Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00327330

Standard Name

TIC1 (Transmembrane Ion Channel 1)

Aliases

PreTt30236 | 33.m00248 | 3705.m00076

Description

TIC1 cation channel family transporter; Voltage-dependent calcium channel alpha-1 subunit

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
2240 TIC1 Tetrahymena thermophile TIT1 is homologous with proteins from a cation channel family. It contains one domain: the ion transport protein (Evalue: 1x10⁻⁸) whose function is to selectively transport ions through the membrane. It is possible that this protein is an integral membrane protein that has a critical function in facilitating ion transport. Transmembrane Ion Channel Family proteins that are found in eukaryotes tend to have up to four additional transmembrane helices. These additional helices help explain the physical properties of the protein. We have determined that TIT1 has a sequence that consists of 604 amino acids, a relatively lengthy sequence. Paragraph by: Kristiana Kim and Will Su(undergraduates), Keck Science Department, Scripps College, Claremont McKenna College

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00327330(coding)
ATGGCAGATCTATTAAAATAAATAGAATAAGTATACCCTGAGCTGAATGTTCCAAATAAA
ATAAAGAACGCCTCAGTTAAAAAGTTTCTTGTCAGATTCAATGAAGCGTTTAATGTCGCA
ATAATTTTAACCTTATTTTTCACATTTATGGCACTGCCAGATGGATCATAAACTGAAAGG
TTTATTTTTAGAAGCATAAATGAAATATCCTCAATATTAATTTCTATAATGAGCATACTA
AATTTAATTCATTTGAAACACTTATACTTCGACTCTAAATACTATGGTGCTCCATTTGTT
TTGATTGACTTTTTATCAGGAGTATTTTGCATATTTTTAGACATCATTTCCCTTATCGTT
GGAAAAAATATGTTGGGTATTTATTATGCAGATGGATTTAGAATGCTAAAATTGTTTACA
TTCGAAAAATTAAGAATTATTATTAAGGATATTTTCTACGTGATGCCAAAAGCTAAAAAG
GTTTTCTTTTCTATGGTTTTCGTATTTTTCGTATTTTCATTGATTGGGTTCAAGCTCTTT
CATCATGTTAATGCTGAATAATTTAGAAATTTGTTTGTCTCTTTGCTATCAATGTTTTAA
GTTTTAACTTTCGATTCATGGAATGTACAAATGAATATTCCTATCATTAATAAATGGGGA
GGTCATTGGAGCATCTTCTTTATAATTGCTATCTTCCTACTCTAATTCTTCTATTTTAAC
TTCTTCTTAAGTGAATTCGTTACCTACTACAGCAATCGTAACTACAGAGTCAATTTTGTC
TATAAATATAATTAAGATGAAATTCACAACCATAAGTTAAAGGAATGGAGTAAAAGATAT
TTGAGTGTAAATGAAGTTTTAAAAGTGTTGAAAATAGAAAAGTCTGAAAAAGATTTAAGT
CTCATAGATTTTATTTTAGCTAACTACAAATATTTATATATTTTTGCAATCTTGTTTATT
GAGCTACTTAGAGTCTTTTTTAATCCACTTTTATTTGTTTATATTTTGGAAGTTATTGTT
GGATTACTTGCTATAATTGAATTCTCTTTAATCTTAAAGGAAAAAAAATCTATAAATGGT
GATAAAAGCACTTTATAATAAATTTGTCAAAGCTCAAAATTAGTATTCTTGTTTTTAGCT
GGGTTTGTTGGTTTTGCAGTAGACTTAATTTCTATGATCTATGGAAATTATACATTGAAT
TATGGATCCTGTTTCAGAATCTTAGTTTTACTAACAACATATGAATGCTAATTCTCATTT
ATCAAGCTATCTTAAGTCTTTTCAAAAATCGGAGAGATGGGATTTGTTAATTTAGCTATA
ATGTACACTTTGGCTATTATTGGATATTACTGCTTATACAGATTCGATGTAACTTTTGGA
TTTTATTTTGAAGATGTGACAAACACTTACATGTATTTACTTCAAACAATTACTTTTGAT
GCTTGGGGAGATATTGCCAGAGCAGCTATGTTAATGAATCCTGTTTATGCGATTTATTTT
GCTTTCATGATTATTTTTATGGGATTTTTGCTTTAAAATTTCATGGTTGGTACAATAGCT
ACTACTGTTTAGCCTGCTTGCGAAGATGAATTCAATCAATCAAGAGTTTTATAGAGAAAA
ATATCATAATACTAAGTTAACATTTTGAGAGAAAGTCTTGGAAATTCATAATAATTCAAT
TAAAATTCATAAAATTTGAAAAAAGATTAAGAATCTACAGAAAATTTGAAGAAATTAAAA
GAGATAATAGAAGAGTTTAACAAAGGCCAAGGTAATTTAACAGTTACTTTTGAAGGTAAA
AGCTACGACCTCAAGTCTAAAAATATAATTAGCCTATAAAATTGA


