Gene Model Identifier
TTHERM_00442760
Standard Name
NMD2
(Nonsense-Mediated mRNA Decay protein 2)
Aliases
PreTt05676 | 50.m00245 | 3681.m00104
Description
NMD2 MIF4G domain protein; MIF4G domain containing protein; factor in Tetrahymena NMD pathway; Nonsense-mediated mRNA decay protein Nmd2/UPF2
Genome
Browser (Macronucleus)
No Genome Browser Data Present
Genome Browser (Micronucleus)
No Genome Browser Data Present
>TTHERM_00442760(coding)
ATGGATAGCGAATAAATTCCTGAAGAAATTAAAAAATTTTTTGATGAAAGAGCTTAGTTA
TAGTCTTTTAGAAGATAGCTGAGATTGTAAAATATTAAGGCTAAGGAGAATTATGCTAAC
TTAAAAATGGATTAAAGAGTTTTAAAGCTTTAGTAAGTTACCAAGTTTCTCAATAAACTT
AAGGGAAGCAGACCTATGGATAGAGATGCTATTTTGAACGAAATAGATAACTATAATTTG
CAAAACTACATTAGCGAAATTACTATCTCAATTGCTGATTATAATATCACTGATAATGAT
ATTCTTTACTTTGTTTAGCTTTGTTCCAAACTTCATTAAAGTTATGAAGATTTCAACATA
CAAATGGTTATTTAGATTTAAAAGCAAATCAAAACAATTATCCCTTAAAAGGAAAAAGAT
GAAAAAGTTGTAGCAGTTAAAAGAAGAGACATGATGAGATTCATCGCTGAGCTCTTTGTT
GTAGGCGTTACAAGCTAATACGATAAAATGATGGAATGCTTAAAAGATATAATAAATCAT
AAAGAAGCTCGTCCTCTTATGTTAAATGTTTAAACAGCTTTAATGTTTTCTGACAGATTT
GGATTTGAAATTACTCGTCGCAAAGGCATTAAAATAAGTTTTAACTACAACAAGTATGAC
GATTTAGTCAATATCTTTGACTTTGATCAAATTGTTACACCTGAAAAAATATAAAAAATT
GTTATGTATTTCTAATATTATTTAAATATATTAATGGATCATCTGAAGAACCTCTACGAT
CTAAAAATTCAATAAGATGAAAAGCTAAATAAGCTAATAAGTGAAGAAAAGCTTACAGAA
AAAGATGAATAGGAATACACTAGAACAAGAAACAATTATATTAATTTATATGAAGCTCTT
TCTACTATTGCTGATAATCTAGAATTGGATTTTAAAGTAAACTTTGGAGAAGAAGAAAGA
GAAAAAAAATAACAAAAAATTCTAGAGGAGTAGAGGAGAAAGAAATTAGAAGAAGAAGAG
CGTCTTCGCTAAGAAAGTGAAAATTTATTTGACACTGATGAAGAAAGGGCATTCTATGAA
GATATATTTGACTTAAAGGTTAAGCTTCCTGGATCTCTTTTTTCCAATAATTACTTCTAA
GGAAATGTTTAAAAGACATCTGCAAACAATGAAAATGATGATGATTTAGATTAAGACAAT
GACAATGAAAAAGAATAAGAAGAGGAGGAGGAAGAAGAAAAAAAAGATGAAGAGGATGAA
GACAAAGATAATGATGATATTCCTAAGTCTTATGAGCAATTTAAAAAGAACTTAAAACAC
TGTGTCAGCTAAGAAAAGGCAGATTTATTAGCAGAATAGTTTGTATATGTTAACAATAAA
TAAAATAGAAAAAAATTAGTTAAAGACATTCTTGAATACAGAAAAGAATATAATTTGATG
GTTCCTCATTTGTGTAGATTTGTTGCTGTTATTAGCAAGCATTTTAAAGATTTGGGTGAT
ATGGTCGTAGAAAAATTAATTAAAGATTTTGACTCCTACAGAGAAAAGTAGAGACAAGAC
