Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00645780

Standard Name

XRN1 (5'-3' exoribonuclease 1)

Aliases

PreTt15783 | 93.m00079 | 3727.m00001

Description

XRN1 XRN 5-prime-3-prime exonuclease amine-terminal protein; XRN 5'-3' exonuclease N-terminus family protein

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• intracellular anatomical structure (IEA) | GO:0005622

Molecular Function

• exonuclease activity (IEA) | GO:0004527
• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676

Domains

• ( PF02524 ) KID repeat
• ( PF03159 ) XRN 5'-3' exonuclease N-terminus
• ( PF06994 ) Involucrin
• ( TIGR01612 ) rhoptry protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_18801.1	9.997093137033517e-262
	Description: XRN 5-3 exonuclease (1743 aa)
Tetrahymena borealis	EI9_12510.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (641 aa)
WormBase	WBGene00012730	2.0009157491910723e-107
	Description: locus:xrn-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q9BHK7 protein_id:CAC35856.3
DictyBase	DDB_G0276137	2.999467474389571e-105
	Description: xrn1 on chromosome: 2 position 6232603 to 6238286
Oxytricha	Contig18254.0.g13	2.0008734984431652e-95
	Description: XRN 5-3 exonuclease N-terminus
SGD	YGL173C	2.0000012618802033e-84
	Description: XRN1 Evolutionarily-conserved 5-3 exonuclease component of cytoplasmic processing (P) bodies involved in mRNA decay; plays a role in microtubule-mediated processes, filamentous growth, ribosomal RNA maturation, and telomere maintenance
Stentor Coeruleus	SteCoe_17518	7.984904245686979e-30
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00645780(coding)
ATGGGAGTTCCTGGATTTTATAGTTGGTTAGCTCGTAGATACCCTTTGATTCTTCACTAA
ATCAAGAAAGGTGAAGTTCCTAACATAGATTGTTTTTACCTCGATATGAATGGTATCATT
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GGTACTTATAACACTAAGAATGCTCCTTTTGGACTATAGGGAACTATAGTTGGTATCATG
GATGACAAATTTGAAGTTGTCTTTATAAAACCTTTCATCGGAGGTGTTAATTTAGGAGGT
CGTTGTCCTCCTCAACGTGGTCTCGTAGTTTAATTCGATGAAATTTATAACTTACAAGGT
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TGGGTTGATGAGTACAAACCTCAATTCCGTGAAGCTATCAAGAGCGATAAAGATCTCTAA
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GCTAATTTGAAATCTGAGACTAGTGATAAGCCCAAAACTAATGTCATAGCAGTTATCAAA
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TTATTGCAAGAATAGAAACAATTCTAGGAAGAAGAACAAAAGCACTAAATTTTGGATGTT
TCTGAGATTGAAAAACAATAAACTGATGTCTAAGAATTCGAAATTCCAAAGGAGTGCAAC
TTAGAAGAAATCGAAAAATAAATGCTTCAAGATCAATTTGAGCATATTAAACATCAAGAT
TAAAAAGATCCCGAAATGTTGGATGTTGCGAAATTCGAAAAAGAATAAATGGAACTAGCT
TAAAAAGAAGCCAAGGGATAAAATCAAGAATCCAACAAATTTTAAGATGATGATAAAGAT
GATACATAAAAACTAAGCAGAAAGCAGAAGAAATTAAAAAATAAAGATATTACTGGTTTT
AATCCTGGATAAAGTGCCGTATAGTTTAAAAATAGAGAATAAGTTAACTAAGAAAAGAGA
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TAGCAATATTATCAATATCTTTATTTGTGGTAGTAGTAATTTATTAAATAGAAAACTTAA
GAAATGGAAGCATTTAAGAGAAGATAAGAAGAAGAAAGGATCAACAAGAGTCTTGCTCAG
CTTACAAATCCCGTTACAGAAGGTGAATCAGTCAACTAAGATCTAATTAACATACAGAAT
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TCTTCTCAAATAGAGCAAAAGCTTTCAGAAAATATTATTCCTTAGGTTCCTTTAACTACA
ATCTAACAAGGCAATGTAAGAAATGAAATTGTAGGAAATTTAACTGCTGAAGACTTGGAA
AACTTCGAAGAATTAGAAAGACAATATCTCAGTTCATTAAATAAATGA

>TTHERM_00645780(gene)
ATGGGAGTTCCTGGATTTTATAGTTGGTTAGCTCGTAGATACCCTTTGATTCTTCACTAA
ATCAAGAAAGGTGAAGTTCCTAACATAGATTGTTTTTACCTCGATATGAATGGTATCATT
TATAAATGCTCTAAGGATGAAGGCACTGTTTTCAAAGACTTGCTTTTATAGAGAAACATT
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AAGAAAGTTTTGTATCTCTTTCTTGATGGCCCATGTCCTCGTGCTAAGTAAAACCAATAG
CGTACTCGTCGTTTTTAGAGCGCTCAATCATGGAAAGACTTGAATGATTCTCTAAGAAAC
TGTGGTTTCCTATCCGAAGGAGAGACGATGAAGAATAACTCTATCTCAACAGGTACAGAA
TTCATGCATGATTTGAATAAGTAGCTCCATTTTTATATCTGCAAGAAATTCGAATAAGAT
CCTCGTTGGTCCAATCTTGAAGTTTTCTTTAGTGGATCCAACGTACCTGGTGAAGGTGAA
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ACTCATTGTATTTATGGTGCAGATGCAGATCTTATCATGTTAGGCTTATCTACCCATATT
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AATATTATTTATTTCAACTAGAATAAATTTAATAAACAAAAATTCATTTCATGCGCTCCA
ATAATAAGTATGGTCGCTTTCAAGATAACGAAATTAAAATGATATTATCTTCATTTTGAA
TCATTTTCTATTTATTATTTTGTTCAACCGATAATTAATTAAAGACTTTTTAAAAAATAA
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CTTCAATAGATAATTTAAAGAATAGCAGAAGTTGAGCTTGATTTTATTGGAGATAAAGCT
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GGAACTATAGTTGGTATCATGGATGACAAATTTGAAGTTGTCTTTATAAAACCTTTCATC
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AATAAATGA

>TTHERM_00645780(protein)
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