Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00470470

Standard Name

PMR1 (potential mRNA regulator 1)

Aliases

PreTt22461 | 56.m00165 | 3686.m00008

Description

PMR1 hypothetical protein; Leucine-rich repeat domain superfamily

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
2238 PMR1 Tetrahymena thermophilia PMR1 (potential mRNA regulator) is homologous to proteins from the LRR_RI domain. The domain suggests that the protein is similar to Leucine rich repeat, ribonucleus inhibiter (Evalue = 7.51 × 〖10〗^(-6)). The leucine rich protein may form tight complexes with a certain ribonuclease, or may be involved in other protein-protein interactions. It is possible that the PMR plays a role in regulating the lifetime of RNA like the ribonuclease inhibitor. Paragraph provided by undergraduates at the Keck Science Department of Claremont McKenna, Pitzer, and Scripps Colleges.

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00470470(coding)
ATGTCAGTTCGACCCTAATCTGCTTAAGTAGCATCTGCTAAAAATCAAGTTTCAGCAAAT
TCAAATTTAAATCATTAGAAAGGTAACTCAATCGCTAACGGTCAAGTAAATGCAGGAGGA
GCAAGTTTAAAAAATGGAGCATCTACTTCCTCTCGTTAGAGATAGTAAGCTTAAAGTCTC
GCCATTAAGCGCAAAAAGAATTAAACTCCTTTTTCATTTTATAAGGATGTTTGTTAGAAG
CTTAACTGCAACATGAACAACGCAATCACACATGGCTTAAAAGGGGATGAATTAATTATT
AACGTTGATAACTTAACTTCACCTGATGTAGATCCAATGAGAGTTTTGCTAAGAGAATGC
GAGTTTTCTATCATTACTCTGACTGGAAATAAAGAATTTAACGAAGAAAAGTTTTATTAA
GAACATGAATAAATCATATTTAATTACCGCAATTAATCAACTATTAGCAATACTAATAGC
ATTTCAAAAATAAATTTACCTCACTAAAATAATTTTGGTATGTCTTCTAATGGATTTTAA
ACAGTAGATGAAAGAGGAAGAACTCTTAATCAAGATTTAGGATATAATGATGGGCATTAA
GGTGGTTTAACACCATTAGGAAATCACAACAGTTAGAAGTAAAGAATAGGTGATGCATCA
AACAAAAGCTAAAACAACAAGGATAATCTAGGAGGTTTTAAAAAGTTATCGAATGCAACT
GCAGAAGGGAGCTAAAATATTAAAGATGGAGCAAACAAATCTAAAAAGCAGAAGAAGAAT
TTTAGCAGTTAAACTTAGAGTTTTAATTAATTGATGCATTCAGTAGGGCTCAATATTGGA
AGAGCTTCAACTTCGGATGTTCAGCTTACAGTAGTGAAAATAATAAATTTAAATTTGAAA
GCTGAAAGTTTAGCAGCAATATGCTAAGGACTATAGAAGTCACAAACAGTGAAAGAGCTC
TACATTTAGAACTGTAATTTAAATTCTGAAACAATAGAAAAAGGAATGCTTCCATATATT
GGTGAAACTAGATCACTAAATTTGCTTGATCTCTCTTTTAATAAACTAGATGGTTAATCA
GGAGGATTAATCGGTAAGCTTCTTTCTTCACACTCTAAAAATAGAGATGAGCACATATGG
TTATGTGGCCTTAGAGGAGAAGTTCCTGAAAATAATGTAAACCTAGAAGGTATTTGTGAA
GTCAATTTAATGGGAAATTTATTAACAGATAGCAGCATCAAAGATTTATGCTACTTTTTA
TAATAAGATGGTTGGACACGTAATATAAATTTACGTTTTAATCGCATCGGAGCTGATGGT
