Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00420610

Standard Name

SOR1 (Sortilin 1 )

Aliases

PreTt07186 | 46.m00241 | 3679.m00091

Description

SOR1 BNR/Asp-box protein; BNR/Asp-box repeat family/ VPS10 domain containing protein

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Gene Ontology Annotations

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Domains

  • ( PF02012 ) BNR/Asp-box repeat
  • ( PF06645 ) Microsomal signal peptidase 12 kDa

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_11013.1 9.997093137033517e-262
Description: BNR/Asp-box repeat family protein (876 aa)
Oxytricha Contig4955.0.0.g74 2.9991470337942304e-139
Description: BNR/Asp-box repeat
Stentor Coeruleus SteCoe_29949 4.834541638053336e-68
Description: None
SGD YJL222W 7.00293386439118e-45
Description: VTH2 Putative membrane glycoprotein with strong similarity to Vth1p and Pep1p/Vps10p, may be involved in vacuolar protein sorting
DictyBase DDB_G0290081 1.999683289470905e-41
Description: sort1 on chromosome: 5 position 3627939 to 3630336

General Information

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Associated Literature

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Sequences 

>TTHERM_00420610(coding)
ATGAAAGCGTACAAGCATTTATAGCTCATAGGTATTGTATTGCTTATTTCAGCTCTACAG
TTCACTGCAACAGCTAAATAGCAAGATATTTCTTTTAGCAAGAACTTTCTTGATTCTGAA
ATAGTTGATGTCATTTGGTGTGGCACCGACACATAGAATGACTAAAACGTTTTGGTTCAA
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GATAATCTTGTTAATGCTGGTATCAAATATGTAGCTGATAATAGTTAAATAGTAGAAAGT
GAAGTTATTAGAATGATAAGAAGTCAAGCTAATCCTAATGTTATTGTTCTTTAAGGCAAA
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AAAGATAGAATAAACACATTTAAGTTGCATCCCAGTTAAGAAGCATGGATGTTAGCAAGC
ACTAATAACGTTTGTGCCAAAAGCTAAAAAGCTCCATGCTTTTCTTTTGCTATACTATGG
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TGGGGTAATTTAAACTTTACTAATAGCTAAGTTCCTCAACAAAGAATATTTTGGGTTTAA
GAAGATGGAAATAAGCAAAACCAAAATAGATATGGATTGCATGAAAAAAGAAACTTTTAT
TACAGCGATGACTTTTTAGCTTCAAAGAAGCTACTCATGACCAAAGGAAATGTCTTTTAC
ATTGATTATAATTACCTTTATGTTGTTCAACTTTTAGAATAAAATTCATAGCAAGTTAAC
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AAGCTGTAAAACCATAAGTTTACAATTTTAGATACTCGTGAAGGATAGGTTTTCTTAAAT
GTAAATCATTTAGGTTCAACATCTCCTATGGGTACTCTTTATATATCAGACTCATTAGGT
GCTCGCTTTTCCTCAAGCTTGTAGGGTCATCTTAGAAGTGAAAATGGTGATACAGATTTT
GAGCGCTTACATGGAATTTATGGAATTTATATAGCAAATGTTTATGAATAAAAAAGAAGA
GAAGAGTTTGAGAATATGTATGCAAGCGAATAAAATGATGATGATGAAAATTAAGGATAA
GACTCCAAAAATAAAAAAAGCAATACATCAATTAAATAGGATAAAAAAGCAGTAAAGATG
AAAGATTTGGTCACCCAAAAAATATAGACAATGATTACTTTCGATAAAGGTGGTATGTGG
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TGCTTCTTAAATATACATTCTAATTCTAATGACTTATATAATTCATTCTACTCATCAAAA
AATGCTGTAGGTTTAGTTTTAGCAAATGGAAATGTTGGTAAGTATCTTTCACATAGTCCA
ACTCAAGTTAATACTTACCTTTCAAGAGATGCAGGTTTAACTTGGAAATAAATTAAAAGA
GGAGCTTATGTTTTCGAAATAGGTGATCATGGTTCAATAATAGTTATGGCTAAAGATAAG
GATTATGGAACCACTAAATTTATCGAATATACTTTAGATGAAGGTATTACTTGGAACCAA
GTTTAAATATCAGATACTGATATCGAAATAGATAATATAATAACAGAGCCATCAAATACT
GGAACCTCATTCATGGTTCTTGCAAAAACACTATCAACAGATAAAAAATAATATGGATTA
GCTATAACAATAGATTTTGCTAATCAGTTTAATAGAAACTGTTCTGGTGCAACAAGTCCA
GATGATCCTGATTCTGATTATGAAAAATGGATACCTCATAGCTATAAATCATCTCAATGT
CTCTTAGGTTAGAAAGTGACTTACTCACGTAAAAAACAAGAATCTGTTTGCTTAAATGGA
GAAGATTATGAAAGACAAATAGAACTTTAAGCATGTGTCTGCTCTGAAGAAGACTGGGAG
TGTGATATCGGCTATATTAGAAATGGATAAAATGGTCCATGTGTAAAGGATGGAACACTT
AGTGATGAAGAATATGAAGGAGTGATCCCAGAAATATGTACTGATTATTATTAAGTAAGT
AGAGGTTATAGAAAAATTCCTTACAATACATGCTAAGGAGGTGTAAATTATTCAGCGGAA
ACTAGAAGATGCCCTGGAAATTCAATTTTTAGCTTTAATACTTTAAAAAATTTGATTCTT
TTGATTTTAGCTATTGCAGCTATTTATTATGGAATTCAGTATAAGAGTTAACTCTCTAGC
TTGTTAATTTACTTAAGTTCTTTGATCCCTCTAATTTATTCTCATCGTAAAGATTATATT
GACTTTTCCAAAGCAAAGTCAGACCATGAAGAAAAGGAAAATAAATTTATGAATCTATTT
TCATTTAGCAACAAAAAAAATGTTAATCATTACAGCAACGTAAATGAAAGTGAAGATTAT
GAAGATAGTGAAGATCATTAACATCTTAATAACCAAAATTACAATCATTTAAATTAACAT
AACTATTTTACTGATAACCAAGATGAAGAGAGTCATTATGATTGA


