Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00449120

Standard Name

TWI8 (Tetrahymena piWI 8)

Aliases

PreTt15430 | 52.m00208 | 3811.m00965 | DQ855965

Description

TWI8 piwi domain protein; Argonaute/Piwi family protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_14988.1 9.997093137033517e-262
Description: piwi domain-containing protein (847 aa)
WormBase WBGene00007055 9.997093137033517e-262
Description: locus:tag-196 status:Confirmed UniProt:O16454 protein_id:CCD64084.1
Oxytricha Contig1484.1.g65 6.998463833652622e-61
Description: Piwi domain
WormBase WBGene00004178 9.999142814001536e-47
Description: locus:prg-1 status:Confirmed UniProt:P90786 protein_id:CAA98113.1
DictyBase DDB_G0271870 3.998479955315009e-46
Description: agnC on chromosome: 2 position 975850 to 979616
Stentor Coeruleus SteCoe_5014 5.900090541597061e-29
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:28053272: Farley BM, Collins K (2017) Transgenerational function of Tetrahymena Piwi protein Twi8p at distinctive noncoding RNA loci. RNA (New York, N.Y.) 23(4):530-545
  2. Ref:19656801: Couvillion MT, Lee SR, Hogstad B, Malone CD, Tonkin LA, Sachidanandam R, Hannon GJ, Collins K (2009) Sequence, biogenesis, and function of diverse small RNA classes bound to the Piwi family proteins of Tetrahymena thermophila. Genes & development 23(17):2016-32

Sequences

>TTHERM_00449120(coding)
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>TTHERM_00449120(gene)
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AATTTGTTATTGGCTTTGTAGCTTCTCAAGATAAAAATGTTAGTCGTTTCTATAGTCGTG
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ATGACACAACTGAATTCCCAGAAGGGAGATTGTAAGAGTTGCTATACAGTTAATGCTTCA
ATTACGTTAACTGGAGTGGTAGTATAAAATATCCTGCCCAAATTTAATATGCAAAGAAAC
TAGCAAAAATGGTCGGAACTTTTATTTAAGAAGAAGTATCAGAAAAGCTTTTCAATTCAA
GATTTTATATTTGA


>TTHERM_00449120(protein)
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