Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00530720Standard Name
Aliases
PreTt04735 | 67.m00250 | 3684.m00120 | MicNup98B | Nup96Description
nucleoporin putativeGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- nuclear pore (IEA) | GO:0005643
Biological Process
- transport (IEA) | GO:0006810
Domains
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_13582.1 7.001655022813022e-178 Description: nucleoporin autopeptidase (1921 aa) SGD YMR047C 0.000000000006001570085597868 Description: NUP116 Subunit of the Nup82 subcomplex of the nuclear pore complex; localized to both sides of the pore; contains a repetitive GLFG motif that interacts with mRNA export factor Mex67p and with karyopherin Kap95p; homologous to Nup100p Oxytricha Contig19821.0.0.g58 0.000000100009565553302 Description: Nucleoporin autopeptidase WormBase WBGene00003796 0.00000019998969434520019 Description: locus:npp-10 Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96 status:Confirmed UniProt:G5EEH9 protein_id:CCD70955.1 WormBase WBGene00018847 0.00000019998969434520019 Description: locus:marc-6 status:Partially_confirmed UniProt:Q400N4 protein_id:CCD66836.1
General Information
No. Gene Name(s) Paragraph Text 89 (no standard gene name) The first 2769 bp and later 3243 bp of TTHERM_00530720 (6012 bp) were expressed for MicNup98B and Nup96, respectively.
Associated Literature
- Ref:25788697: Iwamoto M, Koujin T, Osakada H, Mori C, Kojidani T, Matsuda A, Asakawa H, Hiraoka Y, Haraguchi T (2015) Biased assembly of the nuclear pore complex is required for somatic and germline nuclear differentiation in Tetrahymena. Journal of cell science 128(9):1812-23
- Ref:19375312: Iwamoto M, Mori C, Kojidani T, Bunai F, Hori T, Fukagawa T, Hiraoka Y, Haraguchi T (2009) Two distinct repeat sequences of Nup98 nucleoporins characterize dual nuclei in the binucleated ciliate tetrahymena. Current biology : CB 19(10):843-7
Sequences
>TTHERM_00530720(coding)
ATGATAAACAATCTGTTTGCGAATAATAACACTAACTAGCCAAATATATTTCAGAATAAT
AATAACTAAAACAACAATAATAATAGCAGTAATATCTTTAATCGCAGCGGCTAGAACATA
TTCCAGTCATAGAATAATAACGGATAAGTAAATATCTTTAACGCCAATAATAATAATAAT
TAAGTAGGATACTAGAACTAGAGTTAAAACATCTTTTAGCAAAATAGTAACATGAATAAT
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GGTGGAGCTTAAAATAATAATATTTTTAACAACAATAACTAAAATATGTACTAAAACAGT
AATAACCCTAATGCTTTGATAGGTTCTTAAAGAGGTAAGTATGAATTAACAAAATCTCCT
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GCATTAAATAAAGACATTCGCATGGTTTAAAGTTAATATGTAGGTAATGTGAATAATAAT
AATAATATTTTTAACAATAACAACAATAACGGTAATAATAACAATATATTTGCAAATAAT
AACAATGTAAACAACTCAGTTAATCGGAACATTTTTAATAACAACAACATTAGCACTAAC
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AATAATGGAGGAAATATCTTTTCTGGAAATAATAATTAGAATAATAATGTAAATAACATA
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AACAGCACTAATAACACTAGCAATATTTTCTAAAATAATAATACAAATATGGGAAACAAC
