Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00455610

Standard Name

NUP88 (NUcleoPorin 88)

Aliases

PreTt20290 | 53.m00192 | 3712.m00053

Description

NUP88 Nucleoporin protein; hypothetical protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:28386019: Iwamoto M, Osakada H, Mori C, Fukuda Y, Nagao K, Obuse C, Hiraoka Y, Haraguchi T (2017) Compositionally distinct nuclear pore complexes of functionally distinct dimorphic nuclei in the ciliate Tetrahymena. Journal of cell science 130(10):1822-1834

Sequences 

>TTHERM_00455610(coding)
ATGGAGAATAACCTTTTAGAATCAAGACTAAATAAAATCTTGTCAGATAAAAAGTTTAGC
AAATTGAATAAAAGCATAGAGAAGCATCTCAATAAGGAAACAGGCATTTTTATTAAGGAC
TACTTTTTAGTTCTTGAATATGAATCACTTGATGAAAAGGTAATTCAGAGTAAAAAGAAG
GAGCTTTTAGAAAATTCAATGCACGATCATATAGAAAAAGATGACGATTCTGTTTAATAC
TTTGCACTATACTTATGGATTTTTAATTTGACTGCAGGCCAATTCTTAGAAAATAACGAA
AATAAATTAGCTACTAGAATACCTGTAAATTTACAAAGTTACAACATGTTCAATGCACAA
GATTAATAAATATAGTCTGCCAAAAACACAATCGAAAGCTTTGGTAACGTCTTTTGCATG
TCTAAGAAAATCGGAGAGTAATCTCTCTAAATAATAAATAGTAATATAGATGAATACTAA
ATAGCAATTTATTCTGAAAAATAAATTTTTGTTGGCCATATTGAAAACATTATAAATTCC
TATTTTATTAAGCAAAGCAAAGATGATCAAAATGCCTTTACAATGTACCGTGTATAATTA
TTTATATAAAAATACTCTCCAAGCATTTTAAGCATTAAATTCCACAAATTATCTCCTCAT
CATTTGGCTGTTCTTTTAGATGATTAGTACTTTTGCGTTTATAATCTGCAATCTAGTCTT
TCTTACTAGGAGGTGTAATTTAATCTTTAATAACTTCCACGCTTTGGTAGAAACGAAGAG
TATAATTATTAAGAAAAAGGATAAGTTTAGTTTGTTGATTTCGAATTTGGAGGCAACAGC
TTTTTCACTAGCTATTCGAAAACCAATTTCTAAATTCCTTCTGATTTCGATTTTCTGTCA
GTATATTTTCTTACTGAAGATGGTTAAATTTACTACCAATCTCCATTTTTAGTAAAAGAT
ATGAGAATTAACAGATAATTAATTGAAGAACTTAAGGATTATCTTGTTCAAGAATTAAAA
TTGGTGGAACAGCATGAATAAATATAAGAAAAATTATAGGTGTTAAAATCTTATTTAGAC
TTAGTAGAATAAATTGACAGCAGAGATTTGATAAGTGAATGCGAATAACCTACCAAATTA
