Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00449120Standard Name
TWI8 (Tetrahymena piWI 8)Aliases
PreTt15430 | 52.m00208 | 3811.m00965 | DQ855965Description
TWI8 piwi domain protein; Argonaute/Piwi family proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- ARC complex (IDA) | GO:0033167
- macronucleus (IDA) | GO:0031039
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al.,
2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_14988.1 9.997093137033517e-262 Description: piwi domain-containing protein (847 aa) WormBase WBGene00007055 9.997093137033517e-262 Description: locus:tag-196 status:Confirmed UniProt:O16454 protein_id:CCD64084.1 Oxytricha Contig1484.1.g65 6.998463833652622e-61 Description: Piwi domain WormBase WBGene00004178 9.999142814001536e-47 Description: locus:prg-1 status:Confirmed UniProt:P90786 protein_id:CAA98113.1 DictyBase DDB_G0271870 3.998479955315009e-46 Description: agnC on chromosome: 2 position 975850 to 979616 Stentor Coeruleus SteCoe_5014 5.900090541597061e-29 Description: None
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:28053272: Farley BM, Collins K (2017) Transgenerational function of Tetrahymena Piwi protein Twi8p at distinctive noncoding RNA loci. RNA (New York, N.Y.) 23(4):530-545
- Ref:19656801: Couvillion MT, Lee SR, Hogstad B, Malone CD, Tonkin LA, Sachidanandam R, Hannon GJ, Collins K (2009) Sequence, biogenesis, and function of diverse small RNA classes bound to the Piwi family proteins of Tetrahymena thermophila. Genes & development 23(17):2016-32
Sequences
>TTHERM_00449120(coding)
ATGTAATAAATAGAAACTAAAATATATCCGTTAACATTAGAAAGATATAAGAATTGGCAA
GTAAATAAATAAATTAATTAATATTTATTATAAAATAAAAATCTTTGTTAATAATAATTA
ATAGAAAAACAGCGAAAAAATTAAATGGATCAAGGAAGTTTAAGAGGTGAAAGTGAACAA
GGATCTTCGAGCCAGCAGAAGGAACAGAAACTTTAATTAGCAAGAAGACCCAAGTTAGAT
TACAATTAGCAGTCTAAGTCACTTATGCTCCTCACAAATTATTTAAAATTAGAATTAAAT
AAAAGTATTGAGGAAATCTACTTACTAAGAGTGGATTTTTATCCTAGAATTGAAGCTGAT
AATAGAGTTTTGAGAGATAAATTATTGAGTGTCAGCAGAGCTTAGTTAAAGGAATGTTTG
GGAGGGCATTATTTAATTAATGCTCAATAGATCTTTTCTGTCGAAAAGCCTAATTTTAAT
AAAGAAACATCAATCTCAATAACTTTTCAGAAAACTGATTACCAAGTTAACTTGAAAATC
ACAAAGGTATTTAGATTAGAGGATTTGAACAATGAAAATTAAAGAAAAAGCTAATTCCCT
CTCCTTTTCTTTAATGTCATGGTAAAGAATATACTCAAAGGATTAAATTTCTTTGAATTT