TTTTCTTTCAGAGATAAGAAAATGAGATATTTAAAATATTTATGTGAGCTAGCTAAATTT
AGAGTTTTAGAGCTTTTCAAAATTTTAAATATTTTTAAATCTCTTGTTGATGATTTTAAC
ACTTAATAAGTAGATTTACTTTGTGTTATCATGGATAATGTAGGTAGATTTATTTATAAT
AACTAAGAAACTCGTTTTAGATACATCACTATCCTTGACTAGCTTAACGTTCATCTTCGT
AAAGCTAATTTACCCACAAATAAGTCCATATAGCTTGAAAACTCTATCAGTCTATCCAAG
CCCTCAAAGAAAAAGGCAATTAAATCTGAAAAATAAAGAACTGAATTAGAGCAATATATT
AGATTTTTGGTTTTGGAAAAATTAAACGAAATGAGCTTCAGAGAAGTTACTGCTACTATC
TAAAAACTTAAATGGGATGAGTAGCTTGACGATTATTGCTTCAATGCTATCATTAAGAGA
GCTTTAAAGGGAAGAATAGATGATATATAGCTATGCGCTGGTTTACTCTCTTTCTTGAAT
ACATTTAGACCAACACTAACTCTTAGAATTGTAGATGATCTATTAGAAAAGACTATTTAT
GGAATGGAATAAAATGAAGTTTAGGAATAACAAAAAAGAATCAGTGTTGTGAGATTCTTA
GGAGAGTTATACTTATATTAAGTTGTTGAAATAGATTTTATTTTTGATTTGCTTTATCTA
TGTATTGATTTTGGTCATGAACCTTTTAGAACCTAAGAAGAAATCGAAAGAATTGATAGC
TAAGAGGATTTATTCAGAATTTCTATGATTTGCAATATCCTTGAACCTGTTAGATAATAT
ATCACAAAGAGACGCACATTCCCTAAAATGCTTAGATTCTTAATCTTTTTCCAAAGATAT
ATTCTCTCTAAGAAGTATGTTCCTATAGACATAGAATTCATGGTCCTAGATACTTTCGAA
AGTCTAGATTCAGGTAGCAGCAGATTGACAAAAATTAAAACTTACAATGATGCTAATGAG
CTTGTTAATTCTATAGAGTAAAAAGAGAAAAAAGGAACTCTGAAAACAGTGGAAGAAGAA
TTGAAAGTATTTTTGGGAAACCTTATTTTAAAAAATAATAAACTGTAAGATAATAATAAT
AACTCAACCCAAAATGATTAAAAATAAAATTAAACTAATAAAGCACCTAATGAAGAAGAA
CAAAAACTCAAAGCTATAAATCAATAATATGATGATGATATAGAAAGGGAACTCAATTCA
ATTATAAATCATGACACTTAAATTTAATCATAAATGTTAAATACAAAAAATGTAAACTAT
AAAAAGAAAATCATCAATGCTACTGCTAAAGTTAACATTCAAGATGATTCTGGATAGACT
AAAACCATCACAATTATTAAAAAGAAAAAAGATACATAAAAAAATGATATAACCAATATT
AATAATTTCATATATGGTCCTGATGGTTTAATTCAAAACGAACAAATTCAATTTAAAATG
CCTAAGACTAAAAAGAAATGA
>TTHERM_00442760(gene)
AATAAATATCTTTTCTAAAGAAATTATCTAAATAAATAAACTTTTTAAATAATTAGTAAA
AGCATTTTTAACAATCATAAATAATGGATAGCGAATAAATTCCTGAAGAAATTAAAAAAT
TTTTTGATGAAAGAGCTTAGTTATAGTCTTTTAGAAGATAGCTGAGATTGTAAAATATTA
AGGCTAAGGAGAATTATGCTAACTTAAAAATGGATTAAAGAGTTTTAAAGCTTTAGTAAG
TTACCAAGTTTCTCAATAAACTTAAGGGAAGCAGACCTATGGATAGAGATGCTATTTTGA
ACGAAATAGATAACTATAATTTGCAAAACTACATTAGCGAAATTACTATCTCAATTGCTG
ATTATAATATCACTGATAATGATATTCTTTACTTTGTTTAGCTTTGTTCCAAACTTCATT
