Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00442760

Standard Name

NMD2 (Nonsense-Mediated mRNA Decay protein 2)

Aliases

PreTt05676 | 50.m00245 | 3681.m00104

Description

NMD2 MIF4G domain protein; MIF4G domain containing protein; factor in Tetrahymena NMD pathway

Genome Browser (Macronucleus)

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• cytoplasm (IDA) | GO:0005737

Molecular Function

• protein binding (IEA) | GO:0005515

Biological Process

• RNA metabolic process (IEA) | GO:0016070

Domains

• ( PF02170 ) PAZ domain
• ( PF02854 ) MIF4G domain
• ( PF04546 ) Sigma-70, non-essential region
• ( PF05178 ) Krr1 family
• ( PF08432 ) Fungal protein of unknown function

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_12612.1	9.997093137033517e-262
	Description: MIF4G domain-containing protein (1027 aa)
Oxytricha	Contig22006.0.g86	5.9981191891941984e-64
	Description: MIF4G domain
WormBase	WBGene00004881	2.00017271388466e-38
	Description: locus:smg-3 status:Confirmed UniProt:C2BR97 protein_id:CCD74194.1
DictyBase	DDB_G0281623	9.00381557957642e-37
	Description: upf2 on chromosome: 3 position 4719332 to 4723605
SGD	YHR077C	2.0008113830639685e-30
	Description: NMD2 Protein involved in the nonsense-mediated mRNA decay (NMD) pathway; interacts with Nam7p and Upf3p; involved in telomere maintenance
Stentor Coeruleus	SteCoe_10276	6.305116760146989e-16
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00442760(coding)
ATGGATAGCGAATAAATTCCTGAAGAAATTAAAAAATTTTTTGATGAAAGAGCTTAGTTA
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AATAATTTCATATATGGTCCTGATGGTTTAATTCAAAACGAACAAATTCAATTTAAAATG
CCTAAGACTAAAAAGAAATGA

>TTHERM_00442760(gene)
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TCTTTGTTGTAGGCGTTACAAGCTAATACGATAAAATGATGGAATGCTTAAAAGATATAG
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TTAATCATTAGCTAAAAATTCAATAAGATGAAAAGCTAAATAAGCTAATAAGTGAAGAAA
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AAGAAGAAGAGCGTCTTCGCTAAGAAAGTGAAAATTTATTTGACACTGATGAAGAAAGGG
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AAGAGAGCTTTAAAGGGAAGAATAGATGATATATAGCTATGCGCTGGTTTACTCTCTTTC
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AATTTTGTCAAAATTAGTAATAAAATTGTTAATTAATTATGAAATTAAATAGACTATTTA
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ATGTATTGATTTTGGTCATGAACCTTTTAGAACCTAAGAAGAAATCGAAAGAATTGATAG
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TATCACAAAGAGACGCACATTCCCTAAAATGCTTAGATTCTTAATCTTTTTCCAAAGATA
TATTCTCTCTAAGAAGTATGTTCCTATAGACATAGAATTCATGGTCCTAGATACTTTCGA
AAGTCTAGATTCAGGTAGCAGCAGATTGACAAAAATTAAAACTTACAATGATGCTAATGA
GCTTGTTAATTCTATAGAGTAAAAAGAGAAAAAAGGAACTCTGAAAACAGTGGAAGAAGA
ATTGAAAGTATTTTTGGGAAACCTTATTTTAAAAAATAATAAACTGTAAGATAATAATAA
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AAAAAGAAAATCATCAATGCTACTGCTAAAGTTAACATTCAAGATGATTCTGGATAGACT
AAAACCATCACAATTATTAAAAAGAAAAAAGATGTAATTACACTTAATTATTTATTTTTT
TAAATTTTTAATTTTTATTTTTTAAATTTAGACATAAAAAAATGATATAACCAATATTAA
TAATTTCATATATGGTCCTGATGGTTTAATTCAAAACGAACAAATTCAATTTAAAATGCC
TAAGACTAAAAAGAAATGA

>TTHERM_00442760(protein)
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