Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00645780

Standard Name

XRN1 (5'-3' exoribonuclease 1)

Aliases

PreTt15783 | 93.m00079 | 3727.m00001

Description

XRN1 XRN 5-prime-3-prime exonuclease amine-terminal protein; XRN 5'-3' exonuclease N-terminus family protein; 5'-3' exoribonuclease

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External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

  • ( PF03159 ) XRN 5'-3' exonuclease N-terminus
  • ( PF17846 ) Xrn1 helical domain
  • ( PF18129 ) Xrn1 SH3-like domain

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

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General Information

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Associated Literature

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Sequences 

>TTHERM_00645780(coding)
ATGGGAGTTCCTGGATTTTATAGTTGGTTAGCTCGTAGATACCCTTTGATTCTTCACTAA
ATCAAGAAAGGTGAAGTTCCTAACATAGATTGTTTTTACCTCGATATGAATGGTATCATT
TATAAATGCTCTAAGGATGAAGGCACTGTTTTCAAAGACTTGCTTTTATAGAGAAACATT
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GATATCTGCGATGATAATGATGAAAAGGATTAAGAAAAAAATGATTAAAAAAATCAAGTC
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TTAGGAAAATCATATTATTATTAGCAAAAGCTTAACTTAGATTTCAAGAATTTTGATGAT
ATTAAGACATTAGATTTATTGATAACTAAGTATTTAGAAGGTTTATAGTTTGTTTTGCTT
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TCACATGAATATATTGTAGTCCTTCCCTTTATGGACTAAAAATTAATAGATGATGTTTAT
TCTTCTATTGATTAAGTAAAAACTTTAACTCCTTAGGAAAGAGAGCGCAATTAATTTGGA
AAGAATATTAAGTACAAATTTGACCATAACTTTGCTCCTATTACTATTTAGAGCACACTT
CCTAATTACTATAAGGACTTTTAAGTAACTTTGAAAGTAGAAACATTTGATATCGGTAAA
GTATACTCTCCACCCACAAATCCTTAAGGTGAAGCTTTATCTAGATTCCCTACTCTCCAT
GCTAAATAGGTTATTGGATGTGAGATTGATAAAGTAGAAAAAGGTTTACAAATGAAAATC
AGAGTTAAAAGTGATTTGACTGAGGCAGATATTGTTAATAAAGTTAGAGGAAAACCTAAA
TATGATGCTTATTGCAAATACCCTAATTGCGAAAAAGTATAAGTCACTGGTTTTCTAACT
GAAAGTACTTTCAAAAATATATGGAAGAATAAGAATCTTTCCATCCTTGAAAATTTAGAC
TACAGTGAAGATTCTCATCACAGTTTCTATTTAAAAATAAAAGACGAACTGTCCTAAACA
TTTTACAAGAAGGGAGGAATTATATACAACCATTCTAATCCCGTGATTGCCATTTTGTTA
AAGTATACTGAAGGTAGAAGAACTTTAAAGGGTACTATTATAGAAAACAGTGATAAATAT
GAGGAGATGTTTTGTCCTCTTGATTTATTAATGAAGGAATAGAAAATCGAAAAAGTCATT
CAAGTTACTAAATGTGATAATATAGAAAAAGAGTTCCCTATTGGTTGTAAAGTTGTAATA
GCTTAAAAAGGAAATCTTGATGGTCATACAGGTATTGTGACAGGATACACCAAAGGAAAG
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AGAAGACATCTTAATGAAGTTGTTCCTGAACTTGCTCGTATTAATGAAGCATCTTAAAAT