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TGTAAAGACCATTTACTAAAAATGGGTAAAATGAAAGAAGACTCTCGTCCTTACTCATTT
TAAATTTATTATGATGGAAGTCTCATTAGAAACCAAGAATTACTAGCAAGTGATGTCTTT
CCTGTTAAGTTAGAAGCTACTTATTAGTGTGAAGTCATATTCTTGTACGATAGGTATCCT
TTTATGAATACTTCTGATTACATAATCAACCCACCTTTGGAAGAGCTTCAGACTTATTCA
TTAAAAGAGTTGAAAAATGTTCATAATTTTAGCGTAGAAGGTCATTATGGAAAGTTAGAG
TGGTAAGAACCAGTTGACTTAACAGACTTAGATATTGACAAGACCATTTACATTAGAGAT
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GAAGGAATAAATAATAAATGTATGATCACATATAAGAATGCATCTTCAATACAAAGGAAA
ATTAAATCTGGAGAGCTCAATCTATAAACTGTAATTAAGTGCATAAAAAAGTAAAGTGAT
GAATAAAATGTCTAATTTGTTAAATTTGATCAAAAAAATCTAACTTGGACAATATTAGTT
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GGACAGGATTCTGCTGCTAATTTATAAAATGTATCAAGCAATTCAAATTCTAGATCAAAT
CCATCTAAGTAGTAATAATTAATCTAAGGTTAACAATAATTTAATTAAGACTCGTAAAGA
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ATAAATAGCTCTTACTAATAGCTTCCGATGAGATAACATATTTAAAATTCTAACTAATTT
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ATGAGAGAGCAATAGAATGTTAGCAAGTCTTAGGAAAATTCATTTATTCAACAAGATTAT
CCAATTACTTCTCATTAACAATAAAACAGCAACTACTAAATGAATGAACATAATTAATAT
TAAAATTAACCTAGTTATATGAATCGCGGCTAATTATAGCAATAACAATATTATGGAACT
CATATTGATCCTTCTAATGATATTATAATTGAAGAAGTTGAAAACGGATCATATAATAAT
ACTTAAGCAGATATTGATACTTTGAAATCTTAAGCTTAAGAATTAATTGAGCCTGTTTAT
CAGTTGCCAAAGACTTCATATTAGTAGTTCTTACGCTAGCAAAATAATGAAGAATAATTT
GTAAATTTGTAAAACAAGTAGAAGCCCTTAAATAATTTTAAAGATTTTAAAACTAGAGTA
GACCAACGCAAAAATAAAATATTTTAAAAAGAATAGCAAGTCCCTAAATGTGGTGTTCTT
TACTAAAGTGTTAAAAAACATGAGATTGTAGCCAGAGGTATTTAGACTTTAAACCAATGT
CTTTACTAACACTCAGTAAAGGAGTACACATTTAAAGGGAAGAAATTTTACAATGACTTT
TCTTTTTGTCCCTCTTGGAACTAAAATAGTTATACAAGCTATTCTTCTAAGCTTAAAGCA
ATTAAAAAGCACACAATTCTTCCAAACAATATGGGAAGGATAAAAATTAAAGATAAATAG
AGAGATTAAATTGAGAAATATAACAACATAGTCATTAACGGATTTTTATAAAGTATTATT
GATAGTTAAGCAACTAATGTAATAGAAAATATAGATCAAATCACTAAATTATATACCAAA
GACTAAGGAATGTCTGATACCTAGATTTGGAGCACTCTTCCTGAAATAAAAATTCCTACA
GATAACCAATACACATTATTTTTAATTATCTATATAAAAAATTATCTTTTACCAGTTTTA
AGTGCATCAAAAAATAATCAAAACGATTTATACCAGTCTTTAAAAGAAGAACTAAGTATA
CTTATCATGGTCAATATACTTTTTGGTAATCCTTAAATAGATGTTATCTCGATTTTAAAG
AAGGTAAATAAAAATTCATTTAGTGAAAATCAATGGAAGGTACTCTTTGAAGGTCTAAGA
AATAACAAGATGAATTAAAATGAAAAAGTTGTACAAAATTTGAGAAAGAAATAACTAAAA
AAGTACTTTGAGTGGAAATATTCTGAAAATAAAGTCTAAATTAATGAGTAAAGAGCATTC
TTAGATATGAAGGAAATGAAAACTCAAGAAGAAGTTGAAGATGCTATAATTTAATGCCTC
AAGAATCATTAAATTTAAAATGCTATTTAATTAGCTGATAATTATAAATTACATACTATA
AGCCATCTTTTAACAACTTTTGAATAAGGATCTGTTGAAAATTAGATAAAATAGCTTAAT
CAAGATAAATACCAAAACTTTAATAGAATAATTAATTTTGTTAGCGGCAATTTAGAAGAA
TTGTACAAATAAAGCTAGAGAAATGAAATATCAAATTTAAATAAATTTGCTTGTGAAATT
TGGTATTAAAAAAATTAGAGATAGAGTTTAGCAGAAACTTTTGATTAATTTGTATAAAAA
GTAGATAAATAAATATATGATGTTGATTCAAGATAATAAATAATCTCATTAGAAATTCTT
CTATTGTCTCTTTATGCTTAGCATTAGTTAGGTGAAAATTATGTAAGTAAATAGCTTGTA
AATATCAATATATTTGCTTAAATAAATTCATAGTGTTATTCTTAAAACAGACTTGATAAA
CGTCTAAGTTGGTTTATTATTGAATTTATGAATAGCGTCTATTTTAGTAATGATAAAGCT
