Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00547950

Standard Name

SFR6 (Sfi1 Repeat containing protein)

Aliases

PreTt15047 | 71.m00174 | 3729.m00051

Description

SFR6 hypothetical protein; cortical row basal body localization; predicted to have 12 Sfi1 repeats; Leucine Rich Repeat family protein

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Gene Ontology Annotations

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Domains

  • ( PF00467 ) KOW motif
  • ( PF00560 ) Leucine Rich Repeat
  • ( PF01920 ) Prefoldin subunit
  • ( PF04394 ) Protein of unknown function, DUF536
  • ( PF07989 ) Spindle associated
  • ( PF08182 ) Pedibin/Hym-346 family
  • ( TIGR00042 ) non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1
  • ( TIGR02413 ) Bacillus tandem small hypothetical proetin

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_17049.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1041 aa)
WormBase WBGene00017320 0.0000000010002658722841845
Description: Uncharacterized protein F09G8.5 status:Partially_confirmed UniProt:P34390 protein_id:CCD62650.1
DictyBase DDB_G0284101 0.00000030014504373857585
Description: snrpA1 on chromosome: 4 position 1571395 to 1572487
SGD YPL169C 0.000009999254677478949
Description: MEX67 Poly(A)RNA binding protein involved in nuclear mRNA export, component of the nuclear pore; ortholog of human TAP

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00547950(coding)
ATGAGTCTACATAACTCTAAACAATACATTTCCAGTAAAAGCCCTTTCAAAGGCCCATTT
CCACTTTCTTAGTTCCTTGAAGAAAGACATTAAGATATATAAGGAAACCATTTAGTGTTT
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GTCCTTTAAAAGTAAAAATTGAAAAATGTCTTCAAGATCTAAAATTCTTAAAAGATATTC
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AGTGCTTTGAAATTCTATTAAAAAAATCAATATTAAAAACAAGGCTACTAATTTATATCT
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AATATTGAGCTCAATGCAAAAATAGAAGAAATAAGTGAGTTTAAAAGCATAACAGCAGCA
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AAAATAATTGCAGAATACGAAGAGATGACAAAAAGCTTGTCAAATACAAACAAAGAAGTA
GAGAGCTTAAACATTCATCTGAATGTAAGGGTAGAGTCTTTGCAAGAAAGAATTTCAAAT
TTGCAAAAAGAATCAGCTATGCAAGTTTCTTCACTTGAGAAGTAGTTAGAATTTGCTAAC
AGAGAGAGATCAAACTTGATTGCACAAAACACTTCTCTGATGAATTAAAATAAAACTTTT
TAAGCAGAATTAAATCAGCTAAATCAAAACCTAAAAAAAGAGGAGTTTAAAGTCTCTCTT
CTCAGAGAGTAAGATTATGACAAAACTTCGTAATTTATACAGTTGGCCAAAAATATTAAT
TCACCTAGCAGAAAACAAGCATCGTCTCCATTAAGATTTACTGGAAGACTAAAAACTCTT
CCTGAAGATTCTTTGATAGATGAAAGAGTTCTCAATACATCTCATTCAAGAATAAACACA
TTAATACAATAAAAAACAGACAGAAATTTATTCACTTAACCAATTACTTAGGAAAATGGA
ATTTAAAATCCAAATAACAATTCTATATCATAATTTTTCTCCCATAAGGTTCCCCAAATG
AATCAAACTTAACATAATTCTATAAAAAAAGAAGTCTCTCCTTTGAGGGAATATCTAACT
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AAAAGCATAAGAAACTCACCATAAAAAGGCTGTATTTCCCCTTAAAAGACCTCATCACCA
CAGCTATATAAAAGCCAAAGAAATTTATAGAATCAATCACAAACAAGTGTGATAAAAGAT
GAAATTCAAAGAAGATTGAACAATTTAGACTATAAATTTAATGAGGATATCAAAAAATTT
TAATCTTAGCAATAGCAGTGA


