Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00502180

Standard Name

RRM35 (RNA recognition motif-containing protein 35)

Aliases

PreTt08057 | 63.m00235 | 3716.m00087

Description

RRM35 RNA recognition motif protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

  • ( PF00076 ) RNA recognition motif
  • ( PF00642 ) Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_09613.1 2.0009580008310955e-119
Description: hypothetical protein (797 aa)
Tetrahymena borealis EI9_11756.1 2.0009580008310955e-119
Description: hypothetical protein (588 aa)
Oxytricha Contig22254.0.g55 5.001052752541194e-37
Description: RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
DictyBase DDB_G0275005 2.0006622580855403e-35
Description: DDB_G0275005 on chromosome: 2 position 4898014 to 4903137
SGD YER068W 9.002954397174899e-30
Description: MOT2 Subunit of the CCR4-NOT complex, which has roles in transcription regulation, mRNA degradation, and post-transcriptional modifications; with Ubc4p, ubiquitinates nascent polypeptide-associated complex subunits and histone demethyase Jhd2p
WormBase WBGene00003827 9.997975313387782e-28
Description: locus:ntl-4 status:Partially_confirmed protein_id:CDM63496.1
Tetrahymena borealis EI9_16870.1 9.997975313387782e-28
Description: hypothetical protein (758 aa)
Stentor Coeruleus SteCoe_35204 0.00000000003775134544279098
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00502180(coding)
ATGAGTGAAAGCGAAGATACAGTTATATGTAGTTATTTATACTTTTATTATTTGTTATAA
ACAGTTTAAAAAGGTAATCAATAGGTTGTTCAGCAATCTTAATAGGAGTAAATATCTTAT
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CATTAATTACTTGAGCAAAAAATAATACAAGATTAATAAAACTAAGAAAAAAATCCATTC
TATTATTATGAAAGCGAGTAAAATAGCTTTTAAGAGCTATGTTCTGGCTTTAATACGTTT
GTTTTAACTAAATTTTATTGA


>TTHERM_00502180(gene)
ATGAGTGAAAGCGAAGATACAGTTATATGTAGTTATTTATACTTTTATTATTTGTTATAA
ACAGTTTAAAAAGGTAATCAATAGGTTGTTCAGCAATCTTAATAGGAGTAAATATCTTAT
AACAGCCCTCTGAAACTCAATTAAAAAGTAATTTTTTTAAACAATTTTATATTTGATTAG
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TAAGCAATTAAAAATAATATTTAGATTTTGCAGTCTTACCAGTACTTTGGATAATATGGA
AACATACAAAAAATTGTTGTCAACAAAAACAACATATATAATCCTAAAGGACCTAATGGA
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GTATATATTATTTAATACAAAATAAATTTGTTTATAAAGTATCTATCTTGAAAAGGGTGC
AGAGAACTTCAAAATTTTTGATAGAATAATTAGAGCCTCTTATGGAACAACGAAATATTG
CAGCTTCTTCCTGAAAAATTTAGATTGCCCTAATATACCAGATTGCCTTTACCTTCACTC
ATACGAAAAAGATGATGACTACTTCTCAAAAGATGAAATGGTCAGCAATAAAAATATATT
CATCGATCAACAGAAAATAGCTATTAAACATGTTAAAAAATATATACCAGAAATATTGAG
TGAGTATTAATAAAATAAAAGTTTTTATGAGTCTCAATCTCATATCTTTGCTCTACCAAA
TCTATCAAAAATAATAGATAAACTAAAAGAGTATTCCGCAATTACAAATGAGTAGTATTT
AGCTTGTAGAGAATATTAGCAAATCCCAAATACTTTTGTTTTGAGTATTTTTTTTAATTA
ATTTTATTGGAAATTTTAATTATTTTTGGAAAATATAGGTTAGTTTTTGCCAAATGTAAT
AAATTAGCATGGATTAAATAACTCTTACAGCTCTTTTATAGCTTAAAACACTGTTGTACC
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TTCTTAAAATCAAGAAAGTCTCACTACAACAACCTCTAGTTGCTTTAATAGATAACAATT
TTATTATCAAAAAAAAAATAATTTCTTGTCTTAGAGTGCTATGAGTATAAATTAGGGTAT
TTATAGCAATGCTACTTAAAATTAATCACATTTTTCTTATTATTATCCTTCATCTCCTCC
TATTAAAACATAATATTTTACAGCACAATAATCTTAAAGCGAGTATTTAAACACAAAATA
TTGTTAATATGAATTAGTTAATCAAACCCCTTAAGTTACTCCATTTGAAATAAATGATCA
ATAAAGTAAATAAGATAGTGCTTAATAGAAAATTATCCAATAAAAATTTGATAATTTTCC
ACATCCTCACCATAATAATTTTAATATTTATCAGCAAAATAACGATAATTTAAAATTTGT
TTAACCTAACGATGACAAGTCAAACTTTAGGCTCTAGTAAGACAATTCAAATATGAGTAA
ATAAGAATTTTCAAAGCTTAATTACTCTTATGAAAAAGATAAAATAGCTGAGTTGACTTC
TGAAGACACAACTTAAGTTTCAATGGAATGCTCTCAAGCTGATAACAATTGTGCTTCTCA
AAATTAGGAAAAAAATTTTAAATCTGAAATTGAAAGCTATTCAAACAATTAGTATTCAAC
TTTAACTGAGACAAATAAGGAGTTAACAGACACTCAAAGCTAATATAGTATCGAAGACGA
TCTTAATGCTATTTAATCTGAAACTTTGTAGATTTAAAATAGTAAAGAAGATTATTTTCA
CAAAATGCTTAATAAAAAAAAATCTTTGAACTAAATTTAAAGTCAAGTTGCTCACCTTTC
TAAAAAATCTAGTCACTCAATAAAATCCAATTACTCTTTAGGAGAATCAAATGAAGAAGA
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TAAAGGAGAAGGAAACAGCATATCTTAAAATAAGTTTGATTCTGGAAGTAAGACAATAAA
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ACAAATTCTTTTAAAACAGCAAAATAATTGCTTAGGATAAGAGTCTGAAAACGAAAAACA
TTAATTACTTGAGCAAAAAATAATACAAGATTAATAAAACTAAGAAAAAAATCCATTCTA
TTATTATGAAAGCGAGTAAAATAGCTTTTAAGAGCTATGTTCTGGCTTTAATACGTTTGT
TTTAACTAAATTTTATTGA


>TTHERM_00502180(protein)
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KQEFSKLNYSYEKDKIAELTSEDTTQVSMECSQADNNCASQNQEKNFKSEIESYSNNQYS
TLTETNKELTDTQSQYSIEDDLNAIQSETLQIQNSKEDYFHKMLNKKKSLNQIQSQVAHL
SKKSSHSIKSNYSLGESNEEETNKIQEIQLNQKCECDSLPVKGEGNSISQNKFDSGSKTI
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