Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00392670

Standard Name

SFR10 (Sfi1 repeat protein)

Aliases

PreTt23495 | 42.m00229 | 3813.m01452

Description

SFR10 hypothetical protein; cortical row basal body localization; predicted to have 15 sfi1 repeats; Leucine Rich Repeat family protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD03299 ) Micronucleus: cen2-1[Δ::NEO2]
  • ( SD03300 ) Micronucleus: cen2-1[Δ::NEO2]
  • ( SD03301 ) Micronucleus: cen2-1[Δ::NEO2]
  • ( SD03302 ) Micronucleus: cen2-1[Δ::NEO2] Macronucleus: sfr8-1[Δ::MTT-CHX]

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_11474.1 9.997093137033517e-262
Description: leucine rich repeat family protein (1784 aa)
Oxytricha Contig4888.0.g90 4.997543945741262e-17
Description: Leucine Rich repeats (2 copies)
WormBase WBGene00003390 0.0000029996948234116693
Description: locus:mog-2 Probable U2 small nuclear ribonucleoprotein A status:Confirmed UniProt:Q9BLB6 protein_id:CCD61684.1
SGD YPL213W 0.0007003012208360162
Description: LEA1 Component of U2 snRNP; disruption causes reduced U2 snRNP levels; physically interacts with Msl1p; putative homolog of human U2A snRNP protein