AAAGTTATGAAGATTTCAACATACAAATGGTTATTTAGATTTAAAAGCAAATCAAAACAA
TTATCCCTTAAAAGGAAAAAGATGAAAAAGTTGTAGCAGTTAAAAGAAGAGACATGATGA
GATTCATCGCTGAGCTCTTTGTTGTAGGCGTTACAAGCTAATACGATAAAATGATGGAAT
GCTTAAAAGATATAATAAATCATAAAGAAGCTCGTCCTCTTATGTTAAATGTTTAAACAG
CTTTAATGTTTTCTGACAGATTTGGATTTGAAATTACTCGTCGCAAAGGCATTAAAATAA
GTTTTAACTACAACAAGTATGACGATTTAGTCAATATCTTTGACTTTGATCAAATTGTTA
CACCTGAAAAAATATAAAAAATTGTTATGTATTTCTAATATTATTTAAATATATTAATGG
ATCATCTGAAGAACCTCTACGATCTAAAAATTCAATAAGATGAAAAGCTAAATAAGCTAA
TAAGTGAAGAAAAGCTTACAGAAAAAGATGAATAGGAATACACTAGAACAAGAAACAATT
ATATTAATTTATATGAAGCTCTTTCTACTATTGCTGATAATCTAGAATTGGATTTTAAAG
TAAACTTTGGAGAAGAAGAAAGAGAAAAAAAATAACAAAAAATTCTAGAGGAGTAGAGGA
GAAAGAAATTAGAAGAAGAAGAGCGTCTTCGCTAAGAAAGTGAAAATTTATTTGACACTG
ATGAAGAAAGGGCATTCTATGAAGATATATTTGACTTAAAGGTTAAGCTTCCTGGATCTC
TTTTTTCCAATAATTACTTCTAAGGAAATGTTTAAAAGACATCTGCAAACAATGAAAATG
ATGATGATTTAGATTAAGACAATGACAATGAAAAAGAATAAGAAGAGGAGGAGGAAGAAG
AAAAAAAAGATGAAGAGGATGAAGACAAAGATAATGATGATATTCCTAAGTCTTATGAGC
AATTTAAAAAGAACTTAAAACACTGTGTCAGCTAAGAAAAGGCAGATTTATTAGCAGAAT
AGTTTGTATATGTTAACAATAAATAAAATAGAAAAAAATTAGTTAAAGACATTCTTGAAT
ACAGAAAAGAATATAATTTGATGGTTCCTCATTTGTGTAGATTTGTTGCTGTTATTAGCA
AGCATTTTAAAGATTTGGGTGATATGGTCGTAGAAAAATTAATTAAAGATTTTGACTCCT
ACAGAGAAAAGTAGAGACAAGACTTTTCTTTCAGAGATAAGAAAATGAGATATTTAAAAT
ATTTATGTGAGCTAGCTAAATTTAGAGTTTTAGAGCTTTTCAAAATTTTAAATATTTTTA
AATCTCTTGTTGATGATTTTAACACTTAATAAGTAGATTTACTTTGTGTTATCATGGATA
ATGTAGGTAGATTTATTTATAATAACTAAGAAACTCGTTTTAGATACATCACTATCCTTG
ACTAGCTTAACGTTCATCTTCGTAAAGCTAATTTACCCACAAATAAGTCCATATAGCTTG
AAAACTCTATCAGTCTATCCAAGCCCTCAAAGAAAAAGGCAATTAAATCTGAAAAATAAA
GAACTGAATTAGAGCAATATATTAGATTTTTGGTTTTGGAAAAATTAAACGAAATGAGCT
TCAGAGAAGTTACTGCTACTATCTAAAAACTTAAATGGGATGAGTAGCTTGACGATTATT
GCTTCAATGCTATCATTAAGAGAGCTTTAAAGGGAAGAATAGATGATATATAGCTATGCG
CTGGTTTACTCTCTTTCTTGAATACATTTAGACCAACACTAACTCTTAGAATTGTAGATG
ATCTATTAGAAAAGACTATTTATGGAATGGAATAAAATGAAGTTTAGGAATAACAAAAAA
GAATCAGTGTTGTGAGATTCTTAGGAGAGTTATACTTATATTAAGTTGTTGAAATAGATT
TTATTTTTGATTTGCTTTATCTATGTATTGATTTTGGTCATGAACCTTTTAGAACCTAAG
