Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00645780

Standard Name

XRN1 (5'-3' exoribonuclease 1)

Aliases

PreTt15783 | 93.m00079 | 3727.m00001

Description

XRN1 XRN 5-prime-3-prime exonuclease amine-terminal protein; XRN 5'-3' exonuclease N-terminus family protein

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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_18801.1 9.997093137033517e-262
Description: XRN 5-3 exonuclease (1743 aa)
Tetrahymena borealis EI9_12510.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (641 aa)
WormBase WBGene00012730 2.0009157491910723e-107
Description: locus:xrn-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q9BHK7 protein_id:CAC35856.3
DictyBase DDB_G0276137 2.999467474389571e-105
Description: xrn1 on chromosome: 2 position 6232603 to 6238286
Oxytricha Contig18254.0.g13 2.0008734984431652e-95
Description: XRN 5-3 exonuclease N-terminus
SGD YGL173C 2.0000012618802033e-84
Description: XRN1 Evolutionarily-conserved 5-3 exonuclease component of cytoplasmic processing (P) bodies involved in mRNA decay; plays a role in microtubule-mediated processes, filamentous growth, ribosomal RNA maturation, and telomere maintenance
Stentor Coeruleus SteCoe_17518 7.984904245686979e-30
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00645780(coding)
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GATGACAAATTTGAAGTTGTCTTTATAAAACCTTTCATCGGAGGTGTTAATTTAGGAGGT
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TGGGTTGATGAGTACAAACCTCAATTCCGTGAAGCTATCAAGAGCGATAAAGATCTCTAA
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GCTAATTTGAAATCTGAGACTAGTGATAAGCCCAAAACTAATGTCATAGCAGTTATCAAA
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TCAGCTTAGATAGCTTAATAACAATAATAAGGCAAAGTCACTATTGGACCTGCTCCAACA
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TCTGAGATTGAAAAACAATAAACTGATGTCTAAGAATTCGAAATTCCAAAGGAGTGCAAC
TTAGAAGAAATCGAAAAATAAATGCTTCAAGATCAATTTGAGCATATTAAACATCAAGAT
TAAAAAGATCCCGAAATGTTGGATGTTGCGAAATTCGAAAAAGAATAAATGGAACTAGCT
TAAAAAGAAGCCAAGGGATAAAATCAAGAATCCAACAAATTTTAAGATGATGATAAAGAT
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AACTTCGAAGAATTAGAAAGACAATATCTCAGTTCATTAAATAAATGA


>TTHERM_00645780(gene)
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ATCAAGAAAGGTGAAGTTCCTAACATAGATTGTTTTTACCTCGATATGAATGGTATCATT
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TGTGGTTTCCTATCCGAAGGAGAGACGATGAAGAATAACTCTATCTCAACAGGTACAGAA
TTCATGCATGATTTGAATAAGTAGCTCCATTTTTATATCTGCAAGAAATTCGAATAAGAT
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AATATTATTTATTTCAACTAGAATAAATTTAATAAACAAAAATTCATTTCATGCGCTCCA
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TCATTTTCTATTTATTATTTTGTTCAACCGATAATTAATTAAAGACTTTTTAAAAAATAA
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GCAAGTAATTATATTAAATTATTTATTTATTTAACAAACCGGCAAATAAATAACTATTTA
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AATAAATGA


>TTHERM_00645780(protein)
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