>TTHERM_00327330(gene)
AGTATTGTGATTAAAATTATTCATAATAGTTGAATTAAAAGATCTTTAAATCTAATAAAT
AATTTAAATAGATAACAAATATTTTTACAAATTTAGAGCTTTTTAAATTAGAATTAAGTT
AAAAAAGATAGTAATTGAAAGATATTTCTTCAAAATGGCAGATCTATTAAAATAAATAGA
ATAAGTATACCCTGAGCTGAATGTTCCAAATAAAATAAAGAACGCCTCAGTTAAAAAGTT
TCTTGTCAGATTCAATGAAGCGTTTAATGTCGCAATAATTTTAACCTTATTTTTCACATT
TATGGCACTGCCAGATGGATCATAAACTGAAAGGTTTATTTTTAGAAGCATAAATGAAAT
ATCCTCAATATTAATTTCTATAATGAGCATACTAAATTTAATTCATTTGAAACACTTATA
CTTCGACTCTAAATACTATGGTGCTCCATTTGTTTTGATTGACTTTTTATCAGGAGTATT
TTGCATATTTTTAGACATCATTTCCCTTATCGTTGGAAAAAATATGTTGGGTATTTATTA
TGCAGATGGATTTAGAATGCTAAAATTGTTTACATTCGAAAAATTAAGAATTATTATTAA
GGATATTTTCTACGTGATGCCAAAAGCTAAAAAGGTTTTCTTTTCTATGGTTTTCGTATT
TTTCGTATTTTCATTGATTGGGTTCAAGCTCTTTCATCATGTTAATGCTGAATAATTTAG
AAATTTGTTTGTCTCTTTGCTATCAATGTTTTAAGTTTTAACTTTCGATTCATGGAATGT
ACAAATGAATATTCCTATCATTAATAAATGGGGAGGTCATTGGAGCATCTTCTTTATAAT
TGCTATCTTCCTACTCTAATTCTTCTATTTTAACTTCTTCTTAAGTGAATTCGTTACCTA
CTACAGCAATCGTAACTACAGAGTCAATTTTGTCTATAAATATAATTAAGATGAAATTCA
CAACCATAAGTTAAAGGAATGGAGTAAAAGATATTTGAGTGTAAATGAAGTTTTAAAAGT
GTTGAAAATAGAAAAGTCTGAAAAAGATTTAAGTCTCATAGATTTTATTTTAGCTAACTA
CAAATATTTATATATTTTTGCAATCTTGTTTATTGAGCTACTTAGAGTCTTTTTTAATCC
ACTTTTATTTGTTTATATTTTGGAAGTTATTGTTGGATTACTTGCTATAATTGAATTCTC
TTTAATCTTAAAGGAAAAAAAATCTATAAATGGTGATAAAAGCACTTTATAATAAATTTG
TCAAAGCTCAAAATTAGTATTCTTGTTTTTAGCTGGGTTTGTTGGTTTTGCAGTAGACTT
AATTTCTATGATCTATGGAAATTATACATTGAATTATGGATCCTGTTTCAGAATCTTAGT
TTTACTAACAACATATGAATGCTAATTCTCATTTATCAAGCTATCTTAAGTCTTTTCAAA
AATCGGAGAGATGGGATTTGTTAATTTAGCTATAATGTACACTTTGGCTATTATTGGATA
TTACTGCTTATACAGATTCGATGTAACTTTTGGATTTTATTTTGAAGATGTGACAAACAC
TTACATGTATTTACTTCAAACAATTACTTTTGATGCTTGGGGAGATATTGCCAGAGCAGC
TATGTTAATGAATCCTGTTTATGCGATTTATTTTGCTTTCATGATTATTTTTATGGGATT
TTTGCTTTAAAATTTCATGGTTGGTACAATAGCTACTACTGTTTAGCCTGCTTGCGAAGA
TGAATTCAATCAATCAAGAGTTTTATAGAGAAAAATATCATAATACTAAGTTAACATTTT
GAGAGAAAGTCTTGGAAATTCATAATAATTCAATTAAAATTCATAAAATTTGAAAAAAGA
TTAAGAATCTACAGAAAATTTGAAGAAATTAAAAGAGATAATAGAAGAGTTTAACAAAGG
CCAAGGTAATTTAACAGTTACTTTTGAAGGTAAAAGCTACGACCTCAAGTCTAAAAATAT
AATTAGCCTATAAAATTGAGAAAAATTTCAATTTATAAATAACTAAAAGTTTATAAAAAT
AATCTAAATAAATTTAGCTTTTATTTAGATAGATTTTAGGAAATTAGAAAAAAATTAATA
AAAATAAATATTTTGAATTTTAATAAAAAAATGAAGTAAATTCATATTTTATTTATTATT
AAAAATTATTTTTTTCTTATTTTATTTTATAAATTATTACCTATCTATTCTATCTTTCT


>TTHERM_00327330(protein)
MADLLKQIEQVYPELNVPNKIKNASVKKFLVRFNEAFNVAIILTLFFTFMALPDGSQTER
FIFRSINEISSILISIMSILNLIHLKHLYFDSKYYGAPFVLIDFLSGVFCIFLDIISLIV
GKNMLGIYYADGFRMLKLFTFEKLRIIIKDIFYVMPKAKKVFFSMVFVFFVFSLIGFKLF
HHVNAEQFRNLFVSLLSMFQVLTFDSWNVQMNIPIINKWGGHWSIFFIIAIFLLQFFYFN
FFLSEFVTYYSNRNYRVNFVYKYNQDEIHNHKLKEWSKRYLSVNEVLKVLKIEKSEKDLS
LIDFILANYKYLYIFAILFIELLRVFFNPLLFVYILEVIVGLLAIIEFSLILKEKKSING
DKSTLQQICQSSKLVFLFLAGFVGFAVDLISMIYGNYTLNYGSCFRILVLLTTYECQFSF
IKLSQVFSKIGEMGFVNLAIMYTLAIIGYYCLYRFDVTFGFYFEDVTNTYMYLLQTITFD
AWGDIARAAMLMNPVYAIYFAFMIIFMGFLLQNFMVGTIATTVQPACEDEFNQSRVLQRK
ISQYQVNILRESLGNSQQFNQNSQNLKKDQESTENLKKLKEIIEEFNKGQGNLTVTFEGK
SYDLKSKNIISLQN