Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00547950

Standard Name

SFR6 (Sfi1 Repeat containing protein)

Aliases

PreTt15047 | 71.m00174 | 3729.m00051

Description

SFR6 hypothetical protein; cortical row basal body localization; predicted to have 12 Sfi1 repeats; Leucine Rich Repeat family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00467 ) KOW motif
  • ( PF00560 ) Leucine Rich Repeat
  • ( PF01920 ) Prefoldin subunit
  • ( PF04394 ) Protein of unknown function, DUF536
  • ( PF07989 ) Centrosomin N-terminal motif 1
  • ( PF08182 ) Pedibin/Hym-346 family
  • ( TIGR00042 ) non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1
  • ( TIGR02413 ) Bacillus tandem small hypothetical proetin

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_17049.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1041 aa)
WormBase WBGene00017320 0.0000000010002658722841845
Description: Uncharacterized protein F09G8.5 status:Partially_confirmed UniProt:P34390 protein_id:CCD62650.1
Tetrahymena borealis EI9_17489.1 0.0000000010002658722841845
Description: hypothetical protein (229 aa)
DictyBase DDB_G0284101 0.00000030014504373857585
Description: snrpA1 on chromosome: 4 position 1571395 to 1572487
SGD YPL169C 0.000009999254677478949
Description: MEX67 Poly(A)RNA binding protein involved in nuclear mRNA export, component of the nuclear pore; ortholog of human TAP

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00547950(coding)
ATGAGTCTACATAACTCTAAACAATACATTTCCAGTAAAAGCCCTTTCAAAGGCCCATTT
CCACTTTCTTAGTTCCTTGAAGAAAGACATTAAGATATATAAGGAAACCATTTAGTGTTT
TAAAATCACAATATCGATGAAATTGATGAGCTCTACATGGATATGTCAAAAATAAGATCT
ATTGATCTCTCATCAAACAGACTCAAATCTCTAAAAGGGATTCAACAATTTTAAGATTTA
AGAAACTTAAATATTTCAAATAACTAAATTTCAGATGTAAGCGAACTTTTCTATCTTAAA
GAGTTGCAGAATTTATAGATCCTAAATTTGAATAACAATCCAGTTGTTTAATAATAAAAC
TACAAACTCACTTTAATGACTATTCTACCTAAATTATAGGTTTTAGATAGTAAAAAATTA
TCTTAGACAGATGTAGAAGAAAATACAAGATAAGTCAAGTTTATGAACAACTAACTGAAT
TTACTTTATGAGAATTATTTGAAAATAGTGGAATTACAATCTATAATTTAAAGATTGCTG
ACACATAAAGAATATATATTCACCTTTGAACCTAATGTTATGAATCCACCATTTAATTTG