GGAAAGAATACAAAATATTTTGAACCCTCAGCTGAGTATCATTCAAAAATAGAAGGTACT
AATTTAATAGTTTACAAGGGATGGAATACTCCTTTTGAAAATTGTAGTGACGGCCTACTT
ATGAAGCTGGATATTTAACATAAAGTTGCCAGAAGAGAAAATGCTTTGAATTACATAAAT
TTAATTTATAAAAACAATAATGATGCATCTAAAGAGTAAAAGCGTAAGTTAGTTTGTGAA
AAGTTGCAAGGACAAACTGTAATGGCTAATTATGGCAACTTTAAGCAATTTAAAGTTCAT
GATGTAATTTTTGATAAAAATTGCAAAGAATTAAAAGTATCAGATCCTATTTTAGATCCT
AATTCCAAAGAATCATAGCTACCAATAGAACCACCTACTCTGCAATAACCTAATCCTGAT
TCAGATTTAACAATTTATGACTACTACTATAAAAAATATGGTCTTAAAATTAAATATGAT
AAATAACCTCTTCTTTTAGTTTATGAAAAGAAACTTAAGAGATTCCTCTATTTCGTTCCT
GAATTATGCTTACTCACAGGTATACCAGATGAGCTCAATGATTATTAAAAGAGAGAATTG
ATTACCTGTACCAAACAAAAACCATAAGAATTATACAATATGGTGACATAATTTATAGAT
AAAATAGTGAATGTCAATACCACAGAAGGTTAGCTAAATACATAATCTATATCTGAGCAG
CTAGGTATCAACTTCAGCAACCATCCTCATGTTATCTAAGCCAAACAAATTGCATATCCT
ACCATCACATTTGGTGGTCCTAAAAAGGATGCCCCACGCTAAACAATCGAAGATAACAGC
GCTTCTCAATTTAGTATGAAATACCCTGTTTATAGCTCAGGCAATCAGCTCTCCATAGCT
CTACTTCACTTTAAAGATTTCAACACAATGGATCTTTTTTAAAATTGGATTAAAATTTAG
AAGGAGCTAAGAATTGAAGTTAAAAAACCACAAGAATTCAATTTAGGTGATTTCAATAAT
AAGGCTATGTAAGAAATTGAGCATGTCATCCGTAGAGAAATCAAGAAAGAAAAATTTGAC
ATCGTTGCTATAGTTGCTCCTAATAAATTCTCTACAGTTCAAAATTATAGTAAAATAAAA
AAGTTGTGCACAATCACATAACAAATAAAATCCTAATACATTCGTTAGCAATCTCTAGAC
TCAAAGCAGTCTTACAATGTCTGCTCAGCAATTCTAAGTTAAATGGCTGCAAAATGCGGA
ACTACTTTGTGGGTGGTAAATCCTCCTAATGGTATACCAGACAACACAATGATTATTGGA
ACAAGTGTATAAAAGGTATTTATTAATGGACAACCTCAATTTGTTATTGGCTTTGTAGCT
TCTCAAGATAAAAATGTTAGTCGTTTCTATAGTCGTGCCACATTTTAAAAGTTAAATAAA
GATAATATTGAAAAAATCAGCACTTTTATTGTTGACGCCATTAAGTAGTACTTTGTTTAA
AATAAATTTGTACCTGAAAATATCATTTATTTGCGTGAAAACATTGCTGATTAAGGCATT
CAAAAATACTTGAGTACAGAAATAAAAGAAGTGCTTAAGTCATTTACAGTACTTTCCCCT
TAGTATAAACCAAAGCTCTGTGTAGTTTTGTTAGAATGTCGTCATGGTGTTCGTGTATTG
CATTAGCTAGGAGAAGGACCTAATAAAGAACTTGTAAATCCTCCTCCAGGCACTATCATT
GATTCTTCTATTACCAGCAAGTATCATTATGATTTCTATATGATATCCTAAAACGTAAAA
CAAGGAACTGCTACCCCAGTCCACTATAAAGTAATCTATGACACAACTGAATTCCCAGAA
GGGAGATTGTAAGAGTTGCTATACAGTTAATGCTTCAATTACGTTAACTGGAGTGGTAGT
ATAAAATATCCTGCCCAAATTTAATATGCAAAGAAACTAGCAAAAATGGTCGGAACTTTT
ATTTAAGAAGAAGTATCAGAAAAGCTTTTCAATTCAAGATTTTATATTTGA>TTHERM_00449120(gene)
ATGTAATAAATAGAAACTAAAATATATCCGTTAACATTAGAAAGATATAAGAATTGGCAA
GTAAATAAATAAATTAATTAATATTTATTATAAAATAAAAATCTTTGTTAATAATAATTA
