Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00353420

Standard Name

Aliases

PreTt05356 | 36.m00320 | 3703.m00179 | THK1

Description

hypothetical protein

Genome Browser (Macronucleus)

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Domains

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

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Homologs

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General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
2328 (no standard gene name) Tetrahymena thermophila’s THK1 protein is homologous with protein kinases. It has three domains: Protein kinase domain (E-value = 2.7E-54), Flagellin hook IN motif (E-value = 6.7E-13), and Tyrosine kinase (E-value = 1.30E-93). The first and third domains contain the catalytic function of protein kinases, which phosphorylate proteins. The second domain does not yet have a determined function, but it is located in many flagellar hook proteins. The closest homologs are in Paramecium tetraurelia strain d4-2, a freshwater protest, Ichthyophthirius multifiliis, a freshwater spot disease, and Vitrella brassicaformis CCMP3155. It is possible this protein functions as a tyrosine kinase . Paragraph by Lynnlee Duck-Reynolds and Ann Ly (undergraduates), Keck Science Center, Scripps College.

Associated Literature

  1. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,

Sequences 

>TTHERM_00353420(coding)
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AATAAAATAGAATAAAATTTTGTTGCTAATGAAGATCTGTAAAAAAACTCAAATCTCCAA
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>TTHERM_00353420(gene)
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TTTTTGAAAATAATAAAACACCTAAAGTTGTCAAAAATTCTAGAGGTAAAATAAGAACTC
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TTTCAAAGTGCTTTACTTGGAAAAATCACGAAAGAATGTCGCCTGCTGAAGCCCTCGTTC
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AACCTTAAAATAATGAAAATACAAGTGGAGTTGGATAAGGGAGAAATAGCTTTAAAAAGG
CTGAAATGAATAACTCAAGCAGCTTTGGACCTTCAGTGGTAAGCGTAAATACTGGCCTTT
AAGAGAGAAATAAAAATATAATTAATTCGCAGTCTCATCAAATATAAGATGTAAAGATAA
ATCCATAATCTTAAGCGAGTAATCCTTCTTCATCTTCTTGCTAAAATGCGATAAATAAAT
ATGGATAAAAATAAAATAATGCAAAAAATTATGTTTTTAAAAATTAAAATCCACTAAATA
GTGTTACAAATAATTAACCTCTATCTCAATCTAAGATCGAATAAGCTGAAAACCCTTCTT
CAAATAATCTTTCATAAATTCCATTAAATTAAGGAATATCTTTATAAAATAATAAAAAGA
AGACAGACATGATACACTTAAGTGATTTTAATCCATATGAATCTGATCAATTTTCAAATA
CATTTTCTGCAGCGACAACAACAAATGCCAAAAAAACTTAACAATAATTTGGATTTGTGC
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CTTCCAAAAAAAATAAAATAGAATAAAATTTTGTTGCTAATGAAGATCTGTAAAAAAACT
CAAATCTCCAAATACAAAGTGGGGAAAATTGAAAAACGCATTCTAAATATCGTGATAATT
GTAATATTTTTTACGAATTTAAAGAATGAAACATATTTAAGCTGTAATTAATTATCTCTG
TGCTTTAAATTTTGTTGGTCGAGTAAGAAAATTAAATTTTTTTCTTAAATTAAAAAAGAA
AAAAAGCATGAAAAATATCTATTAATAAAGTCTTTAAAAAAATAAATTAACTATCTATTT
ATATTTAAAAAAACAAAATCTTAATCCTTAAAAATAAAAAAACTCTTGTATTATTTTTTG
TAATTATATTTACTTAAGTGTAGATCTTTCCTTTAATTCTAATTAATTAATAAATTAGCA




>TTHERM_00353420(protein)
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KRIEYQRDSKQSIKQPKLTLNTSSHNNTCNLSNNQSFAQSTKHYQGNSSIHISGEKTLTQ
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IRRSKYKINTETINTQNDYSLTIDHSGGSIPRYPQTETHKTGTKEIIIPQSNKIEQISNR
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