>TTHERM_00420610(gene)
ATGAAAGCGTACAAGCATTTATAGCTCATAGGTATTGTATTGCTTATTTCAGCTCTACAG
TTCACTGCAACAGCTAAATAGCAAGATATTTCTTTTAGCAAGAACTTTCTTGATTCTGAA
ATAGTTGATGTCATTTGGTGTGGCACCGACACATAGAATGACTAAAACGTTTTGGTTCAA
ACTGATAGTGGAACCATTTATAGATCTTAAAACAAAATGGTACACTTCGAAAATATTAGC
GATAATCTTGTTAATGCTGGTATCAAATATGTAGCTGATAATAGTTAAATAGTAAGTTTT
ACATTCAGAAAAAGGTTTTATTACATTTAACTTTATAATAATAATCAACTTAAAGGTAGA
AAGTGAAGTTATTAGAATGATAAGAAGTCAAGCTAATCCTAATGTTATTGTTCTTTAAGG
CAAAAATGAAGTCAACTGGGTAACAAGAGACTGCGGTAATACATTTAGAGCCTTTTCAAG
AAAGAAAGATAGGTAAATTTTACAAGAATTGTTAGACTAGAAATAATTTGACTGAATTTT
CTTTTTTATTTAAGAATAAACACATTTAAGTTGCATCCCAGTTAAGAAGCATGGATGTTA
GCAAGCACTAATAACGTTTGTGCCAAAAGCTAAAAAGCTCCATGCTTTTCTTTTGCTATA
CTATGGTTAAGTAAAGATTTAGGAAATAGTTGGGAGAAGCTTACTCAATATGTTTACAAA
TTCGAATGGTAAATTTCAAAATAATAAAGACAAAGCTCATCACTAATTTATTTTAAAAAT
AAAATCAATTTAGGGGTAATTTAAACTTTACTAATAGCTAAGTTCCTCAACAAAGAATAT
TTTGGGTTTAAGAAGATGGAAGTAATCTAATTTTTAAAATAAATTCAAAAATAGCAAATA
AAATTTTAATAATTAGATAAGCAAAACCAAAATAGATATGGATTGCATGAAAAAAGAAAC
TTTTATTACAGCGATGACTTTTTAGCTTCAAAGAAGCTACTCATGACCAAAGGAAATGTC
TTTTACATTGATTATAATTACCTTTATGTTGTTCAACGTAAATATTTTTATTCACAATAC
TTAGCGAATTTAAATATCTTAAAATAAATTAGTTTTAGAATAAAATTCATAGCAAGTTAA
CCTAAAAGTTGCTAATCCTTAAGACTTAGATATTAAATTAAGGGATGTTTAGTTAGGCGA
GAAGCTGTAAAACCATAAGTTTACAATTTTAGATACTCGTGAAGGATAGGTTTTCTTAAA
TGTAAATCATTTAGGTTCAACATCTCCTATGGGTACTCTTTATATATCAGACTCATTAGG
TGCTCGCTTTTCCTCAAGCTTGTAGGGTCATCTTAGAAGTGAAAATGGTGATACAGATTT
TGAGCGCTTACATGGAATTTATGGAATTTATATAGCAAATGTTTATGAATAAAAAAGAAG
AGAAGAGTTTGAGAATATGTATGCAAGCGAATAAAATGATGATGATGAAAATTAAGGATA
AGACTCCAAAAATAAAAAAAGCAATACATCAATTAAATAGGATAAAAAAGCAGTAAAGAT
GAAAGATTTGGTCACCCAAAAAATATAGACAATGATTACTTTCGATAAAGGTGGTATGTG
GAGTAGAATTAATGCTCCAACCACAGACTAGGAAAACAAAGAAATTAAATGTGGTGACAA
CTGCTTCTTAAATATACATTCTAATTCTAATGACTTATATAATTCATTCTACTCATCAAA
AAATGCTGTAGGTTTAGTTTTAGCAAATGGAAATGTTGGTAAGTATCTTTCACATAGTCC
AACTCAAGTTAATACTTACCTTTCAAGAGATGCAGGTTTAACTTGGAAATAAGTAATTTA
AAATTAAGATTTAACTTCATATTTATTTATTCTTTCAATGATTTAAAAGATTAAAAGAGG
AGCTTATGTTTTCGAAATAGGTGATCATGGTTCAATAATAGTTATGGCTAAAGATAAGGA
TTATGGAACCACTAAATTTATCGAATATACTTTAGATGAAGGTATTACTTGGAACCAAGT
TTAAATATCAGATACTGATATCGAAATAGATAATATAATAACAGAGCCATCAAATACTGG
AACCTCATTCATGGTTCTTGCAAAAACACTATCAACAGATAAAAAATAATATGGATTAGC
TATAACAATAGATTTTGCTAATCAGTTTAATAGAAACTGTTCTGGTGCAACAAGTCCAGA
TGATCCTGATTCTGATTATGAAAAATGGATACCTCATAGCTATAAATCATCTCAATGTCT
CTTAGGTTAGAAAGTGACTTACTCACGTAAAAAACAAGAATCTGTTTGCTTAAATGGAGA
AGTAAAATATTTTAGATATAAAAAAAAAAAATTAAATTAGTAAATTGTAACAAAAGGATT
ATGAAAGACAAATAGAACTTTAAGCATGTGTCTGCTCTGAAGAAGACTGGGAGTGTGATA
TCGGCTATATTAGAAATGGATAAAATGGTCCATGTGTAAAGGATGGAACACTTAGTGATG
AAGAATATGAAGGAGTGATCCCAGAAATATGTACTGATTATTATTAAGTAAGTAGAGGTT
ATAGAAAAATTCCTTACAATACATGCTAAGGAGGTGTAAATTATTCAGCGGAAACTAGAA
GATGCCCTGGAAATTCAATTTTTAGCTTTAATACTTTAAAAAATTTGATTCTTTTGATTT
TAGCTATTGCAGCTATTTATTATGGAATTCAGTATAAGAGTTAACTCTCTAGCTTGTTAA
TTTACTTAAGTTCTTTGATCCCTCTAATTTATTCTCATCGTAAAGATTATATTGACTTTT
CCAAAGCAAAGTCAGACCATGAAGAAAAGGAAAATAAATTTATGAATCTATTTTCATTTA
GCAACAAAAAAAATGTTAATCATTACAGCAACGTAAATGAAAGTGAAGATTATGAAGATA
GTGAAGATCATTAACATCTTAATAACCAAAATTACAATCATTTAAATTAACATAACTATT
TTACTGATAACCAAGATGAAGAGAGTCATTATGATTGA


