGCTATATC
TTAAATTGCAAATAAAAATAAAAAAAGAATGATTTCTTCTTTGAAAGCGATTACTTTTAA
AACTCAAGTAATCTAAACAATAAATATAATAAGAATTCAGATGAAGAGATCGATTAATTA
AATATAACTTAAAAATAAATTAAACTAAAACCAGAAAATTAAAAAAATATAGGATTTAAC
CAAACAAATGAGCAGAATGAAGTATAAAATAATAATGAGATAAGCTCAGAAGAAGGAGAA
AAAAATGAAGAATATAGAGAGAAAGGTATTATTAAGTGGGAAACTTTAAAGACTTATATG
AAAAGTTAAGGCATAGTTTACTTATTTTTTTTTATAGTATTTTTTGCTTTAGTAGAAGTG
GCTAGCTTATTGATTGACTTTTGGCTTAGAGATAAGCTGATAAATTAAAATGAGGAAGAT
TCTGCTTTTATTTTTATAAACAAACTTTTTTAAAGTTTTCAAGAGACATTCCTTTTTTTA
ACAATGCTTTAGCTATCTTTAATGCTTATTGGGGCTTTCTTTTATGTTGTCATATCGTTA
TTAAGTTGTTACAGACTTTATAATAAGTTAAATAACTCTATAATGTCTAGTAAAATGGTT
TTTTTTGATAAAAATCCTGTTGGAAGAATTATGAGCAGACTCTCTGATGATATTAACTCT
ATTGATGATGATCTACCTTTGAATTTTGAAACTGCATCTGAACAAGTTGTTCTTGCAATT
GGTTATCCAGTTGGTATCTCTATTTAGTTTCCTTGGATGAGTGCTTTTTTTGTAGTTGCT
ATAGTAATTACATATTTTATTTCAAATATGTATAGAAGTTCAAACAGAGAAGTCAAAAGG
CTAAACTCCCTAAATAAAGGTTAGCTTCTCACTCATATTTCTGAATCTTGCAAAGGATTA
GTAACAATTAGGTCTTTTTAAAAATAAGCTTACATGACAAAATAATATATTTTAAGATTA
ACGAATAATATAAACACATTTTTACTTTCTTTATCTTTGTAGATGTGGTTGTTTGTAAGG
CTACTTTTAATTTCTAATGGAATCTAGCTAGTTCTTTCAATAACAGCAATTATCATAATA
ACTTCTGAAGCAAATGTGGATATGAATATTATTGTCCTATGTTTATCGTATGGAATTTTA
TTTAGCGGTTAAATTCTTGATGTTGTTTATTTCGTTTGTTTAACTGAATAAGAATTAATC
AGTGTTGAGAGAATAAGACAGTATTTTGATAACCCCTAAGAAAATGTTTATACCATTCAA
AACTCTAACAAATATATACAATCAGCATATGCTTTAAGTCCTTCTGATATAAATCAGAAT
TTTTCCATAATCTTCTAAGATCTAAGCATCACTTATGATGAATTGAATGAATAAAATTCT
GATCTTGTATAGTATGCTCTAAAAGACTTTAATCTTCAAATCAAAAAAGGAGAGAAAATT
GCATTTTGTGGAAGAACAGGTTCTGGTAAAACCTCGATCCTTAATTGTTTGTTTAGATTA
TATGATTACCAAAAAGGATAAATCTTAATAGATAATAAAGATATTCAAGATATGAGCTTG
AAGGAGTTAAGAAATAAAATGGCTATCATTCCTTAATTTGGATTTTTATATAATGCAACT
CTTAGAGATAACATAGATCCAATCAATGAAATACCTGATGAAAATATTTAAAGATGCATT
CAATCAATTCAAGAAGATGGTCAGTTGAATTAAAATGACTGCTTCTAAGAATTAGATTTT
GAAATCCAAGAAGGTGGGAAGAATTTATCAAATGGACAAAAGTAAATTATAAACTTTATT
AGAGTGGCTCTGAGGTAGACAGAAATAATTTGCTTGGATGAAGCTACTTCTAACATGGAT
CCAAAAACAGACGAATTGATTCACAAAAAGTTATTTGAATTAAGTGAAGGAAAAACACTT
CTAGTGATAACTCACAGATTAGAAAATATACATAAATTTGATAGGATAGTAGTGTTAGAT
TCTGGAAAAATTGTCGAAGAAGGAAATTATGAGTAACTAAGATATACAAATATAATAATT
AACATAATTAAAGTATCTATATTAAATAAATTATAAATGGATATAAAGTAACCACTTCTT
GTAGAGTAATCTTCAGATCAAAGTAGTTAGTATACTTTCAAGGCTCATAACATTTTCTTT
ACAAGATTAACTTCATTTATAAAGTAAATTAAGTTTTTAAATGATGGTCAATACATATCT
AATCAGTAAACCTAGCCATTTATAGCCCAAAGCACCAGCGTAGATGTTTAAATCAATAAA
TTAGAAAAATTCATGAGTGATAATTAATAGCACTTTTAACCAAACAATTTTAATTTATAT
AAAATTTACGTTTAAATGACTGGATTTACACTAGGTAAAGGTATTTTCCTTTCAGTTATG
AATGAAGTTTTATCTGCCTCAGGCATATTTTTACTTGATTATGTTACTGATAAACTCAAG
