Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00538940

Standard Name

RPB1 (RNA polymerase II largest subunit)

Aliases

PreTt12151 | 70.m00147 | 3728.m00046

Description

RPB1 DNA-directed RNA polymerase; Largest subunit of RNA polymerase II; DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime

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Gene Ontology Annotations

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Domains

  • ( PF00623 ) RNA polymerase Rpb1, domain 2
  • ( PF04983 ) RNA polymerase Rpb1, domain 3
  • ( PF04992 ) RNA polymerase Rpb1, domain 6
  • ( PF04997 ) RNA polymerase Rpb1, domain 1
  • ( PF04998 ) RNA polymerase Rpb1, domain 5
  • ( PF05000 ) RNA polymerase Rpb1, domain 4

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

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General Information

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Associated Literature

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Sequences 

>TTHERM_00538940(coding)
ATGAAATAGTCTGGACAAAAGTATGCTTACTCCTAGATGGAGACAGCCAAAGTTAATGGC
GTCCATTTCTCTATTCTCTCTGAAAAGGAAATAGAAAGCTGGTGCGTTTGTGAAATTAAA
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AATATTTCTTAGCCTAAGAGAAGACTTAATGAATTGTATAAAATCCTTGGAAAATAATCC
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TTAAATCTTAAAGTAGCTGAAAAGTAAAGTGATAAGGATGCTATTGAGTATGATCTGAGT
GCAGAATAAGCATTAGAAATTTTAAAGAAGATTAGATATGCTGACTCCAAAAAGTTATTA
GCTTACAAAGGATAAAGAAAACATGATGACGATTTCTTGTAGCCAACTAATCTTATCTTA
ACAAAGTTGCTTGTACCTCCACCCTAAGTTCGCCCTTCTATTGAAATGTCATCTAATATG
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AAAGATAATTCTGATAACAGAAAGCTGGTTGAGTAAATCTAGAGTGTTGTTGCCAGAATG
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TTTTCTTAGAGATTAAAAGGAAAAGAAGGTAGATTTAGATAAAATTTAATGGGTAAAAGA
GTAGATTTTTCTGCAAGATCTGTTATTTCCCCAGATGCAAATTTATGGTTGGATGAATTA
GGTGTTCCTAGAAGTATTGCTGACAGTTTGACTGTTCCTGAAATAGTTAACTAACAAAAT
ATAAACAGAATTCGTGAATTATGGAAGTAAGGCAAAATTAAAAGTATTATGAAACCTAAT