ATTTCAGGACGTGAAAAGTATCAATAATTTAGAGAATTGGAATTGAGTCCTTCATTAGTT
AAGTTAATTATTGAATACTATAATGCTTACCCAAAAATATTTGCTTTTGTTGCTAAACTT
TCATAATTAAGAAAGAAGGATAAAAACGCTAATTTTTACTCTGGCTAAATTTGGTCTAAA
GAAGGCCAAGATCCTAACATTGAATTAGTTAAGCTATATATTTGGTTAATGAAAAAGAAG
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TAGTTGGTCAAATTTTAAGATGAATTTGTTTAAACTAAGCTCAACATTCCTTAAAAAGAT
TAGACCATTCATTAAATAGATGCCAACAATGCTATTCCTGCCGTCTATAGCTCAAAACAA
TATATTTACTTTAAAGATTAACCTTTTTACCATGAGGTAGGTGACTAAGTAATTTACATA
GGTACTTATAACACTAAGAATGCTCCTTTTGGACTATAGGGAACTATAGTTGGTATCATG
GATGACAAATTTGAAGTTGTCTTTATAAAACCTTTCATCGGAGGTGTTAATTTAGGAGGT
CGTTGTCCTCCTCAACGTGGTCTCGTAGTTTAATTCGATGAAATTTATAACTTACAAGGT
TGGAATAATTTCTTGCAAAACAGAGACAATTCTAAAGAAAATACTTTAGGCTGGAATGGA
TGGGTTGATGAGTACAAACCTCAATTCCGTGAAGCTATCAAGAGCGATAAAGATCTCTAA
AATAAATAAGCTAATAATGAAACTTAAAAGTTAATAGGTGAGATCATGCATTAACCAGAA
GCTAATTTGAAATCTGAGACTAGTGATAAGCCCAAAACTAATGTCATAGCAGTTATCAAA
AAGCAAACAAATGGTTCAAAAGGAACTGATACCATTTCAGAGGTAACTCAAGAACAAGCT
TCAGCTTAGATAGCTTAATAACAATAATAAGGCAAAGTCACTATTGGACCTGCTCCAACA
ACTGTTCCTCAAAAAACTGAACAGAAACAATAGACATAATCTACTTCTCCTAGCAAAACA
GAGACCTAGAAGAAACCTTAGAAGGAAACTGTCATTTATGTTAAGAAATCAGAAGTTAGT
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AAAGAATCTGAAAGCGTTAAATAAGAAAAAGTGGAAGAATCTCAACAACAATAAATCGTT
TAAGAGGCTGCATTATAAGCTCAAGAAGTATAAATAGTTAAATCTGATTAAATAGAAGTG
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TTATTGCAAGAATAGAAACAATTCTAGGAAGAAGAACAAAAGCACTAAATTTTGGATGTT
TCTGAGATTGAAAAACAATAAACTGATGTCTAAGAATTCGAAATTCCAAAGGAGTGCAAC
TTAGAAGAAATCGAAAAATAAATGCTTCAAGATCAATTTGAGCATATTAAACATCAAGAT
TAAAAAGATCCCGAAATGTTGGATGTTGCGAAATTCGAAAAAGAATAAATGGAACTAGCT
TAAAAAGAAGCCAAGGGATAAAATCAAGAATCCAACAAATTTTAAGATGATGATAAAGAT
GATACATAAAAACTAAGCAGAAAGCAGAAGAAATTAAAAAATAAAGATATTACTGGTTTT
AATCCTGGATAAAGTGCCGTATAGTTTAAAAATAGAGAATAAGTTAACTAAGAAAAGAGA
ATGAAAAGAAACGAAAAGAGGTTAATGATTCAAGAACAAAATCTTTAATATTAATAATAT
TAGCAATATTATCAATATCTTTATTTGTGGTAGTAGTAATTTATTAAATAGAAAACTTAA
GAAATGGAAGCATTTAAGAGAAGATAAGAAGAAGAAAGGATCAACAAGAGTCTTGCTCAG
CTTACAAATCCCGTTACAGAAGGTGAATCAGTCAACTAAGATCTAATTAACATACAGAAT
GCTCTAGAACAATAGAATTCAAAGAACTCAAATTTACCTCAAGATATTTAAATGGTTGAC
TCTTCTCAAATAGAGCAAAAGCTTTCAGAAAATATTATTCCTTAGGTTCCTTTAACTACA
ATCTAACAAGGCAATGTAAGAAATGAAATTGTAGGAAATTTAACTGCTGAAGACTTGGAA
AACTTCGAAGAATTAGAAAGACAATATCTCAGTTCATTAAATAAATGA