TCTAAAATAGTTACTCAAACAGATAAGTCCAGTTCATTTGAAGTTCCTATTTTTAATAGC
ATCAGCATGCAAGACTTGCTGAATGATGATTTCTAAATACAATTAAGATATGTTCCTACA
GAATAAAATAACGAAGATGATTAAGAAAATTTAGAAAATAACAGTAACTTACAGTCTCAG
TTTAAATCAAGTGGCTTTGGAACAAAATCTAACATCTAAGTTTTTTCAAAATCGTTAATG
GACAGATTTACTAGAGATAATAAGAATCAAATTATGTATAGGAAATATAGTAAATTCCAC
AAAGTGGAAACAAAGGGTTAACTCCATGTCTTTATTTTAACAAAGCAAATCGGTAATAAA
ACTTACTCTACTGTATCTTCACGTTTTAGTCCTCTTCCAGTCATGCCTACTCATATTGTT
CAAGACTTTTACTAGTTTTGTCTTTTATCTGGTGAAAAAGCACATCTTGAATGCCCATTA
AGCTCTTTAATCAACTATACAGGAAATTAATCTAAAAAGAATATCTATGAATATAAATAA
AATTAATGTGCTAGACTCTGTTCTAAGGCAATTGAAACATCAACACTTGACAGTGTTTGC
TTCTAACTTATGAATAGAATATATTGTATTAACTTTAAGTGGATTTAGAATTTGATTTTA
ACAAACTTATCAGACCCTAAAGTATTTAATGATGAAGAATTGTCTAGAAGTGAAATTAGA
GTCTTAGTTGATTCTCAGCAAATCGATAGCTAGGATAAATTAGATGCATGTAAATTAACA
GATTTATCTTTTTATTGCTTATCTGAAAAAGACAGAATGCTTCTAGCAGTTATTCCTTCC
CACCACTCACAATAGTAATAGCCTTTTAGGTTAAAATGCTTAACTTTAGACTTCTTGTCA
AACTATATTTAAATTTAAAAGAGTGCTAAGCTTATATCTGAGACTTTACACAAGATGATT
AAAGAATAAGTAGAGCCTGAAAAAGCAAAAGAAAATAACCAATCAGGATAAAAACTAGCT
TAAAATGATGTGAAGCTTCAGGAAATTGCTGATTAAGATAATAAAGTAGATCTTGATAAC
TTTTAAAAGTAAGTAACAGCTTACATAAGCAAGCATGAAGAAGTTTTATAATAGAATATT
TAGTTAATACAAATTAAATATCAAGAGGTATTAAAGAAAAAAGAAGAGTTGAAAAATACA
AAGGAAAAAACAGAAAGCCAATTTTATGAAATCATAGAAAACAAATAAAAGAAGTTGTTA
GAAAGCAAAAAAAGAATTGAAGAAAAAAATAAGTCAATCAATTAAAAAATTTAAGAAATT
GCTTAAAAATTAAAAGACCCTAAAGCTTCAAATGAATTAGACAATGTTAAAGAAGCAAAT
ATCACATTTAATGAAAAATATAATGAGTAAATTAAGACATACTATAATAAACTTAAAGAA
ATCGAAGAATAATACTAAAAGTACTTCAAAACTAGAAGTGAGTTCTTCAATTCATTAGGT
GTTCAAAGCAATACAAACCTACAAATTGATGAAAACACTTTATAAAAAATTAATGAAACA
AGAAATAAGCTAAAATACCACATGAAAATCCTTGATAATTAGATCATTTAAACCAATCCT
CAAGATAATTGA



