Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00529660

Standard Name

PRP10 (Pre-mRNA Processing factor 10)

Aliases

PreTt04635 | 67.m00150 | 3684.m00020

Description

PRP10 splicing factor 3B subunit 1; Splicing factor 3B subunit 1

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External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00514 ) Armadillo/beta-catenin-like repeat
  • ( PF02985 ) HEAT repeat
  • ( PF07498 ) Rho termination factor, N-terminal domain
  • ( PF07813 ) LTXXQ motif family protein
  • ( PF08064 ) UME (NUC010) domain
  • ( PF08920 ) Splicing factor 3B subunit 1

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_34116 0
Description: None
WormBase WBGene00011605 9.997093137033517e-262
Description: status:Partially_confirmed UniProt:G5EEQ8 protein_id:CAA90777.1
Tetrahymena borealis EI9_13683.1 9.997093137033517e-262
Description: splicing factor 3B subunit 1 (1221 aa)
DictyBase DDB_G0275957 9.997093137033517e-262
Description: sf3b1 on chromosome: 2 position 6197621 to 6200891
Oxytricha Contig16616.0.g9 9.997093137033517e-262
Description: Splicing factor 3B subunit 1
SGD YMR288W 9.997093137033517e-262
Description: HSH155 U2-snRNP associated splicing factor that forms extensive associations with the branch site-3 splice site-3 exon region upon prespliceosome formation; similarity to the mammalian U2 snRNP-associated splicing factor SAP155
WormBase WBGene00000764 9.997093137033517e-262
Description: locus:coq-4 Ubiquinone biosynthesis protein coq-4, mitochondrial status:Confirmed UniProt:P91428 protein_id:CCD67787.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00529660(coding)
ATGAGTAATAAAGGTAGCTCAAATCAATTCGTTGATGATGATGGAAGAGAAATTCCAGGA
TAAAAGCCAGTCAAAAAAAGATTTGCATATAATGCTCCGGAAGAATTAATAGAAGAAGCA
AAGATGTAAGGAGCAGATAACGATGATAATGATGATTTATTCAAAAAGAGTTAACAAAGA
GTTACTGATACTCAAAATTCATATCAGTTAAGACAATAAAATAGATAACTTTAGTAAAAG
AGTTATGATGCATTTGCTGATGGTGGTAAATCGCCAGATGAGAATTCAATTAAATTTTCA
GAGAGATTAAAGGAATAAAAGCTTGAAAACGAAAGGGTAGCGTTAGAATAAAAAATAGTT
AAAGAAGCTCAATAAGCTGAATACAATAGTAAGTTTTCAAGTGTACCAACCTAAGTAAAC
TAAAATGCACCTTTAAGATAAGCTAACACTTCAAAAGGTTCATCCAAATTTAGTGATGTT
GATACCGATACTTCTTTTTCAAGTGGCGCTATGTCTGCTAACAGAATGGGATCAAAATGG
GGAGAAACTCCTAAGAGATAAAGTGGTTTTGAACAATCTACTCCTGTAAAGAGACAAAGA
TGGGATATGACACCTTAATAAAGTGGAGGTTTTGGATAAACTCCTTAAAAAGTTGGTGGT
ATGTTTGGTGAAACACCTACACCTGGTCACTTAATCTAAGGTACACCAAGCAGATTTGGT