TAGAAATTTAGGAAAATTTTTAGCTATGGAGATACTATAGATGAAAAAGCTTAATAAGAA
ATCAAAACAAATTTATTAGCTGACGTTTAAACAATTTAAAATGAAATATTGAAAACTTAA
AAAATAGAAGAAGCATTTGCAGAAATGGAAAGGAGATAGATTGATAAAATCTAGTAATTA
GAGAATACTGTGCTATAAAAAGTTAAAGAGTACAAATACAACTGTCTCGATATTGAGATT
TTCCATAAGCTGAATAAAAATAATACCAAAATACAGAACTTAAAAAAATTTATAAACTTT
ACAAGATAAGAGTAGAAATAAGAAGTAGTTGTAGTAGGTAATAAAGGGAAAATATAAAGA
AATAGAAAAGATCAATAAAATATTTATGTTGAAGATAGCTAAAGTAGTTAGTCTTAATAG
AATAAAAACGAATAAGGTTAAATTTAATAAGATTTTTAAACAGATGAAAGCTTAAGAGGA
TCTTTTTAAAATTAAACTTTTACTGAAAGAGACCTGAAAAGATTAGCGAACATAAATAGG
GATAAATCTGATTCAAATATGAGTGAAATGAATGTCAGAAATATGTCAGAGGAGGAAAAA
GAACTTCTTATAGAGAAATTAGCTGGTTCTTTGAAAAAATATATAGGAAAATCAAAAGAA
TTTGAGAAATAGTATGAAAAGGCTTTACTGCAATCTTCTAATGATCAAGAAATGCTCAGA
AAAAAAGAAGAAGAGTTAAATTGTATTATGGAATTACAACAATAAATCAAGCAAAAACTT
GAAGATTACGGAGAAAAAGCATTTAGGAGTTTGTTTATATTTTTAGTTTCTAAAAAAAGA
GAGAAGCAGGATGAAATTGCTGCAGATGAGAAATACTCTTTTCTACTTTTGAAGAAAGGT
TTCCAATCACTCTTTTATAATCATCTGCAACATTCAAATAGGAGAGATCCATTATATGAA
TAAAAAATGTAAATTGCAGAGGACTCTAACATTAAATAAATTTAAATCAAAGTTCTTTCT
CGTTTTCGAGATGCATGTGAAAATTAAAAGTACAATAAAAAGAAAGTTATAGCCATGACT
TAAAGAATACAATGGGCAATGCTTAAGTATAATTTTAGAGAGTTTAAGCTTGAAGATATC
AGAATGAAGAAATTAACTAGCAGAGCAGACAAGTTTTTAGGAAGAAGATAAAAGTATTGG
CTTAGGGAAGCATTTAATGCATGGAAAGTTGATTTTCATAATTATTTATATGAAAAATAA
TAAGTAAACATGCAAATCTCAAAGTTTTAATTGTAAAGTGTTTTTAATACATTTAAGAGA
GGATATAAAATGTCTTGTCAGCAAACTGCAAACATATAAAATTATTAGAGAAGAAAAGAC
TTGCTCTTATACAGCCAATATTTTGCAATAATTAAAAAGTTTTCTAAATAATAAATCAAA
GTAAAGCAATTTGCTAAAAATTACAATACCAAAAAACAGCAATAATCTTTAAAATAATCG
CTTTAATGCATGAAAATACATACTTAACTGGTAAAAGAGAAAAAAATACTTGACAAAAAA
GTTAAAAAAATAATATTCACAAAAGTTATACAAAATTTAAGGTAAGTTTAAAATACCAAA
GTCCTTTAAAAGTAAAAATTGAAAAATGTCTTCAAGATCTAAAATTCTTAAAAGATATTC
TTAATTAAATAAGCCTTAAAAAAATGGAACAAAGAAGCTAATAGAGACAGAAAGCTTGAA
AGTGCTTTGAAATTCTATTAAAAAAATCAATATTAAAAACAAGGCTACTAATTTATATCT
AATTTATTACAAAATGGGAATAAACTGAAAAAGTAGCTGAACAATCAGCTTGATGAAAAA
AACATTCAACTAATGAGGGAGAATTAATACCTAAATGAATAATTAATAGAATAACAAAAG
CAAATCTATTTAATTAATGAGGAATATTAATAGCAGGTAGTTAAATCAGAATAACTTGCA