CGTGAAAAATAGATTTATGAAGCTTACGATGCTATTATTTGCAGTGGTGATAGATAAGCT
GATGATAATTTTGACATGCACGTTAATGATGGTGTTATTATTGAAAGAGCCTTATAGAAT
GGTGATTATGTGCTATTTAACCGTTAGCCCTCTCTCCATAAAATGAGTATGATGGGACAT
AGAGTTAGAATTCTTCCTTACAGTACTTTCCGTCTTAACTTATCAGTCACAACCCCTTAT
AATGCAGATTTTGACGGTGATGAAATGAATATGCATGTGCCATAATCTTATGAAACTCGT
GTTGAACTTGGTTATATTTGCCATGTTCCTAGATAAATTGTCACTCCCAAGGCTAACAAA
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GACCTACCCATGCCTGCTATTCTTAAACCTGAACCTTTATGGACTGGTAAATAAATTATG
TCTTTAGTCATTCCTGAATAAATGACTATGACCAGATTCAAAGGTGACAAGGAAGATGAC
AAGTGGTTCCATAAATAGGATGAATCTATTTACATCTACAAAGGTGAACTAATTTAAGGC
TATATGAATAAGGCTATTGTTGGTGATGGTCCTGGTGGTTTAGTCCATTTGATTTGGTTA
GATATTGGTCATGAAGAAACTAAAAATTTCATGACTAGATGTTAGAGGGTAGTTAATAAC
TGGCTTATTATGTTTGGTCACACAATCAGTTGTGCTGATATCGTGCCTAGTGAAAAATGT
TCAGAAGAAATTGAAAAAATTAGAAAGAAAGCCTTTGAAAAATATGATAAAATTGAATTA
GATTTCTAAGATGCAGCTTATATTGATTAAAATAATATGCACAAGGCTGGTAAGAAGATT
TTTGATTCTTTCGAAGTTCAAGTTAACTCCATCTTGAATGAACTCAGACAAGAATCCGAA
AAGAAAGCAGAAGAAACAATTAAATTCAAGTACAACTAATTCAACAAGATGGTGTGGTCA
GGTTCAAAAGGTAAAGCTACTAACTTAGCCTAAGTCATGGGTCTTGTAGGTTAACAAAAT
ATTGAAGGTGCTAGAATCAGGAATGGTTTTTCAAGAAGAACTCTTCCTCATTTCTGCAAA
GATGATAATGGTATTATTGCAAGAGGTTTCGTCGTTAACAATTTCTACATAGGTTTAAAG
CCCTACGAATTCTTCTTCCACACAATGGGTGGTAGAGAAGGTCTTTCTGATACTGCAGTC
AAGACAAGTAGAACTGGTTATATTTAAAGAAAGCTTGTCAAGGCTCTTGAAGATGTCATC
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GAAGATTCATTGGCAGGTGAATTCATCGAAACCTAAAAGATCGGAGAAGTTGATTATAAG
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GTTTTAATTGCAATCAAGGAAGAATTTATGCGTATGATTAACGAAAGAAACGAAGGAGAA
GATCCTAAATTTATCTTAGAATAAGAGTACGAAGAACTCATCGAAGCTAGAAACCTGTTT
AGAAAGAATTTCTACTTCTACGCATAAGAAGGCAAACTTGATATTAACTTGCCAGTCAAC
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AGAGATTAATGTAAGACTAATCCTATTTAAGTTTATAAGAGTCTCTTAGAATTATTTAAG
AATCTTGATGACTATGCAGTTAAAAGAGGTATGGAGTATGAATCTTTGGCTTTGTTCAAG
GCTCATATCCGTCTCCATCTTGGTTCCAAAAAGATAGTATTAAGGCATAAGCTTTCAATG
GAAGTATTTGATAAACTCACAAAGGAAATTTTTGATAAATTTAAAAAAGCCATTTCTCAC
