Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00420480

Standard Name

RAD16 (helicase and ATPase activities; SNF2 ATPase with E3 Ubiquitin ligase RING domain)

Aliases

PreTt07173 | 46.m00228 | 3679.m00078 | HLTF1 | RAD5L1

Description

RAD16 SNF2 family amine-terminal domain protein; SNF2 family N-terminal domain containing protein with a E3 Ubiquitin Ligase RING domain. Putative homolog to RAD16/RAD5 family of proteins

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

  • ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
  • ( PF00176 ) SNF2 family N-terminal domain
  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
  • ( PF00399 ) Yeast PIR protein repeat
  • ( PF02891 ) MIZ/SP-RING zinc finger
  • ( PF02958 ) Domain of unknown function (DUF227)
  • ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
  • ( PF06467 ) MYM-type Zinc finger
  • ( PF07196 ) Flagellin hook IN motif
  • ( PF07754 ) Domain of unknown function (DUF1610)

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_11022.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1269 aa)
SGD YLR032W 7.000846320060671e-65
Description: RAD5 DNA helicase proposed to promote replication fork regression during postreplication repair by template switching; RING finger containing ubiquitin ligase; stimulates the synthesis of free and PCNA-bound polyubiquitin chains by Ubc13p-Mms2p
Stentor Coeruleus SteCoe_19683 1.6889118802245324e-48
Description: None
WormBase WBGene00020742 5.001052752541194e-37
Description: status:Partially_confirmed UniProt:P91494 protein_id:CCD70774.1
DictyBase DDB_G0282115 2.998577119979921e-31
Description: DDB_G0282115 on chromosome: 3 position 5399711 to 5404710
Oxytricha Contig21260.0.g59 9.995528898049344e-31
Description: SNF2 family N-terminal domain

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences

>TTHERM_00420480(coding)
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>TTHERM_00420480(gene)
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ACTTTGAATTTATTAGAGAAGCATCTCTAAAAAAAGCAAATTTCTTTTATGGTAATTATT
TAAATGATATATTTTTAGATAACCTTTTAATAACTTTTTTTATTTTTTATATTAGAGATT
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AACTAATGCTGACTTGTTACAAGCATCTACTTTAAAAGAAGATAGTAGCTAACAAGAATA
AACCATGGGATAAGAAGAATAATATGATAATTCTAATTAAAATTAAGAGAATACATCATA
AACTCCTACTGTACTTTTAGCTTCGCTTATGAGTGGATATGTTGGACTTAACTTGACAGG
AGCTAACAATTTAATATTATGTGATAGCTGGTGGAATCCTGCTGTTGAAGACTAAGCAAT
AAATAGAATTCATAGGTTAGGCTAATAGAAGCAAACTTATATCTATAAAATGATTTGTAA
AGATACAATAGAAGAAAAGATTTAACAAATCAATGATTAAAAAAGAGATATTTTCCAAAC
AATTTTCAATTCTTCTGAACAAAATAAAAATAAAAAAGCAAAAGAATTCTTATAACAGAT
ATTGAATTGA


>TTHERM_00420480(protein)
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