Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00547950

Standard Name

SFR6 (Sfi1 Repeat containing protein)

Aliases

PreTt15047 | 71.m00174 | 3729.m00051

Description

SFR6 hypothetical protein; cortical row basal body localization; predicted to have 12 Sfi1 repeats; Leucine Rich Repeat family protein

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Gene Ontology Annotations

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Domains

  • ( PF00467 ) KOW motif
  • ( PF00560 ) Leucine Rich Repeat
  • ( PF01920 ) Prefoldin subunit
  • ( PF04394 ) Protein of unknown function, DUF536
  • ( PF07989 ) Spindle associated
  • ( PF08182 ) Pedibin/Hym-346 family
  • ( TIGR00042 ) non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1
  • ( TIGR02413 ) Bacillus tandem small hypothetical proetin

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_17049.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1041 aa)
WormBase WBGene00017320 0.0000000010002658722841845
Description: Uncharacterized protein F09G8.5 status:Partially_confirmed UniProt:P34390 protein_id:CCD62650.1
DictyBase DDB_G0284101 0.00000030014504373857585
Description: snrpA1 on chromosome: 4 position 1571395 to 1572487
SGD YPL169C 0.000009999254677478949
Description: MEX67 Poly(A)RNA binding protein involved in nuclear mRNA export, component of the nuclear pore; ortholog of human TAP

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00547950(coding)
ATGAGTCTACATAACTCTAAACAATACATTTCCAGTAAAAGCCCTTTCAAAGGCCCATTT
CCACTTTCTTAGTTCCTTGAAGAAAGACATTAAGATATATAAGGAAACCATTTAGTGTTT
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AATATTGAGCTCAATGCAAAAATAGAAGAAATAAGTGAGTTTAAAAGCATAACAGCAGCA
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AAAATAATTGCAGAATACGAAGAGATGACAAAAAGCTTGTCAAATACAAACAAAGAAGTA
GAGAGCTTAAACATTCATCTGAATGTAAGGGTAGAGTCTTTGCAAGAAAGAATTTCAAAT
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AGAGAGAGATCAAACTTGATTGCACAAAACACTTCTCTGATGAATTAAAATAAAACTTTT
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CTCAGAGAGTAAGATTATGACAAAACTTCGTAATTTATACAGTTGGCCAAAAATATTAAT
TCACCTAGCAGAAAACAAGCATCGTCTCCATTAAGATTTACTGGAAGACTAAAAACTCTT
CCTGAAGATTCTTTGATAGATGAAAGAGTTCTCAATACATCTCATTCAAGAATAAACACA
TTAATACAATAAAAAACAGACAGAAATTTATTCACTTAACCAATTACTTAGGAAAATGGA
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AATCAAACTTAACATAATTCTATAAAAAAAGAAGTCTCTCCTTTGAGGGAATATCTAACT
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AAAAGCATAAGAAACTCACCATAAAAAGGCTGTATTTCCCCTTAAAAGACCTCATCACCA
CAGCTATATAAAAGCCAAAGAAATTTATAGAATCAATCACAAACAAGTGTGATAAAAGAT
GAAATTCAAAGAAGATTGAACAATTTAGACTATAAATTTAATGAGGATATCAAAAAATTT
TAATCTTAGCAATAGCAGTGA


