Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00492460

Standard Name

TKU80 (Tetrahymena KU80 ortholog )

Aliases

PreTt04182 | 61.m00169 | 3711.m00017

Description

TKU80 Ku70/Ku80 beta-barrel domain protein; Ku70/Ku80 beta-barrel domain containing protein; component of KU heterodimer; repairs non-homologous end breaks in DNA

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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

  • double-strand break repair via nonhomologous end joining (IEA) | GO:0006303

Domains

  • ( PF00092 ) von Willebrand factor type A
  • ( PF02735 ) Ku70/Ku80 beta-barrel domain
  • ( PF03731 ) Ku70/Ku80 N-terminal alpha/beta domain
  • ( PF04212 ) MIT domain
  • ( PF08785 ) Ku C terminal domain like
  • ( TIGR00578 ) ATP-dependent DNA helicase ii, 70
  • ( TIGR02772 ) Ku protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_12939.1 9.997093137033517e-262
Description: Ku70/Ku80 beta-barrel domain-containing protein (759 aa)
Oxytricha Contig9679.0.g87 5.999773492405769e-126
Description: Ku C terminal domain like
DictyBase DDB_G0286303 2.0006821221283624e-88
Description: ku80 on chromosome: 4 position 4329334 to 4331844
Stentor Coeruleus SteCoe_28760 5.0345753587649823e-45
Description: None
SGD YMR106C 0.00000000030007160092483236
Description: YKU80 Subunit of the telomeric Ku complex (Yku70p-Yku80p), involved in telomere length maintenance, structure and telomere position effect; relocates to sites of double-strand cleavage to promote nonhomologous end joining during DSB repair

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00492460(coding)
ATGGCAGGAAAAGAAGCTACTATTATCCTATTAGATATGGGTAGTTCTATGCAATAGTAT
TTAGGTGATAGAGGAACTAATGGTTAAAAAAGAATCGAAATAGCCGTTAATTGCATAAAA
CTCTTATTATAACAAAAAATGTTTAATACAAAGACTCATGAAGTTGGACTTATTTTATTT
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GAAAAATAAATAATGGATTTAATTGAAAAGGCCAGAAAGGTTCAAACTAAAATTAATGTT
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AAAGACGATGCTGCATAAAATACCAGATAAAATTTAAATTAAAAGCTATTCTCAGTTGTT
AAAGATGAATTAGGTGAACAAATTCAACTTTTCCCTTCAGATGTTGCTATTAAAATTTAT
GAGCAGTTTAGAACTCGTCAAGTTAATCTTAGATCAAAGTTTAATGGTGATTTGTAGCTT
GCTCCTAATCTCAATATAGCAGTGCAAATGTTCACAAAAACTTCAGAGGAAAAACTCCCT
GGCTTAAAAATGTATTCATTAGCTGTTGACTTTAATCCTCATTGTGAAAGCGGATAAATC
GAGCGTGATGTAATAATGGCACTTTAAGAAGATCCAAACTTGAATCCTATTGATAAATCT
AACATAACTAAGGCATATCATTATGGAAAATAACTCATTCCTGTTACTTAAGCTTTGGAG
GCTTAAATGAATTATACTTCAAATCGTGAATTGAAGGTTTTAGGTTTTGTAGATTCCAAA
AAAGTTCCAAGATAGTCCTTTATGGCTGGTGTAGATATTATTATTGCTAATAAAAATGAT
TCTGTTGCTAAAAAAGGTATTGCTGCTCTTTGTCATAGTATGATCTAAACCAATAAATAT
GCTATAGCCCGTTATGTATGGCGTAATAATGGTGCTCCCAAGCTTTGCGTTTTGACTCCA
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AATCCTCCCGATGCTGATACTAAAATTCCTCCACTTGATCCTAATATCAGAGACTATATA
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TTTACCACTAAAGAAGCTCTCTAGTTTTTGCACTAAGAAGAAGATGTCATTTAAAATATA
CCTGAAGTAAGAAAATAAATCGAAGATTATGATATCATGGACGAACTAGAATGA


