Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00421020

Standard Name

RRM20 (RNA Recognition Motif-containing protein 20)

Aliases

PreTt07227 | 46.m00282 | 3679.m00132

Description

RRM20 RNA recognition motif protein

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
• protein binding (IEA) | GO:0005515

Domains

• ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
• ( PF00397 ) WW domain
• ( TIGR01622 ) splicing factor, CC1-like family
• ( TIGR01628 ) polyadenylate binding protein, human types
• ( TIGR01648 ) hnRNP-R, Q splicing factor family
• ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor
• ( TIGR01661 ) ELAV/HuD family splicing factor

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_10972.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (797 aa)
WormBase	WBGene00006807	9.99967697349061e-30
	Description: locus:unc-75 status:Confirmed UniProt:G5EE68 protein_id:CAB03896.4
DictyBase	DDB_G0291486	7.002116201343823e-26
	Description: DDB_G0291486 on chromosome: 6 position 413873 to 415521
Oxytricha	Contig18677.0.g10	2.000769134519826e-18
	Description: RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
SGD	YGR250C	0.000000000003998907168546896
	Description: YGR250C Putative RNA binding protein; localizes to stress granules induced by glucose deprivation; interacts with Rbg1p in a two-hybrid
Stentor Coeruleus	SteCoe_10259	0.00000000003775134544279098
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00421020(coding)
ATGCAATTTTAACAATATTCAAGTTCCAGTAGCAAATCAAATAAATTGGGAGGTCAGTAA
TACTATCATCAAGAAAAGCATTATAAAAACGCTGAATAAGAAGATTCTAATTCCTCTCTT
GAAAACAAATCAAAAGGCGGCTAAAAATATAAAAGAAAATAAGTTGAAATAAAGCTATTT
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TCAGAGCCTGAAATAAGAAATGTTTTTGAAAACTATGGAATTGTTAAAGAAGTTGATATC
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CATCACTCAAATAGGGATAACTAAGGACAGTCTAATTATTATCCATCTTCTTCATAGCCT
TAAATGTACTCATAAGGTTAATAGCCTAACCAAAGAAACTCTGACAATTATAATTACCAA
AGAGAATAGCACTCTAATTATAACTAAGGAAGCTAGTCATAAGGATATAGAGGAGGATAA
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AGTAATGACTATAACTACCAAAACCCTTAGTAAAACGACTATGTTCCTCCACCACAAGGA
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TAATAATAACAACAACCAATAAACCCATAGCCTTCATTAGACATTTCTTAGCCTAGTAGT
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GAAAATAAAGAACTTGAAATTTTATCCTAAAAAACAACAGGACCTCCAGGAGCTAATTTA
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GGTTTTGTAAGTTATACAAGCCCAGATGGTGCTCAACAAGCTATACAGTAAATGAATGGC
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TAAATAGAGAAAAAGCTAAAAGTAGAAGTAAAAAAAGGTCAAGGTGATGGAGATTTACCA
CCTAGTCTTAGTTAAAATGGATATTAACCCTTTTGA