General Information

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Associated Literature

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Sequences

>TTHERM_00392670(coding)
ATGAATTCCTATTAGTATGTGAATAAGCTAAAGAAGCAAATCAAATAAACTTCTACACAA
GGATGGAAGCAAAGAGTTAATTAGAAGACATCATATATAAATTAGATTCCACTCTCGAAT
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AATTATTGCGAAATAATTAAACTAAATTCATTTGGGAGAAAGATTGATCTGCACAGAGAA
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TCTAGAAACTTGGCATCTTCTGATGCTTAAAACAAGACCAGTAGCAGACTAAATTTCAAA
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TTACAAAGAAATTTATCAGCTGAGAATATATTGTACCAGAGAAGTGGGTCTCCTAGTGAT
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TTTTATCTATTAAAAGTGGGCTTTGCTATGCTCGTTAAAAATCGCAAAGATTCTATCAAC
AATAATATAAAAGTTAACAAATTTATTCATTATAAAAAGAAGCAGCTACTTCGCTCTGTC
TTTAATTATATGTCAGGTCCTTTGGTTGCTTTCTCAAGAGAAAAGAATGCTAGAAATAAA
GTGGCTGAATTATTCATCAAAAAAAGACTTATTAATACCTGGAAGTAAACCTATTGTATT
TCTAGAAATTTAAAGAGACTGGAAGAAAAGGCAAAGCAATTTAGTTTGAAAAAATTAGTT
TAAAGACATTTTAATGCCTTGAAGGACTTAAGAGAGAAGGTAAGAAAGAGAAATTTATTA
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TAGAAATAAAGATAGATTCTGAATATGGCTGACAAAAAATCAAAACTGACTCTGTCTTAG
GCATTCAACTCCTGGCTTTATATAATCAAGAGAAAAATTAGAAATAGAGGAGTTGTACAA
AATATGTTAGCTAAAAAAGAAACTTAGTTGCTAAGAATATCTTTGTTCTAATTTTCTAAA
GAATAAAAACTAGGTTTGTATAAGAAATTATTGCAGTACAAAAATAACCAAACATTGCTC
AATGCAGATTTCAAAGAAAATCAAATAGTTTTAGAAACAATAAACGAAGAAAAAAATGAA
ATAGTTGATAAATCCCGTGAACTCATGCAATAAAATGTACTGCTTCAAGAACACATCACA
GAAAAGAATTCAGAAATTAATCAGCTGAAGAGATAGATTTAAAACTTAGAAAAGTTAGAA
GCTAACCAAGAAGAAGTGATAAAAGACTTGTAACAAAAAATAGGCGAACAGGAAATGTAA
ATTTTTGAAATCAATAACGAGTATACAGTCTAAATGGATTAAGAAGAAAACACCTAAAAG
ACTATGAGAATGGATAATAAAGCTATGCAAAGAGAAATCCAAAATCTTCAAAAGGAATTA
GACTTAAAGAACACTTAACTTGCAGAGTATGAAAGGTCTTTTTAAAATAGAACCACAGAA
TTGTTTGGTGATAATAGAGATCTTTAGGAGAAATTATAGAACTCTATTGTAATGGCTAAT
GAATTCAAGCAAAAGATAGAATAACAAGATAGCATTATTGCTAACCTAGAAAACAAAATC
ATAGAGTTGAATGATAATAATTAAAAATAAAAGGAGCATATCACTGAGTGTGTGGGTGTT
ATTCAATAATTTGAAAGCACTTATGATGCTAAAGTGACTGAATACGAAAATATAATTAAT
TTACTGAATACTTAGTTAGATGAGAACAAAGTATAATAGGAACAGTCAAATGCCATAATT
GAGTAACTTACTTAGGAAGTAAAAAAATTAGAATACGAAGTATCACTTTTGACTGAAGAT
CATCATGCTAATACAAACCAATTTATAAGTAGTCTTTATAAGAGTGGATAAAAGTAGATG
TTCTCTTCAATAGGATTCAATTAAAATTTAAACCATTCGATTTCTTCAGAAGCTGATGCA
TTTACTCTTAGAAAAAGACAAAATTATTTCACTTCTCCTCTCCAAACTGATCAGAATAGA
AGAACGGCTTCTAAAGATTATAAGATATTATAAAAATCATTTGAGAGATAAAGGACTCAA
ATGAAAGACAAAATCTAATCTCTTACTTAGCAAATTCAAAACACATTAAATAGTTAAGGT
TAAGAAGAATTACTTCCCTAGTAAGATATTAATATAAACAATAGAATGAATGGTGCCTAA
TATAATTTTGTCAGTAACGGCTTCCAATCAGCTAAATCAAACCAATCTTAGATTCTTCTT
TCTGCCAAGCCATAAAACAAAACTTCAACTGCTAATTTTTTCACAGATAGAAGATAATTA
AACTAGGATAAATCTTATGAAGACTCATCTAAATTTATAAATTTGAAAGGTTCAGGCTTG
TATAGTAATAATTTATTAAAGAACAATGAGAGAAAAGAAAGCCCTATTAACAGCTTAAAA
GTGACTCCAAAGGTTTATAAATATAAAAATAGCAGCATTAGTGGAGGTCTAGGAATAGGA
ATAAATTTAATGCCAAACTTCACTGCTTTGGGATAATCTTAGAGCACTACTCATGCAATA
AAAAATGATCTCCATTCTATTGTATCTCCTTCTTACAACCTTAGTTCTAATATATAAAAT
TTAAGGCCAGACTCTGCTAAAGAAAGTCGTACTTAAAAATCAAGTGTTAACGATCTCTCT
ATGATAAATAATACTGAAAATATTCTTTAAGAGTTAGAAAAAAGTAAATCAGGAAGAAAG
ATAATAAAAAATTAATTGGAATTAAGAATTAAGAATCTTAATGACAACTTAGAATAGGAC
ATTTAAAACGCAAAAAGATTGAATGCAGCAAGAGACAACTAATGA


