Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00648910

Standard Name

IFT52 (IntraFlagellar Transport 52 homolog)

Aliases

PreTt09205 | 94.m00123 | 3677.m00031

Description

IFT52 intraflagellar transporter-like protein; Intraflagellar transport protein; essential for ciliary assembly- maintenance- and rotokinesis

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• cilium (IDA) | GO:0005929

Biological Process

• cilium assembly (IMP) | GO:0042384
• obsolete movement of cell or subcellular component (IMP) | GO:0006928
• septum digestion after cytokinesis (IMP) | GO:0000920

Domains

• ( PF01857 ) Retinoblastoma-associated protein B domain

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_17844.1	9.997093137033517e-262
	Description: IFT52/Intraflagellar transporter 52 (435 aa)
Oxytricha	Contig15520.0.g51	2.0005106264580874e-134
	Description: ABC-type uncharacterized transport system
WormBase	WBGene00003886	2.9990539278805726e-74
	Description: locus:osm-6 status:Confirmed UniProt:G5EDF6 protein_id:CAB61026.2
Stentor Coeruleus	SteCoe_19883	3.1743585474772134e-60
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:12925756: Brown JM, Fine NA, Pandiyan G, Thazhath R, Gaertig J (2003) Hypoxia regulates assembly of cilia in suppressors of Tetrahymena lacking an intraflagellar transport subunit gene. Molecular biology of the cell 14(8):3192-207

Sequences

>TTHERM_00648910(coding)
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>TTHERM_00648910(gene)
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TTTAAGCATATTTTAATATTTAATAATAACAGATAAATTTCAAGAAGCTCAATAACTGA

>TTHERM_00648910(protein)
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