Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00658770

Standard Name

RRM42 (RNA recognition motif-containing protein 42)

Aliases

PreTt02162 | 97.m00148 | 3724.m00055

Description

RRM42 polypyrimidine tract-binding protein; RNA recognition motif domain

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00076 ) RNA recognition motif
  • ( PF13893 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00658770(coding)
ATGAATCCATCAAATGACACTACCAAAGGGTAACCATTTTACATAGAAAAAGAAGATTAA
GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
TTAAACAATAATTTGGATGAAAATTGTGAGTCACCAAGCGATACTACTCATAGTAACTCG
AACATAGTAAATGAAAAATAAAATCTTTAAGCTTATCTTATGTTTGACTCGGGAAATTCA
TCTCAACCTCAAAATGAGTGCTCTAAGGAAATAGATGGTTTGATTGCCTCTGAAAAAAAG
GAAAAAAGTTTAAGTCAAGAAATTGAAAATAAGCAGCAAACTTAGTCTTAAACAGATCTT
TAAATAATAAAAAAGTAGGAATAGCAACAAGACTCTAGTTCTTAATCTGATTATTAGTAT
TTATATTATGTAAGTAGCAATAATAATGGCAATAGCAACAATGATAGCAGCAAAAACTAA
ATGAATAATGATAACAATTCTGGCGGCAATAACAATACCAACAAACATTTTGGAATCAGT
AATAATAATATTAGCCCTTAGAATGATTCAAGTTCTAAGATTGATTAATTGTCAAAAGGG
ATTAGACCTTCTAAAGTTCTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCATAGAA
CATAGAATTATTTTTGAAAAGTTTTCATTTTTTGGAGAGGTAGAATAGATTCTTATATTT
AGTAAGAAGCAACCATGGAAATTGTTTGTGGATATGAATTCAATAGAAGTTGCTATAAAG
GCTAAAAATGCGCTTGAAAACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAG
GTTTAATTTTCGAGCCAATAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAAACTAT
AAAGATTTAAACAAGAAATTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCA
ACCTCTTCATAAAGCTAAAACTTATATTAATCAGCTCAAATTATGGATATGAACAGGCGC
CATATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAA
ATGCTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCT
CCATAAAAGGTCTAAATAATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATA
CCTTAGTAAATGGCCCCAATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGCCTTAA
GTTCCTATCTATTAAACAGGTAGAGATTCTCCACAAATGATGCAAAATTCAGGTTTAGCT
CATCCAAAAATCAATATGACAGGATCAGTTTAAATGTAATCGGGAAATTTAATTTAAATG
GCACCTTATAATTAATACGAGTAGCTTTAATAACCTTTAATGACTTATAGCTTTGGTGGA
AACCCTGTAATTCTTAAGGATGATTCTTTTTCAAATTAATAGGTTCAGCAGAATTAGAAT
TAGTTATTCTAATCTTAACATTATATTGGCTAGCATTTAAATAATTAGTATTAACAACCT
AAGTCTGAAATGACTAGCAGTTTGCAATATCCCATTAATTAAATATCTAGCTATCACTAA
ACAATAAATATGACTTAATCTATGAATATTCATAGCAATAGTATGACTTTCAGTAAACCC
TAAGAATCTATTTTTGCATTAAATAAAAATGATAATAACCCAAAAAATGAATCAGTAGAA
CAACTTGATGATATCTTAGAAAGAATCCAAAATAATCAGTTTGAAAACTCTGGCGAAATT
TCTAAAGAAGACCTTAAAGACTTAGAAGAGCAAAAATCAAATTCATTTGACGATTTTAAA
GGATTTAATGATCAAAAGACAAGTATTGGTTAAGAAAATTTATAAAATAATCAACAATTG
TTAAATAGCTCTGACAATAGGAATGGCATTAACTAATCTCCCTTTAGTCCTGAGTAAAAA
AGTATTTAACCATAATCCACCATGCAAAGATCTCATAGCAATAGTTCAGATGGGAATTAA
ATGACTGGCATCTAAAAATTAGATTAACTTATTGGATAGGCGTAAGGTTCAGATTAATCT
GATGGTGAATAATACCCACTATCAGACGATGAAGGACCTACTTTTCCTTTCTAAAAAACT
TAATAAAAATCTTAGCAATAATAACCTATTAGAGCAATATAGTAACTGGATACTCAGCTA
AAAACATAATATGGTAGTAATAATTAAGGAGCTTACTTTATAAATATGTAAGGCAGTGCA
GGATAGTAGAATTAAAGCGCAAATATTATTGGAAATTAATTAATGAGCTCATCTTAAGGC
AAGCCTATTCATGGTAGCTTAATGATGTAGCCATATATTTAAAATAATTAATTAAATTAA
AATTAATCTCTCATGAACCAAGGATAAGTATAAATGCTACAGCAGTAAGCTAATTCTGGA
GTTTAATTTGGTCAATTTTAAAACTAAAATGCTAATAACTCGTATTAGTAAATACCAAAT
TAGTATGGATACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAACCCAGCT
TATGCCTAATCATGCATGTTAGTTAATTAGCAGTAATAATAAAATTTATAATTATAACAA
TCTGGTTAGGTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATGTAAATT
AAACCAAATTTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAAAATATG
GGAACTTTCAATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAACCTTCT
TTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTCTACAAT
ATCTTTAGCAATTTTGGTGACATAGTTAAAATTATATTGAAAAGAAATAAATGTACAGCT
TTCATTGAGTATACGATGTAAGAGAACGCTACAAAAGCAAAGGAATTTATGGATAAAAAA
ATCTTCTTTGATAATGAGATCAGAGTATTCTATTCTCACTTTGAAACTCTCTAAAAATAA
GATGACAAATTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAAAAAGAT
AGCAAAATGACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAATAAGAA
ATTTGTGATCACGAGAAAATACATGAATTGTTCCGTCCTTATGGCAAAATTGAAGCAATC
CATATTGAAAAAGTTCCTCCTAGATACATGAGCCATATAAAATTTTCTTCGTTGAAGGAG
TCTTTAATGGCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGCTTATT
TCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTAAAAAT
ATTCAATTCAACAATTGA