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AATATATAAACACCTTTAGGAGGTTATATGGGTATTACACCTACTCCTGGTGGTTTATAT
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ATGAGATAGTTTTTAATGTCATAATAAACTCCGTCAATGACACCCATGGGTTATTAAATC
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GAGTTAACTCCTGAGGAATTGAAGAAGAGAAAAATAAAAGAATTATTGCTCAAAATTAAA
AGAGGTACTCCTTAAATGAGAAAATCTGCTTTACGTTAAATTACTTAAAATGCAAGAGAG
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TTAGTCCGTCCTCATGTGCATAATATTTTGGTCGTTATTGAACCCTTGCTTATTGATGAA
GATTATTACGCTCGTGTTGAAGGTCGTGAAATTATTTCTAACTTAGCTAAGGCTGCCGGT
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AATACAACAGCTCGTGCATTTGCCGTCGTCGCAAGTAGTTTAGGTATTTCATCTATGTTA
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AAAATCGTTTAATAAATTGCTATCTTGATGGGTTGCGCTATTCTTCCTCATCTTCGTTCA
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AGTCTTGCTCTTGCTGCCTTAGCAGAAGCTGCTACTCCTTATGGTATCGACGCTTTTGCT
AGTGTGTTAATTCCTCTTTGGGAAGGTATTACATAGTACAAGGGTAAAAGTTTAGCTGCC
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AAAATTGTATTAAAAGTAGTAAAGTAGTGTGTTAGTTGTTAGGGTGTTGATGCACAATAC
GTCCGTGAGCATGTTGTACCAAAGTTTTTTGAACAATTTTGGGTATCTCGTATGGCAACT
GATAAGAATTCTCGTTAACTTATTGATACTACTATTGAAATTGCTTCCAAAGTTGGAGGT
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GCTTTAGAATAATAATTAATGGATGGTATCATCTCTGCTTTCCATGAACAAAATAGTGAA
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CGTGTCCGTCAATAAGCAGCTGATCTAATTTCTCGTATAGCTTCTTGTATGAAGAATTGC
AGTGAAGAGAATAGACTTGGTAATTTAGGTCTTTTGTTGTATGAGAGTTTGGGTGAAGAA
TATCCTGAAGTCCTTGGTTCTATCCTTGGTGGTTTGAAAGCAATAGTAAATGTCATAGGT
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AATAGACATGAAAAAGTTTAAGAAAACTCTATTGATTTAATAGGTAGAATTTCAGATAGA
GGAGCTGAGCATGTTTCTCCTAAAGAATGGATGCGTATATGTTTCGATTTACTTGATCTT
CTTAAGGCACATAAAAAGGGTATTCGTCGTGCTACAGTCAATACATTTGGTTATATTGCT
AAAGCCATCGGTCCATAGGATGTTTTGGTTACTTTATTGAATAACTTGAAGGTCTAAGAA
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GGTGTATTAAAATCTTTATCATTCATGTTTGAATATATTGGAGAAATGGCAAAGAATTAT
ATTGCCGCTATAATTACTCTTCTAGAAGATGCCTTGGTAGATCGTGATCCAGTTCATCGT
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GATTGCTTAATCCACTTACTCAACTTCATTTGGCCTAACATTTTTGAAACATCTCCTCAC
GTCATCACCGCTATGACCGAAGCTATAGATGCCCTTCGTGTTGCATTAGGACCTGGAGTC
ATATTACTTTATCTTCTTTAAGGATTGTATCATCCAGCTAAAAGAGTTAGACAAGTATAT
TGGAAGTTGTATAACATGATATATGTTGGAAGTTAAGATGCTCTAGTTGCATTTTTCCCA
ACACTTGAAGATGACGAAGGAGAAGATAGAAAACAGTATTCATACTCCAGAAATGAACTG
CAATTAATGCTCTGA