CCAGGTGAAACCATTGGTGCTATTTCAGCTTAATCTGTAGGTGAACCCACAACATAAATG
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CGTCTTTAGGAAATATTAGATGCTTCTAAAAATGTAAAGACACCAGAAATGACTGTCTTC
TTTGAAAATGGTTTAAGAAAAAAAATTTTCAGGAAAGATATGATGAGCAACTATGATGCA
GAAAGCTTTAAGAGAGAATATGACGAAATTGTTTCGTAGGAAAGATAGGAAATTTTAAGA
CTTAAACAAGAGATTGAATACTAAACTATTTCTTACTACATTAATCAAACCAGAATTGTT
TATAAATCTAAAGATGATGAAGACTTTTAATAACAAGATAACATTTTCGATGATGATAAT
ATTTCTGATGATCTCGAAGATCCTATTGTCCTCATTATTTATTTTGATACTTAAAAGACA
ACAATTGATACTTTTGAACTCTTGAATGCAAAAATTAGAAAAATTGCTGATGACTCTAAA
AAGTGGGGTAACCTCATAGTTGAAAAGAAATAATTTGAAAAAGGACAAATTCATGTTAAA
TTTGACTCTACCCAATTAGGTTAAGGATAATAAAATCCAGATTCTTAAATGAACGCTTAT
TCTTCTCTCCTTCTCTTTGAATCCGAATTCAAGGATGCATACATAGGAGGTATTTAGAAA
ATCCAAAAAGTTTATCCTACCCAAAAGAAGGAATTCAGACCTTGGGTTGAAAATGAATGT
ATATGTGAAGCCCCCAAACCAGGTGCAGCTTTCTTCACAGAGAGAAAACCTTAAGAACAT
ATTTTCAATACTTCTGGTTCAAATCTCAAAGAAGTATTGAAGGTTGATAAAGTAGATGCT
ACTAGAACTTATTCTAACGATATCTAAGAAATCATTACCATTCTTGGTATCGAAGCAGGT
AGAAGATCTATTGTTAATTAAATTAGAGTCGTCATTGAACCTTATGGTATTTACATCAAC
TATCGTCATTTAGCTATTTTGGCTGAGTGGATGACTGTAAGAGGTCGTTTGACTCCTATT
AATAGAAACGGTATCAATCGTATTCCTGGTTTATCTTGCCTCAGAAAATCTTCCTTTGAA
GAGACAGTAGATATTCTCAACACAGCTGCCATTTTCTTTGAAAAGGATGATTTGAAAGGT
GTTACTGAAAATATTATCTTTGGTCAAAATTGTGATATTGGTACTGGTTGCTTCGACTTA
TTAGTCGACTTGAATAAGGTTGGTGAATTTAAAACAAAGAGATAGGTTGAATAGACATTA
GAGATGGAAGATTATTCAGAAAACGAATCCTCTCGTTACGAAAATACTCCTTCTCATTTC
CAAACTCCTGGTCCCGGTCTCGTTTCTGCTTATCCTAATTCTATTAGAACAGTATAACAT
GCTGGATCTTTCACTCCAACCACTCCCTACCTAAACTCTCCTGGATACAATATGTCAACT
CCTATCTCTTACTCTAACACCTATAACCAAACCAGAAGTTCTTAATATAGTCCTCAGACA
GGCAATAATTCTCCATTTGTTCCTTCTCCAAACTACTCACCTCCAAGCCACACTCCAGCT
GGTTCAACAAGCCCTGCAAACGCTAGTCCTTATGCAAGCTCACCTTAATATAAAAGCAGT
AGTCTTAGTGGAGCTCACTCTCCCTCTTACACTTCACCTTCACAAGTGAGATATAATTCC
CCAAGTTATCAAAATCCTCATGCTAGTTCATCTAGTCCACTTGATAGATCTAAGTCAGCT
TATATGGGATCCTAACAATCACCTTAATACATGAGTTCTCCTCACTATGAATAGAGAACA
ACTCCTATGACTAGAAATATTAAAAGCGAAACTTCTTACAATCCAACTGAAGAAAGGGAA
AGTGAAGAAAGTGATTCTGATCAAGATTGA