ATAGAAAAACAGCGAAAAAATTAAATGGATCAAGGAAGTTTAAGAGGTGAAAGTGAACAA
GGATCTTCGAGCCAGCAGAAGGAACAGAAAGTAATTGAATTTATATGCAATAAAGAATAG
TATAATTAAGCTATTGATGGATGACAGTCAATTTTTTGATGAGAAATAGATCCACTTCTT
ATCATACTATTATATCATTATTATATAATTGGCAATATTAATATGTAAAAAACCAATATT
TTCTTAAAATAATAAGCTTTAATTAGCAAGAAGACCCAAGTTAGATTACAATTAGCAGTC
TAAGTCACTTATGCTCCTCACAAATTATTTAAAATTAGAATTAAATAAAAGTATTGAGGA
AATCTACTTACTAAGAGTGGATTTTTATCCTAGAATTGAAGCTGATAATAGAGTTTTGAG
AGATAAATTATTGAGTGTCAGCAGAGCTTAGTTAAAGGAATGTTTGGGAGGGCATTATTT
AATTAATGCTCAATAGATCTTTTCTGTCGAAAAGCCTAATTTTAATAAAGAAACATCAAT
CTCAATAACTTTTCAGAAAACTGATTACCAAGTTAACTTGAAAATCACAAAGGTATTTAC
CAAATAACCATGCAATATTTTAGAATAAAATTGATTTTTCCCAGATTGTCTTACAAATAA
AATTTAAAGAAGCAGAAATTCCATAAAATGCAGAGTTAGATTTATAAATAACTTAAATAT
GAGACAAACACAGTCAGTCTCATAATTATGTGAAATAATTTTTTTATAAATAGTTTAGAT
TTTACTATTAGATTAGATCAAATGTGTGTGATACGTGGGGATTAAACTTTATTATAAACT
ACCAGCCTTCTTCAAAGCAAATAGTTTTTAATTATTTAATTTGTTAGTTGATTGTAAAAA
TACTAAAATTTAGTTAGAAAAAAATAAAGAAATCAATATTTAAAGCAGATTTTATTTTTA
CGAAATAAAGATAAAAAGGAATAAATAATAAAATAAATAAATTTAGCTATCAAAGTTAAT
TAAATCTGAATTACTAAAAATTTTTATTAAAATTAAATTTAATTTAAAAATTTTTACTAC
TATAAAAAATTTAGGTATTTAGATTAGAGGATTTGAACAATGAAAATTAAAGAAAAAGCT
AATTCCCTCTCCTTTTCTTTAATGTCATGGTAAAGAATATACTCAAAGGATTAAATTTCT
TTGAATTTGGAAAGAATACAAAATATTTTGAACCCTCAGCTGAGTATCATTCAAAAATAG
AAGGTACTAATTTAATAGTTTACAAGGGATGGAATACTCCTTTTGAAAATTGTAGTGACG
GCCTACTTATGAAGCTGGATATTTAACATAAAGTTGCCAGAAGAGAAAATGCTTTGAATT
ACATAAATTTAATTTATAAAAACAATAATGATGCATCTAAAGAGTAAAAGCGTAAGTTAG
TTTGTGAAAAGTTGCAAGGACAAACTGTAATGGCTAATTATGGCAACTTTAAGCAATTTA
AAGTTCATGATGTAATTTTTGATAAAAATTGCAAAGAATTAAAAGTATCAGATCCTATTT
TAGATCCTAATTCCAAAGAATCATAGCTACCAATAGAACCACCTACTCTGCAATAACCTA
ATCCTGATTCAGATTTAACAATTTATGACTACTACTATAAAAAATATGGTCTTAAAATTA
AATATGATAAATAACCTCTTCTTTTAGTTTATGAAAAGAAACTTAAGAGATTCCTCTATT
TCGTTCCTGAATTATGCTTACTCACAGGTATACCAGATGAGCTCAATGATTATTAAAAGA
GAGAATTGATTACCTGTACCAAACAAAAACCATAAGAATTATACAATATGGTGACATAAT
TTATAGATAAAATAGTGAATGTCAATACCACAGAAGGTTAGCTAAATACATAATCTATAT
CTGAGCAGCTAGGTATCAACTTCAGCAACCATCCTCATGTTATCTAAGCCAAACAAATTG
CATATCCTACCATCACATTTGGTGGTCCTAAAAAGGATGCCCCACGCTAAACAATCGAAG
ATAACAGCGCTTCTCAATTTAGTATGAAATACCCTGTTTATAGCTCAGGCAATCAGCTCT
CCATAGCTCTACTTCACTTTAAAGATTTCAACACAATGGATCTTTTTTAAGTAAAATTTA
TTAATTAAAGTTAAGCTTTCAATAAACAAATAGCTTTTTTATTTATATGATTGAATTTTT
