Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00647070

Standard Name

UTP21 (Predicted U3 snoRNP protein Utp21)

Aliases

PreTt15813 | 93.m00109 | 3727.m00029

Description

UTP21 Utp21 specific WD40 associated domain protein; Subunit of U3-containing 90S preribosome and Small Subunit (SSU) processome complexes involved in production of 18S rRNA and assembly of small ribosomal subunit

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

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Domains

• ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
• ( PF03178 ) CPSF A subunit region
• ( PF04192 ) Utp21 specific WD40 associated domain
• ( PF06430 ) Lactococcus lactis RepB C-terminus

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_18819.1	9.997093137033517e-262
	Description: hypothetical protein (909 aa)
Oxytricha	Contig6655.0.g84	2.999277470785175e-69
	Description: Utp21 specific WD40 associated putative domain
SGD	YLR409C	9.999353957415832e-59
	Description: UTP21 Subunit of U3-containing 90S preribosome and Small Subunit (SSU) processome complexes involved in production of 18S rRNA and assembly of small ribosomal subunit; synthetic defect with STI1 Hsp90 cochaperone; human homolog linked to glaucoma
DictyBase	DDB_G0277019	3.0006824396935516e-51
	Description: wdr36 on chromosome: 2 position 7238641 to 7241913
WormBase	WBGene00012887	4.9986056260133516e-43
	Description: status:Partially_confirmed UniProt:O62477 protein_id:CAA16382.5
Stentor Coeruleus	SteCoe_13519	5.900090541597061e-29
	Description: None

General Information

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Associated Literature

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Sequences

>TTHERM_00647070(coding)
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>TTHERM_00647070(gene)
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ATATTATTTCTAGCATGGCTGAACATTTTGCTAGAATTCCTAATTGA

>TTHERM_00647070(protein)
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FDSTDELDLKNAYFSRVIKISGDELMRDTQYKEVIEQIRNKIQNSWQALMDKQYIISSMA
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