TAGTTTAATGGAGAGTCCAATGAAAAGCTTATCATATCGTTTATTCTTATTGGAATAGTT
GTGAACTATACTGTCAAAAATATTATTTAGGGGAAATATTATTGGTTGGATTACAAATGG
CAAGCTTTGTGTAAAACAACTCTTTAATATTTAATTTATAAAAAATCACTAAAAGTCAAA
AACTACTCTAAGTAGAGCAACTTAGTGGCTGAACAAAAAAAGGAGGATAATCAAAAATAA
GAGAATGATGAAACAGAAGGAGAAGAGGAAATTACATCTTTTTAAAAAAGAAATCCTGAT
ATAAACAACTTATTGACTGTTGATATTGAAGAATCGATGCAGCTTTTTTGGGGTATTACT
TAACTAGTTGACAGTATAGCTGTTATAATTATTACTCTAATTTTCCTCTTCTATAAAATT
GGAAAGTCCATGTTTAACGGATTATATTTAATGGCTGGAGCTATGTTAATAGGTTTCCTC
TCAGGCTACATAATGAATATCTTCTATGATAAAATTTATGGATGTAAAGACAATAGAATC
TCACTAAGTAAGGATGTTATTGAAGGAATGAAGAGCATTAAATATTTAGGATGGGAAACT
ATATTTTCAAATAAAATAAAAGATTTGAGAAGAAAAGAGTTTTTCTAAATATCTGTTATG
AGAATTATTGATGGATTCTTCAGTACCTTCATGCTAAGCTTAGGATATTTGTTACTTTAT
ATTTTTATTGTTTCATATGTTAATGATGGAAATGACCTATAAGATTCAAATGTATTCACA
ATAATTGCTCTTTTTGGTAATTTAGCTTTCCCAATAGGCATGATTCCTTTCACTACTAAA
TGTATCTCCAAAGCTAGAATCTCTTTCTTAAGAATTAAAGGCTTTTTGAATATTGAAGAA
ATAAATGAATCAGATGTCATAAAGGTAGATAATGATGAAATTAATTAAGATGTATAAAAC
GCAATTGTTATGAATCAACTCAAGTTCAGCTGGCCAAACAAAGAGATAAATGAAGAATAA
AATGAAGAGAGAGTTTCTGAAAAATCAAATAATATAAAGTCTTCAGGATAGCTTAATTAA
CTAGATGATTAAAGTATCTAAGATTCTAAAATTAGCTCTGAATTTACTTTATATATTGAT
GAAATGATAATATAGAAAGGCACCTTGAATTTTGTTATTGGTAAAATAGGTTGTGGAAAA
ACTGCTTTTTTGCTTTCGATTTTGAATGAGATGGAAAAAAAATAACACCAATCTGATCCA
TCAATTATTAATAACAATTCTCAACAAATAGATGCCTTAAAAATGACTAACTTTGATAAT
AAAATAGTTGTAAATGGGAGTATAGGATATGTAAGCTAAAATCATTGGCTATAAACCAAG
ACAATAAGAGATAATATTCTTTTTGGAAAAATTTATGATTAAGAACTTTATCAAAAGTGT
CTGGATTTATGCTAATTGAAGATTGATTTATCTCATTTTTATAAGGGTGATTAAAAGGTT
ATATCTTCAGACGGTAATAATCTGAGTGGAGGTTAGAGATAAAGAATTTCTTTGTGCAGA
GCACTGTACTAAGATAATGATATTTATTTATTAGATGATATATTTAGCTCTTTGGATGCT
CATGTTGCTGAGCATATCTATAAAAATGCCATTTTAGATTATTTAATTAAATAAAAAAAT
AAAACAGTCATTCTAGTTACAAGTCACTATGGATTTATAACAAATGATAATATTTCTAAT
ATCATTTACTTAAAGAACGGAGAAATTATTCATGACTAAAAATAAATTTATAGTTATATT
CAGAATTCTTAATAAGATTCTAAAACTAAAGATTTTAATTTCTTAAATGAATAAGAAGAT
GATTTATAAGATCAAGAAGTAGAAGAAAATAAGGTTGAAAACTCTGAGACTAACTAATAA
TTAATCTAAAGAAAAGTAGATAGTGAATAAGACCACTTGATGCTTTAAAAGAAAAATTCT
ACAAGTAGCGAAACTAAATTAGCATTGAGAAAAGAAAACTCTAAAAAGTAGAATTTTAAG
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TTTTCCAGCTTTAAAGATACATTCCTTTTTTTGACTATGCTTTAATTGTTTTTAATGATT
TTAAGCTCTGTTTTTTATGTTCTGGTTTCATTATTAAGTTGCTACAGACTTTTTAATAAA
CTAAATAGCTCAATAATGTCAAGCAAAATGGTCTTTTTTGATAAAAATCCTGTTGGAAGA
ATTATGAATAGACTCTCTGATGATATGAATTCTATTGATGATGATCTTCCTTTAAATATT
GAAGTCACATTAGAACTTATGACTTATGCTATAGGATATCCTGTTGGCATTTCAATTTAG
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ATGTACAGAATGGCTAATAGAGAAATTAAAAGATTAAATTCTTTAAATAAAGGATAACTG
