Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00426230

Standard Name

MSH3 (homolog to human protein MSH3)

Aliases

PreTt14058 | 47.m00253 | MSH6L1

Description

MSH3 DNA mismatch repair MutS family ATPase domain protein; MutS domain III family protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_00176.1 9.997093137033517e-262
Description: MutS domain III family protein (2231 aa)
Oxytricha Contig820.1.g122 9.997093137033517e-262
Description: MutS domain V
DictyBase DDB_G0268614 2.000319284850678e-127
Description: msh6 on chromosome: 1 position 238722 to 242663
SGD YDR097C 9.997006461365152e-115
Description: MSH6 Protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis, forms a complex with Msh2p to repair both single-base & insertion-deletion mispairs; potentially phosphorylated by Cdc28p
WormBase WBGene00003422 1.9994050701445255e-104
Description: locus:msh-6 status:Partially_confirmed UniProt:Q9N3T8 protein_id:CCD72556.1
Stentor Coeruleus SteCoe_17585 9.710436457780846e-67
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences

>TTHERM_00426230(coding)
ATGCAAATCAACTTGAAAGCAAAAGAGTTTAGTACACTCGATGAAGATTCATCGTCAGAT
GATGATTAAGAATTCGTCAAAAGAATATTAGGATAAACTTCTAAAAATGAAAATAAATCA
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TAAAATAATTCACCTCAATAAAAGCTTCAGCCATAAGCTAAGACTTCATCAAATAATCTC
TCAGGAATCAACAAATCTTTATTAAATAAAAGTAAAAAGTCTACTTTAAATTAAAGTGAT
GATGAAGCTGAATAAATGAACATCGAAGAAGACTAAAATAGCGTTTAGACAAACCAAAAT
GATTTTTTAAACTAATTCTAGATGCAATCAAAACAAACTACTTTTAAGAACTCAACTTCA
AGATAAAGCAAATAGTATAGTGGAGATAATTAAAAAGGCAGCTTATCAATACCTAATAAA
GAGGAGGAATAGTTAAATTAAATCCCAAAATTTGCTTAACAAAGGTATCGTAAAGATTCC
AGATAAATTCCATTTGGGAATCCATAATATGACCCAACAACTTTGTATATTCCACCCTAA
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GACAAAATCATCTTATTCAAGATGGGAAAATTTTATGAACTCTTTTATGAAGATGCTATA
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GAGAAGGCATTGGAAAAATTTGCTTCAAAGCTTGTTCAATTCGGATACAAAGTAGTTGTA
GTAGAGTAAACTTCTAAAAAGACGACTACAGGTATAGTAGACAGAGACATTACATAAATC
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TTAAAAGTAAAATTCAAAACAAATGATATTTCATATGCATTTCTGAATAATAGATAATAT
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TAAAGCCATTCTGGGTCGTTTCAGAGATTTACTAGCAGATTTACATCTGAAAAAGTTGCA
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GGTAAATCAACAACTTTAAGGTTGTTCTGTTTATCTGCTATTTTAGCTTAAATAGGTTGT
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GCTGGTGATAAATTGATAGAAGGAAAAAGTACATTTTATATAGAAATGGAAGAAGTTAAA
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GAAAACAGCTTAGAGTATGCAGAAGTAGAAAAGTAATAAACTATAAAATAGTTTAATGGG
CTCATTTCTAAGCTATTTACCTATGAAAAAGATAGAATATAATGA


