Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00370870

Standard Name

VPS16A (vacuolar protein sorting 16A)

Aliases

PreTt28603 | 39.m00176 | 3693.m00023

Description

corvet complex core vacuolar protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

No Genome Browser Data Present

External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF04840 ) Vps16, C-terminal region
• ( PF04841 ) Vps16, N-terminal region
• ( PF09285 ) Elongation factor P, C-terminal

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_14865.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (973 aa)
DictyBase	DDB_G0270754	8.00089003463867e-30
	Description: vps16 on chromosome: 1 position 4423807 to 4426401
Stentor Coeruleus	SteCoe_18913	8.533047625744066e-17
	Description: None
Oxytricha	Contig9251.0.g55	0.000000000040005666873964816
	Description: Vps16, N-terminal region
SGD	YPL045W	0.00000019998969434520019
	Description: VPS16 Subunit of the vacuole fusion and protein sorting HOPS complex and the CORVET tethering complex; part of the Class C Vps complex essential for membrane docking and fusion at Golgi-to-endosome and endosome-to-vacuole protein transport stages

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:

Sequences

>TTHERM_00370870(coding)
ATGGAAGATTCATTAATTTTACAAGAATTTAAGAGCTTAGATGATGAAAAGTATGAATTT
AGTATATACTGCGATTTAGTATAAAGATTGAAATTTGATCTTTAGTAAAAGAAGGTTGCC
ATAGCAAGATTTGGTGGGCCTATAGCAATTTGTAGAGATATTGTTTAGACTTAGTTTTTT
GAAAATAATGACATGTTTAAAGAAGATATCTGGTTTTATTCAAATGAAGGACTTATCTTA
AATAAAATTAAGTTCCCTTATAATTAGAGAATAGTAGGATTTGATTTTATATACGAAGAA
CTTCTAGTAGTTGTTTTAGAAAATGGATTTTATTATCTTATTAATCCATTTGAATTCGAT
TAATATGAAAGCAAAAGAATTGAAGAAAAAAGATTTAACAAACCAGATGAAGATTTAATT
GTAGAAGCCAAAATTTTAAAGAATGGATTGGGATTTTTCACTAAAAGTAATAGATTTTAC
ATTATGAATAATCTAGTTGAGGGAAAATTAATTGATTTTGGAAATCCTGGTATTAGCAGT
GAAATTTCATGCTGGAATTTAATTCCTTAAGGTGATTCTTTTGATGAGAATGATGTTAAA
TTCAATTTATATGTTGCTAATTCTGCTGGAAATGGAGGTGGAGTTTTGTGCATTTCGGAA
AGTTTTAAAGACCCAATTAAATTATATAATGGTTAAGAAAAGCATCTTGGGCTTGATTAA
GACACTGTCATTAACTTAAAAAATATAAAAGCAATAGCTTCAGACTGTAAAGGTTTGCAT
ACAGCATATTTAACTTAGGAATTTTCTTAAAATAAAGAAACGTGGATTGTTCATTTAATC
