Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00586840

Standard Name

RAD3L5 (RADiation sensitive protein family 3-like protein 5)

Aliases

PreTt24096 | 81.m00153 | 3726.m00032

Description

type III restriction enzyme res subunit; Type III restriction enzyme- res subunit family protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
  • ( PF04488 ) Glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD
  • ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
  • ( PF06733 ) DEAD_2
  • ( PF08486 ) Stage II sporulation protein
  • ( TIGR00604 ) DNA repair helicase (rad3)

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_16927.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (879 aa)
Oxytricha Contig243.0.g104 7.000402845995459e-29
Description: Helicase C-terminal domain
DictyBase DDB_G0286621 6.001696815660978e-24
Description: fncJ on chromosome: 4 position 4729555 to 4732791
SGD YPL008W 8.998359040303252e-24
Description: CHL1 Probable DNA helicase involved in sister-chromatid cohesion and genome integrity; interacts with ECO1 and CTF18; mutants are defective in silencing, rDNA recombination, aging and the heat shock response; FANCJ-like helicase family member
WormBase WBGene00001049 9.998720540547892e-23
Description: locus:dog-1 status:Partially_confirmed UniProt:O62217 protein_id:CAB04262.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:23884606: Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79

Sequences

>TTHERM_00586840(coding)
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>TTHERM_00586840(gene)
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ATTGAAGCCTATGATAATTTTTTAGATATGAAGGCTTTAGAGAAAACAGACTAAGATTAA
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>TTHERM_00586840(protein)
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