>TTHERM_00547950(gene)
ATGAGTCTACATAACTCTAAACAATACGTAAGGAATTTTTATAAATATTCATTAAATAAT
TGTATTCATTTTATTTTAACTTACTATTTTATAGATTTCCAGTAAAAGCCCTTTCAAAGG
CCCATTTCCAGTATGATTTATTAATGATGTTGAAGATAAATTAAAGACTTTGCTAAAAAA
TTATTAAAATAGCTTTCTTAGTTCCTTGAAGAAAGACATTAAGATATATAAGGAAACCAT
TTAGTGTTTTAAAATCACAATATCGATGAAATTGATGAGCTCTACATGGATATGTCAAAA
ATAAGATCTATTGATCTCTCATCAAACAGACTCAAATCTCTAAAAGGGATTCAACAATTT
TAAGATTTAAGAAACTTAAATATTTCAAATAACTAAGTACATTTTACAAAAGAAAACCAA
TAGCTATTGATTGATTCATTTATATTTATTTTATTATAGATTTCAGATGTAAGCGAACTT
TTCTATCTTAAAGAGTTGCAGAATTTATAGATCCTAAATTTGAATAACAATCCAGTTGTT
TAATAATAAAACTACAAACTCACTTTAATGACTATTCTACCTAAATTATAGGTTTTAGAT
AGTAAAGTAAATATTTAAATTTAGAGATATAATTTAACATTTTATATTAGATACAATTAA
TTAATTGTGATTTTTTATTTTTATAAAAAGAAATTATCTTAGACAGATGTAGAAGAAAAT
ACAAGATAAGTCAAGTTTATGAACAACTAACTGAATTTACTTTATGAGAATTATTTGAAA
ATAGTGGAATTACAATCTGTAAGCAAAGTTTTTTAGATAAAAATAGAAAATATTTTAAAA
ATTAATTATAAGTTTTATATTAAAAAGATATTATTAAATCTTAAATAAATTTAATAAAAT
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ATGTTATGAATCCACCATTTAATTTGTAGAAATTTAGGAAAATTTTTAGCTATGGAGATA
CTATAGATGAAAAAGCTTAATAAGAAATCAAAACAAATTTATTAGCTGACGTTTAAACAA
TTTAAAATGAAATATTGAAAACGTAGGACTTTATTTTTTTTAAAACTCTTGTTTTTTAAA
TAAATTATTTAGTTAAAAAATAGAAGAAGCATTTGCAGAAATGGAAAGGAGATAGATTGA
TAAAATCTAGTAATTAGAGAATACTGTGCTATAAAAAGTTAAAGAGTACAAATACAACTG
TCTCGATATTGAGATTTTCCATAAGCTGAATAAAAATAATACCAAAATACAGAACTTAAA
AGTAAATTAAAATTAATATTTTATTTACCAAAACTAACACTCTAAAGAAGCTATTGATAT
TTGCTAGATTAAAAGCTGTTTAAAATAGATTTTAGAATATTTAGGATTTTATTCAATATC
TTATTAATTTTAGAAAAGAATTATAAAATTAATATTTAATTATTTACCAAAATTAACACT
CTAAAGTTTATTCAATATCTTATTAATTTTAGAAAAAAAGGATTTTATTCAATATTTTTT
TAACTTTAGAAAAGAATTATAAAAATAATTATTTAATATAGAAATTTATAAACTTTACAA
GATAAGAGTAGAAATAAGAAGTAGTTGTAGTAGGTAATAAAGGGAAAATATAAAGAAATA
GAAAAGATCAATAAAATATTTATGTTGAAGATAGCTAAAGTAGTTAGTCTTAATAGAATA
AAAACGAATAAGGTTAAATTTAATAAGATTTTTAAACAGATGAAAGCTTAAGAGGATCTT
TTTAAAATTAAACTTTTACTGAAAGAGACCTGAAAAGATTAGCGAACATAAATAGTAAAT
GGATTTAAGTTGGCTGTGTTTAAGTTTTTTTTAATTGAATAGGGGATAAATCTGATTCAA
ATATGAGTGAAATGAATGTCAGAAATATGTCAGAGGAGGAAAAAGAACTTCTTATAGAGA
AATTAGCTGGTTCTTTGAAAAAATATATAGGAAAATCAAAAGAATTTGAGAAATAGTATG
AAAAGGCTTTACTGCAATCTTCTAATGATCAAGAAATGCTCAGAAAAAAAGAAGAAGAGT
TAAATTGTATTATGGAATTACAACAATAAATCAAGCAAAAACTTGAAGATTACGGAGTGC
AAAATATAGATGAGTGCTTTTAAACTCTTTAAACATAGTTGGAATAAATCAAAGAACTCA
GATAACTACTTGAATAGCAATAAATTGAAGAGGAAAACACACTAAAAGCAGATTACTTTT
CTAATCAAAGATTAATGCAAAGATCTTTAGGATAATTGTATTTCTAAACAAAAAAAATAA
AATGGTGAAAACTGTTGTTGAAAAGAGCAATAAATACAGAAATCTAAAAATTCTAAAATT
ATATCTCAGTCATTGGAAATAATACCATGTTTTTTCAAAAATAAGAAAAACAAAATAAGA
AGACTTGCTTTAGAGAGTTTATGTTGGCTGTTTTTTTGCTTTAAAGTTTAATGTAAATAG
