Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00538800

Standard Name

RRM36 (RNA recognition motif-containing protein 36)

Aliases

PreTt12137 | 70.m00133 | 3728.m00032

Description

RRM36 RNA recognition motif protein

Genome Browser (Macronucleus)

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
• zinc ion binding (IEA) | GO:0008270

Domains

• ( PF00013 ) KH domain
• ( PF00076 ) RNA recognition motif
• ( PF00096 ) Zinc finger, C2H2 type
• ( PF00097 ) Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
• ( PF01485 ) IBR domain, a half RING-finger domain
• ( PF01840 ) TCL1/MTCP1 family
• ( PF02756 ) GYR motif
• ( PF02891 ) MIZ/SP-RING zinc finger
• ( PF04032 ) RNAse P Rpr2/Rpp21/SNM1 subunit domain
• ( PF06827 ) Zinc finger found in FPG and IleRS
• ( TIGR00013 ) 4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme
• ( TIGR02794 ) protein TolA

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_18193.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (1699 aa)
Tetrahymena borealis	EI9_03176.1	9.997093137033517e-262
	Description: peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type family protein (250 aa)
WormBase	WBGene00013270	5.000468829272308e-18
	Description: status:Partially_confirmed UniProt:Q9NA71 protein_id:CAB55036.2
WormBase	WBGene00009829	5.000468829272308e-18
	Description: status:Confirmed UniProt:Q20546 protein_id:CAA98480.1
Oxytricha	Contig16750.0.g70	4.997543945741262e-17
	Description: IBR domain
DictyBase	DDB_G0289043	0.00000000000003999587784428659
	Description: DDB_G0289043 on chromosome: 5 position 2291494 to 2297048
SGD	YKR017C	0.000000000000900343533975275
	Description: YKR017C Putative protein of unknown function; contains a RING finger motif

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00538800(coding)
ATGTAGCAGCTTTAATAGGAACTCTCTGAACTCATAAACTAATAGGGTTAAGTTCAAGAT
ATACACAGTACATTAACAAGAAACTCTGCTTCTAATAGTATTATAAGAGAAGAAACATTA
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TAAAATAGCCATGTTTGGTAAATTTTATAAAGTTTGAACGAACTTTAATCTGTAAATAGT
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TTAAAGAGTGCTTTTAATCTTTATCATAAAATTAACTTAGTTAACATATTCGAATCATAA
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TACTTTGAAGATAACAATTAAATAATTAAAGATATGGAAAATAAATTCGATTGTTATTAT
GAGCCTAATCATCATATGGACACTATAACCATACATTCTGATGCAAGCTAAAAGGAAAAA
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GAAGTTACTATTTTACAGAATGAACACATCTTTATTGTTGATAATCTACCCTTAAATGTG
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GCTGAAACAGAAGATTCCAAATTTTTTGTAGAAACATTTAATTAAATAGAATTTTAAGAT
AGAGTCCTGCAGTTGCGTTTGAAAAACCACAGCTACTAAATACATCAAGATAATAATTCT
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GAATTTCTTGATGAATCATCAGTTTAATCTTTTATGAAATTAGTTTAAAATAAACTAATT
GTTGATGGTAAGGAAATTAAAGCAGAATAGGATAAAAATTTTAATAAAACCGTCATATTG
AGTGGGCTATAAAAATGCACAGATGAAGAAACTTTAAAATCTTGTTTGATACCAGAACTT
TAAAAGAATATTGTGAGAATAAATGTAGATAGAATAGCTGATGTTGACAGAGGAATTAGC
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TATAAGATGAACACTTACTATGAAAGATTTAATAGTAAGCCAGATATTTTAGGATAATAA
AAATTATATGTTTAAAGAAATTATATTGAAACCTTTAACTATGACTTGAAGATGATGAAC
GTAGTCTAAATGATATTAAAAGGTAATCAGGAATTAGTTTAAATGTAACAAAAGAATGAA
ATAAAACTCAAGGAAAAAATTGTAAGACCAATTCCCTCTAAATAAGAATTCATTGTAATT
TTGAAATGCAATGATGAAACCCACTTTAATAAGGCAAAAGGAATTATGTAAGCTCTGCTT
TAATCAAAACTGCTTGATTTGAGAAATGTAAAATTAGATTTGGCCAGCTTATTCGATGAG
GAAGATTAAGTAGATTACTCTTAGTTGTTCACTGAAATAGGATAAAAGAAGCTCAAAGAA
ATAGAAAGCAAATACCCAGTATTTTTCAAAATAAATTTAATCAAAGAAGAAGTTAGAGTT
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AGTGTCAGAGTTAAAATTCCTATTAGTGGAAAAAATATTAGAAACATACTTGGAATAGAT
GGAAGAGGTTTAGAAGAGTTTAAAAATAAAACTAACATTTGCAAAATTTAGCTAGACTAC
ATATCTAAAGACATTTATATGGAAGGTAATTCTAAGTAAGTTGACTAAGCTAAGAATGCT
TTACTTGCTTTATTGGAGGAAAAAAATAGCTAAGCATGCTTAAATAACATGCCTTATTCA
TATGAAGATTGCTAAGTCTGCTCTGACACTATTGTCACAGGATACAGATTGCAAGGCTGT
GGTCATAAATTTTGCCTAAGCTGTATTATGTTTGTAATAGATAATTCTTTAGGTGATGTG
AATTCTCTTCCAATTAAATGTCCTTTTTGCAGTTAAGCTATTATTATGAAAGATATAAAA
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CAAAACAACTTTTAAGAATTCAGCTTTTGTGTGAATGAAAATTGTAAGTCTATTCATTCA
TCTAAACTAACTAAATATACTTGTTATGAATGCAAAAAAACTTACTGTTCAAAGTGTGCA
GCAGAATATCATTTTGGTATGACTTGTACAGTTTATTAGGAAACTGAAGCGAAAAACATA
GAATTCTTAATCAAAGAAGGTGCTCGTAAATGCCCTAATTGTGGAGTCTACATCATTCGT
ATAGATGGATGTTATAGGGTAGAATGTAGAAGATGCAACCAGCATATTTGCTGGAAAGAT
AATTGCATGAAGTTCTTTGCAACTTCATCCGAATGTTATAACCATTTAGACGAGAATCAT
GGAGGTTATTGGTGA