>TTHERM_00492460(gene)
ATGGCAGGAAAAGAAGCTACTATTATCCTATTAGATATGGGTAGTTCTATGCAATAGTAT
TTAGGTGATAGAGGAACTAATGGTTAAAAAAGAATCGAAATAGCCGTTAATTGCATAAAA
CTCTTATTATAACAAAAAATGTTTAATACAAAGACTCATGAAGTTGGACTTATTTTATTT
GGTCTTAAAGATGAAGGTGACGATAAAATTATGTATATCAGAGGTATAGGAAAGCCTGAT
ATTGACTTTTTAAAGAATGTTCAAGATTTGAAAGATTATTAATCTGATGAATGCGAAGGA
GGAGATATTTTTGAAGCTATTGAGCAAACAATAGATGTTATTCATGATTACGTTAAAGAA
AAAAAATATGAAAAGAAAATTCAATTGATGACAGCAGGATTTGGAAAAACCAGCTACAAG
GAAAAATAAATAATGGATTTAATTGAAAAGGCCAGAAAGGTATTTTATTTCATTCATGTT
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AATTAACTATAATTTTACTCTGATCTTTTTTTTTTTCAAAATTAATAAATTAGCATTTTA
AAAGTTTTAAAGTATATTAAACACATTTTTTTTAATTTTTCTAGGAGGGCAAGATTTATT
TTTAATTAAGTGTATTAATTGTTTCAAAATATCATTTTTTCATATCAAAAAATTTCAAAA
AATAATTATTTATTTTTCATTTATTTAATAATAGAAATATTCAAAAATTTAATATATTTT
TAAATATTTAAACAGGTTCAAACTAAAATTAATGTTATTGGTTTTGACTTCTTAAAGAAA
TATAATCCTGAAGAAAGCAATACTGATGTGTTGAAAAAAGACGATGCTGCATAAAATACC
AGATAAAATTTAAATTAAAAGCTATTCTCAGTTGTTAAAGATGAATTAGGTGAACAAATT
CAACTTTTCCCTTCAGATGTTGCTATTAAAATTTATGAGCAGTTTAGAACTCGTCAAGTT
AATCTTAGATCAAAGTTTAATGGTGATTTGTAGCTTGCTCCTAATCTCAATATAGCAGTG
CAAATGTTCACAAAAACTTCAGAGGAAAAACTCCCTGGCTTAAAAATGTATTCATTAGCT
GTTGACTTTAATCCTCATTGTGAAAGCGGATAAATCGAGCGTGATGTAATAATGGCACTT
TAAGAAGATCCAAACTTGAATCCTATTGATAAATCTAACATAACTAAGGCATATCATTAT
GGAAAATAACTCATTCCTGTTACTTAAGCTTTGGAGGCTTAAATGAATTATACTTCAAAT
CGTGAATTGAAGGTTTTAGGTTTTGTAGATTCCAAAAAAGTTCCAAGATAGTCCTTTATG
GCTGGTGTAGATATTATTATTGCTAATAAAAATGATTCTGTTGCTAAAAAAGGTATTGCT
GCTCTTTGTCATAGTATGATCTAAACCAATAAATATGCTATAGCCCGTTATGTATGGCGT
AATAATGGTGCTCCCAAGCTTTGCGTTTTGACTCCATAAATTGGTAAAGACTATGAATGC
CTTTACATGTGCTAAATTCCTACTTCTGAAAGTGTCCGCGATTTTTAGTTTAATTCTCTC
AAAGAAAGCACAAAAGAATAACAAGATTTAATGGGATCTCTTATAGACAAAATGGATTTA
ATGAATCTTGAAGATGGCGAAGAAGCATTATAGATGAAATACACTTTTAATCCTACCCGT
TAATACTTTTATTAAACTGTTTTCCATCGAGTATTTAATCCTCCCGATGCTGATACTAAA
ATTCCTCCACTTGATCCTAATATCAGAGACTATATAACTCCTGAAAAGAAGGTTTACCCC
AAAGCTGCAGAAGAGTTAAAGAAAATAAAAGAGTCTTTCTAACTTTAAGAGCAAGAAATT
AAAGACGAAATTTCAAAGAAAATTTTTTGGTAATAACTCTTTAATCCTAACTATCAAGTA
CCTGCTGCAAATATTAATGCTCCTCAAGTCTAAATTAAGATGGAAAACGGCTAGATGGAG
TCAGAAGATGTAGAACAGTAAGCTTAAATTCTTGTAGATGTAAAAGAAGAATTAGAAAAT
ATTCCTATCTCAAAGAAATTTGCTTTCGACGATTATAACAAAGACGATGTAGTACGCAAG
GTTTCATCAGTATCGCCTGTTGATGATTTCTTCAAGATGATGACAAACAAGCGCGAAGAT
CTCGTTTCTGATGCTATATCACAAATATAAGGTATGATATCTCAGTTAATAGAAACAAGT
ATCCGTGGCTCTTATTATGAAAAAGCTCTTGAATGTATCAAAGCATTTAGAAAAGGTTGT
ACTTCAGAATACGAACAGTTAGAAGCACCCAAATTTAATAATTTCCTTAATACTTTCAAA
GACAAGTTGTTAAAGTCAGATTAAAAAGGATTTTGGAAAATGCTCATATAATAAGGTATA
ACTCTAATTACAGATAAAGAAAGCACAAAATCTAATTTTACCACTAAAGAAGCTCTCTAG
GTAAACAATATTTTAATTACTTTTAACCAGTTTTGGAATTCGCTCAATATTAATCACACA
TTTAATTATAAAGTTAAATTGTAAATTTGCTTATTTTTTAATTATTATTTAATATTAAAA
GTTTTTGCACTAAGAAGAAGATGTCATTTAAAATATACCTGAAGTAAGAAAATAAATCGA
AGATTATGATATCATGGACGAACTAGAATGA


>TTHERM_00492460(protein)
MAGKEATIILLDMGSSMQQYLGDRGTNGQKRIEIAVNCIKLLLQQKMFNTKTHEVGLILF
GLKDEGDDKIMYIRGIGKPDIDFLKNVQDLKDYQSDECEGGDIFEAIEQTIDVIHDYVKE
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