Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00442210

Standard Name

RPN2 (26S proteasome regulatory subunit N2)

Aliases

PreTt05621 | 50.m00190 | 3681.m00049

Description

RPN2 26S proteasome regulatory complex subunit RPN2; Proteasome/cyclosome repeat family protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Domains

  • ( PF01851 ) Proteasome/cyclosome repeat
  • ( PF02985 ) HEAT repeat
  • ( PF05972 ) APC 15 residue motif
  • ( PF07719 ) Tetratricopeptide repeat
  • ( PF07721 ) Tetratricopeptide repeat
  • ( TIGR01716 ) transcriptional activator, Rgg/GadR/MutR family, C-terminal

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_34358 0
Description: None
Tetrahymena borealis EI9_12556.1 9.997093137033517e-262
Description: proteasome/cyclosome repeat family protein (943 aa)
DictyBase DDB_G0287953 9.997093137033517e-262
Description: psmD1 on chromosome: 5 position 881632 to 884917
Oxytricha Contig8285.0.g24 9.997093137033517e-262
Description: Proteasome/cyclosome repeat
SGD YIL075C 9.997093137033517e-262
Description: RPN2 Subunit of the 26S proteasome, substrate of the N-acetyltransferase Nat1p
WormBase WBGene00002173 9.997093137033517e-262
Description: locus:itr-1 Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor itr-1 status:Confirmed UniProt:Q9Y0A1 protein_id:CCD63764.1
WormBase WBGene00000405 9.997093137033517e-262
Description: locus:cdk-1 Cyclin-dependent kinase 1 status:Confirmed UniProt:P34556 protein_id:CAA81590.1
WormBase WBGene00004459 4.998121237022794e-130
Description: locus:rpn-2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 status:Confirmed UniProt:Q18115 protein_id:CCD65298.1
Tetrahymena borealis EI9_07161.1 4.998121237022794e-130
Description: hypothetical protein (909 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:21637855: Xiong J, Yuan D, Fillingham JS, Garg J, Lu X, Chang Y, Liu Y, Fu C, Pearlman RE, Miao W (2011) Gene network landscape of the ciliate Tetrahymena thermophila. PloS one 6(5):e20124

Sequences 

>TTHERM_00442210(coding)
ATGAGTTTAAGCAGCGTTAGATAGTACTTGCAATTATTGTAAGAAAAGGATAATGAGCTA
AAAGTTATTGGATTGGAAAAGTTAGTTTCTGTTGTAGAAACCAACTGGGCTGAAATAGCT
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GCTGTTGGTGACTAAAACGATGATATAGCTCCACCTGAGGACTTCGTCTATGATGAAAAC
TAATAACTTTTGAATTGA


