Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00584840

Standard Name

SWI3

Aliases

PreTt04091 | 80.m00137 | 3675.m00035

Description

SWIRM domain protein; SANT domain containing protein. Member of the SWI/SNF complex.

Genome Browser (Macronucleus)

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• nucleus (IEA) | GO:0005634

Molecular Function

• DNA binding (IEA) | GO:0003677

Domains

• ( PF00249 ) Myb-like DNA-binding domain
• ( PF04433 ) SWIRM domain
• ( PF04702 ) Vicilin N terminal region
• ( TIGR01954 ) transcription termination factor NusA, C-terminal

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_15229.1	9.997093137033517e-262
	Description: SWIRM domain-containing protein (1016 aa)
Oxytricha	Contig17870.0.g72	2.0009381340492598e-66
	Description: SWIRM domain
SGD	YFR037C	6.000354955737408e-39
	Description: RSC8 Component of the RSC chromatin remodeling complex; essential for viability and mitotic growth; homolog of SWI/SNF subunit Swi3p, but unlike Swi3p, does not activate transcription of reporters
DictyBase	DDB_G0277033	1.0003081162615753e-33
	Description: swi3 on chromosome: 2 position 7295274 to 7299183
WormBase	WBGene00004203	4.000054831110256e-33
	Description: locus:swsn-1 status:Confirmed UniProt:G5EF87 protein_id:CAB54337.2
Stentor Coeruleus	SteCoe_12813	1.4251640827409352e-21
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10

Sequences

>TTHERM_00584840(coding)
ATGAAATAAAAAAAAAATCAGATAGTTATAAATTTGTTAAAGTTACCCAACAATTCATAC
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>TTHERM_00584840(gene)
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AATCACATTGCAGAAACAGTTAGTCTTGCTTATCGCAGAAATGAATTCAATAAAGAATTC
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>TTHERM_00584840(protein)
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