Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00470500

Standard Name

TBS2 (Fusion of SEC7-family GTPase and TBC1 domain GTPase activator)

Aliases

PreTt22464 | 56.m00168 | 3686.m00011

Description

TBS2 Sec7 domain protein; Fusion of SEC7-family GTPase and TBC1 domain GTPase activator

Genome Browser (Macronucleus)

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• intracellular anatomical structure (IEA) | GO:0005622

Molecular Function

• ARF guanyl-nucleotide exchange factor activity (IEA) | GO:0005086

Biological Process

• regulation of ARF protein signal transduction (IEA) | GO:0032012

Domains

• ( PF00169 ) PH domain
• ( PF00566 ) Rab-GTPase-TBC domain
• ( PF01369 ) Sec7 domain
• ( PF06295 ) Z-ring associated protein G-like
• ( PF07813 ) LTXXQ motif family protein
• ( TIGR00162 ) conserved hypothetical protein TIGR00162
• ( TIGR00166 ) ribosomal protein S6

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_11393.1	9.997093137033517e-262
	Description: Sec7 domain-containing protein (1182 aa)
WormBase	WBGene00015164	9.997093137033517e-262
	Description: locus:ykt-6 status:Confirmed UniProt:Q9TXZ9 protein_id:CCD61825.1
Oxytricha	Contig17452.0.g48	5.0012639607461234e-61
	Description: Sec7 domain
DictyBase	DDB_G0279241	1.999981404597394e-31
	Description: DDB_G0279241 on chromosome: 3 position 1814829 to 1818189
SGD	YDR170C	3.99801309251602e-27
	Description: SEC7 Guanine nucleotide exchange factor (GEF) for ADP ribosylation factors involved in proliferation of the Golgi, intra-Golgi transport and ER-to-Golgi transport; found in the cytoplasm and on Golgi-associated coated vesicles
WormBase	WBGene00012386	7.996806159126539e-24
	Description: locus:agef-1 status:Partially_confirmed UniProt:G5EFH7 protein_id:CAA21704.3
Stentor Coeruleus	SteCoe_9424	0.000000000000012664165549094176
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00470500(coding)
ATGGTGATAATTTTGAGATTTTAGGTAATAATTCTAAAATATACTATTGAATTGGTTTAT
TTTGATTTGAAATTTATTATAGAAGATACTTTCTTTTTAATTTTCTATCTATCTATCAAA
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AATTCTAATTAGAATTCAAATGATTAACAATAAATTTAATAGTAAATAAATGGTGACACC
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AGCGAGTAAAATATAAAGTCTGATGAAAATAAAATGAATAATATTCCATAATAGAGTTAA
TAGTACCTAAATAGAAATTAATTTGACATAGATGAGAAAGATTAATTTGATATAGAAGAT
AAAAATGAATAAGGCTTTACTTTGATAACAAAAAACTAAAATAAATAATTGATAGAATCA
AATGATAATCCTTAGAACATAAACGAAGATTTGTATATAAACGAAAACTTTAACAATCTA
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ATAGATCTCAGGTTTTCATCTTTTACTATAGCCTTCAAATTTTTAACTGAAACATCTAAA
AACGTAAATGAAGAGTTTCTATTTGATACCATAGAATGCATCGATATAAATAAGTAAGAT
TATGAAAAATTTTTCACTGATTTAAAGAAATCGCAAGCTAAATCACTAATACATGAAATA
TTAGTAGAATTGTGA

>TTHERM_00470500(gene)
ATGGTGATAATTTTGAGATTTTAGGTAATAATTCTAAAATATACTATTGAATTGGTTTAT
TTTGATTTGAAATTTATTATAGAAGATACTTTCTTTTTAATTTTCTATCTATCTATCAAA
AATTAACATTAGAGTTACTTATTAAAATTTAAGAAACAAAAATTAACTTAATTTCTAATT
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AATCTTTAGAAATAAGCAAAGTAGTAATAAAATAATTCGTTTATAATTAGCCAATCCTGA
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TGACATAGATGAGAAAGATTAATTTGATATAGAAGATAAAAATGAATAAGGCTTTACTTT
GATAACAAAAAACTAAAATAAATAATTGATAGAATCAAATGATAATCCTTAGAACATAAA
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ATTTGAACAAAAATAATAAAGTAGGTACAAATAAAGATATTATAGCGAATATACTCATGT
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TCATAATGTCTAGCTTTCCACGAATGTACCAGATCCATTAGATTTTTACTCTCACAGACC
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AAGAAGCCAATATTCTGAAGGAAGAGCAAAAAAAGTAGTTAAAGAGAGATTAATTTATGA
TTGAGTTTAATACAGATCCCAACTCAGCTATCTAAAAATTAGAGTAAGACTAAAAACTCA
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AGATATTCTTAAGTTGGAATTTTTAATGAAAGCGAAATGATAAGAGAACACATAGAAGAT
TTGCAAAAAGACAAAGAAATACTATTCATTAGATTATGGAAATAGGGACTACCTCATTTT
GTTAGAAAGACTCTATATAAGCTATCTATTGGAAACAGTTTATAAATAACTCACTAATAT
TATTTAATTGTCAAGCAATAAGCTGAATAAAGTATTTTTAAATAAAGTAATAATAATAAC
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GAGTACTCTCTTTTTGATAAAATTTAATAGATGGAAGCAGATATGGTTGAGTTTTTAGAG
AAAAATCCCATCTTCAAACCTAATCATGAAGTAATTAATTTGCTATTATTTAAATTTCAT
TTGAGTATTAAGTTTTTTGAATTTTTTAAGAAAAACAAAAAAATTTCTTTAAATAAGCAC
TAAATAAAAAATTTAAAGCTAGATTTTGATATTTTAATAATAAATTATTCATTAAAATTA
ATTAGATGATATAAAACGTATTAAAATATACATTGTACGTTCGCTAGGATTTGAACTACC
TAAACTATATGATAAATATTGCAGCCTTAATTGTGAACGTTTTCTAAAATGAAAGTGATT
CATTTATATATTTCATTAATTTGATTTATAGCTATCACTTTAAGCCCTTATATAGTGGTG
ATAAAATCAAAGTAAAACAATTTAAATTTATCATCATATTTTAATTAACTATATGCTAAT
TTTAAATAAACATTTTAGATTGAGTTTTACAATTAGTTCTTTTATCAAAGCTTCTAAAAA
GAGATGAAAGATTTACATGAGAGATTCATAGGTTTAAACTTAGGGCCCTAAAATTATCTC
TATAGTTGGATGCTCTCACTATTTTCAAATTATTTTTAAGATGTCAATATAGTATATAGA
ATTTTAGATAATGTTCTAATAGAAGGTGAGTATTATATTTTTAAAGCAGCACTAGGTATT
ATAAAAATGTTTGAAATAGATCTCAGGTTTTCATCTTTTACTATAGCCTTCAAATTTTTA
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GTAATAATTCCATTTTATTATTAATTAATAAATACATTTTTTATTATTTTATAAAAGATA
AATAAGTAAGATTATGAAAAATTTTTCACTGATTTAAAGAAATCGCAAGCTAAATCACTA
ATACATGAAATATTAGTAGAATTGTGA

>TTHERM_00470500(protein)
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LVEL