>TTHERM_00455610(gene)
AAAGCTATTAAGGCAAATAAGATAAATAAAAAGAATAAATTCATTAATAAAATAAATAAA
TAACCAAATTGAATAAATTACATTTAGAATTTTCATAACCTGCTATTTTAAGCCTAGAAT
TAAATGGAGAATAACCTTTTAGAATCAAGACTAAATAAAATCTTGTCAGATAAAAAGTTT
AGCAAATTGAATAAAAGCATAGAGAAGCATCTCAATAAGGAAACAGGCATTTTTATTAAG
GACTACTTTTTAGTTCTTGAATATGAATCACTTGATGAAAAGGTAATTCAGAGTAAAAAG
AAGGAGCTTTTAGAAAATTCAATGCACGATCATATAGAAAAAGATGACGATTCTGTTTAA
TACTTTGCACTATACTTATGGATTTTTAATTTGACTGCAGGCCAATTCTTAGAAAATAAC
GAAAATAAATTAGCTACTAGAATACCTGTAAATTTACAAAGTTACAACATGTTCAATGCA
CAAGATTAATAAATATAGTCTGCCAAAAACACAATCGAAAGCTTTGGTAACGTCTTTTGC
ATGTCTAAGAAAATCGGAGAGTAATCTCTCTAAATAATAAATAGTAATATAGATGAATAC
TAAATAGCAATTTATTCTGAAAAATAAATTTTTGTTGGCCATATTGAAAACATTATAAAT
TCCTATTTTATTAAGCAAAGCAAAGATGATCAAAATGCCTTTACAATGTACCGTGTATAA
TTATTTATATAAAAATACTCTCCAAGCATTTTAAGCATTAAATTCCACAAATTATCTCCT
CATCATTTGGCTGTTCTTTTAGATGATTAGTACTTTTGCGTTTATAATCTGCAATCTAGT
CTTTCTTACTAGGAGGTGTAATTTAATCTTTAATAACTTCCACGCTTTGGTAGAAACGAA
GAGTATAATTATTAAGAAAAAGGATAAGTTTAGTTTGTTGATTTCGAATTTGGAGGCAAC
AGCTTTTTCACTAGCTATTCGAAAACCAATTTCTAAATTCCTTCTGATTTCGATTTTCTG
TCAGTATATTTTCTTACTGAAGATGGTTAAATTTACTACCAATCTCCATTTTTAGTAAAA
GATATGAGAATTAACAGATAATTAATTGAAGAACTTAAGGATTATCTTGTTCAAGAATTA
AAATTGGTGGAACAGCATGAATAAATATAAGAAAAATTATAGGTGTTAAAATCTTATTTA
GACTTAGTAGAATAAATTGACAGCAGAGATTTGATAAGTGAATGCGAATAACCTACCAAA
TTATCTAAAATAGTTACTCAAACAGATAAGTCCAGTTCATTTGAAGTTCCTATTTTTAAT
AGCATCAGCATGCAAGACTTGCTGAATGATGATTTCTAAATACAATTAAGATATGTTCCT
ACAGAATAAAATAACGAAGATGATTAAGAAAATTTAGAAAATAACAGTAACTTACAGTCT
CAGTTTAAATCAAGTGGCTTTGGAACAAAATCTAACATCTAAGTTTTTTCAAAATCGTTA
ATGGACAGATTTACTAGAGATAATAAGAATCAAATTATGTATAGGAAATATAGTAAATTC
CACAAAGTGGAAACAAAGGGTTAACTCCATGTCTTTATTTTAACAAAGCAAATCGGTAAT
AAAACTTACTCTACTGTATCTTCACGTTTTAGTCCTCTTCCAGTCATGCCTACTCATATT
GTTCAAGACTTTTACTAGTTTTGTCTTTTATCTGGTGAAAAAGCACATCTTGAATGCCCA
TTAAGCTCTTTAATCAACTATACAGGAAATTAATCTAAAAAGAATATCTATGAATATAAA
TAAAATTAATGTGCTAGACTCTGTTCTAAGGCAATTGAAACATCAACACTTGACAGTGTT
TGCTTCTAACTTATGAATAGAATATATTGTATTAACTTTAAGTGGATTTAGAATTTGATT
TTAACAAACTTATCAGACCCTAAAGTATTTAATGATGAAGAATTGTCTAGAAGTGAAATT
AGAGTCTTAGTTGATTCTCAGCAAATCGATAGCTAGGATAAATTAGATGCATGTAAATTA
ACAGATTTATCTTTTTATTGCTTATCTGAAAAAGACAGAATGCTTCTAGCAGTTATTCCT
TCCCACCACTCACAATAGTAATAGCCTTTTAGGTTAAAATGCTTAACTTTAGACTTCTTG
TCAAACTATATTTAAATTTAAAAGAGTGCTAAGCTTATATCTGAGACTTTACACAAGATG
ATTAAAGAATAAGTAGAGCCTGAAAAAGCAAAAGAAAATAACCAATCAGGATAAAAACTA
GCTTAAAATGATGTGAAGCTTCAGGAAATTGCTGATTAAGATAATAAAGTAGATCTTGAT
AACTTTTAAAAGTAAGTAACAGCTTACATAAGCAAGCATGAAGAAGTTTTATAATAGAAT
ATTTAGTTAATACAAATTAAATATCAAGAGGTATTAAAGAAAAAAGAAGAGTTGAAAAAT
ACAAAGGAAAAAACAGAAAGCCAATTTTATGAAATCATAGAAAACAAATAAAAGAAGTTG
TTAGAAAGCAAAAAAAGAATTGAAGAAAAAAATAAGTCAATCAATTAAAAAATTTAAGAA
ATTGCTTAAAAATTAAAAGACCCTAAAGCTTCAAATGAATTAGACAATGTTAAAGAAGCA
AATATCACATTTAATGAAAAATATAATGAGTAAATTAAGACATACTATAATAAACTTAAA
GAAATCGAAGAATAATACTAAAAGTACTTCAAAACTAGAAGTGAGTTCTTCAATTCATTA
GGTGTTCAAAGCAATACAAACCTACAAATTGATGAAAACACTTTATAAAAAATTAATGAA
ACAAGAAATAAGCTAAAATACCACATGAAAATCCTTGATAATTAGATCATTTAAACCAAT
CCTCAAGATAATTGAGTTATATTTTTTAATTTTTTATCAATCTTATCAATTGTAATTTAT
ATTATTTATTTTTAATAATAACACACTATTATTTTAAA