TGCGAAGATGATTATAAGCAAATTGTTGTTAGCGATTTAGGAATATACTATTAAGAGGAA
GTAGAAAAAGTTAAAAGTTAAATCCAATATTATAATAAATCAAATATTACTAATCCTTAA
ACACCGCTTTCAGGTAATTAAATGAGCAACTCTTAAAGATAAAAGCTTTACAATACTCCA
AGGGTGAACATTAATATGTACTGGATAGAAAATAAGGCAGTTGTTATATAAATAAGAAAT
GCATTATTTTTAGTTGGCAGTGAAACTTCAACAAAAGTTGAATTTAACAATGATTTTGAA
TCTAAAATTCCTTCTTTTGTATGTGTTTAGGAATTAGATGGGGTAAAAATTCTAGCAGAA
AATAGAATTTACATGCTTAGAAACACTCCTTAAGAATACCTTAATATTTTTGATACTACT
GGGTCTTATTCTCCAGCATATTAACTGTATCAAAAATCGTAGATTAATGTTGAAAACTAG
AACTATGATTAAACTTAAGTAAATTCATAAGATGATATATTAAATAACTAGGTAGATTTA
GAGAAGGCTGTAAATGATTGTATTATTGCAGGGTAATACGAATTCAATATATATAGATAG
TAAAAACTTTTGAAGGCAGCTTCTCATGGAAGAATTTTATTATAAGGGTTCTTGTTGGGT
AATAAAGTAAATAATGTTGATAATGAAGATGAAGATGGCGAGAATTAATTAACAAAAGTG
TGCAAATTACTGAGAGTGGCATATTAGTTAAATTAGTATCAAAAGTACAAAAGATCGATT
ACTTACAAGTAAATGGAATATCTTTATGAAACAAGTGAAGTATTTTTGAAAATTTTATTG
AGATACAATTACCACTATATTGCTATTGAGATATCCAAATTTCTTAGATTAGATATAAAA
AAAGAAATTTACATACATTGGGCATGTTGTAAAATAGAAAAAAACGAAGATGATTCGAAG
ATCATAAACGATATAAAAAATTAATTTAAAGATTAAACAGATATCCCATTCAGCGATATT
ATACACAAAGCTCTTTAAGTAGGAAAATCTAAAATAGTCCTTGAATTACTCAATTTTGAA
CCTAGTATTCAGAAAAGAATACCAGTCCTCCTTTGTATGGCAAAGACTCAACCAAACTCA
AATGAAGAATATTTTTACAAGGCCCTTGTTGAAGCTTTACAAAGTAAAGACTCGAATCTT
ATATACTTAGTCATTAAAACTATTTGGGATAAGTTAGGCGAAAAGAGCTTCGATTACTTT
TCTAAGGAAGAAATTTTAAGTGCTCATTTCTAAATATTTTTAAAAACTTAGCTTGATACA
TAAAAATTATAACAACAATACGTCTTACTCTATAAGTTTTTGTTAAAGTAGAAATAATTT
ATAAAGGCAGGGTTCTCTCTCCTTGAATTTGCTATTAAATAAAATGACATCAATAAAAAA
TCAGAATTAATTAAACAAGTTAAAATAGAATTCTAAAAAGATTTAAGTGATAAATTTTAT
ACATTAGCTATCGATGATTAAATTAAATTTGTGAATTATCTTAATAGTTTGGATGAAAAA
AATATCAAAATAAGTATCTACCAACAACTAAAGCAACTCCTAGCTAAAAACTAGGACATA
GCTAGAGAAAAACTTCAAAGTGAAATAAAAATGCATCCGAAAGCTGTTAGTGTAAACTAA
TTAAAACTTCTCATCAATGAGCCTGTACCTAAAGAATAGGAAATAGAAAGAAAAGTAGAT
GAAATAAATAGAAAAACTGAAGTTATTCCCTATTCAATTATAATTGACCAACTCCTAAAA
AATAATTTAGAGCAAGTTGCTTTTAGGATAGCATTAAAAATAAGAGACTAAGAATCAAGA
GAACATCAATATGAAAGAATTATTAGATAAGCCTATTAAAAAGAGAAAGATGATTTACTT
GATAGTATGAGTTACTAAATTACAAGTCCTCATATTGTTGATTTGATTAATGAGCTTAGA
GAAAAGCTTAAGAGCTTAAAATAGATATCATCATAAAATTAATTTACTAATTAATCTTAA
TCAATTTATAACATGCGTTGA

