Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00502600

Standard Name

PARP6 (Poly [ADP-Ribose] Polymerase 6)

Aliases

PreTt08099 | 63.m00277 | 3716.m00129

Description

PARP6 WGR domain protein; WGR domain containing protein; abundant protein associated with RNA polymerase II; WGR domain

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00023 ) Ankyrin repeat
  • ( PF00644 ) Poly(ADP-ribose) polymerase catalytic domain
  • ( PF02877 ) Poly(ADP-ribose) polymerase, regulatory domain
  • ( PF05406 ) WGR domain
  • ( PF12796 ) Ankyrin repeats (3 copies)
  • ( PF13637 ) Ankyrin repeats (many copies)

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01738 ) Micronucleus: PAR1 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette.
  • ( SD01783 ) Micronucleus: GCP3 gene partially replaced by neo4-KanR2 cassette.

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:34086947: Nabeel-Shah S, Garg J, Saettone A, Ashraf K, Lee H, Wahab S, Ahmed N, Fine J, Derynck J, Pu S, Ponce M, Marcon E, Zhang Z, Greenblatt JF, Pearlman RE, Lambert JP, Fillingham J (2021) Functional characterization of RebL1 highlights the evolutionary conservation of oncogenic activities of the RBBP4/7 orthologue in Tetrahymena thermophila. Nucleic acids research ( ):
  2. Ref:30796450: Ashraf K, Nabeel-Shah S, Garg J, Saettone A, Derynck J, Gingras AC, Lambert JP, Pearlman RE, Fillingham J (2019) Proteomic analysis of histones H2A/H2B and variant Hv1 in Tetrahymena thermophila reveals an ancient network of chaperones. Molecular biology and evolution ( ):

Sequences

>TTHERM_00502600(coding)
ATGGCTGATAAAGGAATTTTTATTTACGCAGTCAGAGATGAAGACAGCATGCAAGGCTTC
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GGTAATCCAATCAAAACTAGAAGAAGATAAAACTATTCTAGCTATGGAAGCAGATACTTA
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>TTHERM_00502600(gene)
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TATTGAAGATGCCAATGGTAATACTCCATTAGCTGTCGCTTTCCGTTTCAAAAGAAGTGA
AATTACTACTACCCTTATTCAAAATGGTGCTAATACTTCAAAGTTCATAACTATTAACAA
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GGGTAATCCAATCAAAACTAGAAGAAGATAAAACTATTCTAGCTATGGAAGCAGATACTT
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TGCTTTAGAGGATGCCATTAAAATTGATCTTTATTAACTTTCAATCACTCTTCTTTTTAA
GTATCCAGAAGATGAAACGATTACTTAATGTAATAGCGAAGGACAAAACCTGATACACAT
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ATTCTACATCATGTAAGTTATTCATGATAAAAATTCAGACGTTTATATTCTTTACACTCG
TTGGGGTCATATGGGTGGTATGGGTCAAATGCAACACACTCCTTTTGCTACCAAAGAAGC
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AATAAGAGATTGAAATAATTTAATAAATTTTTATAGATTGTATGATAATAAAATAAAGAA
AATAAAACATTTTTTAAATTTTTAAATAAAGTAGTAACTTATACT


>TTHERM_00502600(protein)
MADKGIFIYAVRDEDSMQGFILVASEVDIDVENSKAEKVGVYHIHSVKNKPYNYTVNKKL
TNVRLDEFMSVVDEDLYEFNEKNRTLVFDKKGYDNLIGQLMDDLEEENDDDSSEEEEKKK
KKPAPKAASARKTRSSKGSDKVKGSDSESYEAADEEDEEEKKRSRGRPKKNKSTEEITED
KDENSQEDQPKPKGKRGRPPSKDKAASVAVPKKQDKQDDKDGEENGEDQNGHEENGDEDK
EEGEQKRVPGKRGRKPGKKTAETPAKKEAQQNIIHNRKPQVFLIQRPGKRGRKPAKKGSE
SEDNEDADDEQEEVSKKGAKKKVEKYKKGSHNPNIPDVVKTDETFEGDSQDINDVCCSFC
TNRELLRAVYTGNSNLLKKLVQSKAKVSTLFAKRGPDADETTLEIILKNKDKKCLDVLIN
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