Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00455610

Standard Name

NUP88 (NUcleoPorin 88)

Aliases

PreTt20290 | 53.m00192 | 3712.m00053

Description

hypothetical protein; Nucleoporin protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_36368 0
Description: None
Tetrahymena borealis EI9_13753.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (937 aa)
WormBase WBGene00002179 9.997093137033517e-262
Description: locus:jph-1 status:Confirmed UniProt:Q22667 protein_id:CAA99924.2
DictyBase DDB_G0279039 0.000019995566179747357
Description: DDB_G0279039 on chromosome: 3 position 1541078 to 1544303

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:28386019: Iwamoto M, Osakada H, Mori C, Fukuda Y, Nagao K, Obuse C, Hiraoka Y, Haraguchi T (2017) Compositionally distinct nuclear pore complexes of functionally distinct dimorphic nuclei in the ciliate Tetrahymena. Journal of cell science 130(10):1822-1834

Sequences

>TTHERM_00455610(coding)
ATGGAGAATAACCTTTTAGAATCAAGACTAAATAAAATCTTGTCAGATAAAAAGTTTAGC
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TTTATATAAAAATACTCTCCAAGCATTTTAAGCATTAAATTCCACAAATTATCTCCTCAT
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TTTTTCACTAGCTATTCGAAAACCAATTTCTAAATTCCTTCTGATTTCGATTTTCTGTCA
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AGAAATAAGCTAAAATACCACATGAAAATCCTTGATAATTAGATCATTTAAACCAATCCT
CAAGATAATTGA


>TTHERM_00455610(gene)
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AAATTGAATAAAAGCATAGAGAAGCATCTCAATAAGGAAACAGGCATTTTTATTAAGGAC
TACTTTTTAGTTCTTGAATATGAATCACTTGATGAAAAGGTAATTCAGAGTAAAAAGAAG
GAGCTTTTAGAAAATTCAATGCACGATCATATAGAAAAAGATGACGATTCTGTTTAATAC
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TTTTTCACTAGCTATTCGAAAACCAATTTCTAAATTCCTTCTGATTTCGATTTTCTGTCA
GTATATTTTCTTACTGAAGATGGTTAAATTTACTACCAATCTCCATTTTTAGTAAAAGAT
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TCATTCTATAATATATAAGTTTTAAATATGTTTATTAGAGTTTTGAGTTTTAAAAAATAA
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TGAATGATGATTTCTAAATACAATTAAGATATGTTCCTACAGAATAAAATAACGAAGATG
ATTAAGAAAATTTAGAAAATAACAGTAACTTACAGTCTCAGTTTAAATCAAGTGGCTTTG
GAACAAAATCTAACATCTAAGTTTTTTCAAAATCGTTAATGGACAGATTTACTAGAGATA
ATAAGAATCAAATTATGTATAGGAAATATAGTAAATTCCACAAAGTGGAAACAAAGGGTT
AACTCCATGTCTTTATTTTAACAAAGCAAATCGGTAATAAAACTTACTCTACTGTATCTT
CACGTTTTAGTCCTCTTCCAGTCATGCCTACTCATATTGTTCAAGACTTTTACTAGTTTT
GTCTTTTATCTGGTGAAAAAGCACATCTTGAATGCCCATTAAGCTCTTTAATCAACTATA
CAGGAAATTAATCTAAAAAGAATATCTATGAATATAAATAAAATTAATGTGCTAGACTCT
GTTCTAAGGCAATTGAAACATCAACACTTGACAGTGTTTGCTTCTAACTTATGAATAGAA
TATATTGTATTAACTTTAAGTGGATTTAGAATTTGATTTTAACAAACTTATCAGACCCTA
AAGTATTTAATGATGAAGAATTGTCTAGAAGTGAAATTAGAGTCTTAGTTGATTCTCAGC
AAATCGATAGCTAGGATAAATTAGATGCATGTAAATTAACAGATTTATCTTTTTATTGCT
TATCTGAAAAAGACAGAATGCTTCTAGCAGTTATTCCTTCCCACCACTCACAATAGTAAT
AGCCTTTTAGGTTAAAATGCTTAACTTTAGACTTCTTGTCAAACTATATTTAAATTTAAA
AGAGTGCTAAGCTTATATCTGAGACTTTACACAAGATGATTAAAGAATAAGTAGAGCCTG
AAAAAGCAAAAGAAAATAACCAATCAGGATAAAAACTAGCTTAAAATGATGTGAAGCTTC
AGGAAATTGCTGATTAAGATAATAAAGTAGATCTTGATAACTTTTAAAAGTAAGTAACAG
CTTACATAAGCAAGCATGAAGAAGTTTTATAATAGAATATTTAGTTAATACAAATTAAAT
ATCAAGAGGTATTAAAGAAAAAAGAAGAGTTGAAAAATACAAAGGAAAAAACAGAAAGCC
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AAGAAAAAAATAAGTCAATCAATTAAAAAATTTAAGAAATTGCTTAAAAATTAAAAGACC
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AGTACTTCAAAACTAGAAGTGAGTTCTTCAATTCATTAGGTGTTCAAAGCAATACAAACC
TACAAATTGATGAAAACACTTTATAAAAAATTAATGAAACAAGAAATAAGCTAAAATACC
ACATGAAAATCCTTGATAATTAGATCATTTAAACCAATCCTCAAGATAATTGA


>TTHERM_00455610(protein)
MENNLLESRLNKILSDKKFSKLNKSIEKHLNKETGIFIKDYFLVLEYESLDEKVIQSKKK
ELLENSMHDHIEKDDDSVQYFALYLWIFNLTAGQFLENNENKLATRIPVNLQSYNMFNAQ
DQQIQSAKNTIESFGNVFCMSKKIGEQSLQIINSNIDEYQIAIYSEKQIFVGHIENIINS
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TNLSDPKVFNDEELSRSEIRVLVDSQQIDSQDKLDACKLTDLSFYCLSEKDRMLLAVIPS
HHSQQQQPFRLKCLTLDFLSNYIQIQKSAKLISETLHKMIKEQVEPEKAKENNQSGQKLA
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KEKTESQFYEIIENKQKKLLESKKRIEEKNKSINQKIQEIAQKLKDPKASNELDNVKEAN
ITFNEKYNEQIKTYYNKLKEIEEQYQKYFKTRSEFFNSLGVQSNTNLQIDENTLQKINET
RNKLKYHMKILDNQIIQTNPQDN