AAATATAACCTAGAGAAAGATGTTTTAATTTAGCAATTAATCAAGTAAAATAATGATCTC
AAAGAGATTAACATCCAACTGACAGAAGTTGCTGAGAAAAGAGAAGAAAACAATTAGAAT
TTGGAGAGCAACTTAAACATCATCTAAGACGAATACGAGTAGCAGATTAGAAACTTAAAG
AATGTCTAAATCTAATTCGATAAAGAAAGAGATCTGCTAAATAGCAATATCTAAAATTTA
AATATTGAGCTCAATGCAAAAATAGAAGAAATAAGTGAGTTTAAAAGCATAACAGCAGCA
AAGAATGAAGATTTTTACTAAGAAATAACCCAACTAAAGAACAAAATTTTAGCTTAAGAT
AAAATAATTGCAGAATACGAAGAGATGACAAAAAGCTTGTCAAATACAAACAAAGAAGTA
GAGAGCTTAAACATTCATCTGAATGTAAGGGTAGAGTCTTTGCAAGAAAGAATTTCAAAT
TTGCAAAAAGAATCAGCTATGCAAGTTTCTTCACTTGAGAAGTAGTTAGAATTTGCTAAC
AGAGAGAGATCAAACTTGATTGCACAAAACACTTCTCTGATGAATTAAAATAAAACTTTT
TAAGCAGAATTAAATCAGCTAAATCAAAACCTAAAAAAAGAGGAGTTTAAAGTCTCTCTT
CTCAGAGAGTAAGATTATGACAAAACTTCGTAATTTATACAGTTGGCCAAAAATATTAAT
TCACCTAGCAGAAAACAAGCATCGTCTCCATTAAGATTTACTGGAAGACTAAAAACTCTT
CCTGAAGATTCTTTGATAGATGAAAGAGTTCTCAATACATCTCATTCAAGAATAAACACA
TTAATACAATAAAAAACAGACAGAAATTTATTCACTTAACCAATTACTTAGGAAAATGGA
ATTTAAAATCCAAATAACAATTCTATATCATAATTTTTCTCCCATAAGGTTCCCCAAATG
AATCAAACTTAACATAATTCTATAAAAAAAGAAGTCTCTCCTTTGAGGGAATATCTAACT
GACATGAAATTCAGGGCCTCAGTGTTTATAAAAACAATTGACATGGATGAAAAAAATAAA
AAAAGCATAAGAAACTCACCATAAAAAGGCTGTATTTCCCCTTAAAAGACCTCATCACCA
CAGCTATATAAAAGCCAAAGAAATTTATAGAATCAATCACAAACAAGTGTGATAAAAGAT
GAAATTCAAAGAAGATTGAACAATTTAGACTATAAATTTAATGAGGATATCAAAAAATTT
TAATCTTAGCAATAGCAGTGA


>TTHERM_00547950(gene)
ATGAGTCTACATAACTCTAAACAATACGTAAGGAATTTTTATAAATATTCATTAAATAAT
TGTATTCATTTTATTTTAACTTACTATTTTATAGATTTCCAGTAAAAGCCCTTTCAAAGG
CCCATTTCCAGTATGATTTATTAATGATGTTGAAGATAAATTAAAGACTTTGCTAAAAAA
TTATTAAAATAGCTTTCTTAGTTCCTTGAAGAAAGACATTAAGATATATAAGGAAACCAT
TTAGTGTTTTAAAATCACAATATCGATGAAATTGATGAGCTCTACATGGATATGTCAAAA
ATAAGATCTATTGATCTCTCATCAAACAGACTCAAATCTCTAAAAGGGATTCAACAATTT
TAAGATTTAAGAAACTTAAATATTTCAAATAACTAAGTACATTTTACAAAAGAAAACCAA
TAGCTATTGATTGATTCATTTATATTTATTTTATTATAGATTTCAGATGTAAGCGAACTT
TTCTATCTTAAAGAGTTGCAGAATTTATAGATCCTAAATTTGAATAACAATCCAGTTGTT
TAATAATAAAACTACAAACTCACTTTAATGACTATTCTACCTAAATTATAGGTTTTAGAT
AGTAAAGTAAATATTTAAATTTAGAGATATAATTTAACATTTTATATTAGATACAATTAA
TTAATTGTGATTTTTTATTTTTATAAAAAGAAATTATCTTAGACAGATGTAGAAGAAAAT