>TTHERM_00420610(protein)
MKAYKHLQLIGIVLLISALQFTATAKQQDISFSKNFLDSEIVDVIWCGTDTQNDQNVLVQ
TDSGTIYRSQNKMVHFENISDNLVNAGIKYVADNSQIVESEVIRMIRSQANPNVIVLQGK
NEVNWVTRDCGNTFRAFSRKKDRINTFKLHPSQEAWMLASTNNVCAKSQKAPCFSFAILW
LSKDLGNSWEKLTQYVYKFEWGNLNFTNSQVPQQRIFWVQEDGNKQNQNRYGLHEKRNFY
YSDDFLASKKLLMTKGNVFYIDYNYLYVVQLLEQNSQQVNLKVANPQDLDIKLRDVQLGE
KLQNHKFTILDTREGQVFLNVNHLGSTSPMGTLYISDSLGARFSSSLQGHLRSENGDTDF
ERLHGIYGIYIANVYEQKRREEFENMYASEQNDDDENQGQDSKNKKSNTSIKQDKKAVKM
KDLVTQKIQTMITFDKGGMWSRINAPTTDQENKEIKCGDNCFLNIHSNSNDLYNSFYSSK
NAVGLVLANGNVGKYLSHSPTQVNTYLSRDAGLTWKQIKRGAYVFEIGDHGSIIVMAKDK
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