CTTTTGAAAGATAAACGTGCAAGACTTATGAGAGGTTTTCTTTAATAACTATAAATTTTG
AAGAAATGGAAATATGAATTAATAGTTTTGATAATAATGAAAGATATTATCAGAAAACCA
TAATTTATTTCTAGCATAAAGAATACATTCTTACGTAACTGTATTCCTTAAATAAGTTAA
GAAGATAAATCAGAAGTAGGCTAGCCAAATAATTTAAATAATAAATTCTTGATTTAATCC
AGCAACAGAGACAGTTCTTCTGATAATTCATTAGAAATCAACAAAAGTTTTCAAATTGAC
TCAGAAAATAGCAACAGTGTTGAACGTTTGCTATACTTAATATATACTTAGTATTTCCAT
CAATCCTTAGGATTGTATTATTATAATTCTCAAATTTATTAGTCTGCACTATATCACTTT
ATGAGAGATCCCAATTTAACATATTTAGATATTAGCAATAAAATATTAGCATACTATGAA
GGACCTCGTATATATTTATTTGGTGAATAGAATGAGCGCTAAGAGATTGAAAAGTACTTG
GAACAGATTGCAAAAAAAGCAAATTTAATTTTCAAATACAAGTATTAATCTGGGTTAATA
AAAGAAGTTTTTTCCCTTTTGCAAAGTAATAACTAAGACCAATATAAGCAAGAATATATA
AATGGCATTATAAATCTTAAAGATCTCCTATTAGAAACTCAAAATGTGTTAAATTTAGTT
ATTTATCCCCATCAATATCAAGTTATAGTAGATAATTAAGAATTTTAATCTAAGAATAGA
AGACTACAAAGTAAGACTGATGATTCAGTAACAACTTTAGACAATGGCGGAATGCTCTTC
TAAGAATTTATTTCTTTCATATTCTAATAACTTGCAGAAAAGGTACCAGATATTAGAAGA
TATTCTTAACATTATTAAACTTCTGGTGATATTCAACAACTCTTAGAAATAGTATCTGAG
CATAAAGCCCCTAAAAATGAATAAATAAAGCACCTCATCCTATCAACTTTAAAATAAAAT
TAATATATGTGA>TTHERM_00530720(gene)
ATGATAAACAATCTGTTTGCGAATAATAACACTAACTAGCCAAATATATTTCAGAATAAT
AATAACTAAAACAACAATAATAATAGCAGTAATATCTTTAATCGCAGCGGCTAGAACATA
TTCCAGTCATAGAATAATAACGGATAAGTAAATATCTTTAACGCCAATAATAATAATAAT
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GCCAGCAGCAGCAACAACAACAATATTTTTGGAAATAACATAAGTAATAACAACAATTAT
GGTGGAGCTTAAAATAATAATATTTTTAACAACAATAACTAAAATATGTACTAAAACAGT
AATAACCCTAATGCTTTGATAGGTTCTTAAAGAGGTAAGTATGAATTAACAAAATCTCCT
CACACTGAAACTTAATAAAATAATCAAGCGGGAGTAATAATGAATACAAGTATTATTTTC
TGTAAAGGATTTGAAAAAATGAATCCTTTGTTGGTAAGGCTCGAAGATTATTACTTGATA
AGAACAGGCAAATTATCTGATGCTGAAAAATAAAAAATAACTAGCTCAATATAAATAAAC
TCCTTTAACTAAAATCTTATTACCAACCTTCCTTAAAACTTTTAACCTCCAAACACTTAA
GCATTAAATAAAGACATTCGCATGGTTTAAAGTTAATATGTAGGTAATGTGAATAATAAT
AATAATATTTTTAACAATAACAACAATAACGGTAATAATAACAATATATTTGCAAATAAT
AACAATGTAAACAACTCAGTTAATCGGAACATTTTTAATAACAACAACATTAGCACTAAC
AACAACATTAACAATAACAACAATGGCAATATATTTAATAATAATAATAATAACATGAAT
AATAATGGAGGAAATATCTTTTCTGGAAATAATAATTAGAATAATAATGTAAATAACATA
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TTTAGAAACAATAATAACAACAATACAAATATTTTTAACAATGGTAATAATAATGGTGGG
AACAATACTTCAAGTATCTTTAATAATAGTGGTAGCAATAATAGTGTTAATATTTTCAGA
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AATAACAACAATAATAATTTTAACAATGGAAATATTTTTACAAATTATAACAATCCTTAA
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TGCTCCTGCTTTTAGGAAAAAGCCCATATTTAAGCCATTTTATGTAACAGTTTAAGAAGA
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TGATGGAAGTCTCATTAGAAACCAAGAATTACTAGCAAGTGATGTCTTTCCTGTTAAGTT
AGAAGCTACTTATTAGGTAAAAAATATATCTTGGCTAATTTATCAAAAAAAATTTTCAAA
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AACAAAAGTAGACTCTAACTAACACTAAGAAAAAATAAAATAATGATAGATGCTGAAACT
TTATTTTTAGTTTAACTAGAGATAGTTAATAATAATAAAGATAGCAAGTATCTTTTTAAT
TTATTTTTGAAAATTAAAGATAAATCTTAGATAGATAGAGATTATGAAAAAGTATATTTT