ACAAGATAAGTCAAGTTTATGAACAACTAACTGAATTTACTTTATGAGAATTATTTGAAA
ATAGTGGAATTACAATCTGTAAGCAAAGTTTTTTAGATAAAAATAGAAAATATTTTAAAA
ATTAATTATAAGTTTTATATTAAAAAGATATTATTAAATCTTAAATAAATTTAATAAAAT
TTCAAAAGATAATTTAAAGATTGCTGACACATAAAGAATATATATTCACCTTTGAACCTA
ATGTTATGAATCCACCATTTAATTTGTAGAAATTTAGGAAAATTTTTAGCTATGGAGATA
CTATAGATGAAAAAGCTTAATAAGAAATCAAAACAAATTTATTAGCTGACGTTTAAACAA
TTTAAAATGAAATATTGAAAACGTAGGACTTTATTTTTTTTAAAACTCTTGTTTTTTAAA
TAAATTATTTAGTTAAAAAATAGAAGAAGCATTTGCAGAAATGGAAAGGAGATAGATTGA
TAAAATCTAGTAATTAGAGAATACTGTGCTATAAAAAGTTAAAGAGTACAAATACAACTG
TCTCGATATTGAGATTTTCCATAAGCTGAATAAAAATAATACCAAAATACAGAACTTAAA
AGTAAATTAAAATTAATATTTTATTTACCAAAACTAACACTCTAAAGAAGCTATTGATAT
TTGCTAGATTAAAAGCTGTTTAAAATAGATTTTAGAATATTTAGGATTTTATTCAATATC
TTATTAATTTTAGAAAAGAATTATAAAATTAATATTTAATTATTTACCAAAATTAACACT
CTAAAGTTTATTCAATATCTTATTAATTTTAGAAAAAAAGGATTTTATTCAATATTTTTT
TAACTTTAGAAAAGAATTATAAAAATAATTATTTAATATAGAAATTTATAAACTTTACAA
GATAAGAGTAGAAATAAGAAGTAGTTGTAGTAGGTAATAAAGGGAAAATATAAAGAAATA
GAAAAGATCAATAAAATATTTATGTTGAAGATAGCTAAAGTAGTTAGTCTTAATAGAATA
AAAACGAATAAGGTTAAATTTAATAAGATTTTTAAACAGATGAAAGCTTAAGAGGATCTT
TTTAAAATTAAACTTTTACTGAAAGAGACCTGAAAAGATTAGCGAACATAAATAGTAAAT
GGATTTAAGTTGGCTGTGTTTAAGTTTTTTTTAATTGAATAGGGGATAAATCTGATTCAA
ATATGAGTGAAATGAATGTCAGAAATATGTCAGAGGAGGAAAAAGAACTTCTTATAGAGA
AATTAGCTGGTTCTTTGAAAAAATATATAGGAAAATCAAAAGAATTTGAGAAATAGTATG
AAAAGGCTTTACTGCAATCTTCTAATGATCAAGAAATGCTCAGAAAAAAAGAAGAAGAGT
TAAATTGTATTATGGAATTACAACAATAAATCAAGCAAAAACTTGAAGATTACGGAGTGC
AAAATATAGATGAGTGCTTTTAAACTCTTTAAACATAGTTGGAATAAATCAAAGAACTCA
GATAACTACTTGAATAGCAATAAATTGAAGAGGAAAACACACTAAAAGCAGATTACTTTT
CTAATCAAAGATTAATGCAAAGATCTTTAGGATAATTGTATTTCTAAACAAAAAAAATAA
AATGGTGAAAACTGTTGTTGAAAAGAGCAATAAATACAGAAATCTAAAAATTCTAAAATT
ATATCTCAGTCATTGGAAATAATACCATGTTTTTTCAAAAATAAGAAAAACAAAATAAGA
AGACTTGCTTTAGAGAGTTTATGTTGGCTGTTTTTTTGCTTTAAAGTTTAATGTAAATAG
GAAAAAAGCATTAAAATAATTCTAAGAAAAATTCGAAAAAGGATTAGCAGTAATTTAGTT
TCGTTTAAGAGTATTTGTTTATAATCAATAATATATTTTTATATTAATAGGAAAAAGCAT
TTAGGAGTTTGTTTATATTTTTAGTTTCTAAAAAAAGAGAGAAGCAGGATGAAATTGCTG