CTTGTTGAATTAAACAAGATGCTAGATAATAATGAAAACCTAATTAGCTTAGACATACGC
AATAATCCAGGTATGACTCCTAATGCAGATGACTATTAGAAATATGGCTAGTCAATAAAA
TTTATTTCAAAGAGTATTTTTAATAGACTCCTCAACAATATTAAGGTGTTTAAATAAAAA
CACGATGATATGACAAGAAAGCAATAAGAATAAATTATTACAAACATTTTATATGAAAAT
AATAATTAGCTTCCTCCCAACATTTTCCCTTAAATTTAACAAGACGAAGCTGCTATGATG
ATGATGGCCTCTTAAAATTAATAGCAATAGTAACAGTTACAACATCCAAACCTTATACCC
CAGCAATAAAATTATTTAGGTTAGGTACCATAATAGTAGTAATAGTAGTAATTACAATTA
CAATAAGAGTAATTATATATGCAATATTAATAATAAAATTAATAACAATTAATGTTGTAG
TAGTAATAGTAGCAATAACAGGATATTAACTACCAGGCAAATTTATAAGGATAAAATTTG
TAATAGATTCAGTAAGAAATATAGGCTTAGAATGCTTAAATGTATGCTCAATAAGCAGCA
AATATACCTCAAGAGTAATAGTATAAGCACTTAGAAAATTAAGAAGATGAGTATCAAGAT
GAGGATTAGTAAGAGAAAGATTAGGAAGATGGAAATGAGGAGCTTTAATAATAAGAAGAA
TAAGGTTAAGAAGAATTACATGCTGAAGAAGGAGATGAAGAGTTAACTGAGGAGCAGCTA
TTACTAAAAGAAAAACAAAATTTTGTTTTGAGTGAGGAATTTATTGAAATTCAATAATAA
AATTTCGCAAACGAATATGGAGATAATTAAGACTTTTTAAATTTAACTCCTGAAGAGCAA
GAAATAGTTTTCTAACAATATCTTACTCATCACTAACAGTAATATTTGCTTGAACTAGAA
AATGAAGAATAAATGGAAGGAGTTTAAGAGGTTCAAGAAGAATAATATGAAGAAGATGAT
GAAGAGGACGAAAATTAACCACACGATAATCATTATAATGAATAATAGATTTATTACTAA
TAAAATGAAGCAAATAATGAAATCCATGAGGTGGATGCATTAAAAAAAAATAGTAAAGTC
TAAAATTAAGATTTTGATTAGAATAAAGATTAAGTAGAATTTCAAGAGAACGAACATGAT
GAAGAAGTTACAGAAAATAATTAAAATATTGAAGATTTTCCTTAGGAAATTGAAGAAGAA
GAGTATGATGAAGAGAAAATAAAGCAAGTTATGGATTAAATCTATTAAAATTAAAATTTA
GAGCAAATCGTTGATAAAAATTGTAAATGTTGCCTGCAATTACAAGATAAAATACTTTAA
TCTGAATACGAAAAACTGATTATACTTATTAAGTGGAATAATTGCAAAGTTCGCTTGCAG
TAAATCGAAAAACAAAATGACTCTTAAAAAGCAAGCTTAAAGCAATAAATTTAATAACTA
CAGTTAACAGCTTCATAGCAGAATTAATAATTGTAGCAATAGCAAATAGCTAATAGCTGG
TCTGCAATATAACCTAACACTATGGATTAAGAAAATAATAATTTAATAATGCATCCTGAA
AGCTTTTTACTTGGAGGTAAGCCCTAACAGTAGCTAGCCATGAATGCAAATCCTTAAGGA
AACGATTAAAATGAGGGAGAAGACAACATGTTAAACAGGATTGAAGGTCTGATGACTGAA
CTAACACGCCTTATGGATAATTTAGAAATAATGTAAAATAATGTGACTAACAATATAACT
TGCTAATTATCAAATACCACTAATACTAATAATCAAACTTACCATCTCCTTAACTCAAAT
CCTAATATTAACTTTAACAATACTTTCACAAATATTTTAGGAGGATCCCATAATAATTCA
AACATTTTACCTAGAAATGCTAATTCCAACCTTTTGAACAATTTAAATCAGTAAACAATT
ATTTAATAATAACAAACCTCCACCTTTGTTCCATCACAATCTTCAAATAATAATACTTAA
ATATAATAAGTATCTTCTACTTAAAGTGGATAAAAAAAATAGAAAAAGAATCCTTAAAGG
TAAATTGTATAGTAGTAATACTACTAATAACAACAATAATAACCTTAATAACTAATTCAA
GCATAGCAGTAGTCACAACAATAAAAATTTAGTGGACACAATAACTCTAGATGA