>TTHERM_00645780(gene)
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AGAATAGAATCAAATTTAGAAAAGCACAAAAAGCGAAAACAAACAAACAAACAAAGAATA
GTAAATAGCAAAAGCATAGCGATAGCTTGTATTTTATAGAAATGGGAGTTCCTGGATTTT
ATAGTTGGTTAGCTCGTAGATACCCTTTGATTCTTCACTAAATCAAGAAAGGTGAAGTTC
CTAACATAGATTGTTTTTACCTCGATATGAATGGTATCATTTATAAATGCTCTAAGGATG
AAGGCACTGTTTTCAAAGACTTGCTTTTATAGAGAAACATTTAGGAAATTTTCTCAATGA
TATTTAATTATATTGATGAAATGGTCAACTTAGTAGAACCAAAGAAAGTTTTGTATCTCT
TTCTTGATGGCCCATGTCCTCGTGCTAAGTAAAACCAATAGCGTACTCGTCGTTTTTAGA
GCGCTCAATCATGGAAAGACTTGAATGATTCTCTAAGAAACTGTGGTTTCCTATCCGAAG
GAGAGACGATGAAGAATAACTCTATCTCAACAGGTACAGAATTCATGCATGATTTGAATA
AGTAGCTCCATTTTTATATCTGCAAGAAATTCGAATAAGATCCTCGTTGGTCCAATCTTG
AAGTTTTCTTTAGTGGATCCAACGTACCTGGTGAAGGTGAACATAAAATTATTAATTTTA
TGCATTAGTATTGTTCATCCTAAGATTATGATCCAACTACTACTCATTGTATTTATGGTG
CAGATGCAGATCTTATCATGTTAGGCTTATCTACCCATATTAAATATGTCTCAATTCTGA
GAGAAGAAATGAAATTTTAACCTCCTGTAAGTAGAGCTGCTAAAAGAGATAGAGAATCAG
TAACATTTTAGATGATCTACTTAAATATAGTTAGAGAATATATGGAGTTAGAATATAAGA
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GAGAAGGACAATTTGAAATTTTGATTTAGATTTATAAAGATTATCTAGTTGAAGCAGATT
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TAGCAGAAGTTGAGCTTGATTTTATTGGAGATAAAGCTACAGATATCACAAAGGAATATA
AAAGACGTATCAAGCATCAATCAGATAAAGATCAAGAAATCGGAGATGATGAAGTTCCCG
GAGTTAAAAAAGGAAATGATAAGAAAAACTCCTCTTCAGAAGGTGAAAATGATGAAGATG
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ATGAAAAGGATTAAGAAAAAAATGATTAAAAAAATCAAGTCACTTTCTAACAAAATTTTG
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TTATTAATGATTTATAAGAAAATTATAAAAAAGATTAGTTTTTAGGAAAATCATATTATT
ATTAGCAAAAGCTTAACTTAGATTTCAAGAATTTTGATGATATTAAGACATTAGATTTAT
TGATAACTAAGTATTTAGAAGGTTTATAGTTTGTTTTGCTTTATTACTACCAAGGATGTC
CTTCCTGGAGCTGGTATTTCCCATTCTATTATGCTCCTATGACTTCAGATATCAGTTTAT
TCTTGAATTACAAGGCTGAACATTTATCATAAGAAATTGTATTTGATCTTTCCGAACCAT
ACCCTCCTATGAAATAGTTAATGTGTATTATACATCCTGAAAATGCAAATTTGCTCCCTA
AGCCTTTTGCTCAATTATTGACTGATCCTAATTCAAAATTAAGAAGCCCTGTAGATTACT
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TCCTTCCCTTTATGGACTAAAAATTAATAGATGATGTTTATTCTTCTATTGATTAAGTAA
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TTGACCATAACTTTGCTCCTATTACTATTTAGAGCACACTTCCTAATTACTATAAGGACT
TTTAAGTAACTTTGAAAGTAGAAACATTTGATATCGGTAAAGTATACTCTCCACCCACAA
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GTGAGATTGATAAAGTAGAAAAAGGTTTACAAATGAAAATCAGAGTTAAAAGTGATTTGA
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ACCCTAATTGCGAAAAAGTATAAGTCACTGGTTTTCTAACTGAAAGTACTTTCAAAAATA
