Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00463740

Standard Name

VPS18B (vacuolar protein sorting 18B)

Aliases

PreTt25826 | 54.m00282 | 3823.m01192

Description

corvet complex core vacuolar protein

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Gene Ontology Annotations

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Domains

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Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_10692.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1114 aa)
Oxytricha Contig618.1.g107 1.0000844672813518e-48
Description: Pep3/Vps18/deep orange family
DictyBase DDB_G0269924 1.000159011384939e-43
Description: vps18 on chromosome: 1 position 3875953 to 3879788
SGD YLR148W 1.999981404597394e-31
Description: PEP3 Component of CORVET tethering complex; vacuolar peripheral membrane protein that promotes vesicular docking/fusion reactions in conjunction with SNARE proteins, required for vacuolar biogenesis
Stentor Coeruleus SteCoe_29243 1.185064864233981e-27
Description: None
WormBase WBGene00021058 9.996273942859018e-26
Description: locus:vps-18 status:Partially_confirmed UniProt:Q23194 protein_id:CCD73641.1
Tetrahymena borealis EI9_40993.1 9.996273942859018e-26
Description: hypothetical protein (597 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:

Sequences 

>TTHERM_00463740(coding)
ATGTCGTTCAAAGAAGTGGCAGTTTAAGGCTATCAGCGTAATAGAAATAATGCTGGCATA
GCAAATTCTGAAAATAGTAAATCAAATAAATAGCAATACTATAATAGCGGAGTATCTACA
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TTAGCAAATGTAGGTGGAAAGATAGGAGGAAAAATCATTCCATTTAAAAGATTTAAAAAA
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CATAACTCATCATAAGTTAAGCCTTTACCGAAGCTGAAGAGAATAATTCTAAAAAGTGTT
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TATGAAAAAGCTTACTAATTATGTAGAAAGACAGAGAGTGAGTTTATACCTACTATAAGT
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GAGCAAATAGTTATTTATGAATCCCAGAAAACATGGATGAAAATAATAGAACACATGATG
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TTTAATAAATAACTTGATGATTTGATTTGTAAAGAATGTCCTTTGTGTGGTCCTATACAT
GCTAGTCTTGCTTTCTAGAACTATGAAAAAGATAATTCTTGGACTATTGAATGA