>TTHERM_00538940(gene)
ATTTAGTTAGATACATTAAAAAAATAAATCTTTTTACAGCTAATAATTAAACAAAGCAAT
TGATATAATTAATAAATCAGATTTATTGCATTTTATTGATATTAAAAAGCAAAAAAAAAT
CAAGAAATGAAATAGTCTGGACAAAAGTATGCTTACTCCTAGATGGAGACAGCCAAAGTT
AATGGCGTCCATTTCTCTATTCTCTCTGAAAAGGAAATAGAAAGCTGGTGCGTTTGTGAA
ATTAAAAATTTTGAAAATGGTAATAAAGAAGATGAAGGCTTTATAAACGATAAAAGATTA
GGTACTACCTCTAAGGATGCATGCAAAACTTGTAATTAAAAGAATGAATGTCCTGGTCAT
TTTGGTTACATCAATCTTAGAAGGCCTATATATCATATCAATTTCATAAACACAGTCAAG
CAAATTCTTCTCTGCGTCTGTCACAAATGTGGTGCTGTAAGAGAGCCCCCTATTAAGAGA
AATGAGAGTGGTAAACCTGCAAGTAAAACAGAATTTGCTAAACTTGAAAAGTATTTAGAA
GTTATGAATATTTCTTAGCCTAAGAGAAGACTTAATGAATTGTATAAAATCCTTGGAAAA
TAATCCAAATGCCAAAACGATAAGTGCAACTCATATTTATTTGTTAAAGTCAGTGTAGTG
AAGTTCTTAAATCTTAAAGTAGCTGAAAAGTAAAGTGATAAGGATGCTATTGAGTATGAT
CTGAGTGCAGAATAAGCATTAGAAATTTTAAAGAAGATTAGATATGCTGACTCCAAAAAG
TTATTAGCTTACAAAGGATAAAGAAAACATGATGACGATTTCTTGTAGCCAACTAATCTT
ATCTTAACAAAGTTGCTTGTACCTCCACCCTAAGTTCGCCCTTCTATTGAAATGTCATCT
AATATGACCTGTCAAGATGAACTCACTAAATGCTATGAAGAAGTATTGAAGCTAAATGCA
TAAATTAAAGATAATTCTGATAACAGAAAGCTGGTTGAGTAAATCTAGAGTGTTGTTGCC
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AAAAGTTTTTCTTAGAGATTAAAAGGAAAAGAAGGTAGATTTAGATAAAATTTAATGGGT
AAAAGAGTAGATTTTTCTGCAAGATCTGTTATTTCCCCAGATGCAAATTTATGGTTGGAT
GAATTAGGTGTTCCTAGAAGTATTGCTGACAGTTTGACTGTTCCTGAAATAGTTAACTAA
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CCTAATCGTGAAAAATAGATTTATGAAGCTTACGATGCTATTATTTGCAGTGGTGATAGA
TAAGCTGATGATAATTTTGACATGCACGTTAATGATGGTGTTATTATTGAAAGAGCCTTA
TAGAATGGTGATTATGTGCTATTTAACCGTTAGCCCTCTCTCCATAAAATGAGTATGATG
GGACATAGAGTTAGAATTCTTCCTTACAGTACTTTCCGTCTTAACTTATCAGTCACAACC
CCTTATAATGCAGATTTTGACGGTGATGAAATGAATATGCATGTGCCATAATCTTATGAA
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AACAAACCAGTTATGGGTTTGGTGCAAGATTCATTATTAGGTGTAGCTATGTTTACTTTA
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GAAGGAGACCTACCCATGCCTGCTATTCTTAAACCTGAACCTTTATGGACTGGTAAATAA
ATTATGTCTTTAGTCATTCCTGAATAAATGACTATGACCAGATTCAAAGGTGACAAGGAA
GATGACAAGTGGTTCCATAAATAGGATGAATCTATTTACATCTACAAAGGTGAACTAATT
TAAGGCTATATGAATAAGGCTATTGTTGGTGATGGTCCTGGTGGTTTAGTCCATTTGATT
TGGTTAGATATTGGTCATGAAGAAACTAAAAATTTCATGACTAGATGTTAGAGGGTAGTT
AATAACTGGCTTATTATGTTTGGTCACACAATCAGTTGTGCTGATATCGTGCCTAGTGAA
AAATGTTCAGAAGAAATTGAAAAAATTAGAAAGAAAGCCTTTGAAAAATATGATAAAATT
GAATTAGATTTCTAAGATGCAGCTTATATTGATTAAAATAATATGCACAAGGCTGGTAAG
AAGATTTTTGATTCTTTCGAAGTTCAAGTTAACTCCATCTTGAATGAACTCAGACAAGAA
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TGGTCAGGTTCAAAAGGTAAAGCTACTAACTTAGCCTAAGTCATGGGTCTTGTAGGTTAA
CAAAATATTGAAGGTGCTAGAATCAGGAATGGTTTTTCAAGAAGAACTCTTCCTCATTTC
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TTAAAGCCCTACGAATTCTTCTTCCACACAATGGGTGGTAGAGAAGGTCTTTCTGATACT
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GTCATCGTACGTTATGATGGTACAGTTAGAGATAGTTAGGGTATGATTATTTAAACATGC