>TTHERM_00470470(gene)
TCTTAATTATATTAAACATAATTATAATTAAAAATATTAATAGGGTGTTACTTTTGATAA
GTCAAAAAAGTTAGTTAGCTTATTTTTTATTTTGATTAGTTTTTGAACATAGAATAAATA
TCCAAACAATTTAAAGATTAAGTAAACAGTATAAAAATGTCAGTTCGACCCTAATCTGCT
TAAGTAGCATCTGCTAAAAATCAAGTTTCAGCAAATTCAAATTTAAATCATTAGAAAGGT
AACTCAATCGCTAACGGTCAAGTAAATGCAGGAGGAGCAAGTTTAAAAAATGGAGCATCT
ACTTCCTCTCGTTAGAGATAGTAAGCTTAAAGTCTCGCCATTAAGCGCAAAAAGAATTAA
ACTCCTTTTTCATTTTATAAGGATGTTTGTTAGAAGCTTAACTGCAACATGAACAACGCA
ATCACACATGGCTTAAAAGGGGATGAATTAATTATTAACGTTGATAACTTAACTTCACCT
GATGTAGATCCAATGAGAGTTTTGCTAAGAGAATGCGAGTTTTCTATCATTACTCTGACT
GGAAATAAAGAATTTAACGAAGAAAAGTTTTATTAAGAACATGAATAAATCATATTTAAT
TACCGCAATTAATCAACTATTAGCAATACTAATAGCATTTCAAAAATAAATTTACCTCAC
TAAAATAATTTTGGTATGTCTTCTAATGGATTTTAAACAGTAGATGAAAGAGGAAGAACT
CTTAATCAAGATTTAGGATATAATGATGGGCATTAAGGTGGTTTAACACCATTAGGAAAT
CACAACAGTTAGAAGTAAAGAATAGGTGATGCATCAAACAAAAGCTAAAACAACAAGGAT
AATCTAGGAGGTTTTAAAAAGTTATCGAATGCAACTGCAGAAGGGAGCTAAAATATTAAA
GATGGAGCAAACAAATCTAAAAAGCAGAAGAAGAATTTTAGCAGTTAAACTTAGAGTTTT
AATTAATTGATGCATTCAGTAGGGCTCAATATTGGAAGAGCTTCAACTTCGGATGTTCAG
CTTACAGTAGTGAAAATAATAAATTTAAATTTGAAAGCTGAAAGTTTAGCAGCAATATGC
TAAGGACTATAGAAGTCACAAACAGTGAAAGAGCTCTACATTTAGAACTGTAATTTAAAT
TCTGAAACAATAGAAAAAGGAATGCTTCCATATATTGGTGAAACTAGATCACTAAATTTG
CTTGATCTCTCTTTTAATAAACTAGATGGTTAATCAGGAGGATTAATCGGTAAGCTTCTT
TCTTCACACTCTAAAAATAGAGATGAGCACATATGGTTATGTGGCCTTAGAGGAGAAGTT
CCTGAAAATAATGTAAACCTAGAAGGTATTTGTGAAGTCAATTTAATGGGAAATTTATTA
ACAGATAGCAGCATCAAAGATTTATGCTACTTTTTATAATAAGATGGTTGGACACGTAAT
ATAAATTTACGTTTTAATCGCATCGGAGCTGATGGTCTTGTTGAATTAAACAAGATGCTA
GATAATAATGAAAACCTAATTAGCTTAGACATACGCAATAATCCAGGTATGACTCCTAAT
GCAGATGACTATTAGAAATATGGCTAGTCAATAAAATTTATTTCAAAGAGTATTTTTAAT
AGACTCCTCAACAATATTAAGGTGTTTAAATAAAAACACGATGATATGACAAGAAAGCAA
TAAGAATAAATTATTACAAACATTTTATATGAAAATAATAATTAGCTTCCTCCCAACATT
TTCCCTTAAATTTAACAAGACGAAGCTGCTATGATGATGATGGCCTCTTAAAATTAATAG
CAATAGTAACAGTTACAACATCCAAACCTTATACCCCAGCAATAAAATTATTTAGGTTAG
GTACCATAATAGTAGTAATAGTAGTAATTACAATTACAATAAGAGTAATTATATATGCAA
TATTAATAATAAAATTAATAACAATTAATGTTGTAGTAGTAATAGTAGCAATAACAGGAT