>TTHERM_00529660(gene)
ATGAGTAATAAATATTCTATTTATTCAAAATAACTTTTACATACAAATCAATAGAGATTT
TATGAGCTAGATTAAACGTATACTAATAAGTATTTTGTATTAATAGGTAATAAAGGTAGC
TCAAATCAATTCGTTGATGATGATGGAAGAGAAATTCCAGGATAAAAGCCAGTCAAAAAA
AGATTTGCATATAATGCTCCGGAAGAATTAATAGAAGAAGCAAAGATGTAAGGAGCAGAT
AACGATGATAATGATGATTTATTCAAAAAGAGTTAACAAAGAGTTACTGATACTCAAAAT
TCATATCAGTTAAGACAATAAAATAGATAACTTTAGTAAAAGAGTTATGATGCATTTGCT
GATGGTGGTAAATCGCCAGATGAGAATTCAATTAAATTTTCAGAGAGATTAAAGGAATAA
AAGCTTGAAAACGAAAGGGTAGCGTTAGAATAAAAAATAGTTAAAGAAGCTCAATAAGCT
GAATACAATAGTAAGTTTTCAAGTGTACCAACCTAAGTAAACTAAAATGCACCTTTAAGA
TAAGCTAACACTTCAAAAGGTTCATCCAAATTTAGTGATGTTGATACCGATACTTCTTTT
TCAAGTGGCGCTATGTCTGCTAACAGAATGGGATCAAAATGGGGAGAAACTCCTAAGAGA
TAAAGTAATCATTTTTACTTACTTTATTGAATATTAAATTTCAGTTGATTTTAAAAATAT
TTCATTTTTTTTAAGATCAAATCAAATTAATTTTTAAGAATGCCTCAATATTTATTTCTG
AGTCATTTAAAAATAAATAGATATATAAATAAATAGATAGATAGATACTATTTATATTCA
AAAGTATTTAAATTAATACTTTCTTTAAAAAGATATCTCATGAAAGATTTTTTAAATTTG
ATTTGATTTGAACAAATTTTTTTAATATATTCAGAATTTTTAAATTAATTTTATTTTTTA
TAAAAAAGGTGGTTTTGAACAATCTACTCCTGTAAAGAGACAAAGATGGGATATGACACC
TTAATAAAGTGGAGGTTTTGGATAAACTCCTTAAAAAGTTGGTGGTATGTTTGGTGAAAC
ACCTACACCTGGTCACTTAATCTAAGGTACACCAAGCAGATTTGGTGAAACCCCTACTCC
TAAAAGAAGTACCACACGTACTCGTTGGGATGAATAAACTCCTAAAAATATATAAACACC
TTTAGGAGGTTATATGGGTATTACACCTACTCCTGGTGGTTTATATACTCCCTAAAATCA
ACCCAATTTAACTCCTGAATAAATTATGAATCTTAAATAATTACAAGCTAATGAAATGAG
AAATAGACCTCTCACTGATGAAGATCTTGATCAAATGTTACCTGGACCTGGAGACGGTTA
TGAAGTAAAAATTCTTTTCACTAATTCACTAACATAAAATTATGAGAGTAATAATCGAGT
AGACTTGAAAAAATTTTTCTATCTTAAAAAATATTATTAAATAATCAATTTTATTTTTAT
TAAAAAAATAAAATCAGTAAAAATAAAAAAAATATTTTAATTTTAATTTAAAATAAATGC
TTTCGTTGTCGTGATAAAAACACTTCTTTTATAAAAACCTTAGCATTTTCAACAGAAACC
CTCTCAGAGAGCAATTAGAAAATATTTTTATCCTTTCTCCTATTAATTATCTCCATGGTT
AGATACATCTAAGTCTATATGTATATGGAAAATTTGACACAAGTAAAATATGTGAAAGGG
AGATCAACAAACTAGAAACATTGAGCGATTGATGATGGTTGAAGAAAAGTAGGAGAGATA
AATTTAAAATAATGTGGATATGTTAGTTCTTTATGATCTATATAAAAATAAGAATAAAAG
CAAAATAAGTTATATGAATAATTAAAAAAACAACATTTTGAATATTTGAAGCTTTCATAT
TCTCAAAAAAAATGCACCCAATTTGCTATTTAAGTTGGCAGATAAACAAATAGATAGATC
TAATGAATCATCATCTAATCTAACTCGATTATAACTCCACTCTTTTGACTTTAAGTAGCT
TTTATTTAATTTTTTTTTTATTAATTTAAATAGATTGTTAAACCACCAGATAGCTACAAC
CCTCCTAAAAATATGATGAGATAGTTTTTAATGTCATAATAAACTCCGTCAATGACACCC
ATGGGTTATTAAATCCCTGATGAAATGACTAAGCCTATTGAAGTTCCTCAATCTCCAAGC
ATAAATGGTTTGCCTTCAATTAAACCTGAAGACTTGGCTTATTTTGGAGAGTTATAAAAC
CCTGTCAATGAATCAGAGTTAACTCCTGAGGAATTGAAGAAGAGAAAAATAAAAGAATTA
TTGCTCAAAATTAAAAGAGGTACTCCTTAAATGAGAAAATCTGCTTTACGTTAAATTACT
TAAAATGCAAGAGAGTTTGGTGCTGATCTTTTGTTTAACGATATTTTGACTTTGCTTATG
TCTCCAACACTTGAAGTACAAGAACGTCACTTGCTTGTTAAAGTCATTGATCGTATTCTC
TACAAATTAGACGATTTAGTCCGTCCTCATGTGCATAATATTTTGGTCGTTATTGAACCC
