Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00502600

Standard Name

PARP6 (Poly [ADP-Ribose] Polymerase 6)

Aliases

PreTt08099 | 63.m00277 | 3716.m00129

Description

PARP6 WGR domain protein; WGR domain containing protein; abundant protein associated with RNA polymerase II

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External Links

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

  • ( PF00023 ) Ankyrin repeat
  • ( PF00644 ) Poly(ADP-ribose) polymerase catalytic domain
  • ( PF02178 ) AT hook motif
  • ( PF02877 ) Poly(ADP-ribose) polymerase, regulatory domain
  • ( PF04086 ) Signal recognition particle, alpha subunit,
  • ( PF05406 ) WGR domain
  • ( PF09151 ) Domain of unknown function (DUF1936)
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
  • ( TIGR01396 ) flagellar basal-body rod protein FlgB
  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01738 ) Micronucleus: PAR1 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette.
  • ( SD01783 ) Micronucleus: GCP3 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette.

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_09552.1 9.997093137033517e-262
Description: WGR domain-containing protein (2622 aa)
Oxytricha Contig20797.0.g56 3.001476460448119e-154
Description: Ankyrin repeats (3 copies)
DictyBase DDB_G0291788 9.99679536751975e-103
Description: adprt3 on chromosome: 6 position 795337 to 803296
WormBase WBGene00004053 6.997942222381785e-66
Description: locus:pme-5 Poly(ADP-ribose) polymerase pme-5 status:Partially_confirmed UniProt:Q9TXQ1 protein_id:CCD69563.1
Stentor Coeruleus SteCoe_33275 1.1379798735078682e-50
Description: None
SGD YIL112W 0.000000000010004361180063202
Description: HOS4 Subunit of the Set3 complex, which is a meiotic-specific repressor of sporulation specific genes that contains deacetylase activity; potential Cdc28p substrate

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:34086947: Nabeel-Shah S, Garg J, Saettone A, Ashraf K, Lee H, Wahab S, Ahmed N, Fine J, Derynck J, Pu S, Ponce M, Marcon E, Zhang Z, Greenblatt JF, Pearlman RE, Lambert JP, Fillingham J (2021) Functional characterization of RebL1 highlights the evolutionary conservation of oncogenic activities of the RBBP4/7 orthologue in Tetrahymena thermophila. Nucleic acids research ( ):
  2. Ref:30796450: Ashraf K, Nabeel-Shah S, Garg J, Saettone A, Derynck J, Gingras AC, Lambert JP, Pearlman RE, Fillingham J (2019) Proteomic analysis of histones H2A/H2B and variant Hv1 in Tetrahymena thermophila reveals an ancient network of chaperones. Molecular biology and evolution ( ):

Sequences

>TTHERM_00502600(coding)
ATGGCTGATAAAGGAATTTTTATTTACGCAGTCAGAGATGAAGACAGCATGCAAGGCTTC
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>TTHERM_00502600(gene)
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GCTGCCGTTAAGGAATTCAGTAAAATTTTCTACTAAAAGGTAACTTAAATTCAAACTTTA
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TCAAATAAGCATATCGCCAATTTGCCCTTTCTGACTAATATCTTCCCATAACTAAGCTAT
CAAAAGCAGCCTTAATTGAAGCTTAGGGCATTCTTGCAGATATTAGAGAAGAAGTCATAG
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