ATTAACTACCAGGCAAATTTATAAGGATAAAATTTGTAATAGATTCAGTAAGAAATATAG
GCTTAGAATGCTTAAATGTATGCTCAATAAGCAGCAAATATACCTCAAGAGTAATAGTAT
AAGCACTTAGAAAATTAAGAAGATGAGTATCAAGATGAGGATTAGTAAGAGAAAGATTAG
GAAGATGGAAATGAGGAGCTTTAATAATAAGAAGAATAAGGTTAAGAAGAATTACATGCT
GAAGAAGGAGATGAAGAGTTAACTGAGGAGCAGCTATTACTAAAAGAAAAACAAAATTTT
GTTTTGAGTGAGGAATTTATTGAAATTCAATAATAAAATTTCGCAAACGAATATGGAGAT
AATTAAGACTTTTTAAATTTAACTCCTGAAGAGCAAGAAATAGTTTTCTAACAATATCTT
ACTCATCACTAACAGTAATATTTGCTTGAACTAGAAAATGAAGAATAAATGGAAGGAGTT
TAAGAGGTTCAAGAAGAATAATATGAAGAAGATGATGAAGAGGACGAAAATTAACCACAC
GATAATCATTATAATGAATAATAGATTTATTACTAATAAAATGAAGCAAATAATGAAATC
CATGAGGTGGATGCATTAAAAAAAAATAGTAAAGTCTAAAATTAAGATTTTGATTAGAAT
AAAGATTAAGTAGAATTTCAAGAGAACGAACATGATGAAGAAGTTACAGAAAATAATTAA
AATATTGAAGATTTTCCTTAGGAAATTGAAGAAGAAGAGTATGATGAAGAGAAAATAAAG
CAAGTTATGGATTAAATCTATTAAAATTAAAATTTAGAGCAAATCGTTGATAAAAATTGT
AAATGTTGCCTGCAATTACAAGATAAAATACTTTAATCTGAATACGAAAAACTGATTATA
CTTATTAAGTGGAATAATTGCAAAGTTCGCTTGCAGTAAATCGAAAAACAAAATGACTCT
TAAAAAGCAAGCTTAAAGCAATAAATTTAATAACTACAGTTAACAGCTTCATAGCAGAAT
TAATAATTGTAGCAATAGCAAATAGCTAATAGCTGGTCTGCAATATAACCTAACACTATG
GATTAAGAAAATAATAATTTAATAATGCATCCTGAAAGCTTTTTACTTGGAGGTAAGCCC
TAACAGTAGCTAGCCATGAATGCAAATCCTTAAGGAAACGATTAAAATGAGGGAGAAGAC
AACATGTTAAACAGGATTGAAGGTCTGATGACTGAACTAACACGCCTTATGGATAATTTA
GAAATAATGTAAAATAATGTGACTAACAATATAACTTGCTAATTATCAAATACCACTAAT
ACTAATAATCAAACTTACCATCTCCTTAACTCAAATCCTAATATTAACTTTAACAATACT
TTCACAAATATTTTAGGAGGATCCCATAATAATTCAAACATTTTACCTAGAAATGCTAAT
TCCAACCTTTTGAACAATTTAAATCAGTAAACAATTATTTAATAATAACAAACCTCCACC
TTTGTTCCATCACAATCTTCAAATAATAATACTTAAATATAATAAGTATCTTCTACTTAA
AGTGGATAAAAAAAATAGAAAAAGAATCCTTAAAGGTAAATTGTATAGTAGTAATACTAC
TAATAACAACAATAATAACCTTAATAACTAATTCAAGCATAGCAGTAGTCACAACAATAA
AAATTTAGTGGACACAATAACTCTAGATGAAAAAACAAAAAATTTAACTTTTTTTCATCA
AGTTTAATTTGATAGTAAACAAACTTACTCCGTTTTTAAAATAAAATATGTAAGAAGATT
TAACATAAATAAATATAACAATTTATTAATTAGTAGAATTAATTCATATTATAATTATTA
TTTTTAAATATAAATATAAAGCTTCTACTTTATGTTGTTTTAATTCAATAAATAAACCTG
ATTAATTTCTTGATTTTTTTTAT