TTGCTTATTGATGAAGATTATTACGCTCGTGTTGAAGGTCGTGAAATTATTTCTAACTTA
GCTAAGGCTGCCGGTTTACCTACTATGATTAAAACACTCAAGCCTGATATTGACCATAAT
GATGAATTCGTACGTAATACAACAGCTCGTGCATTTGCCGTCGTCGCAAGTAGTTTAGGT
ATTTCATCTATGTTACCTTTCTTAAAGCCTGTCTGCAAAAGTAAAAAAAGTTGGTACACC
CGTCACACTGGTATTAAAATCGTTTAATAAATTGCTATCTTGATGGGTTGCGCTATTCTT
CCTCATCTTCGTTCACTTGTTGAAATTATTGAGCTTGGTTTAAAAGATGAACAAAATAAA
GTGAGAACAATTACAAGTCTTGCTCTTGCTGCCTTAGCAGAAGCTGCTACTCCTTATGGT
ATCGACGCTTTTGCTAGTGTGTTAATTCCTCTTTGGGAAGGTATTACATAGTACAAGGGT
AAAAGTTTAGCTGCCTTCCTTAAGGCTATTGGCTTTATCATTCCATTGATGGATGCTGAC
AGAGCTCTCGAATACACTAAAGAAGTAATGGAAATATTGAAAAATGAATTTTCAAATCCT
GAAGAAGAAATGCGTAAAATTGTATTAAAAGTAGTAAAGTAGTGTGTTAGTTGTTAGGGT
GTTGATGCACAATACGTCCGTGAGCATGTTGTACCAAAGTTTTTTGAACAATTTTGGGTA
TCTCGTATGGCAACTGATAAGAATTCTCGTTAACTTATTGATACTACTATTGAAATTGCT
TCCAAAGTTGGAGGTGCTGAAATTCTTGAAATTATAGTTCCTCACTTAAAATCAACTAGT
GAAGCTTATCGTAAAATGGTCATGGAGACTATTGAAAAAATAGTAGCAGCCCTTGGTGTT
TCTGACGTTGATAACGCTTTAGAATAATAATTAATGGATGGTATCATCTCTGCTTTCCAT
GAACAAAATAGTGAAGATACTGGTACCATGCTTAATGGTTTCGGTACTTGTGTTAACGCT
TTAGGCTAACGTGCAAAGCCTTATTTCTCTTAAATTTGTGGTATTATATAATGGCGTCTG
AATAACAAGAGTGCTCGTGTCCGTCAATAAGCAGCTGATCTAATTTCTCGTATAGCTTCT
TGTATGAAGAATTGCAGTGAAGAGAATAGACTTGGTAATTTAGGTCTTTTGTTGTATGAG
AGTTTGGGTGAAGAATATCCTGAAGTCCTTGGTTCTATCCTTGGTGGTTTGAAAGCAATA
GTAAATGTCATAGGTATGAATAAAATGACACCACCAATAAAAGATCTATTACCTCGTCTT
ACTCCAATTTTGAAAAATAGACATGAAAAAGTTTAAGAAAACTCTATTGATTTAATAGGT
AGAATTTCAGATAGAGGAGCTGAGCATGTTTCTCCTAAAGAATGGATGCGTATATGTTTC
GATTTACTTGATCTTCTTAAGGCACATAAAAAGGGTATTCGTCGTGCTACAGTCAATACA
TTTGGTTATATTGCTAAAGCCATCGGTCCATAGGATGTTTTGGTTACTTTATTGAATAAC
TTGAAGGTCTAAGAAAGACAACTTCGTGTTTGCACAACAGTAGCTATTGCTATCGTAGCA
GAAACATGTGGTCCCTTCACAGTCCTCCCTGCTTTGATGAATGAATATCGTGTCTAAGAA
TTGAATGTTTAAAATGGTGTATTAAAATCTTTATCATTCATGTTTGAATATATTGGAGAA
ATGGCAAAGAATTATATTGCCGCTATAATTACTCTTCTAGAAGATGCCTTGGTAGATCGT
GATCCAGTTCATCGTCAAACTGCAGCCTCAGCAGTAAAACATTTAGCTCTTGGTGTTTCC
AATCTTGGATGTGAAGATTGCTTAATCCACTTACTCAACTTCATTTGGCCTAACATTTTT
GAAACATCTCCTCACGTCATCACCGCTATGACCGAAGCTATAGATGCCCTTCGTGTTGCA
TTAGGACCTGGAGTCATATTACTTTATCTTCTTTAAGGATTGTATCATCCAGCTAAAAGA
GTAATCAATTTTTTATTCAGCTTTAACATTTGAATTTAGAAAGTTTTTTGCAAATTCTTT
CTACACTCAAGAAGAATTATATTTCATTCGTTTTTTTTTTATGATATAGGTTAGACAAGT
ATATTGGAAGTTGTATAACATGATATATGTTGGAAGTTAAGATGCTCTAGTTGCATTTTT
CCCAACACTTGAAGATGACGAAGGAGAAGATAGAAAACAGTATTCATACTCCAGAAATGA
ACTGCAATTAATGCTCTGA


>TTHERM_00529660(protein)
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RQLRVCTTVAIAIVAETCGPFTVLPALMNEYRVQELNVQNGVLKSLSFMFEYIGEMAKNY
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VITAMTEAIDALRVALGPGVILLYLLQGLYHPAKRVRQVYWKLYNMIYVGSQDALVAFFP
TLEDDEGEDRKQYSYSRNELQLML