>TTHERM_00455610(protein)
MENNLLESRLNKILSDKKFSKLNKSIEKHLNKETGIFIKDYFLVLEYESLDEKVIQSKKK
ELLENSMHDHIEKDDDSVQYFALYLWIFNLTAGQFLENNENKLATRIPVNLQSYNMFNAQ
DQQIQSAKNTIESFGNVFCMSKKIGEQSLQIINSNIDEYQIAIYSEKQIFVGHIENIINS
YFIKQSKDDQNAFTMYRVQLFIQKYSPSILSIKFHKLSPHHLAVLLDDQYFCVYNLQSSL
SYQEVQFNLQQLPRFGRNEEYNYQEKGQVQFVDFEFGGNSFFTSYSKTNFQIPSDFDFLS
VYFLTEDGQIYYQSPFLVKDMRINRQLIEELKDYLVQELKLVEQHEQIQEKLQVLKSYLD
LVEQIDSRDLISECEQPTKLSKIVTQTDKSSSFEVPIFNSISMQDLLNDDFQIQLRYVPT
EQNNEDDQENLENNSNLQSQFKSSGFGTKSNIQVFSKSLMDRFTRDNKNQIMYRKYSKFH
KVETKGQLHVFILTKQIGNKTYSTVSSRFSPLPVMPTHIVQDFYQFCLLSGEKAHLECPL
SSLINYTGNQSKKNIYEYKQNQCARLCSKAIETSTLDSVCFQLMNRIYCINFKWIQNLIL
TNLSDPKVFNDEELSRSEIRVLVDSQQIDSQDKLDACKLTDLSFYCLSEKDRMLLAVIPS
HHSQQQQPFRLKCLTLDFLSNYIQIQKSAKLISETLHKMIKEQVEPEKAKENNQSGQKLA
QNDVKLQEIADQDNKVDLDNFQKQVTAYISKHEEVLQQNIQLIQIKYQEVLKKKEELKNT
KEKTESQFYEIIENKQKKLLESKKRIEEKNKSINQKIQEIAQKLKDPKASNELDNVKEAN
ITFNEKYNEQIKTYYNKLKEIEEQYQKYFKTRSEFFNSLGVQSNTNLQIDENTLQKINET
RNKLKYHMKILDNQIIQTNPQDN