Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00388440

Standard Name

RPN9 (26S proteasome regulatory subunit N9)

Aliases

PreTt24839 | 41.m00246

Description

RPN9 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit

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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_04469.1 9.997093137033517e-262
Description: PCI domain-containing protein (379 aa)
DictyBase DDB_G0285105 1.0002758036576784e-62
Description: psmD13 on chromosome: 4 position 2852779 to 2854360
Oxytricha Contig746.1.g14 5.999013395827003e-54
Description: PCI domain
SGD YDR427W 1.0003292389192957e-45
Description: RPN9 Non-ATPase regulatory subunit of the 26S proteasome, has similarity to putative proteasomal subunits in other species; null mutant is temperature sensitive and exhibits cell cycle and proteasome assembly defects
WormBase WBGene00004465 3.000619078166531e-39
Description: locus:rpn-9 status:Confirmed UniProt:Q22253 protein_id:CAA88971.1
Tetrahymena borealis EI9_04073.1 3.000619078166531e-39
Description: hypothetical protein (352 aa)
Stentor Coeruleus SteCoe_8781 1.0530617357553812e-20
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:21637855: Xiong J, Yuan D, Fillingham JS, Garg J, Lu X, Chang Y, Liu Y, Fu C, Pearlman RE, Miao W (2011) Gene network landscape of the ciliate Tetrahymena thermophila. PloS one 6(5):e20124

Sequences

>TTHERM_00388440(coding)
ATGGATTCAGATCTTTTGTAATAATTATAAGCTCAATTCCCTCAACAATAAACAATTTTA
GAATAGCTAGCCTTGTTATATACTTAAAAATTGTGGCATGAAATTACCTTAAATTTGAAT
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TCTAATTTCTCAGAAGATAATGCCAGATATATAATCTAATTGCAACAAATTAGTTACAGA
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GAAAAGCAACAAGTAATTGAACCTCTTGCTTATTCCTTCTTATATAGAGTTAGCTACGAG
TTCTATTCCCAAAAGAAAAATTATGAACTTTTATATTTAAATGCTCTTTAATTCCTTGCT
TACACCCAACCTTAAGATATTCCTATTAGCTATTAACAAGATATCTCTCTTAAGATGGCT
ATAGCTATTTTAGTCTCACCTAAGATCTACAATTTCAGTGAACTTCTTCAACAAAGTGTT
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GGATTAGTTAAAGGATCTATAAATTAGGTTTAAGGCAACGTAACAATAAGTTGGATGATT
CCTAGAATCTTAGATAACTCAAGAATATAAATTATGAAAAATAAATTCGATGAATGGACT
AATAGTCTTAGAAATTTAATTTAATTAGTAGAATAAGAACCAGTACCTCTTTATTGA


>TTHERM_00388440(gene)
ATGGATTCAGATCTTTTGTAATAATTATAAGCTCAATTCCCTCAACAATAAACAATTTTA
GAATAGCTAGCCTTGTTATATACTTAAAAGTACATATTTATTTTATTAAGTCACTATTAG
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TTTCTCAGAAGATAATGCCAGATATATAATCTAATTGCAACAAGTAATACATTAACACAT
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AATAGATTAGTTACAGATTAGATGATAAGCACAGTGAATAAAATGATATTGAGTTGACTG
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ATAGAGTTAGCTACGAGTTCTATTCCCAAAAGAAAAATTATGAACTTTTATATTTAAATG
CTCTTTAATTCCTTGCTTACACCCAACCTTAAGTAAAATATATTGTTTCAAAATATTCTA
TGGTTAATCTTTATTTAATAAAAGGATATTCCTATTAGCTATTAACAAGATATCTCTCTT
AAGATGGCTATAGCTATTTTAGTCTCACCTAAGATCTACAATTTCAGTGAACTTGTAATA
AATTAATAAAATTTTAAGCAAAAACAGCTAGTTAAAAAGTTAATTTAAATATTTTATATA
GCTTCAACAAAGTGTTGTTAAATCTCTTCAAAACACTACTTACTCATGGTTGTACACTTT
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TAAATAAATTTTTAAAGCAAACTCATTCATTATTTCTTTATTTATTATTAATTTGTTAAC
AGGTTTAAGGCAACGTAACAATAAGTTGGATGATTCCTAGAATCTTAGATAACTCAAGAA
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TAGTAGAATAAGAACCAGTACCTCTTTATTGA


>TTHERM_00388440(protein)
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YTQPQDIPISYQQDISLKMAIAILVSPKIYNFSELLQQSVVKSLQNTTYSWLYTLIETFN
SGNVDKYYQDLKSFDAQIKQNALLVSNQKLLEEKIRIMAFLDLVFNLPKNDRTISFQKVA
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NSLRNLIQLVEQEPVPLY