TATGGAAGAATAAGAATCTTTCCATCCTTGAAAATTTAGACTACAGTGAAGATTCTCATC
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TTTAATTAAAGACTAAGCCTGTCTATTTGACTGACAATCAACTAAAATTCTACTCAAAGG
ATGATGAAGCATTCATAACCTTGAAATTTTTGTCATTCAAGCTTTAATTATCATAAGATG
TTTTACTTGATATCTTAGATAGCTTTAGCATTAAAATTGAACCTAATCTTCCTTCTGCTA
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ATCAATAATTTAGAGAATTGGAATTGAGTCCTTCATTAGTTAAGTTAATTATTGAATACT
ATAATGCTTACCCAAAAATATTTGCTTTTGTTGCTAAACTTTCATAATTAAGAAAGAAGG
ATAAAAACGCTAATTTTTACTCTGGCTAAATTTGGTCTAAAGAAGGCCAAGATCCTAACA
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ATGCCAACAATGCTATTCCTGCCGTCTATAGCTCAAAACAATATATTTACTTTAAAGATT
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TCTTTATAAAACCTTTCATCGGAGGTGTTAATTTAGGAGGTCGTTGTCCTCCTCAACGTG
GTCTCGTAGTTTAATTCGATGAAATTTATAACTTACAAGGTTGGAATAATTTCTTGCAAA
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CTCAATTCCGTGAAGCTATCAAGAGCGATAAAGATCTCTAAAATAAATAAGCTAATAATG
AAACTTAAAAGTTAATAGGTGAGATCATGCATTAACCAGAAGCTAATTTGAAATCTGAGA
CTAGTGATAAGCCCAAAACTAATGTCATAGCAGTTATCAAAAAGCAAACAAATGGTTCAA
AAGGAACTGATACCATTTCAGAGGTAACTCAAGAACAAGCTTCAGCTTAGATAGCTTAAT
AACAATAATAAGGCAAAGTCACTATTGGACCTGCTCCAACAACTGTTCCTCAAAAAACTG
AACAGAAACAATAGACATAATCTACTTCTCCTAGCAAAACAGAGACCTAGAAGAAACCTT
AGAAGGAAACTGTCATTTATGTTAAGAAATCAGAAGTTAGTTAATAATAATAAGTAGAAT
AAAAATAACCAAGCACCTAAATTACCCAATAAGAAGAGAAAAAAGAATCTGAAAGCGTTA
AATAAGAAAAAGTGGAAGAATCTCAACAACAATAAATCGTTTAAGAGGCTGCATTATAAG
CTCAAGAAGTATAAATAGTTAAATCTGATTAAATAGAAGTGCCAAAAGAAGATAATAGTA
ATCAAAATGAAAACATTTAAGATGTCTCTGAAATAGAAAAGTTATTGCAAGAATAGAAAC
AATTCTAGGAAGAAGAACAAAAGCACTAAATTTTGGATGTTTCTGAGATTGAAAAACAAT
AAACTGATGTCTAAGAATTCGAAATTCCAAAGGAGTGCAACTTAGAAGAAATCGAAAAAT
AAATGCTTCAAGATCAATTTGAGCATATTAAACATCAAGATTAAAAAGATCCCGAAATGT
TGGATGTTGCGAAATTCGAAAAAGAATAAATGGAACTAGCTTAAAAAGAAGCCAAGGGAT
AAAATCAAGAATCCAACAAATTTTAAGATGATGATAAAGATGATACATAAAAACTAAGCA
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TATAGTTTAAAAATAGAGAATAAGTTAACTAAGAAAAGAGAATGAAAAGAAACGAAAAGA
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AAGGTGAATCAGTCAACTAAGATCTAATTAACATACAGAATGCTCTAGAACAATAGAATT
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GAAATGAAATTGTAGGAAATTTAACTGCTGAAGACTTGGAAAACTTCGAAGAATTAGAAA
GACAATATCTCAGTTCATTAAATAAATGATTATTTTAATATTTTAATTTGTTTACTTCTT
ATTTTTATTTAAATATAATATATATGTAAAGTTTACTTAAATAAATAAATCAATCAATAA
TTATAAATGTTAATCAAAGCTGTGTACTTTTTTACTATATTATTTTTC



>TTHERM_00645780(protein)
MGVPGFYSWLARRYPLILHQIKKGEVPNIDCFYLDMNGIIYKCSKDEGTVFKDLLLQRNI
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