GAAAAAAGCATTAAAATAATTCTAAGAAAAATTCGAAAAAGGATTAGCAGTAATTTAGTT
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TTAGGAGTTTGTTTATATTTTTAGTTTCTAAAAAAAGAGAGAAGCAGGATGAAATTGCTG
CAGATGAGAAATACTCTTTTCTACTTTTGAAGAAAGGTTTCCAATCACTCTTTTATAATC
ATCTGCAACATTCAAATAGGAGAGATCCATTATATGAATAAAAAATGTAAATTGCAGAGG
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TTAAGTATAATTTTAGAGAGTTTAAGCTTGAAGATATCAGAATGAAGAAATTAACTAGCA
GAGCAGACAAGTTTTTAGGAAGAAGAGTAAAATTAATATTTCATCAAAATTCTTTTAATC
AAATATTTAATTAATTAGTAAAAGTATTGGCTTAGGGAAGCATTTAATGCATGGAAAGTT
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ATTAAAAAGTTTTCTAAATAATAAATCAAAGTAAAGCAATTTGCTAAAAATTACAATACC
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ATTTTTTTTATTTATTTTGAATAGCTTTTTAACTTTATTTAAAATAATAAAAGCAATATT
AAAAACAAGGCTACTAATTTATATCTAATTTATTACAAAATGGGAATAAACTGAAAAAGT
AGCTGAACAATCAGCTTGATGAAAAAAACATTCAACTAATGAGGGAGAATTAATACCTAA
ATGAATAATTAATAGAATAACAAAAGCAAATCTATTTAATTAATGAGGAATATTAATAGC
AGGTAGTTAAATCAGAATAACTTGCAAAATATAACCTAGAGAAAGATGTTTTAATTTAGC
AATTAATCAAGTAAAATAATGATCTCAAAGAGATTAACATCCAACTGACAGAAGTTGCTG
AGAAAAGAGAAGAAAACAATTAGAATTTGGAGAGCAACTTAAACATCATCTAAGACGAAT
ACGAGTAGCAGATTAGAAACTTAAAGAATGTCTAAATCTAATTCGATAAAGAAAGAGATC
TGCTAAATAGCAATATCTAAAATTTAAATATTGAGCTCAATGCAAAAATAGAAGAAATAA
GTGAGTTTAAAAGCATAACAGCAGCAAAGAATGAAGATTTTTACTAAGAAATAACCCAAC
TAAAGAACAAAATTTTAGCTTAAGATAAAATAATTGCAGAATACGAAGAGATGACAAAAA
GCTTGTCAAATACAGTAATTAATATTTATTTATAGGAAATAATTTAGTGAAAATATTTTA
TTAAGAACAAAGAAGTAGAGAGCTTAAACATTCATCTGAATGTAAGGGTAGAGTCTTTGC
AAGAAAGAATTTCAAATTTGCAAAAAGAATCAGCTATGCAAGTTTCTTCACTTGAGAAGT
AGTTAGAATTTGCTAACAGAGAGAGATCAAACTTGATTGCACAAAACACTTCTCTGATGA
ATTAAAATAAAACTTTTTAAGCAGAATTAAATCAGCTAAATCAAAACCTAAAAAAAGAGG
AGTTTAAAGTCTCTCTTCTCAGAGAGTAAGATTATGACAAAACTTCGTAATTTATACAGT
TGGCCAAAAATATTAATTCACCTAGCAGTAATTTTTATAAATCTATATTTATCAATTAAT
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AACTCTTCCTGAAGATTCTTTGATAGATGAAAGAGTTCTCAATACATCTCATTCAAGAAT
AAACACATTAATACAATAAAAAACAGACAGAAATTTATTCACTTAACCAATTACTTAGGA
AAATGGAATTTAAAATCCAAATAACAATTCTATATCATAATTTTTCTCCCATAAGGTTCC
CCAAATGAATCAAACTTAACATAATTCTATAAAAAAAGAAGTCTCTCCTTTGAGGGAATA
TCTAACTGACATGAAATTCAGGGCCTCAGTGTTTATAAAAACAATTGACATGGATGAAAA
AAGTAAAAAAATAAATATATTTTTATAATAAATTGAAGTTAACTTGAAAAATGATTAATA
GATAAAAAAAGCATAAGAAACTCACCATAAAAAGGCTGTATTTCCCCTTAAAAGACCTCA
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CAAGTTTATTTAATTATATATAATATATTGAATAAAGGAATCAATCACAAACAAGTGTGA
TAAAAGATGAAATTCAAAGAAGATTGAACAATTTAGACTATAAATTTAATGAGGATATCA
AAAAATTTTAATCTTAGCAATAGCAGTGA


>TTHERM_00547950(protein)
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