Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00339610

Standard Name

RPN1 (26S proteasome regulatory subunit N1)

Aliases

PreTt06102 | 34.m00339 | 3689.m00133

Description

RPN1 26S proteasome regulatory subunit; Proteasome/cyclosome repeat family protein

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• proteasome regulatory particle (ISS) | GO:0005838

Domains

• ( PF01851 ) Proteasome/cyclosome repeat
• ( TIGR01752 ) flavodoxin
• ( TIGR03338 ) phosphonate utilization associated transcriptional regulator

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Stentor Coeruleus	SteCoe_14790	0
	Description: None
Tetrahymena borealis	EI9_15097.1	9.997093137033517e-262
	Description: proteasome/cyclosome repeat family protein (883 aa)
DictyBase	DDB_G0293752	9.997093137033517e-262
	Description: psmD2 on chromosome: 6 position 3279468 to 3282352
Oxytricha	Contig7554.0.g32	9.997093137033517e-262
	Description: Proteasome/cyclosome repeat
WormBase	WBGene00004458	9.998707956568768e-117
	Description: locus:rpn-1 status:Confirmed UniProt:Q9GZH5 protein_id:CCD62025.1
Tetrahymena borealis	EI9_17927.1	9.998707956568768e-117
	Description: hypothetical protein (209 aa)
SGD	YHR027C	5.0021648428951944e-116
	Description: RPN1 Non-ATPase base subunit of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome; may participate in the recognition of several ligands of the proteasome; contains a leucine-rich repeat (LRR) domain, a site for protein-protein interactions

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:21637855: Xiong J, Yuan D, Fillingham JS, Garg J, Lu X, Chang Y, Liu Y, Fu C, Pearlman RE, Miao W (2011) Gene network landscape of the ciliate Tetrahymena thermophila. PloS one 6(5):e20124

Sequences

>TTHERM_00339610(coding)
ATGTCTGACAAAAACAAAATGGAGGAAGAAAAGCCTGTTGCTGAGTAACCTAAGAAAAAC
AATAAAAAGGATAAGAAAGAAAAGGAAGACGAACTCAGTGAGGAAGATAAAAAGTTGAAG
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GAAAGAGCTGAGTTAGGAAGCGACGAATATATTCCTTTATAAGCAACTGTTCTTGAAAAT
ATTATCATAGTATAGAAAAATCCCGATTATGTTCCTGAAGAAGAAAGTAAAAATAAAAGA
AAGCAATGA

>TTHERM_00339610(gene)
ATGTCTGACAAAAACAAAATGGAGGAAGAAAAGCCTGTTGCTGAGTAACCTAAGAAAAAC
AATAAAAAGGATAAGAAAGAAAAGGAAGACGAACTCGTAAAACAAATTTCACAATTAAAT
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AATATTGCATAATCAATTTGTAGCAAAATGCAAGCTAGGTTAATGAGTATTGATAAAAGG
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TGATTCTTTAAATGCCAATATTGCAGATACTTACGTAAATGCTTTTGTCAATATGGGTTG
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GAAAACCGGTATTGCTGCTGCTACTTCTTCAATCGGTTTGATTGATATGTGGGATATTGA
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GAAAAATATCTTGATACTCATTTAGCTAGATATTTCGCTGTTGCTATGGGTCTTCTCTTC
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ATTGAAGGTTGTGCTTACGCTGGTAGTGGCAATGTCTTAAAAGTATAAAAAATGTTACAT
CACTGCACTTAGAAGGTAGAAGAAGACAAGGTATTTATTAGTTAAATAAACTATTGAGTT
TAAATTAAAATATTATCATATTTATAAAAGTCTGCTTTCTAATAAGCTGCAATTGTTTCT
CTTGCTTTGATAAGTTCAAGTGAAGGTATTGGTAATGAAATGGCTCACCGCTCATTAAAT
CATATTTTATAATACTGTGAATTACCTGTTAAAAGAGCAGTTCCATTAGCTCTCGCAATT
TTAAATATTTCAAATCCTAAAATTAATGTTATGGATCTCTTATTAAAATTCAGTCATGAT
GATGACTAAGAACTCAGCTAGAGAGCCATCTTCTCTATGGGTTTAGTAGGTGCTGGTACC
AATAATTCAAGATTAGCTGATATTTTGAGAAATTTATCATCAACTTATAAGTAAGACAGT
AGCAATAAATTCTTTATCAGAATTGCTTAAGGTCTTGTTTAGATGGGAAAAGTAATTAAT
ATCTAAAAATTTTGCAATTAATGTATTAAAAATTAATTAATTAATCAATTAGGGTATGGT
AACATTGTAACCTTACTATTCTGACAAATTCTTGTTGAACAAGGTCGGATTATCTGGCAT
AATTACAGTAATTCACTCTTTAATGGATACTAAATCTGTTTTCGGTGATTAACATTACAC
CATGCTTTATCTAGGATTAGCTGCCTATCCTCGTATGCTCTTTACAGTAAAATATTTATT
CAATATTGAAATAGCAGTTTTAAAGTATTAATTATATTTTCATTAATAAAATAGGTTGAT
GAAAATGGTGAAAATAAAGCTATAGATATCAGAGTTGGACAAGCTGTAGATGTTGTTGGT
CAAGCTGGTAAGCCTAAGAAAATTACTGGTTTCTAAACTCATCAATCACCTGTCCTTATC
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AAATAAATAGAGCTGAGTTAGGAAGCGACGAATATATTCCTTTATAAGCAACTGTTCTTG
AAAATATTATCATAGTATAGAAAAATCCCGATTATGTTCCTGAAGAAGAAAGTAAAAATA
AAAGAAAGCAATGA

>TTHERM_00339610(protein)
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