Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00426230

Standard Name

MSH3 (homolog to human protein MSH3)

Aliases

PreTt14058 | 47.m00253 | MSH6L1

Description

MSH3 DNA mismatch repair MutS family ATPase domain protein; MutS domain III family protein

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• mismatched DNA binding (IEA) | GO:0030983

Biological Process

• mismatch repair (IEA) | GO:0006298

Domains

• ( PF00488 ) MutS domain V
• ( PF01624 ) MutS domain I
• ( PF05188 ) MutS domain II
• ( PF05190 ) MutS family domain IV
• ( PF05192 ) MutS domain III
• ( TIGR01070 ) DNA mismatch repair protein MutS

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_00176.1	9.997093137033517e-262
	Description: MutS domain III family protein (2231 aa)
Oxytricha	Contig820.1.g122	9.997093137033517e-262
	Description: MutS domain V
Tetrahymena borealis	EI9_05250.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (553 aa)
DictyBase	DDB_G0268614	2.000319284850678e-127
	Description: msh6 on chromosome: 1 position 238722 to 242663
SGD	YDR097C	9.997006461365152e-115
	Description: MSH6 Protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis, forms a complex with Msh2p to repair both single-base & insertion-deletion mispairs; potentially phosphorylated by Cdc28p
WormBase	WBGene00003422	1.9994050701445255e-104
	Description: locus:msh-6 status:Partially_confirmed UniProt:Q9N3T8 protein_id:CCD72556.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_17585	9.710436457780846e-67
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences

>TTHERM_00426230(coding)
ATGCAAATCAACTTGAAAGCAAAAGAGTTTAGTACACTCGATGAAGATTCATCGTCAGAT
GATGATTAAGAATTCGTCAAAAGAATATTAGGATAAACTTCTAAAAATGAAAATAAATCA
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GACAAAATCATCTTATTCAAGATGGGAAAATTTTATGAACTCTTTTATGAAGATGCTATA
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GAGAAGGCATTGGAAAAATTTGCTTCAAAGCTTGTTCAATTCGGATACAAAGTAGTTGTA
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GAAAACAGCTTAGAGTATGCAGAAGTAGAAAAGTAATAAACTATAAAATAGTTTAATGGG
CTCATTTCTAAGCTATTTACCTATGAAAAAGATAGAATATAATGA

>TTHERM_00426230(gene)
ATGCAAATCAACTTGAAAGCAAAAGAGTTTAGTACACTCGATGAAGATTCATCGTCAGAT
GATGATTAAGAATTCGTCAAAAGAATATTAGGATAAACTTCTAAAAATGTAAGTTCATAC
TTAAAATTTAATGATAACGACATAATATTTTTGAGATTCGCAGCACATATTAGAATTAAA
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AATATGACCCAACAACTTTGTATATTCCACCCTAAGAATTTAGTAAACTCACAAGTGCGA
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CATTTTTATTTAATTTTTTGCAATTATTTTTTTATTTTAAAATCAGTTAATTTTTTTTGG
AATAAATTAAAAAATTTCACTTTAGATTTTATTAAATTTTTCAGGTTTTTAGTTGAATTA
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AGCATAAGCCATGCTTGCTTTACAATGGCTGATGGTGTTATGTGCAGACCTGTCATAAAG
TTTGCAAAAAATTAAAAAGAAACCTTTTTCTATTTAAAATAAGGAAGAAACCCTAATCTA
ATTTAATTGGATTTAAAATAAGTTCCAAATGATATCATTCTAGGAAACATTGCAGGAATG
AATGCTTAGCCTAATATTATGATTTTAACAGGTCCAAATATGGGTGGTAAATCAACAACT
TTAAGGTTGTTCTGTTTATCTGCTATTTTAGCTTAAATAGGTATTTATTTTAGAAATTAT
TAAAATTTTAAACTGATTCTTTAATTGAAACAAGGTTGTTATGTTCCTGCAGAGTAATGC
GAATTTAGTTTAGTGGACAGAATTTTCACAAGAATTGGTGCTGGTGATAAATTGATAGAA
GGAAAAAGTACATTTTATATAGAAATGGAAGAAGTTAAAAATTCAATTATGTATGGTACT
TACAACAGTATTGCAATATTTGATGAATTAGGAAGAGGAACTTCCACATTTGATGGTGTA
GCTATTGCTTTTGGAATTCTTAAATATTTTATTGAAAAAATTTAAAGTAGATGCATATTT
GCTACCCATTTTTTCCTTTTGATAAATGAATTAAGATTTTATAAAGAAATATCCTTTTAT
CATATGGAATACTATTACGATAACAAATCTAAAAAGCTCATATTTAAATACAAACTTAAA
TAAGGCAACGCAGAAAGCAGCTTTGGTATAGATTTAGCAAAGGTAAATTAAATTTATATC
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TGTACTTAATTTAGCCTAAAAGAAGTAACTAGAATTCGAAAACAGCTTAGAGTATGCAGA
AGTAGAAAAGTAATAAACTATAAAATAGTTTAATGGGCTCATTTCTAAGCTATTTACCTA
TGAAAAAGATAGAATATAATGA

>TTHERM_00426230(protein)
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LKQNVANSYENQFKGLNGLYQNNSPQQKLQPQAKTSSNNLSGINKSLLNKSKKSTLNQSD
DEAEQMNIEEDQNSVQTNQNDFLNQFQMQSKQTTFKNSTSRQSKQYSGDNQKGSLSIPNK
EEEQLNQIPKFAQQRYRKDSRQIPFGNPQYDPTTLYIPPQEFSKLTSAMKQYWQIKAKHF
DKIILFKMGKFYELFYEDAIIATRLLDITFTNKELHCGFPEKALEKFASKLVQFGYKVVV
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AGDKLIEGKSTFYIEMEEVKNSIMYGTYNSIAIFDELGRGTSTFDGVAIAFGILKYFIEK
IQSRCIFATHFFLLINELRFYKEISFYHMEYYYDNKSKKLIFKYKLKQGNAESSFGIDLA
KIVGIEQSVLNLAQKKQLEFENSLEYAEVEKQQTIKQFNGLISKLFTYEKDRIQ