>TTHERM_00463740(gene)
ATGTCGTTCAAAGAAGTGGCAGTTTAAGGCTATCAGCGTAATAGAAATAATGCTGGCATA
GCAAATTCTGAAAATAGTAAATCAAATAAATAGCAATACTATAATAGCGGAGTATCTACA
TCTATATAAGAAGAAAGTGAAATATAGGAATCACTTTAATGGGGCGACCCTAAACAAAGA
GAAGAAGAAATAGTTGGATTTTAAGAAAAATAAGTTGACTATAGCTCTCCTATAGAAGTT
AAAAATTTATATATCTCTCTGCCTTAGCAAAAAATAAAGCATTTAGCAATATCATAAAAA
TCTGCTGTTGCAATTACTGAAAATAACATGGTGATAAGATGGAAATTCGAAAAGTAAATA
AATTTCAACAGAAAAATTTAGAAAATAATTTATCTTTAAATTCAGATGAATATCGTCCAA
ATTTAAATAAAAATGTGAATTTTCCAAGAAGTTTAACGAAATTATTAAATATTTAATATA
GTGGATATGACACGTATGAATCGATGTCGTTGCCTGAAAAAGTGTCTGGCTTATCATTAG
GAGGAAAGTTAGCAAATGTAGGTGGAAAGATAGGAGGAAAAATCATTCCATTTAAAAGAT
TTAAAAAATATTAAAATGATAAAGAAGTAGAAAGGTAAAAGCGAAGAATTATAGATAGAG
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ATTTGAATCATAACTCATCATAAGTTAAGCCTTTACCGAAGCTGAAGAGAATAATTCTAA
AAAGTGTTATGTTTGATGATAGATAGGCATACAAAACACTGTATTTAAAGATTTTTTTTC
ATTAATTAATACTAAATTTTGGTTGGTTTTTTGGAAAAGCAAACCGATCAGAAATTCTTA
TTTTACTTAAATCTCCTTATTAGAACAAAGGCAATAAAAAAATAGATGCATCGATTTATT
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AAATAATTCGATTTATTAGTGCAAACTAGAGTATAATGAAAAAGATGGTCAATTCTATGA
GACAGTTCCTCAGTTGCTTATATCAATTCACGATGAGAAACCAAAATTTATCACAGATAT
AAAAATACTTCATAATAAATTTGGAGCTAGGAAAGGAGAAGTTCAAACTATTGTTTTAGC
ATCAACCAATTCGCAAATATATTTTTTTTGTAAATCAGCAAAAGAGTAAAAAATAATAAA
ACTTTTTTTTAAAGATGATTAAATATTTTTATTTTTTAAATTTAAGACTTCTGACGTTTG
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GTCGCTCATACATTTATACTAATGGAAATTATTTGCAGTATTATAAATTTCCCGAAAAGG
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TGGTTAACGATATGTATTAGATTATTTATTTTTTCTTTATTAAGATAATATATGTTAATC
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TGTTAGACTTTTTATTAAAAACGAATTTGAGCAGTCTTGGAGAATTTATTTGGAGCTAAA
AAACTATGAAAAAGCTTACTAATTATGTAGAAAGACAGAGAGTGAGTTTATACCTACTAT
AAGTCTTTAATATGGAAATTAGTTATTTGATTAATAAAAATACAAAGACGCAGCACGTAT
TTATTTGGAAAGTAGTTTAGGGTTTGAAGAAGTCTTTGTGAAATTTTAAGTAAATTAAAA
AAAAAAAGATTTTAGGATGAAAATTATTTAATTTATTAAATTATATAGGGAATTGATATT
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CTCTAAGAATTTTAGATTAGAGTACTTACTAATTGGCTAGCTGATTTTTATATCCACAAA
GTAACAATTCTAAATCAAAGAGTTTATGGAGCTAAAAATAAGATCCCAGCTCCAAACGAG
ATTTCAAAAGACAGTTTAATCTTAGATATGAAAGAAAGTTATGAAGTTTTAAAGAGATTT
ATGGATAAGTATCAAAAATATTTGATTGAAGATCTTATTTATGAATTGATGAGTTCATAT
GGCTAGTTAGAGCTATGCTTAAACTATGCCCTGTAAAAGGAAAATTACTAAATGGTAATC
GGTAATTACATTCACTCTGAAAGATACTCTGAAGTAATTAATATTTAATTTTTTTTATTT
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AAAACAGTATTTAAAAATTTGAACCTTCTCGTATCATGAGGAGTTTGATGGAAATTGAAA
AAGAAACTCCTTAATTTGAAGAGGGATTTTAATTTATAAAATATTGCATCAACGAAAGAA
AGCTTCGTGAATAAATTGTCCATAATATCTACATTTTTTATTTATCAGAGCACAAAGATA
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AGAGAGAATATTTCGATATGAATTTTGCTTTCAATCTAGCAAAGGCTCACAATTTTGTAA
GAGCAACAATATCTCTTTTAGCGTAAATAGAAAATATAATTATTTTAATGAGTTTTATAT
TTGAGGAGTCTCCTTATTTTTAACTCATTTTTATTAATCTAAAGAATGAAAAAATTGTTT
GAAGAAGCTGTTCAAATAGCGATTGAAAATAACATGATCGATGTAGCTATTGAATATGCT
TAGTTATCTGAGCAAATAGTTATTTATGAATCCCAGAAAACATGGATGAAAGTATTTTTA
GATTTAATTTCAAACCAAATTGTTAGATTCATAAATTTATTTAAGATAATAGAACACATG
ATGAAGACAGAATAAAATGGTCCATAAAAGATTGAAAAAATATTTGTAATTTATTTTTCA
ATTCATTCATAAATTTTTCATTTTTTTTAATTAAAAAATGTTTATTATATTCATGATTTT
CTAGGTTGAAATTTAATTATTTTCTATGTTATTTTTGTAAATTTAAGTTTTATCATTAAA
TATTTTTTGATTAAATTTAACGAAGAATGTAATGGAATAATGTGCTTATATTAAAATTGA
AGACCTAATACCTTACTTTGATAATAATATGCCTCTATCTTTGTTTAAGGGTAAGATAGA
AGAAAGTGTGAGGAGCTATTAGGAGGATATTGTTGGGTTAAAAAATGAAATTAACTATAA
AAATGAGAAATTGGAGGAATTGAAAGGAGAGCTTAGTAAGCAAAACGGGAAATACATGAG
AATAAGCGAGAAATCAACATGCTACATATGCTCTGAATTTTTATTAAATAATGACTTTAT
TACATTCCCTTGTGATCATCATGTCCACAAAAAATGTGCTATCTAATACATTTAATCTAA
GTAGCTTTATACTGCTGAAGAAATATAGGAAATAATTTCTCTTACAGAGAGAATAGCTAT
GCTTCGTAGAAATGTCAGATCGTATGATCCTAATCAAGTAAAAAAATGCATAGAATTCTA
CACTTAAGTGTATCGTTCTTTCAATCAAACAAATAATTCAAAAGAAGATTAAATCTATAA
ATATGTGATTAACTATGAAAGTGACATAGTTAAATTAAAATAATTTAATAAATAACTTGA
TGATTTGATTTGTAAAGAATGTCCTTTGTGTGGTCCTATACATGCTAGTCTTGCTTTCTA
GAACTATGAAAAAGATAATTCTTGGACTATTGAATGA


>TTHERM_00463740(protein)
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LASTNSQIYFFCKSAKELLTFDQLFKEYDNVQSMLYTMPTPASHLSFTDLCYEYDSKLRR
RCRSYIYTNGNYLQYYKFPEKEGVEEIDDNFFRTVNYFNYGKEIQTSDHKAELKVKDMPL
GVGITLYHYIILHSDSVSVLSQITQQVVFHENLTKLGKIYGMVNDMENKCYWIYGESKIV
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TERIAMLRRNVRSYDPNQVKKCIEFYTQVYRSFNQTNNSKEDQIYKYVINYESDIVKLKQ
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