>TTHERM_00421020(gene)
ATGCAATTTTAACAATGTGAAATTTGATTTAATCTTCATTACAATAATGAGGATATTATT
TTACATGCAAACATTTTTTATGAACGATTTTAACTTATTATTCAACCTAACCTTCCTTTT
CTATTATTTGTACAATTCTTAGATTCAAGTTCCAGTAGCAAATCAAATAAATTGGGAGGT
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TTATTTATTTGCATATTTTATGAAAGTATCTGCAAGAGATTGATAAACAATTTCAAAATT
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TATCATTTTCTTTTTGCATTTCTATTTTATATTTTTATGTAGGATGACACTACTAACTAA
CCTTGGGTGATGCTGCAAAAAATTAAGATTAAGAAAGAATACATTTCATTTCATTACATG
CATGAATCAATCAATCAATAACTTATTTTTAATTATAATCAAAAATAAATAACACAAAAT
TTATTTCATTTGCTCTATTAATAAAATATGTATAAAATTTTATTAATAGACACATATAAA
CAATTAATATTTAATCAAATTCTGTACTGCACCTTTTTTACAGTTTAATTAAATTTTGAT
TCTTTCTCTTGTTTTTTTTGAAAGCTATCACCCTAGCAAATAAATTTTCATTTATAATTA
ATTATTTTTTGATCTTTCTTTCTTACTTACTTACATTTATTTTGTTTGTAAACTTAAAAA
ATTTCATTTATATTTGATTTAAGGGAAGAGAATGATTTGAAAACATTTTTTGAGAAGTAT
GGTGAAATTGTGAAAGTTTAAGTAATCAGAGACAAAAATAATTAGCACAAAGGGTGTGCT
TTTGTTGTTTTTGCCTCTATTTTATGCGCCAATATTGCAATTGAAGCTCTCAAAGCAACT
AAATTGCCTGGAGTATATTTGAAATTATATATAAATATATATACATATACATTTTTTCAA
CCAATATTTTGTGAAAGAATAAATTCTATTGTTGAATGGCAAACCCATTTTCTATCAACA
TTTATTGAAATTATGTTTTCAATAAATTAATTCATTCACTCATTAACTGTTTATTTATTT
AAAATCCCATTTTTTTCAAAGGTTTGTAGGCAAACAATTTTTTTTTCAATTGTTTATTGA
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TTTGAAACTTACACACCAACCAACAATAAAAATGTTTTAATCCTTTTTAAGATGTAAAAC
AACATACAGGTTAAGTGGGCTGATAATGAGCCTGATAGGCTAGGAATCAGACAAGACCAA
GACTATGTCTTATATGTAGCTCATATTCCTAAAAATGCATCAGAGGTGAGCTATTTATTT
TTTCAAACTTTGAATTTATGCTCTATCTATTTTAAAAATAAATCAAGTGATATTTTTTAC
ATTTATATAATACTAGCCTGAAATAAGAAATGTTTTTGAAAACTATGGAATTGTTAAAGA
AGTTGATATCCCTAAAGATTAATCTGGAACAAGCAGAGGATTTGTTTTTGTGAAATTTGA
AAATATTGAACAAGCTATTTTAGCCAAATAGGCTCTCCATGAAAAATAAGTTTTAAATAA
TCAAACACAGTCCTTAGTGGTCAAGTTTTATGATCCTAAAAAGAAATAAACTCAAGGAAA
TTAAGGACCATAGTAAGGTCAATCTGGCAATTCTTCAAACAGTAAATGCTTTTTTTTTTT
AAAGAGATAAATAAAATATATTATTTAAAAAAAATAGATTACAACAACAATGGACAGGGA
TAGCCTCATCACTCAAATAGGGATAACTAAGGACAGTCTAATTATTATCCATCTTCTTCA
TAGCCTTAAATGTACTCATAAGGTTAATAGCCTAACCAAAGAAACTCTGACAATTATAAT
TACCAAAGAGAATAGCACTCTAATTATAACTAAGGAAGCTAGTCATAAGGATATAGAGGA
GGATAAGGAAATTATCACGGGCATCATGAAAGCAAAGGGTCCTATAACTAAAATAATTAA
AATTACCCAAGAGAAAGTGCCAATTTAAACAACAGTGAACATTATGATTAGCCAAGCTAG
TCGTTCGATAGCTTCTAAAGTCACTCTTCTAATTTTAGAGAGTAATATGGCAATCAAAAT
CTCCAATAATCATAACATAAGTAAATTTTTTATTTTTATTTTTAACTTGTAAAAAGTATT
TAAGTATTTTCATTTTTAATTAGTAACGGTTATCCTCACCATAATCGTAACAACAACAGC
AACAACAATAACAGTAATAATAGCAGCAACAATAACTTTTAGTATAGCAGTAGCTACCCC
TCTAATTAGCCTGCTGGAAATAATTTGAGCAATTAGCAATTTAATTAAACTTATAATAAC
AGCAACTAGAGTAATGACTATAACTACCAAAACCCTTAGTAAAACGACTATGTTCCTCCA
CCACAAGGACAAAATAACTTTTAGTTTAATGATTATTAACAGCAGCATCACAGTAATAAT
AATGGACCTGTTCCAAATAGTGCTAATAATAATTAAATTTAATAGTTTAATCCATACTAT
AATAACGAAAATTTTGATAACTATAACAATCCTTAGATTCACAACGAATAGCCCAGCTTT
ACTCCAAATTAACCTCCATAATAAATACCTTAACATGAAATAAATTAACCTCCATTATTC
AATATGCCATAATAATAACAACAACCAATAAACCCATAGCCTTCATTAGACATTTCTTAG
CCTAGTAGTGGTTACTAAGAGCCAATCCCTGCTGTAGAACCTAATTAATAGCCAATTTAA
GTAAAATCTTTGTTTCCAATTAAATTATTTATTCTTTTTTATTTAATAGCAAAAAGCCTA
TATTAAGTATTACACTGATGACAAAGTCCCTTATTACTATGATACTCAAACTTAATCTAC
ATCATATGACTAACCTCCTTTAGGATCGATAATATATAATCCAGATGGAACACAAGAACA
TGTATAACCAGAAAGCATCGAACAACTGCAAAAATTTTAACAAGAAACAGGATTAGCAGA
AAATAAAGAACTTGAAATTTTATGTAATAAAAAGTTTTTAATTAAAGTTAAATTAAATTA
ATTAATTAAATTTTTTAAAGCCTAAAAAACAACAGGACCTCCAGGAGCTAATTTATTCAT
TTTCCATCTTCCAAACGACTACCGTGATTCAGATCTTTTAAGACTCTTCAAAAAATTCGG
TGATTTGCTCTCCGCAAGAGTTATCACACGTCCTGATGGTTCTAGCAAAGGCTATGGTAA
AAAAAAAAATTAAAATAAATTTAATTTAAACATTTAATTTTATTTGAACTAGGTTTTGTA
AGTTATACAAGCCCAGATGGTGCTCAACAAGCTATACAGTAAATGAATGGCCTATAAGTT
GGAAGTAAATAAAAATTAAAGTATGAGTTTTAAATTAAATATAATTTACATTAAATAGAG
AAAAAGCTAAAAGTAGAAGTAAAAAAAGGTCAAGGTGATGGAGATTTACCACCTAGTCTT
AGTTAAAATGGATATTAACCCTTTTGA

>TTHERM_00421020(protein)
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