Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00339610

Standard Name

RPN1 (26S proteasome regulatory subunit N1)

Aliases

PreTt06102 | 34.m00339 | 3689.m00133

Description

RPN1 26S proteasome regulatory subunit; Proteasome/cyclosome repeat family protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Domains

  • ( PF01851 ) Proteasome/cyclosome repeat
  • ( TIGR01752 ) flavodoxin
  • ( TIGR03338 ) phosphonate utilization associated transcriptional regulator

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_14790 0
Description: None
Tetrahymena borealis EI9_15097.1 9.997093137033517e-262
Description: proteasome/cyclosome repeat family protein (883 aa)
DictyBase DDB_G0293752 9.997093137033517e-262
Description: psmD2 on chromosome: 6 position 3279468 to 3282352
Oxytricha Contig7554.0.g32 9.997093137033517e-262
Description: Proteasome/cyclosome repeat
WormBase WBGene00004458 9.998707956568768e-117
Description: locus:rpn-1 status:Confirmed UniProt:Q9GZH5 protein_id:CCD62025.1
Tetrahymena borealis EI9_17927.1 9.998707956568768e-117
Description: hypothetical protein (209 aa)
SGD YHR027C 5.0021648428951944e-116
Description: RPN1 Non-ATPase base subunit of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome; may participate in the recognition of several ligands of the proteasome; contains a leucine-rich repeat (LRR) domain, a site for protein-protein interactions

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:21637855: Xiong J, Yuan D, Fillingham JS, Garg J, Lu X, Chang Y, Liu Y, Fu C, Pearlman RE, Miao W (2011) Gene network landscape of the ciliate Tetrahymena thermophila. PloS one 6(5):e20124

Sequences

>TTHERM_00339610(coding)
ATGTCTGACAAAAACAAAATGGAGGAAGAAAAGCCTGTTGCTGAGTAACCTAAGAAAAAC
AATAAAAAGGATAAGAAAGAAAAGGAAGACGAACTCAGTGAGGAAGATAAAAAGTTGAAG
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GAAAATAAAGCTATAGATATCAGAGTTGGACAAGCTGTAGATGTTGTTGGTCAAGCTGGT
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ATTATCATAGTATAGAAAAATCCCGATTATGTTCCTGAAGAAGAAAGTAAAAATAAAAGA
AAGCAATGA


>TTHERM_00339610(gene)
ATGTCTGACAAAAACAAAATGGAGGAAGAAAAGCCTGTTGCTGAGTAACCTAAGAAAAAC
AATAAAAAGGATAAGAAAGAAAAGGAAGACGAACTCGTAAAACAAATTTCACAATTAAAT
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ATATTGTGTAGATTAAAATGAAATGGAAGAAACCTTAAAAGTTAATTATGAAATAGCATT
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AATTAAAGAAGTTTTCTAAAGTTGTAAAGATAAATTAATTTTAAAATAACTCTGCTACCT
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GAAAACCGGTATTGCTGCTGCTACTTCTTCAATCGGTTTGATTGATATGTGGGATATTGA
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TTGATTTGAATAAAAAAACATATTTTATCACATTTAATGATAAGTTGGATTTTAACATTA
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CTTGCTTTGATAAGTTCAAGTGAAGGTATTGGTAATGAAATGGCTCACCGCTCATTAAAT
CATATTTTATAATACTGTGAATTACCTGTTAAAAGAGCAGTTCCATTAGCTCTCGCAATT
TTAAATATTTCAAATCCTAAAATTAATGTTATGGATCTCTTATTAAAATTCAGTCATGAT
GATGACTAAGAACTCAGCTAGAGAGCCATCTTCTCTATGGGTTTAGTAGGTGCTGGTACC
AATAATTCAAGATTAGCTGATATTTTGAGAAATTTATCATCAACTTATAAGTAAGACAGT
AGCAATAAATTCTTTATCAGAATTGCTTAAGGTCTTGTTTAGATGGGAAAAGTAATTAAT
ATCTAAAAATTTTGCAATTAATGTATTAAAAATTAATTAATTAATCAATTAGGGTATGGT
AACATTGTAACCTTACTATTCTGACAAATTCTTGTTGAACAAGGTCGGATTATCTGGCAT
AATTACAGTAATTCACTCTTTAATGGATACTAAATCTGTTTTCGGTGATTAACATTACAC
CATGCTTTATCTAGGATTAGCTGCCTATCCTCGTATGCTCTTTACAGTAAAATATTTATT
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GAAAATGGTGAAAATAAAGCTATAGATATCAGAGTTGGACAAGCTGTAGATGTTGTTGGT
CAAGCTGGTAAGCCTAAGAAAATTACTGGTTTCTAAACTCATCAATCACCTGTCCTTATC
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AAAATATTATCATAGTATAGAAAAATCCCGATTATGTTCCTGAAGAAGAAAGTAAAAATA
AAAGAAAGCAATGA


>TTHERM_00339610(protein)
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NYEIALSLQLYVSALRLAIKLDDIEKIKEVFQSCKDKLILKQLCYLIARQRIVLSELDLD
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FVNMGCKKDTLMVVPKTEKPWIYNLKKTGIAAATSSIGLIDMWDIESGTEHINEYLNLSD
GYGKQGALIGIGLFSSGIVDENLTAKALLESELSSKDELCKLGAIIGLGMAYAGSANEDL
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ERAELGSDEYIPLQATVLENIIIVQKNPDYVPEEESKNKRKQ