Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00647070

Standard Name

UTP21 (Predicted U3 snoRNP protein Utp21)

Aliases

PreTt15813 | 93.m00109 | 3727.m00029

Description

UTP21 Utp21 specific WD40 associated domain protein; Subunit of U3-containing 90S preribosome and Small Subunit (SSU) processome complexes involved in production of 18S rRNA and assembly of small ribosomal subunit

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External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

  • ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
  • ( PF03178 ) CPSF A subunit region
  • ( PF04192 ) Utp21 specific WD40 associated putative domain
  • ( PF06430 ) Lactococcus lactis RepB C-terminus

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_18819.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (909 aa)
Tetrahymena borealis EI9_12540.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (232 aa)
Oxytricha Contig6655.0.g84 2.999277470785175e-69
Description: Utp21 specific WD40 associated putative domain
SGD YLR409C 9.999353957415832e-59
Description: UTP21 Subunit of U3-containing 90S preribosome and Small Subunit (SSU) processome complexes involved in production of 18S rRNA and assembly of small ribosomal subunit; synthetic defect with STI1 Hsp90 cochaperone; human homolog linked to glaucoma
DictyBase DDB_G0277019 3.0006824396935516e-51
Description: wdr36 on chromosome: 2 position 7238641 to 7241913
WormBase WBGene00012887 4.9986056260133516e-43
Description: status:Partially_confirmed UniProt:O62477 protein_id:CAA16382.5
Stentor Coeruleus SteCoe_13519 5.900090541597061e-29
Description: None

General Information

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Associated Literature

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Sequences

>TTHERM_00647070(coding)
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>TTHERM_00647070(gene)
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ATATTATTTCTAGCATGGCTGAACATTTTGCTAGAATTCCTAATTGA


>TTHERM_00647070(protein)
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