>TTHERM_00370870(gene)
ATGGAAGATTCATTAATTTTACAAGAATTTAAGAGCTTAGATGATGAAAAGTATGAATTT
AGTATATACTGCGATTTAGTATAAAGATTGAAATTTGATCTTTAGTAAAAGAAGGTTGCC
ATAGCAAGATTTGGTGGGCCTATAGCAATTTGTAGAGATATTGTTTAGACTTAGTTTTTT
GAAAATAATGACATGTTTAAAGAAGATATCTGGTTTTATTCAAATGAAGGACTTATCTTA
AATAAAATTAAGTTCCCTTATAATTAGAGAATAGTAGGATTTGATTTTATATACGAAGAA
CTTCTAGTAGTTGTTTTAGAAAATGGATTTTATTATCTTATTAATCCATTTGAATTCGAT
TAATATGAAAGCAAAAGAATTGAAGAAAAAAGATTTAACAAACCAGATGAAGATTTAATT
GTAGAAGCCAAAGTAAATTCATAAATTTAAACATAAGATTTTAACTCTATTTTAATTTTT
CACAAAGATTTTAAAGAATGGATTGGGATTTTTCACTAAAAGTAATAGATTTTACATTAT
GAATAATCTAGTTGAGGGAAAATTAATTGATTTTGGAAATCCTGGTATTAGCAGTGAAAT
TTCATGCTGGAATTTAATTCCTTAAGGTGATTCTTTTGATGAGAATGATGTTAAATTCAA
TTTATATGTTGCTAATTCTGCTGGAAATGGAGGTGGAGTTTTGTGCATTTCGGAAAGTTT
TAAAGACCCAATTAAATTATATAATGGTTAAGAAAAGCATCTTGGGCTTGATTAAGACAC
TGTCATTAACTTAAAAAATATAAAAGCAATAGCTTCAGACTGTAAAGGTTTGCATACAGC
ATATTTAACTTAGGAATTTTCTTAAAATAAAGAAACGTGGATTGTTCATTTAATCTGCGA
AGATGATTATAAGCAAATTGTTGTTAGCGATTTAGGAATATACTATTAAGAGGAAGTAGA
AAAAGTTAAAAGTTAAATCCAATATTATAATAAATCAAATATTACTAATCCTTAAACACC
GCTTTCAGGTAATTAAATGAGCAACTCTTAAAGATAAAAGCTTTACAATACTCCAAGGGT
GAACATTAATATGTACTGGATAGAAAATAAGGCAGTTGTTATATAAATAAGAAATGCATT
ATTTTTAGTTGGCAGTGAAACTTCAACAAAAGTTGAATTTAACAATGATTTTGAATCTAA
AATTCCTTCTTTTGTATGTGTTTAGGAATTAGATGGGGTAAAAATTCTAGCAGAAAATAG
AATTTACATGCTTAGAAACACTCCTTAAGAATACCTTAATATTTTTGATACTACTGGGTC
TTATTCTCCAGTAATATTCATTAACGATTAAATATTAAGATCAAATTATATGATTTTATT
TATTTTTAAGGATGAATGGAAGTTTAAACTTCAAAATAAGTTTCTTTTTTTATTGAAATT
AATATTAAAAAAATTAGTTAAAATTTTATAATTTTATTTAAATAGGCATATTAACTGTAT
CAAAAATCGTAGATTAATGTTGAAAACTAGAACTATGATTAAACTTAAGTAAATTCATAA
GATGATATATTAAATAACTAGGTAGATTTAGAGAAGGCTGTAAATGATTGTATTATTGCA
GGGTAATACGAATTCAATATATATAGATAGTAAAAACTTTTGAAGGCAGCTTCTCATGGA
AGAATTTTATTATAAGGGTTCTTGTTGGGTAATAAAGTAAATAATGTTGATAATGAAGAT
GAAGATGGCGAGAATTAATTAACAAAAGTGTGCAAATTACTGAGAGTGGCATATTAGTTA
AATTAGTATCAAAAGTACAAAAGATCGATTACTTACAAGTAAATGGAATATCTTTATGAA
ACAAGTGAAGTATTTTTGAAAATTTTATTGAGATACAATTACCACTATATTGCTATTGAG
ATATCCAAATTTCTTAGATTAGATATAAAAAAAGAAATTTACATACATTGGGCATGTTGT
AAAATAGAAAAAAACGAAGATGATTCGAAGATCATAAACGATATAAAAAATTAATTTAAA
GATTAAACAGATATCCCATTCAGCGATATTATACACAAAGCTCTTTAAGTAGGAAAATCT
AAAATAGTCCTTGAATTACTCAATTTTGAACCTAGTATTCAGAAAAGAATACCAGTCCTC
CTTTGTATGGCAAAGACTCAAGTAAAAAAATTAATTTTATTTATTTAATTTTTTATTTTG
TTTTTTAAAATTAAAGCCAAACTCAAATGAAGAATATTTTTACAAGGCCCTTGTTGAAGC
TTTACAAAGTAAAGACTCGAATCTTATATACTTAGTCATTAAAACTATTTGGGATAAGTT
AGGCGAAAAGAGCTTCGATTACTTTTCTAAGGAAGAAATTTTAAGTGCTCATTTCTAAAT
ATTTTTAAAAACTTAGCTTGATACATAAAAATTATAACAACAATACGTCTTACTCTATAA
GTTTTTGTTAAAGTAGAAATAATTTATAAAGGCAGGGTTCTCTCTCCTTGAATTTGCTAT
TAAATAAAATGACATCAATAAAAAATCAGAATTAATTAAACAAGTTAAAATAGAATTCTA
AAAAGATTTAAGTGATAAATTTTATACATTAGCTATCGATGATTAAATTAAATTTGTGAA
TTATCTTAATAGTTTGGATGAAAAAAATATCAAAATAAGTATCTACCAACAACTAAAGCA
ACTCCTAGCTAAAAACTAGGACATAGCTAGAGAAAAACTTCAAAGTGAAATAAAAATGCA
TCCGAAAGCTGTTAGTGTAAACTAATTAAAACTTCTCATCAATGAGCCTGTACCTAAAGA
ATAGGAAATAGAAAGAAAAGTAGATGAAATAAATAGAAAAACTGAAGTTATTCCCTATTC
AATTATAATTGACCAACTCCTAAAAAATAATTTAGAGCAAGTTGCTTTTAGGATAGCATT
AAAAATAAGAGACTAAGAATCAAGAGAACATCAATATGAAAGAATTATTAGATAAGCCTA
TTAAAAAGAGAAAGATGATTTACTTGATAGTATGAGTTACTAAATTACAAGTCCTCATAT
TGTTGATTTGATTAATGAGCTTAGAGAAAAGCTTAAGAGCTTAAAATAGATATCATCATA
AAATTAATTTACTAATTAATCTTAATCAATTTATAACATGCGTTGA