>TTHERM_00547950(gene)
ATGAGTCTACATAACTCTAAACAATACGTAAGGAATTTTTATAAATATTCATTAAATAAT
TGTATTCATTTTATTTTAACTTACTATTTTATAGATTTCCAGTAAAAGCCCTTTCAAAGG
CCCATTTCCAGTATGATTTATTAATGATGTTGAAGATAAATTAAAGACTTTGCTAAAAAA
TTATTAAAATAGCTTTCTTAGTTCCTTGAAGAAAGACATTAAGATATATAAGGAAACCAT
TTAGTGTTTTAAAATCACAATATCGATGAAATTGATGAGCTCTACATGGATATGTCAAAA
ATAAGATCTATTGATCTCTCATCAAACAGACTCAAATCTCTAAAAGGGATTCAACAATTT
TAAGATTTAAGAAACTTAAATATTTCAAATAACTAAGTACATTTTACAAAAGAAAACCAA
TAGCTATTGATTGATTCATTTATATTTATTTTATTATAGATTTCAGATGTAAGCGAACTT
TTCTATCTTAAAGAGTTGCAGAATTTATAGATCCTAAATTTGAATAACAATCCAGTTGTT
TAATAATAAAACTACAAACTCACTTTAATGACTATTCTACCTAAATTATAGGTTTTAGAT
AGTAAAGTAAATATTTAAATTTAGAGATATAATTTAACATTTTATATTAGATACAATTAA
TTAATTGTGATTTTTTATTTTTATAAAAAGAAATTATCTTAGACAGATGTAGAAGAAAAT
ACAAGATAAGTCAAGTTTATGAACAACTAACTGAATTTACTTTATGAGAATTATTTGAAA
ATAGTGGAATTACAATCTGTAAGCAAAGTTTTTTAGATAAAAATAGAAAATATTTTAAAA
ATTAATTATAAGTTTTATATTAAAAAGATATTATTAAATCTTAAATAAATTTAATAAAAT
TTCAAAAGATAATTTAAAGATTGCTGACACATAAAGAATATATATTCACCTTTGAACCTA
ATGTTATGAATCCACCATTTAATTTGTAGAAATTTAGGAAAATTTTTAGCTATGGAGATA
CTATAGATGAAAAAGCTTAATAAGAAATCAAAACAAATTTATTAGCTGACGTTTAAACAA
TTTAAAATGAAATATTGAAAACGTAGGACTTTATTTTTTTTAAAACTCTTGTTTTTTAAA
TAAATTATTTAGTTAAAAAATAGAAGAAGCATTTGCAGAAATGGAAAGGAGATAGATTGA
TAAAATCTAGTAATTAGAGAATACTGTGCTATAAAAAGTTAAAGAGTACAAATACAACTG
TCTCGATATTGAGATTTTCCATAAGCTGAATAAAAATAATACCAAAATACAGAACTTAAA
AGTAAATTAAAATTAATATTTTATTTACCAAAACTAACACTCTAAAGAAGCTATTGATAT
TTGCTAGATTAAAAGCTGTTTAAAATAGATTTTAGAATATTTAGGATTTTATTCAATATC
TTATTAATTTTAGAAAAGAATTATAAAATTAATATTTAATTATTTACCAAAATTAACACT
CTAAAGTTTATTCAATATCTTATTAATTTTAGAAAAAAAGGATTTTATTCAATATTTTTT
TAACTTTAGAAAAGAATTATAAAAATAATTATTTAATATAGAAATTTATAAACTTTACAA
GATAAGAGTAGAAATAAGAAGTAGTTGTAGTAGGTAATAAAGGGAAAATATAAAGAAATA
GAAAAGATCAATAAAATATTTATGTTGAAGATAGCTAAAGTAGTTAGTCTTAATAGAATA
AAAACGAATAAGGTTAAATTTAATAAGATTTTTAAACAGATGAAAGCTTAAGAGGATCTT