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ACATAATCAACCCACCTTTGGAAGAGCTTCAGACTTATTCATTAAAAGAGTTGAAAAATG
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TAACAGACTTAGATATTGACAAGGTATACATACATACTTGCAGAATTTAATTGTTTCTTA
TAAATAATAAAAATTTGTTTAATTTATCAAATTTAAGTAAATCAATCAACTTTAAATAAA
ATTAGACCATTTACATTAGAGATTAGCAAATATAAGTTTATCCTGAAGTTGAATATGCAT
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GCAATTCAAATTCTAGATCAAATCCATCTAAGTAGTAATAATTAATCTAAGGTTAACAAT
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CTGAAAATTAGTTTTAACAAAAGATAAATAGCTCTTACTAATAGCTTCCGATGAGATAAC
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AGCAATAACAATATTATGGAACTCATATTGATCCTTCTAATGATATTATAATTGAAGAAG
TTGAAAACGGATCATATAATAATACTTAAGCAGATATTGATACTTTGAAATCTTAAGCTT
AAGAATTAATTGAGCCTGTTTATCAGTTGCCAAAGACTTCATATTAGTAGTTCTTACGCT
AGCAAAATAATGAAGAATAATTTGTAAATTTGTAAAACAAGTAGAAGCCCTTAAATAATT
TTAAAGATTTTAAAACTAGAGTAGACCAACGCAAAAATAAAATATTTTAAAAAGAATAGC
AAGTCCCTAAATGTGGTGTTCTTTACTAAAGTGTTAAAAAACATGAGATTGTAGCCAGAG
GTATTTAGACTTTAAACCAATGTCTTTACTAACACTCAGTAAAGGAGTACACATTTAAAG
GGAAGAAATTTTACAATGACTTTTCTTTTTGTCCCTCTTGGAACTAAAATAGTTATACAA
GCTATTCTTCTAAGCTTAAAGCAATTAAAAAGCACACAATTCTTCCAAACAATATGGGTA
ATTAAAAAAATCATTTATTTTTAAATTTTACATTTATAATAAATAATATCAATTTCATTT
TTTATTTTTTAAATAAAAGGAAGGATAAAAATTAAAGATAAATAGAGAGATTAAATTGAG
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AATGTAATAGAAAATATAGATCAAATCACTAAATTATATACCAAAGACTAAGGAATGTCT
GATACCTAGATTTGGAGCACTCTTCCTGAAATAAAAATTCCTACAGATAACCAATACACA
TTATTTTTAATTATCTATATAAAAAATTATCTTTTACCAGTTTTAAGTGCATCAAAAAAT
AATCAAAACGATTTATACCAGTCTTTAAAAGAAGAACTAAGTATACTTATCATGGTCAAT
ATACTTTTTGGTAATCCTTAAATAGATGTTATCTCGATTTTAAAGAAGGTAATTAATTAA
TTAATTCATTTTTTTATACTCTTGTGAAAAATTTTTTAAAAATAAGTTTTTGTTAATTTT
ACATTTTATAAACACAAAAAAGGTAAATAAAAATTCATTTAGTGAAAATCAATGGAAGGT
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GAGAAAGAAATAACTAAAAAAGTACTTTGAGTGGAAATATTCTGAAAATAAAGTCTAAAT
TAATGAGTAAAGAGCATTCTTAGATATGAAGGAAATGAAAACTCAAGAAGAAGTTGAAGA
TGCTATAATTTAATGCCTCAAGAATCATTAAATTTAAAATGCTATTTAATTAGCTGATAA
TTATAAATTACATACTATAAGCCATCTTTTAACAACTTTTGAATAAGGATCTGTTGAAAA
TTAGATAAAATAGCTTAATCAAGATAAATACCAAAACTTTAATAGAATAATTAATTTTGT
TAGCGGCAATTTAGAAGAATTGTACAAATAAAGCTAGAGAAATGAAATATCAAATTTAAA
TAAATTTGCTTGTGAAATTTGGTATTAAAAAAATTAGAGATAGAGTTTAGCAGAAACTTT
TGATTAATTTGTATAAAAAGTAGATAAATAAATATATGATGTTGATTCAAGATAATAAAT
AATCTCATTAGAAATTCTTCTATTGTCTCTTTATGCTTAGCATTAGTTAGGTGAAAATTA
TGTAAGTAAATAGCTTGTAAATATCAATATATTTGCTTAAATAAATTCATAGTGTTATTC
TTAAAACAGACTTGATAAACGTCTAAGTTGGTTTATTATTGAATTTATGAATAGCGTCTA
TTTTAGTAATGATAAAGCTCTTTTGAAAGATAAACGTGCAAGACTTATGAGAGGTTTTCT
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AATATTAGCATACTATGAAGGACCTCGTATATATTTATTTGGTGAATAGAATGAGCGCTA
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ATCAACTTTAAAATAAAATTAATATATGTGA>TTHERM_00530720(protein)
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