>TTHERM_00392670(gene)
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ATTTATACATACATATTCTCAAAATTTATTATGATCATCAAAACATTAAAATTGTCTTGT
TAATTGAAAAGCAAATCAAATAAACTTCTACACAAGGATGGAAGCAAAGAGTTAATTAGA
AGACATCATATATAAATTAGATTCCAGTATATTTAATTTACATTTTCAAAGAGATAACAA
ATAAATATGCATTATTTATAAAATTTTCAATAGCTCTCGAATGCATTAGAGAGATTTCCT
CAGTTCTTTGATGATATAAAGATTTCAGTAGTGTAGAAGAGCATTAATGAGATAGATCGT
TTACCTTACAAATATAATAATATTGAAATTCTTTACCTTAGCAACAATAATTTAACTGAC
TTAGAAGGTATCCAGCAATTCAAAAAGTTAAAAACATTAACTTTAGCCCATAATGAGGTA
AATAAGTTACTAATTTCATTTCAATCATAGGATTTTTATAGCAACAAATATAAAAAAATA
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ATGAAATTATTTTAATATAAATAGCCCGTCAGCGAGGAGGCAAGATTAAAAGCGGAAATA
AAAGCAAAATAGCAAACCCAACTTCTGCAGTTGATGTTGAAGAATTATTGCGAAATAATT
AAACTAAATTCAGTAAATTTTTAAAAATAAATTTTATTGCAATAATTAAATCGAATGATT
TTTTGTAATTAATACTAAATCAATAAATCTAGTTTGGGAGAAAGATTGATCTGCACAGAG
AAATGATATAAAATAATTTAAAATTTGTAAAAAATATGGAAAATAAGGAATTGAATCATT
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TATAAGACTTGCTATTGAATGATATTCTCACCTTCTATGAATAGTTTTAATAACAAAACC
CAAATAACAATGAGGAAGATAACTACGATAAGGCTTTCTAAGAAATGATCAAACAATAAA
ATATCAAATTAGCTGAGATAGATGTTCTCCTTGAAAAAAAAGTTTAAAATTATAATGAAT
TTTTAGAAGAAATGATAGCTAAATTTAAACCTCTGCCTCAAAATGTATTTTGATTCATTT
TAAAATTATTTTTTTATTTTTTACTTTTGTTAGGTAAAAACATTTTCTCCATCTAGAAAC
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ATTTATATTTAATTAAATTTTATGAAAATTTATTGAAATTAAAGGAAATAAGACCAAATC
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TAATCAAGAGAAAAATTAGAAATAGAGGAGTTGTACAAAATATGTTAGCTAAAAAAGAAA
CTTAGTTGCTAAGAATATCTTTGTTCTAATTTTCTAAAGAATAAAAACTAGGTTTGTATA
AGAAATTATTGCAGTACAAAAATAACCAAACATTGCTCAATGCAGATTTCAAAGAAAATC
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TTAATTATTAAAATTGTTAAATAATAAAAAAATCTTTTGTTTGATTAAAATTAAATTATT
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ATAAAAGTAGATGTTCTCTTCAATAGGATTCAATTAAAATTTAAACCATTCGATTTCTTC
AGAAGCTGATGCATTTACTCTTAGAAAAAGACAAAATTATTTCACTTCTCCTCTCCAAAC
TGATCAGAATAGAAGAACGGCTTCTAAAGATTATAAGATATTATAAAAATCATTTGAGAG
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TTAGATTCTTCTTTCTGCCAAGCCATAAAACAAAACTTCAACTGCTAATTTTTTCACAGA
TAGAAGATAATTAAACTAGGATAAATCTTATGAAGACTCATCTAAATTTATAAGTAAATT
TTAAATTAATTAAAAAAAATAAAGCTAATTACTTTTATTAAGATTTGAAAGGTTCAGGCT
TGTATAGTAATAATTTATTAAAGAACAATGAGAGAAAAGAAAGCCCTATTAACAGCTTAA
AAGTGACTCCAAAGGTTTATAAATATAAAAATAGCAGCATTAGTGGAGGTCTAGGAATAG
GAATAAATTTAATGCCAAACTTCACTGCTTTGGGATAATCTTAGAGCACTACTCATGCAA
TAAAAAATGATCTCCATTCTATTGTATCTCCTTCTTACAACCTTAGTTCTAATATATAAA
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CTATGATAAATAATACTGAAAATATTCTTTAAGAGTAATTTTTTTTTTAGAAATCCAAAT
AATTGAAAGTATTTTATAAAATGTAATAATTAGGTTAGAAAAAAGTAAATCAGGAAGAAA
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>TTHERM_00392670(protein)
MNSYQYVNKLKKQIKQTSTQGWKQRVNQKTSYINQIPLSNALERFPQFFDDIKISVVQKS
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