TAATTAATTAATTAAAATGGAATTGATTGGCTAGTGTAAACAAACTAGATAAATAAATAT
AATATTTTCCTTTAATTTTTTACCAATTAATTCTTTTGTCTCAAAATTAAATAAAAAATT
ATATTTTGGCGTCTTATTTTTTCTTAATTAAATCTTACTAAAATCTTTTATTTTAAAAAT
GAAAGAATTGGATTAAAATTTAGAAGGAGCTAAGAATTGAAGTTAAAAAACCACAAGAAT
TCAATTTAGGTGATTTCAATAATAAGGCTATGTAAGAAATTGAGCATGTCATCCGTAGAG
AAATCAAGAAAGAAAAATTTGACATCGTTGCTATAGTTGCTCCTAATAAATTCTCTACAG
TTCAAAATTATAGTAAAATAAAAAAGTTGTGCACAATCACATAACAAATAAAATCCTAAT
ACATTCGTTAGCAATCTCTAGACTCAAAGCAGTCTTACAATGTCTGCTCAGCAATTCTAA
GTTAAATGGCTGCAAAATGCGGAACTACTTTGTGGGTGGTAAATCCTCCTAATGGTATAC
CAGACAACACAATGATTATTGGAACAAGTGTATAAAAGGTATTTATTAATGGACAACCTC
AATTTGTTATTGGCTTTGTAGCTTCTCAAGATAAAAATGTTAGTCGTTTCTATAGTCGTG
CCACATTTTAAAAGTTAAATAAAGATAATATTGAAAAAATCAGCACTTTTATTGTTGACG
CCATTAAGTAGTACTTTGTTTAAAATAAATTTGTACCTGAAAATATCATTTATTTGCGTG
AAAACATTGCTGATTAAGGCATTCAAAAATACTTGAGTACAGAAATAAAAGAAGTGCTTA
AGTCATTTACAGTACTTTCCCCTTAGTATAAACCAAAGCTCTGTGTAGTTTTGTTAGAAT
GTCGTCATGGTGTTCGTGTATTGCATTAGCTAGGAGAAGGACCTAATAAAGAACTTGTAA
ATCCTCCTCCAGGCACTATCATTGATTCTTCTATTACCAGCAAGTATCATTATGATTTCT
ATATGATATCCTAAAACGTAAAACAAGGAACTGCTACCCCAGTCCACTATAAAGTAATCT
ATGACACAACTGAATTCCCAGAAGGGAGATTGTAAGAGTTGCTATACAGTTAATGCTTCA
ATTACGTTAACTGGAGTGGTAGTATAAAATATCCTGCCCAAATTTAATATGCAAAGAAAC
TAGCAAAAATGGTCGGAACTTTTATTTAAGAAGAAGTATCAGAAAAGCTTTTCAATTCAA
GATTTTATATTTGA>TTHERM_00449120(protein)
MQQIETKIYPLTLERYKNWQVNKQINQYLLQNKNLCQQQLIEKQRKNQMDQGSLRGESEQ
GSSSQQKEQKLQLARRPKLDYNQQSKSLMLLTNYLKLELNKSIEEIYLLRVDFYPRIEAD
NRVLRDKLLSVSRAQLKECLGGHYLINAQQIFSVEKPNFNKETSISITFQKTDYQVNLKI
TKVFRLEDLNNENQRKSQFPLLFFNVMVKNILKGLNFFEFGKNTKYFEPSAEYHSKIEGT
NLIVYKGWNTPFENCSDGLLMKLDIQHKVARRENALNYINLIYKNNNDASKEQKRKLVCE
KLQGQTVMANYGNFKQFKVHDVIFDKNCKELKVSDPILDPNSKESQLPIEPPTLQQPNPD
SDLTIYDYYYKKYGLKIKYDKQPLLLVYEKKLKRFLYFVPELCLLTGIPDELNDYQKREL
ITCTKQKPQELYNMVTQFIDKIVNVNTTEGQLNTQSISEQLGINFSNHPHVIQAKQIAYP
TITFGGPKKDAPRQTIEDNSASQFSMKYPVYSSGNQLSIALLHFKDFNTMDLFQNWIKIQ
KELRIEVKKPQEFNLGDFNNKAMQEIEHVIRREIKKEKFDIVAIVAPNKFSTVQNYSKIK
KLCTITQQIKSQYIRQQSLDSKQSYNVCSAILSQMAAKCGTTLWVVNPPNGIPDNTMIIG
TSVQKVFINGQPQFVIGFVASQDKNVSRFYSRATFQKLNKDNIEKISTFIVDAIKQYFVQ
NKFVPENIIYLRENIADQGIQKYLSTEIKEVLKSFTVLSPQYKPKLCVVLLECRHGVRVL
HQLGEGPNKELVNPPPGTIIDSSITSKYHYDFYMISQNVKQGTATPVHYKVIYDTTEFPE
GRLQELLYSQCFNYVNWSGSIKYPAQIQYAKKLAKMVGTFIQEEVSEKLFNSRFYI