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CTTTATATGAGTTAGTTATATGTCGAAAGATTAAAAAACAATGTTAATACATTTTTACTA
TCATTATCACTATAATAATGGATGATTGTAAGGTTGCTTTTAATTTCAAATATAATTCAG
CTTTTGGTTGTAATAACAGCTATTATGATCATTACAATTGAATTTTCTGTAGATATTAAT
GTTATCGTTTTATGCTTATCATATGGAATCTTATTTAGTGGATCGATATGTGATGTCATG
TACTTTATATGCTTAACTGAGTAAGAGTTAATCAGTGTTGAGAGAGTAAGACAGTACTTT
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GAATAGACCTTAAGTCCTTCTGATATTAATCAGAATTTCTCTATAATCTTCAAAGATTTG
TCTATTACATACGATGAACTGAACGAGCATAATACTGATCATGTACAATATGCTCTCAAA
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GGTAAAACCTCTATCCTTAATTGTTTGTTTAGATTATATGATTACCAAAAAGGGTAAATC
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ATCATTCCTTAGTTTGGCTTTTTATACAATGCCACTCTTAGAGATAATATAGATCCTGTA
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TTATCAAATGGATAAAAGTAAATAATTAATTTTATTAGAGTGGCTTTGAGGTAGACAGAA
ATAATTTGCTTGGATGAAGCCACTTCTAATATGGATCCAAAAACAGACGAATTAATTCAT
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AACTATGATTAACTAAGATAAATAGAAGGAGGATTTTTTAATAGATTAATCACATAAAAA
TGA>TTHERM_00320020(gene)
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TATCAATGGATGAATTACAGATGGTAGGCTTTGTGTAAAACTACACTCTAATATATCATT
TATAAAAAATCCTTAAAAGTTAAGAATTATTCAAAATAGAATAATAGTGTTGAGCCAAAA
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GCTATCATTTATTATAAAATCGGTAAGTCGATTGTAAATGGACTTTATTTAATGGCAGGA
GCAATGGCAGTAAGTTTTCTTTCTGGATTTTTCATGAATGTAATTTTTTTTATTTTATAT
TAACCATTCAATTAATTGTTTGAAATAAAAAATAAATTAATATTTATTTAAAAAGATCTT
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AGGGATGAAGAGTATAAAATACTTAGGATGGGAAAATATATTTTCTAATAAAATCAAAGA
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AGCTTTTCCAATTGGAATGATACCCTTTTCTCTTAAGTGCATGACAAAAGCAAGAATTTC
TTTCTTTAGAATCAAAAGCTTCTTAAACATTGATGAAATTGATGAATCTCAAAGTAATAT
TTTTATTTAGTTAATTTTTAATAACTTTAATAAATAGTTATTTAGACAAGTGAAAATCAA
TCCTAAGTAGCTGTTCAAATTCAAAATTAATATTTCTCTTGGCCTAACAAAGAATTAAAT
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TTTGAAGACTAAGAAAATAGCGTTTCTAAAAATAGCTCAGAATTTAATTTGTTTATTGAT
AACATTTAAATCTAAAAAAATTCTCTGAATTTTGTAATCGGAAAAGTTGGTAATCAATCA
ATAATTTTTTGAAGATAAATAATATTATTTACTTACCTAATTTATGCTTTATATTTAGTT
TTAATGATAATATTTTATCTAAAAATAAAAGGATGTGGAAAAACATTATTTTTACTCTCA
ATCATGAATGAGATGGAAAAAAGGTCTTAAAATTTTGACCAATCTATTATTAAAGATGAC
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AATGTGGCATATGTCAGTTAGAATCATTGGCTTTAATCAAAAACAATCAAAGAAAATATA
CTTTTAGGAAAAAAATATGATCAAGACCTTTATTTGAAATGTCTTGAAATAAGCTAGCTA
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