AAGAAATCGAAAGAATTGATAGCTAAGAGGATTTATTCAGAATTTCTATGATTTGCAATA
TCCTTGAACCTGTTAGATAATATATCACAAAGAGACGCACATTCCCTAAAATGCTTAGAT
TCTTAATCTTTTTCCAAAGATATATTCTCTCTAAGAAGTATGTTCCTATAGACATAGAAT
TCATGGTCCTAGATACTTTCGAAAGTCTAGATTCAGGTAGCAGCAGATTGACAAAAATTA
AAACTTACAATGATGCTAATGAGCTTGTTAATTCTATAGAGTAAAAAGAGAAAAAAGGAA
CTCTGAAAACAGTGGAAGAAGAATTGAAAGTATTTTTGGGAAACCTTATTTTAAAAAATA
ATAAACTGTAAGATAATAATAATAACTCAACCCAAAATGATTAAAAATAAAATTAAACTA
ATAAAGCACCTAATGAAGAAGAACAAAAACTCAAAGCTATAAATCAATAATATGATGATG
ATATAGAAAGGGAACTCAATTCAATTATAAATCATGACACTTAAATTTAATCATAAATGT
TAAATACAAAAAATGTAAACTATAAAAAGAAAATCATCAATGCTACTGCTAAAGTTAACA
TTCAAGATGATTCTGGATAGACTAAAACCATCACAATTATTAAAAAGAAAAAAGATACAT
AAAAAAATGATATAACCAATATTAATAATTTCATATATGGTCCTGATGGTTTAATTCAAA
ACGAACAAATTCAATTTAAAATGCCTAAGACTAAAAAGAAATGATCTAAGATATTTAACT
AAATTAACTTTAATTGTACCTATAAACTTTATTTTGAATTGTAGCAAACAACTATTTCAT
ATGATATTCATTGATAAAATGTATTATAATGATTGTAAAAAAATAAATAAATA
>TTHERM_00442760(protein)
MDSEQIPEEIKKFFDERAQLQSFRRQLRLQNIKAKENYANLKMDQRVLKLQQVTKFLNKL
KGSRPMDRDAILNEIDNYNLQNYISEITISIADYNITDNDILYFVQLCSKLHQSYEDFNI
QMVIQIQKQIKTIIPQKEKDEKVVAVKRRDMMRFIAELFVVGVTSQYDKMMECLKDIINH
KEARPLMLNVQTALMFSDRFGFEITRRKGIKISFNYNKYDDLVNIFDFDQIVTPEKIQKI
VMYFQYYLNILMDHLKNLYDLKIQQDEKLNKLISEEKLTEKDEQEYTRTRNNYINLYEAL
STIADNLELDFKVNFGEEEREKKQQKILEEQRRKKLEEEERLRQESENLFDTDEERAFYE
DIFDLKVKLPGSLFSNNYFQGNVQKTSANNENDDDLDQDNDNEKEQEEEEEEEKKDEEDE
DKDNDDIPKSYEQFKKNLKHCVSQEKADLLAEQFVYVNNKQNRKKLVKDILEYRKEYNLM
VPHLCRFVAVISKHFKDLGDMVVEKLIKDFDSYREKQRQDFSFRDKKMRYLKYLCELAKF
RVLELFKILNIFKSLVDDFNTQQVDLLCVIMDNVGRFIYNNQETRFRYITILDQLNVHLR
KANLPTNKSIQLENSISLSKPSKKKAIKSEKQRTELEQYIRFLVLEKLNEMSFREVTATI
QKLKWDEQLDDYCFNAIIKRALKGRIDDIQLCAGLLSFLNTFRPTLTLRIVDDLLEKTIY
GMEQNEVQEQQKRISVVRFLGELYLYQVVEIDFIFDLLYLCIDFGHEPFRTQEEIERIDS
QEDLFRISMICNILEPVRQYITKRRTFPKMLRFLIFFQRYILSKKYVPIDIEFMVLDTFE
SLDSGSSRLTKIKTYNDANELVNSIEQKEKKGTLKTVEEELKVFLGNLILKNNKLQDNNN
NSTQNDQKQNQTNKAPNEEEQKLKAINQQYDDDIERELNSIINHDTQIQSQMLNTKNVNY
KKKIINATAKVNIQDDSGQTKTITIIKKKKDTQKNDITNINNFIYGPDGLIQNEQIQFKM
PKTKKK