TTTAAAATTAAACTTTTACTGAAAGAGACCTGAAAAGATTAGCGAACATAAATAGTAAAT
GGATTTAAGTTGGCTGTGTTTAAGTTTTTTTTAATTGAATAGGGGATAAATCTGATTCAA
ATATGAGTGAAATGAATGTCAGAAATATGTCAGAGGAGGAAAAAGAACTTCTTATAGAGA
AATTAGCTGGTTCTTTGAAAAAATATATAGGAAAATCAAAAGAATTTGAGAAATAGTATG
AAAAGGCTTTACTGCAATCTTCTAATGATCAAGAAATGCTCAGAAAAAAAGAAGAAGAGT
TAAATTGTATTATGGAATTACAACAATAAATCAAGCAAAAACTTGAAGATTACGGAGTGC
AAAATATAGATGAGTGCTTTTAAACTCTTTAAACATAGTTGGAATAAATCAAAGAACTCA
GATAACTACTTGAATAGCAATAAATTGAAGAGGAAAACACACTAAAAGCAGATTACTTTT
CTAATCAAAGATTAATGCAAAGATCTTTAGGATAATTGTATTTCTAAACAAAAAAAATAA
AATGGTGAAAACTGTTGTTGAAAAGAGCAATAAATACAGAAATCTAAAAATTCTAAAATT
ATATCTCAGTCATTGGAAATAATACCATGTTTTTTCAAAAATAAGAAAAACAAAATAAGA
AGACTTGCTTTAGAGAGTTTATGTTGGCTGTTTTTTTGCTTTAAAGTTTAATGTAAATAG
GAAAAAAGCATTAAAATAATTCTAAGAAAAATTCGAAAAAGGATTAGCAGTAATTTAGTT
TCGTTTAAGAGTATTTGTTTATAATCAATAATATATTTTTATATTAATAGGAAAAAGCAT
TTAGGAGTTTGTTTATATTTTTAGTTTCTAAAAAAAGAGAGAAGCAGGATGAAATTGCTG
CAGATGAGAAATACTCTTTTCTACTTTTGAAGAAAGGTTTCCAATCACTCTTTTATAATC
ATCTGCAACATTCAAATAGGAGAGATCCATTATATGAATAAAAAATGTAAATTGCAGAGG
ACTCTAACATTAAATAAATTTAAATCAAAGTTCTTTCTCGTTTTCGAGATGCATGTGAAA
ATTAAAAGTACAATAAAAAGAAAGTTATAGCCATGACTTAAAGAATACAATGGGCAATGC
TTAAGTATAATTTTAGAGAGTTTAAGCTTGAAGATATCAGAATGAAGAAATTAACTAGCA
GAGCAGACAAGTTTTTAGGAAGAAGAGTAAAATTAATATTTCATCAAAATTCTTTTAATC
AAATATTTAATTAATTAGTAAAAGTATTGGCTTAGGGAAGCATTTAATGCATGGAAAGTT
GATTTTCATAATTATTTATATGAAAAATAATAAGTAAACATGCAAATCTCAAAGTTTTAA
TTGTAAAGTGTTTTTAATACATTTAAGAGAGGATATAAAATGTCTTGTCAGCAAACTGCA
AACATATAAAATTATTAGAGAAGAAAAGACTTGCTCTTATACAGCCAATATTTTGCAATA
ATTAAAAAGTTTTCTAAATAATAAATCAAAGTAAAGCAATTTGCTAAAAATTACAATACC
AAAAAACAGCAATAATCTTTAAAATAATCGCTTTAATGCATGAAAATACATACTTAACTG
GTAAAAGAGAAAAAAATACTTGACAAAAAAGTTAAAAAAATAATATTCACAAAAGTTATA
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AAAAACAAGGCTACTAATTTATATCTAATTTATTACAAAATGGGAATAAACTGAAAAAGT
AGCTGAACAATCAGCTTGATGAAAAAAACATTCAACTAATGAGGGAGAATTAATACCTAA