>TTHERM_00470470(protein)
MSVRPQSAQVASAKNQVSANSNLNHQKGNSIANGQVNAGGASLKNGASTSSRQRQQAQSL
AIKRKKNQTPFSFYKDVCQKLNCNMNNAITHGLKGDELIINVDNLTSPDVDPMRVLLREC
EFSIITLTGNKEFNEEKFYQEHEQIIFNYRNQSTISNTNSISKINLPHQNNFGMSSNGFQ
TVDERGRTLNQDLGYNDGHQGGLTPLGNHNSQKQRIGDASNKSQNNKDNLGGFKKLSNAT
AEGSQNIKDGANKSKKQKKNFSSQTQSFNQLMHSVGLNIGRASTSDVQLTVVKIINLNLK
AESLAAICQGLQKSQTVKELYIQNCNLNSETIEKGMLPYIGETRSLNLLDLSFNKLDGQS
GGLIGKLLSSHSKNRDEHIWLCGLRGEVPENNVNLEGICEVNLMGNLLTDSSIKDLCYFL
QQDGWTRNINLRFNRIGADGLVELNKMLDNNENLISLDIRNNPGMTPNADDYQKYGQSIK
FISKSIFNRLLNNIKVFKQKHDDMTRKQQEQIITNILYENNNQLPPNIFPQIQQDEAAMM
MMASQNQQQQQQLQHPNLIPQQQNYLGQVPQQQQQQQLQLQQEQLYMQYQQQNQQQLMLQ
QQQQQQQDINYQANLQGQNLQQIQQEIQAQNAQMYAQQAANIPQEQQYKHLENQEDEYQD
EDQQEKDQEDGNEELQQQEEQGQEELHAEEGDEELTEEQLLLKEKQNFVLSEEFIEIQQQ
NFANEYGDNQDFLNLTPEEQEIVFQQYLTHHQQQYLLELENEEQMEGVQEVQEEQYEEDD
EEDENQPHDNHYNEQQIYYQQNEANNEIHEVDALKKNSKVQNQDFDQNKDQVEFQENEHD
EEVTENNQNIEDFPQEIEEEEYDEEKIKQVMDQIYQNQNLEQIVDKNCKCCLQLQDKILQ
SEYEKLIILIKWNNCKVRLQQIEKQNDSQKASLKQQIQQLQLTASQQNQQLQQQQIANSW
SAIQPNTMDQENNNLIMHPESFLLGGKPQQQLAMNANPQGNDQNEGEDNMLNRIEGLMTE
LTRLMDNLEIMQNNVTNNITCQLSNTTNTNNQTYHLLNSNPNINFNNTFTNILGGSHNNS
NILPRNANSNLLNNLNQQTIIQQQQTSTFVPSQSSNNNTQIQQVSSTQSGQKKQKKNPQR
QIVQQQYYQQQQQQPQQLIQAQQQSQQQKFSGHNNSR