>TTHERM_00426230(gene)
ATGCAAATCAACTTGAAAGCAAAAGAGTTTAGTACACTCGATGAAGATTCATCGTCAGAT
GATGATTAAGAATTCGTCAAAAGAATATTAGGATAAACTTCTAAAAATGTAAGTTCATAC
TTAAAATTTAATGATAACGACATAATATTTTTGAGATTCGCAGCACATATTAGAATTAAA
TCTAAACTTTTATTGACTATTAGGAAAATAAATCAGACATTAATACTAATCCGATTTAAA
GCAATGCTCAAATAGGACAAAAATAGTAAAGCAATCTAAAATAAAATGTAGCTAATAGTT
ACGAAAATTAATTCAAGGGATTGAATGGGTTATATTAAAATAATTCACCTCAATAAAAGC
TTCAGCCATAAGCTAAGACTTCATCAAATAATCTCTCAGGAATCAACAAATCTTTATTAA
ATAAAAGTAAAAAGTCTACTTTAAATTAAAGTGATGATGAAGCTGAATAAATGAACATCG
AAGAAGACTAAAATAGCGTTTAGACAAACCAAAATGATTTTTTAAACTAATTCTAGATGC
AATCAAAACAAACTACTTTTAAGAACTCAACTTCAAGATAAAGCAAATAGTATAGTGGAG
ATAATTAAAAAGGCAGCTTATCAATACCTAATAAAGAGGAGGAATAGTTAAATTAAATCC
CAAAATTTGCTTAACAAAGGTATCGTAAAGATTCCAGATAAATTCCATTTGGGAATCCAT
AATATGACCCAACAACTTTGTATATTCCACCCTAAGAATTTAGTAAACTCACAAGTGCGA
TGAAATAGTATTGGTAAATAAAAGCAAAGCATTTTGACAAAATCATCTTATTCAAGATGG
GAAAATTTTATGAACTCTTTTATGAAGATGCTATAATTGCAACTAGACTTTTAGATATCA
CTTTTACAAACAAAGAATTGCATTGTGGTTTCCCTGAGAAGGCATTGGAAAAATTTGCTT
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CTACAGGTATAGTAGACAGAGACATTACATAAATCATTACAAAAGGTACAATTAACTTCA
CTTTTGAAGAGTAAAATCACGATCCTAAGTATCTCCTTGTTATCAGGTAAGAAAAATATT
CATTTGATCAATTTTTTTTACTTACTACTGATCAAATCTTATCAAATTCTAAGCTTAATT
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TGATGATTGTGATATAGATTATTTATGTTTTTTATTTAAAAGCAAATAATTTCTATCTAT
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GTTTTAATTTTAATAGATAAAAAACAAACTAAGAGTTCGGTATAATTGTTTATGAATCTT
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CATTTTTATGTGTTACTAAACCTTAAGAAATAGTTTATGATCCAGGAAATATAACATCAG
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CATTTCTGAATAATAGATAATATGATATTTAAGTCAACAAAACTCTTTTTGATAAAATAT
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GATTTACATCTGAAAAAGTTGCATTCATTGAGGAGTTGGAGGAATAACTTAAAGAAATTT
TATCAAACTTCTGTGTAACTGTGTTTAGAGAGTTCTATAAAAAGAAGCATGTTGGTTTTT
CATTTTTATTTAATTTTTTGCAATTATTTTTTTATTTTAAAATCAGTTAATTTTTTTTGG
AATAAATTAAAAAATTTCACTTTAGATTTTATTAAATTTTTCAGGTTTTTAGTTGAATTA
TTTATTTACTTAACAAAAATATTTTTTAATAATTTATTATTTTGAATTTTATTTTACTTA
AAAATAAAATAGGTTTGGGATAAATTTGTAAGTATAGTAGCTGAACTGGATTGCTTAATA
AGCATAAGCCATGCTTGCTTTACAATGGCTGATGGTGTTATGTGCAGACCTGTCATAAAG
TTTGCAAAAAATTAAAAAGAAACCTTTTTCTATTTAAAATAAGGAAGAAACCCTAATCTA
ATTTAATTGGATTTAAAATAAGTTCCAAATGATATCATTCTAGGAAACATTGCAGGAATG
AATGCTTAGCCTAATATTATGATTTTAACAGGTCCAAATATGGGTGGTAAATCAACAACT
TTAAGGTTGTTCTGTTTATCTGCTATTTTAGCTTAAATAGGTATTTATTTTAGAAATTAT
TAAAATTTTAAACTGATTCTTTAATTGAAACAAGGTTGTTATGTTCCTGCAGAGTAATGC
GAATTTAGTTTAGTGGACAGAATTTTCACAAGAATTGGTGCTGGTGATAAATTGATAGAA
GGAAAAAGTACATTTTATATAGAAATGGAAGAAGTTAAAAATTCAATTATGTATGGTACT
TACAACAGTATTGCAATATTTGATGAATTAGGAAGAGGAACTTCCACATTTGATGGTGTA
GCTATTGCTTTTGGAATTCTTAAATATTTTATTGAAAAAATTTAAAGTAGATGCATATTT
GCTACCCATTTTTTCCTTTTGATAAATGAATTAAGATTTTATAAAGAAATATCCTTTTAT
CATATGGAATACTATTACGATAACAAATCTAAAAAGCTCATATTTAAATACAAACTTAAA
TAAGGCAACGCAGAAAGCAGCTTTGGTATAGATTTAGCAAAGGTAAATTAAATTTATATC
TTTATTTAAAATATGTGAAAATTAAAAAAAAATATTTTAGATAGTCGGTATAGAATAATC
TGTACTTAATTTAGCCTAAAAGAAGTAACTAGAATTCGAAAACAGCTTAGAGTATGCAGA
AGTAGAAAAGTAATAAACTATAAAATAGTTTAATGGGCTCATTTCTAAGCTATTTACCTA
TGAAAAAGATAGAATATAATGA


>TTHERM_00426230(protein)
MQINLKAKEFSTLDEDSSSDDDQEFVKRILGQTSKNENKSDINTNPIQSNAQIGQKQQSN
LKQNVANSYENQFKGLNGLYQNNSPQQKLQPQAKTSSNNLSGINKSLLNKSKKSTLNQSD
DEAEQMNIEEDQNSVQTNQNDFLNQFQMQSKQTTFKNSTSRQSKQYSGDNQKGSLSIPNK
EEEQLNQIPKFAQQRYRKDSRQIPFGNPQYDPTTLYIPPQEFSKLTSAMKQYWQIKAKHF
DKIILFKMGKFYELFYEDAIIATRLLDITFTNKELHCGFPEKALEKFASKLVQFGYKVVV
VEQTSKKTTTGIVDRDITQIITKGTINFTFEEQNHDPKYLLVIRQKTNQEFGIIVYESFT
SKIQVGLLQDDKTQTRLKSFLCVTKPQEIVYDPGNITSDILKILKSQYFQSVMSPMRDNK
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