>TTHERM_00442210(gene)
ATGAGTTTAAGCAGCGTTAGATAGTACTTGCAATTATTGTAAGAAAAGGATAATGAGCTA
AAAGTTATTGGATTGGAAAAGTTAGTTTCTGTTGTAGAAACCAACTGGGCTGAAATAGCT
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TATTTAAGTTCTAAAATTGCTTATAATATAAAATATTGTTGCCTTTTAAAATATAACTTT
TCTTCTAACAAAATAAATAGTGAAAATTTATATGAAGATGAGTCATTCCCTAAGAGATAG
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GACTTAGCTTTAGAATCATAAGAATACTTTTAAGTTGATGAAAACACATAATTTGTAGAA
GTTTTAGTTAATACTTGCATTAATAAATATATTACTCATAGATAATCTGACTAGGTAATT
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TTATATGATGTTTGTATTAAATCATTAAACAGCAGAAATTATCGTATTGAAATTATGCAA
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GATGATCTTCTTGCCAAAAATATACCTCTTGCCTATCAAGTAGCCACAGAAATTAGTGAA
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TGTTTTAATGAACGACAGTGCAGTAACTGGTGAATCTGCAGCACTTGCTATTGGTCTTAT
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ACAACATGAAAAAATTATTAGAGCAACTGGTCTTGCTCTTGCTTTAGTTTCTTTCGGATA
AGAAGAAAATGCTGACGGTGTTATCGAATCACTTCTTACTGATAAAGATTTTATTCTTAG
GTAATTTTTGAAAATTATTTTAGCAAATATACTTATATAAAATTGTTTAATAGATACGGT
GGTGTCTTAACTGTTGGTCTTGCTTATGTTGGTACTTCCAACAATAAAGCTATTAGAAAA
TTACTTCATTATGCAGTTGATGATGTTGCTGATGATGTCAGAAGAGCAGCTGTTATCGCA
TTAGGTTTTGTTATGTTTAACTAATATGAACAAATGCCTAAAATTATGAATCTTTTAGCC
ATGAGTTATAGTCCTCACGTAAGATATGGTACTGCCATTGCTTTAGGTATAGCATGCGCT
GGCACTGGATACTAAGAAGCCTTAAATATGATTGAACCAATGCTCACTGACACCACTGAC
TTTGTAAGATAGGGAGCTATGATTGGTACAGCTCTTATTTTACAATAAGCCAATTAAAAC
TCTGAACCTAAATTAGAAAAATTCAAAAAGACTCTTTAAAGCGTTTATTCTAAAAAGCAC
GAAGATATTTTATGTAAGATGGGTGCCATACTTTCATCTGGTATTATTGAGGCTGGTGGA
AGAAATTAAGTTGTTAGACTTGCTTCTTAGTAAGCATTTAAAATTTAATGAGCATTTAAA
TTTAAATAAATATTTTTCTTTTAATAGATAAGGTTTCCCTAAATTAGCTAGTTGCGTTGG
TATGGTTATTTTCACCAATTTCTGGTACTGGTTCCCTTATGTTAACTTCATTAATTTGAG
TTTTGCTCCTTCTGCTTTAATTGGTATTGATTAAACCTTACGTATTCCTACAGACTTCAG
CTTTAAAATTAATACAAAGAAGAGCACTTATGATTACCCTGAGCCAATTAAATAAGATGA
CAACAAAGATAAAAAGGAATTTGAAAAGGTAACTCTTTCAACAACTAACAAGGCTAAGGC
CAGAGCTGCTGTCAAAAGTAAAATTATTGCCTACCTAAATTTAATTTATTAAAAATTATA
CAATTTATTAACAAAAAGTTGATGCTAAAGATAGTAAAATGGAAGAAGAAGTTGCTGGTA
CAAGTTAAGCTGAAAATAAAGAAAAGGCAGAAGAAAAAACTGAAGAAAAAGAGCCAAATT
CTTATATTTAAACAAATCCTGGTAGAGTACTTGAGAAATAAAAGAAATATGTTGAGTTTA
TAGAGAATCATAGATATCAACCTATTATTAAAGTAAAACAAACTACTTTTTATTAGCCAT
TTTTTATTTTAATTTATAAATAAAACTTTATCTAGGAAAGAAAATTCGGTATTGTATTTT
TAAATGATACATAAAATTCAGATGATGCCAGCTACCTTGGAGTTGCTAAAAAATGTATAT
TTTAATTTAATTTTTATTACAAAATAATTAATATTATCTTTTTATATAGAAGCTGAATAA
AAATCTGAAATGGTTCCAGAACAAGCTGTTGGTGACTAAAACGATGATATAGCTCCACCT
GAGGACTTCGTCTATGATGAAAACTAATAACTTTTGAATTGA


>TTHERM_00442210(protein)
MSLSSVRQYLQLLQEKDNELKVIGLEKLVSVVETNWAEIADHLGDIENLYEDESFPKRQL
AYYLASKVYFNLEEYEDALDLALESQEYFQVDENTQFVEVLVNTCINKYITHRQSDQTTK
LNPKYESIVERMFAKCQRDQDYKSGLGIAVESRRTDKINEILSQSEESKRGELVNYLYDV
CIKSLNSRNYRIEIMQLLISFYKEKLASQGLLPHEYINLSLSYHTLGKYEECSQLIDDLL
AKNIPLAYQVATEISETQNYSFIKKVIQALPIEESNSEKRKTVIDILDGRTQREINQKVL
EHLNKSDPLYIKQIHSAVDSKKSVAHTALILCNSILNAGTGNDQFVKDNIDWAQKSQLWA
RFASLASLGMIHSGKPEQAKQIFASHLPKGQAGGNTGGAPNYYSNGGALYGIGIMHSGTR
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AEEKTEEKEPNSYIQTNPGRVLEKQKKYVEFIENHRYQPIIKERKFGIVFLNDTQNSDDA
SYLGVAKKQAEQKSEMVPEQAVGDQNDDIAPPEDFVYDENQQLLN