>TTHERM_00370870(protein)
MEDSLILQEFKSLDDEKYEFSIYCDLVQRLKFDLQQKKVAIARFGGPIAICRDIVQTQFF
ENNDMFKEDIWFYSNEGLILNKIKFPYNQRIVGFDFIYEELLVVVLENGFYYLINPFEFD
QYESKRIEEKRFNKPDEDLIVEAKILKNGLGFFTKSNRFYIMNNLVEGKLIDFGNPGISS
EISCWNLIPQGDSFDENDVKFNLYVANSAGNGGGVLCISESFKDPIKLYNGQEKHLGLDQ
DTVINLKNIKAIASDCKGLHTAYLTQEFSQNKETWIVHLICEDDYKQIVVSDLGIYYQEE
VEKVKSQIQYYNKSNITNPQTPLSGNQMSNSQRQKLYNTPRVNINMYWIENKAVVIQIRN
ALFLVGSETSTKVEFNNDFESKIPSFVCVQELDGVKILAENRIYMLRNTPQEYLNIFDTT
GSYSPAYQLYQKSQINVENQNYDQTQVNSQDDILNNQVDLEKAVNDCIIAGQYEFNIYRQ
QKLLKAASHGRILLQGFLLGNKVNNVDNEDEDGENQLTKVCKLLRVAYQLNQYQKYKRSI
TYKQMEYLYETSEVFLKILLRYNYHYIAIEISKFLRLDIKKEIYIHWACCKIEKNEDDSK
IINDIKNQFKDQTDIPFSDIIHKALQVGKSKIVLELLNFEPSIQKRIPVLLCMAKTQPNS
NEEYFYKALVEALQSKDSNLIYLVIKTIWDKLGEKSFDYFSKEEILSAHFQIFLKTQLDT
QKLQQQYVLLYKFLLKQKQFIKAGFSLLEFAIKQNDINKKSELIKQVKIEFQKDLSDKFY
TLAIDDQIKFVNYLNSLDEKNIKISIYQQLKQLLAKNQDIAREKLQSEIKMHPKAVSVNQ
LKLLINEPVPKEQEIERKVDEINRKTEVIPYSIIIDQLLKNNLEQVAFRIALKIRDQESR
EHQYERIIRQAYQKEKDDLLDSMSYQITSPHIVDLINELREKLKSLKQISSQNQFTNQSQ
SIYNMR