Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00427410

Standard Name

RRM21 (RNA Recognition Motif-containing protein 21)

Aliases

PreTt14077 | 47.m00272

Description

RRM21 RNA recognition motif protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00076 ) RNA recognition motif
  • ( PF00404 ) Dockerin type I domain
  • ( TIGR01649 ) hnRNP-L/PTB/hephaestus splicing factor family

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_00155.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (571 aa)
Tetrahymena borealis EI9_05254.1 9.997093137033517e-262
Description: leucine rich repeat family protein (452 aa)
WormBase WBGene00004207 0.0000000010002658722841845
Description: locus:ptb-1 status:Confirmed UniProt:Q8T3E6 protein_id:CAD30435.1
DictyBase DDB_G0284321 0.000000007002490258088747
Description: DDB_G0284321 on chromosome: 4 position 1760065 to 1764027
SGD YER165W 0.000019995566179747357
Description: PAB1 Poly(A) binding protein, part of the 3-end RNA-processing complex, mediates interactions between the 5 cap structure and the 3 mRNA poly(A) tail, involved in control of poly(A) tail length, interacts with translation factor eIF-4G

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00427410(coding)
ATGGAAAATAGCAATGAAAAATCATTATAATTAATTAATTGCTGCAAAAAACAAAGACTA
ATTAAATTGATAATAATCATTTAAGAAACAATAAGCATAGAAATTTATCTTCAATTTAAT
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ATAGCTATGTGGGTTTTAGCTAATGTTCACAATAAAATGATTTCTGATAGACCAATCAAA
ATTTCTTTTTCGAAAAGAACTTTGGAATGA


>TTHERM_00427410(gene)
ATGGAAAATAGCAATGAAAAATCATTATAATTAATTAATTGCTGCAAAAAACAAAGACTA
ATTAAATTGATAATAATCATTTAAGAAACAATAAGCATAGAAATTTATCTTCAATTTAAT
ATGAATATCAACTAATCTACAAAAGATGAAATGACTGAGCAGAAGGTTTCTCTTAGCTCC
AGGATATCAGTTTCAGATTAAATCAATGAATTAAAATAATCAAAACCAAAGGAGACCCGA
GTGCTCCTTGTAACTCTTGTTAATAACGTTAATAACACTGTTTTGTAACATAATGTTTAC
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CGTTGATTGCAAAATTATTTGAAAAAATGTTTTAATGTCATTAAAATTTACCAATAACCA
TAAAATTACTAGTTTTTTGAAGGAAAATTTTACCATGAGTAAATAAAATTACAAAATTCT
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ATAGCTGATTTCAAGTGATAATTAAGAAGTTACTATTTCATACCATTCTAGCTAATCTTC
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TTCAAATGTGAGTGAGGAGTAAAATGGCAAATATCACACATCAATTAGTAATAGCAACAT
AAAAAATAACTCCATTCATTCTGATAACTCATTAAATTTCGGTAAAAAGGCTGTTTGTAG
CACTACTAGCCGTAATTAAGGCTAAAGCTTCTAAAAGCAAGGACATAACTTAACCAATTC
TGCTCCAAACGACCTTTGCTTTTAAAAATCCTCAAATAGTTTACAAAGTGATATATATGA
AAATGTTGATGAAAAAACAGATATATCTCAATATGTTCATCCACAGTTCTCTTAAAGTAA
AATTTACATTAAAAATATTCTTTTTTTAAAATAAAATTGTTGTTATTACTGAATTAAGAA
AATATTTTTCAAAAAATACAAACTTTTATCAAAAAAGTTTATTGTAAGTAATTATTGTTA
CTTGTAATTCACTTACCAAAAATTATTAAAGAATTTTAAGGTAAGTAAAATCTAATTTGT
TGCGAATTAAAAAAAAACCATTAAAATTTAAAAATCGCATAATACAAAAGTTTAAAAAGC
CTCTCTCAAATTAGTTATCTAAAATTTAGAACCTTCGACTATAAAAATACTATTTAAAAT
ATATTTCAAAGAGCTTAATCCAATTTATAAAAATATTAGCTTCATTTTCTCATATTAATT
AATTTTTATTTTATGAATATAGTGATAAAGAAGTCAAAAGTAATCTATGTTAATAGATTT
GACTCTTCTAAAACTACAATGTAGTAAATTTTTAACTTGTTCAGCGCATTTGGCAATATT
GTTAAGATGATTTTCATGAAATCAAAATCAGCTGTTTTGATCGAATACTCTACTGTTGAC
TTTGCTTGTTAAGCTAAAGATTTGTTGAGCGATACAACTTTTAATGGCAACATTATAAAA
ATATTTTATTCAAGATATGAAAATATTTTCTTCAAAGAAGCAGAAGAAAAGCCAGAAGAC
GAAGAATACTTTGAACCTAATGAGAAATTAAATAGATTTAAAAGTGACGCTCAGGCCATT
ATAAATACTCCTATTGATACTTTACACATATCTAATATTAGAATTAACGATTGCAACTTC
GAAACAATAAAAAAAATTACAGAGCCTTATGGTCAAATTAAAAAAATAAAGTAAAAATTC
TTTTTTAATTTATTCCAAATTGAATTTCATAAAAAATATTTAAATAAAATAAATTTAATT
TTAATTCTTCAAATAAAAAACTTTATTAAATAAAATAAATAGATTCATGCTTGAAAAAAA
TAACAAAAATATGTGTTTAGTCAAATTTGAAACAGTATCAATAGCTATGTGGGTTTTAGC
TAATGTTCACAATAAAATGATTTCTGATAGGTAAAATAAAAATTCATTTTTAATAATATT
TGTTTTTTTAAAATTTATTTCTTTAATAAATTAACTAACTTAATTTTTTATAAATTAAAG
ACCAATCAAAATTTCTTTTTCGAAAAGAACTTTGGAATGA


>TTHERM_00427410(protein)
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QSFQKQGHNLTNSAPNDLCFQKSSNSLQSDIYENVDEKTDISQYVHPQFSQMIKKSKVIY
VNRFDSSKTTMQQIFNLFSAFGNIVKMIFMKSKSAVLIEYSTVDFACQAKDLLSDTTFNG
NIIKIFYSRYENIFFKEAEEKPEDEEYFEPNEKLNRFKSDAQAIINTPIDTLHISNIRIN
DCNFETIKKITEPYGQIKKIKFMLEKNNKNMCLVKFETVSIAMWVLANVHNKMISDRPIK
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