>TTHERM_00538800(gene)
ATGTAGCAGCTTTAATAGGAACTCTCTGAACTCATAAACTAATAGGGTTAAGTTCAAGAT
ATACACAGTACATTAACAAGAAACTCTGCTTCTAATAGTATTATAAGAGAAGAAACATTA
CAAAACTATTTGATTTCTGAAAGTAAAGAAAGCCAAGAAAATTTAAAGCATATTATCCAA
AAAAGCAAAATAGATTATTTGTGCAAATTGTAATCAACTTTCACTAGCTCTGAATAAGAA
CAAGAGTTGGCTGAATATATCAAAGATTTCAAAAATAATTTTGGATATCTTGGAAGCGAC
TAAAATAGCCATGTTTGGTAAATTTTATAAAGTTTGAACGAACTTTAATCTGTAAATAGT
GGATTATCATTTATAACAGATAAAAACCCTATTTAGAATGGAGGACTCATTTTTTCTCTT
TTAAAGAGTGCTTTTAATCTTTATCATAAAATTAACTTAGTTAACATATTCGAATCATAA
GCTAGTGAAGACAAGAACTTAAAGCTATAACTAGACGAATAGATGATAGAGACAATTTGG
GACTCCGTTATCGTAAATGGATCCAATAATAAAAAAACTGTTTACTTTTTAAATTTAGAG
TTTTTGAATCCTTCTTAGATTATTTTTATAGCAAAGTTATAGAAACATTTAAATAATTTA
AAAAATGAAGCTTAGATTCCAAATATCGTGATTTACTCTGATGACATTTTAGCATCATAG
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AAAGAATTCCTTAGACTACAAAAGAGGGATTTTTTGAATTTAATAAATTTGGAATAGTAT
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GTTTCTTAGACTGATGATTTATATTTAGCTTGCTAAAATCTCAATCTGCAGAATATTTTA
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TAAAGACATTTATATGGAAGGTAATTCTAAGTAAGTTGACTAAGCTAAGAATGCTTTACT
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ATTTTGCCTAAGCTGTATTATGTTTGTAATAGATAATTCTTTAGGTGATGTGAATTCTCT
TCCAATTAAATGTCCTTTTTGCAGTTAAGCTATTATTATGAAAGATATAAAAACTCTTAT
GAGTGAGGATCAAATATAAAAAATGACAAGAATGTCTTTAAATCATTACATACAAAACAA
CTTTTAAGAATTCAGCTTTTGTGTGAATGAAAATTGTAAGTCTATTCATTCATCTAAACT
AACTAAATATACTTGTTATGAATGCAAAAAAACTTACTGTTCAAAGTGTGCAGCAGAATA
TCATTTTGGTATGACTTGTACAGTTTATTAGGAAACTGAAGCGAAAAACATAGAATTCTT
AATCAAAGAAGGTGCTCGTAAATGCCCTAATTGTGGAGTCTACATCATTCGTATAGATGG
ATGTTATAGGGTAGAATGTAGAAGATGCAACCAGCATATTTGCTGGAAAGATAATTGCAT
GAAGTTCTTTGCAACTTCATCCGAATGTTATAACCATTTAGACGAGAATCATGGAGGTTA
TTGGTGA

>TTHERM_00538800(protein)
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TLMSEDQIQKMTRMSLNHYIQNNFQEFSFCVNENCKSIHSSKLTKYTCYECKKTYCSKCA
AEYHFGMTCTVYQETEAKNIEFLIKEGARKCPNCGVYIIRIDGCYRVECRRCNQHICWKD
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