Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00327340

Standard Name

CDC16 (Cell Division Cycle 16)

Aliases

PreTt30237 | 33.m00249 | 3705.m00077

Description

CDC16 tetratricopeptide repeat protein; TPR domain containing protein; subunit of anaphase promoting complex

Genome Browser (Macronucleus)



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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00515 ) Tetratricopeptide repeat
  • ( PF01239 ) Protein prenyltransferase alpha subunit repeat
  • ( PF07719 ) Tetratricopeptide repeat
  • ( PF07720 ) Tetratricopeptide repeat
  • ( PF07721 ) Tetratricopeptide repeat
  • ( PF08238 ) Sel1 repeat
  • ( TIGR00213 ) D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase
  • ( TIGR00990 ) mitochondrial precursor proteins import receptor
  • ( TIGR02521 ) type IV pilus biogenesis/stability protein
  • ( TIGR02552 ) type III secretion low calcium

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_08574.1 9.997093137033517e-262
Description: TPR Domain containing protein (867 aa)
Oxytricha Contig17304.0.g24 6.99920276797163e-121
Description: TPR repeat
SGD YKL022C 6.998316056150599e-49
Description: CDC16 Subunit of the anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C), which is a ubiquitin-protein ligase required for degradation of anaphase inhibitors, including mitotic cyclins, during the metaphase/anaphase transition; required for sporulation
DictyBase DDB_G0286233 3.000555717977434e-27
Description: anapc6 on chromosome: 4 position 4222260 to 4225138
WormBase WBGene00001281 1.9994498063102785e-22
Description: locus:emb-27 status:Confirmed UniProt:G5EG38 protein_id:CAA88313.1
WormBase WBGene00012342 1.9994498063102785e-22
Description: locus:mtr-4 mRNA transport homolog 4 status:Confirmed UniProt:Q23223 protein_id:CAA94235.1
Stentor Coeruleus SteCoe_10424 0.00000001522997974471263
Description: None

General Information

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Associated Literature

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Sequences

>TTHERM_00327340(coding)
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>TTHERM_00327340(gene)
ATGTCATAATCTAGCGGATAGAAACCAACAAGCATAGGATTATAGCAAGGTTAGCAGTAG
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GCAATTAAAATTGATCCATTATATTTTGACATAATACCTGTATATTGCGCTTGTTTACTT
CATCTCAACTATCTGGGTGAATTGTACTACTGTGCCCACAATCTAGTAGAAAATTACTCA
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ATTAATTTTCTCAAAATTAATTAAACCTTTGGAATTCGATCAAATTTAGTATTTTAATAA
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GAAAATATCTTATTTTTTCTTTTAAATTAAAGGTGTAATCTATTTTAAGTAGAAAGCCTA
TGAAGAAGCAAAGCAAAAGTACTTGCAAGCTATGAATTTGTGTACTGAAGCAACTAATTC
GATAGTTCATACCATTTTAAACAATCTGGCTCATACCTGTAGAAAAATGAAAGATTATAA
ATCTGCTATTTAATATTATGAAAGATGCATTCAGTTAGAGCCTAAAAATTATCAAACATA
TTTTTCTTTGGCATACACTTATCATATATCAAACCAATTGAATAAAGCTATAGCTTATTA
TCATAAATCTTTATATTACAAGCATGAAAACCAATTTGCTTTTGACATGCTTGATAGATG
CCTTAAAGATGCTTCAGAGTATCCTTGGGAAAGTGTATACGAAGCTAAAAATGAATGA


>TTHERM_00327340(protein)
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