CAGATGAGAAATACTCTTTTCTACTTTTGAAGAAAGGTTTCCAATCACTCTTTTATAATC
ATCTGCAACATTCAAATAGGAGAGATCCATTATATGAATAAAAAATGTAAATTGCAGAGG
ACTCTAACATTAAATAAATTTAAATCAAAGTTCTTTCTCGTTTTCGAGATGCATGTGAAA
ATTAAAAGTACAATAAAAAGAAAGTTATAGCCATGACTTAAAGAATACAATGGGCAATGC
TTAAGTATAATTTTAGAGAGTTTAAGCTTGAAGATATCAGAATGAAGAAATTAACTAGCA
GAGCAGACAAGTTTTTAGGAAGAAGAGTAAAATTAATATTTCATCAAAATTCTTTTAATC
AAATATTTAATTAATTAGTAAAAGTATTGGCTTAGGGAAGCATTTAATGCATGGAAAGTT
GATTTTCATAATTATTTATATGAAAAATAATAAGTAAACATGCAAATCTCAAAGTTTTAA
TTGTAAAGTGTTTTTAATACATTTAAGAGAGGATATAAAATGTCTTGTCAGCAAACTGCA
AACATATAAAATTATTAGAGAAGAAAAGACTTGCTCTTATACAGCCAATATTTTGCAATA
ATTAAAAAGTTTTCTAAATAATAAATCAAAGTAAAGCAATTTGCTAAAAATTACAATACC
AAAAAACAGCAATAATCTTTAAAATAATCGCTTTAATGCATGAAAATACATACTTAACTG
GTAAAAGAGAAAAAAATACTTGACAAAAAAGTTAAAAAAATAATATTCACAAAAGTTATA
CAAAATTTAAGGTAAGTTTAAAATACCAAAGTCCTTTAAAAGTAAAAATTGAAAAATGTC
TTCAAGATCTAAAATTCTTAAAAGATATTCTTAATTAAATAAGCCTTAAAAAAATGGAAC
AAAGAAGCTAATAGAGACAGAAAGCTTGAAAGTGCTTTGAAATTCTATTAAAAAAATGTA
ATTTTTTTTATTTATTTTGAATAGCTTTTTAACTTTATTTAAAATAATAAAAGCAATATT
AAAAACAAGGCTACTAATTTATATCTAATTTATTACAAAATGGGAATAAACTGAAAAAGT
AGCTGAACAATCAGCTTGATGAAAAAAACATTCAACTAATGAGGGAGAATTAATACCTAA
ATGAATAATTAATAGAATAACAAAAGCAAATCTATTTAATTAATGAGGAATATTAATAGC
AGGTAGTTAAATCAGAATAACTTGCAAAATATAACCTAGAGAAAGATGTTTTAATTTAGC
AATTAATCAAGTAAAATAATGATCTCAAAGAGATTAACATCCAACTGACAGAAGTTGCTG
AGAAAAGAGAAGAAAACAATTAGAATTTGGAGAGCAACTTAAACATCATCTAAGACGAAT
ACGAGTAGCAGATTAGAAACTTAAAGAATGTCTAAATCTAATTCGATAAAGAAAGAGATC
TGCTAAATAGCAATATCTAAAATTTAAATATTGAGCTCAATGCAAAAATAGAAGAAATAA
GTGAGTTTAAAAGCATAACAGCAGCAAAGAATGAAGATTTTTACTAAGAAATAACCCAAC
TAAAGAACAAAATTTTAGCTTAAGATAAAATAATTGCAGAATACGAAGAGATGACAAAAA
GCTTGTCAAATACAGTAATTAATATTTATTTATAGGAAATAATTTAGTGAAAATATTTTA
TTAAGAACAAAGAAGTAGAGAGCTTAAACATTCATCTGAATGTAAGGGTAGAGTCTTTGC
AAGAAAGAATTTCAAATTTGCAAAAAGAATCAGCTATGCAAGTTTCTTCACTTGAGAAGT
AGTTAGAATTTGCTAACAGAGAGAGATCAAACTTGATTGCACAAAACACTTCTCTGATGA
ATTAAAATAAAACTTTTTAAGCAGAATTAAATCAGCTAAATCAAAACCTAAAAAAAGAGG
AGTTTAAAGTCTCTCTTCTCAGAGAGTAAGATTATGACAAAACTTCGTAATTTATACAGT
TGGCCAAAAATATTAATTCACCTAGCAGTAATTTTTATAAATCTATATTTATCAATTAAT