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TATAAGGAAGAAGATTTCCAAAAGGAATACAGATTTGTCAAAGCAAATAAAAGCGACGAC
TGGTTATTCCAATATACAAAATTGGACTAGATGGAAAATCAAATTAGCAAAGAAATCAGT
AGAGATGTTTTAATTGCAATCAAGGAAGAATTTATGCGTATGATTAACGAAAGAAACGAA
GGAGAAGATCCTAAATTTATCTTAGAATAAGAGTACGAAGAACTCATCGAAGCTAGAAAC
CTGTTTAGAAAGAATTTCTACTTCTACGCATAAGAAGGCAAACTTGATATTAACTTGCCA
GTCAACATTGGTAGAATGATTGAATCTGCTAAAATTGAAATGTCTTAAAAGAATAAAACT
TATACTAGAGATTAATGTAAGACTAATCCTATTTAAGTTTATAAGAGTCTCTTAGAATTA
TTTAAGAATCTTGATGACTATGCAGTTAAAAGAGGTATGGAGTATGAATCTTTGGCTTTG
TTCAAGGCTCATATCCGTCTCCATCTTGGTTCCAAAAAGATAGTATTAAGGCATAAGCTT
TCAATGGAAGTATTTGATAAACTCACAAAGGAAATTTTTGATAAATTTAAAAAAGCCATT
TCTCACCCAGGTGAAACCATTGGTGCTATTTCAGCTTAATCTGTAGGTGAACCCACAACA
TAAATGACTTTGAATACTTTCCACTTTGCAGGTGTGTCAGATCGTAACGTTACGCTTGGT
GTCCCTCGTCTTTAGGAAATATTAGATGCTTCTAAAAATGTAAAGACACCAGAAATGACT
GTCTTCTTTGAAAATGGTTTAAGAAAAAAAATTTTCAGGAAAGATATGATGAGCAACTAT
GATGCAGAAAGCTTTAAGAGAGAATATGACGAAATTGTTTCGTAGGAAAGATAGGAAATT
TTAAGACTTAAACAAGAGATTGAATACTAAACTATTTCTTACTACATTAATCAAACCAGA
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GATAATATTTCTGATGATCTCGAAGATCCTATTGTCCTCATTATTTATTTTGATACTTAA
AAGACAACAATTGATACTTTTGAACTCTTGAATGCAAAAATTAGAAAAATTGCTGATGAC
TCTAAAAAGTGGGGTAACCTCATAGTTGAAAAGAAATAATTTGAAAAAGGACAAATTCAT
GTTAAATTTGACTCTACCCAATTAGGTTAAGGATAATAAAATCCAGATTCTTAAATGAAC
GCTTATTCTTCTCTCCTTCTCTTTGAATCCGAATTCAAGGATGCATACATAGGAGGTATT
TAGAAAATCCAAAAAGTTTATCCTACCCAAAAGAAGGAATTCAGACCTTGGGTTGAAAAT
GAATGTATATGTGAAGCCCCCAAACCAGGTGCAGCTTTCTTCACAGAGAGAAAACCTTAA
GAACATATTTTCAATACTTCTGGTTCAAATCTCAAAGAAGTATTGAAGGTTGATAAAGTA
GATGCTACTAGAACTTATTCTAACGATATCTAAGAAATCATTACCATTCTTGGTATCGAA
GCAGGTAGAAGATCTATTGTTAATTAAATTAGAGTCGTCATTGAACCTTATGGTATTTAC
ATCAACTATCGTCATTTAGCTATTTTGGCTGAGTGGATGACTGTAAGAGGTCGTTTGACT
CCTATTAATAGAAACGGTATCAATCGTATTCCTGGTTTATCTTGCCTCAGAAAATCTTCC
TTTGAAGAGACAGTAGATATTCTCAACACAGCTGCCATTTTCTTTGAAAAGGATGATTTG
AAAGGTGTTACTGAAAATATTATCTTTGGTCAAAATTGTGATATTGGTACTGGTTGCTTC
GACTTATTAGTCGACTTGAATAAGGTTGGTGAATTTAAAACAAAGAGATAGGTTGAATAG
ACATTAGAGATGGAAGATTATTCAGAAAACGAATCCTCTCGTTACGAAAATACTCCTTCT
CATTTCCAAACTCCTGGTCCCGGTCTCGTTTCTGCTTATCCTAATTCTATTAGAACAGTA
TAACATGCTGGATCTTTCACTCCAACCACTCCCTACCTAAACTCTCCTGGATACAATATG
TCAACTCCTATCTCTTACTCTAACACCTATAACCAAACCAGAAGTTCTTAATATAGTCCT
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CCAGCTGGTTCAACAAGCCCTGCAAACGCTAGTCCTTATGCAAGCTCACCTTAATATAAA
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ATTAAACTTTATCAAAAAGAGTTAGGTTTCAATTAAAATTATAAAATATTTTCAAAAAAC
TTATGTTTCAATTTTTAAATAAGTTTATATCGAGTATTTTTTTATTTTTTATTTTCATTA




>TTHERM_00538940(protein)
MKQSGQKYAYSQMETAKVNGVHFSILSEKEIESWCVCEIKNFENGNKEDEGFINDKRLGT
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SEESDSDQD