ATGAATAATTAATAGAATAACAAAAGCAAATCTATTTAATTAATGAGGAATATTAATAGC
AGGTAGTTAAATCAGAATAACTTGCAAAATATAACCTAGAGAAAGATGTTTTAATTTAGC
AATTAATCAAGTAAAATAATGATCTCAAAGAGATTAACATCCAACTGACAGAAGTTGCTG
AGAAAAGAGAAGAAAACAATTAGAATTTGGAGAGCAACTTAAACATCATCTAAGACGAAT
ACGAGTAGCAGATTAGAAACTTAAAGAATGTCTAAATCTAATTCGATAAAGAAAGAGATC
TGCTAAATAGCAATATCTAAAATTTAAATATTGAGCTCAATGCAAAAATAGAAGAAATAA
GTGAGTTTAAAAGCATAACAGCAGCAAAGAATGAAGATTTTTACTAAGAAATAACCCAAC
TAAAGAACAAAATTTTAGCTTAAGATAAAATAATTGCAGAATACGAAGAGATGACAAAAA
GCTTGTCAAATACAGTAATTAATATTTATTTATAGGAAATAATTTAGTGAAAATATTTTA
TTAAGAACAAAGAAGTAGAGAGCTTAAACATTCATCTGAATGTAAGGGTAGAGTCTTTGC
AAGAAAGAATTTCAAATTTGCAAAAAGAATCAGCTATGCAAGTTTCTTCACTTGAGAAGT
AGTTAGAATTTGCTAACAGAGAGAGATCAAACTTGATTGCACAAAACACTTCTCTGATGA
ATTAAAATAAAACTTTTTAAGCAGAATTAAATCAGCTAAATCAAAACCTAAAAAAAGAGG
AGTTTAAAGTCTCTCTTCTCAGAGAGTAAGATTATGACAAAACTTCGTAATTTATACAGT
TGGCCAAAAATATTAATTCACCTAGCAGTAATTTTTATAAATCTATATTTATCAATTAAT
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AACTCTTCCTGAAGATTCTTTGATAGATGAAAGAGTTCTCAATACATCTCATTCAAGAAT
AAACACATTAATACAATAAAAAACAGACAGAAATTTATTCACTTAACCAATTACTTAGGA
AAATGGAATTTAAAATCCAAATAACAATTCTATATCATAATTTTTCTCCCATAAGGTTCC
CCAAATGAATCAAACTTAACATAATTCTATAAAAAAAGAAGTCTCTCCTTTGAGGGAATA
TCTAACTGACATGAAATTCAGGGCCTCAGTGTTTATAAAAACAATTGACATGGATGAAAA
AAGTAAAAAAATAAATATATTTTTATAATAAATTGAAGTTAACTTGAAAAATGATTAATA
GATAAAAAAAGCATAAGAAACTCACCATAAAAAGGCTGTATTTCCCCTTAAAAGACCTCA
TCACCACAGCTATATAAAAGCCAAAGAAATTTATAGTACAATTTCATAATTCAAATAAAA
CAAGTTTATTTAATTATATATAATATATTGAATAAAGGAATCAATCACAAACAAGTGTGA
TAAAAGATGAAATTCAAAGAAGATTGAACAATTTAGACTATAAATTTAATGAGGATATCA
AAAAATTTTAATCTTAGCAATAGCAGTGA


>TTHERM_00547950(protein)
MSLHNSKQYISSKSPFKGPFPLSQFLEERHQDIQGNHLVFQNHNIDEIDELYMDMSKIRS
IDLSSNRLKSLKGIQQFQDLRNLNISNNQISDVSELFYLKELQNLQILNLNNNPVVQQQN
YKLTLMTILPKLQVLDSKKLSQTDVEENTRQVKFMNNQLNLLYENYLKIVELQSIIQRLL
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