AAATTTTAATAAAAAAGGAAAACAAGCATCGTCTCCATTAAGATTTACTGGAAGACTAAA
AACTCTTCCTGAAGATTCTTTGATAGATGAAAGAGTTCTCAATACATCTCATTCAAGAAT
AAACACATTAATACAATAAAAAACAGACAGAAATTTATTCACTTAACCAATTACTTAGGA
AAATGGAATTTAAAATCCAAATAACAATTCTATATCATAATTTTTCTCCCATAAGGTTCC
CCAAATGAATCAAACTTAACATAATTCTATAAAAAAAGAAGTCTCTCCTTTGAGGGAATA
TCTAACTGACATGAAATTCAGGGCCTCAGTGTTTATAAAAACAATTGACATGGATGAAAA
AAGTAAAAAAATAAATATATTTTTATAATAAATTGAAGTTAACTTGAAAAATGATTAATA
GATAAAAAAAGCATAAGAAACTCACCATAAAAAGGCTGTATTTCCCCTTAAAAGACCTCA
TCACCACAGCTATATAAAAGCCAAAGAAATTTATAGTACAATTTCATAATTCAAATAAAA
CAAGTTTATTTAATTATATATAATATATTGAATAAAGGAATCAATCACAAACAAGTGTGA
TAAAAGATGAAATTCAAAGAAGATTGAACAATTTAGACTATAAATTTAATGAGGATATCA
AAAAATTTTAATCTTAGCAATAGCAGTGA


>TTHERM_00547950(protein)
MSLHNSKQYISSKSPFKGPFPLSQFLEERHQDIQGNHLVFQNHNIDEIDELYMDMSKIRS
IDLSSNRLKSLKGIQQFQDLRNLNISNNQISDVSELFYLKELQNLQILNLNNNPVVQQQN
YKLTLMTILPKLQVLDSKKLSQTDVEENTRQVKFMNNQLNLLYENYLKIVELQSIIQRLL
THKEYIFTFEPNVMNPPFNLQKFRKIFSYGDTIDEKAQQEIKTNLLADVQTIQNEILKTQ
KIEEAFAEMERRQIDKIQQLENTVLQKVKEYKYNCLDIEIFHKLNKNNTKIQNLKKFINF
TRQEQKQEVVVVGNKGKIQRNRKDQQNIYVEDSQSSQSQQNKNEQGQIQQDFQTDESLRG
SFQNQTFTERDLKRLANINRDKSDSNMSEMNVRNMSEEEKELLIEKLAGSLKKYIGKSKE
FEKQYEKALLQSSNDQEMLRKKEEELNCIMELQQQIKQKLEDYGEKAFRSLFIFLVSKKR
EKQDEIAADEKYSFLLLKKGFQSLFYNHLQHSNRRDPLYEQKMQIAEDSNIKQIQIKVLS
RFRDACENQKYNKKKVIAMTQRIQWAMLKYNFREFKLEDIRMKKLTSRADKFLGRRQKYW
LREAFNAWKVDFHNYLYEKQQVNMQISKFQLQSVFNTFKRGYKMSCQQTANIQNYQRRKD
LLLYSQYFAIIKKFSKQQIKVKQFAKNYNTKKQQQSLKQSLQCMKIHTQLVKEKKILDKK
VKKIIFTKVIQNLRQVQNTKVLQKQKLKNVFKIQNSQKIFLIKQALKKWNKEANRDRKLE
SALKFYQKNQYQKQGYQFISNLLQNGNKLKKQLNNQLDEKNIQLMRENQYLNEQLIEQQK
QIYLINEEYQQQVVKSEQLAKYNLEKDVLIQQLIKQNNDLKEINIQLTEVAEKREENNQN
LESNLNIIQDEYEQQIRNLKNVQIQFDKERDLLNSNIQNLNIELNAKIEEISEFKSITAA
KNEDFYQEITQLKNKILAQDKIIAEYEEMTKSLSNTNKEVESLNIHLNVRVESLQERISN
LQKESAMQVSSLEKQLEFANRERSNLIAQNTSLMNQNKTFQAELNQLNQNLKKEEFKVSL
LREQDYDKTSQFIQLAKNINSPSRKQASSPLRFTGRLKTLPEDSLIDERVLNTSHSRINT
LIQQKTDRNLFTQPITQENGIQNPNNNSISQFFSHKVPQMNQTQHNSIKKEVSPLREYLT
DMKFRASVFIKTIDMDEKNKKSIRNSPQKGCISPQKTSSPQLYKSQRNLQNQSQTSVIKD
EIQRRLNNLDYKFNEDIKKFQSQQQQ