>TTHERM_00658770(gene)
ATTAATAAGTTAAAATTGGTAACATTGATATATTTTTTTATAAATTATCTAGTACTTTAT
TCAAAGAATTAACATATATATATAAGAAAGCTAGTTAGCCTTAAATCAATCAATATTTTG
CTGCCATAAAAAAATTAAGAAATTAACAAATTGAGATATCATTTTCTGCAAAGCAAACAA
AAAGAATGAATCCATCAAATGACACTACCAAAGGGTAACCATTTTACATAGAAAAAGAAG
ATTAAGAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATA
CTAACTTAAACAATAATTTGGATGAAAATTGTGAGTCACCAAGCGATACTACTCATAGTA
ACTCGAACATAGTAAATGAAAAATAAAATCTTTAAGCTTATCTTATGTTTGACTCGGGAA
ATTCATCTCAACCTCAAAATGAGTGCTCTAAGGAAATAGATGGTTTGATTGCCTCTGAAA
AAAAGGAAAAAAGTTTAAGTCAAGAAATTGAAAATAAGCAGCAAACTTAGTCTTAAACAG
ATCTTTAAATAATAAAAAAGTAGGAATAGCAACAAGACTCTAGTTCTTAATCTGATTATT
AGTATTTATATTATGTAAGTAGCAATAATAATGGCAATAGCAACAATGATAGCAGCAAAA
ACTAAATGAATAATGATAACAATTCTGGCGGCAATAACAATACCAACAAACATTTTGGAA
TCAGTAATAATAATATTAGCCCTTAGAATGATTCAAGTTCTAAGATTGATTAATTGTCAA
AAGGGATTAGACCTTCTAAAGTTCTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCA
TAGAACATAGAATTATTTTTGAAAAGTTTTCATTTTTTGGAGAGGTAGAATAGATTCTTA
TATTTAGTAAGAAGCAACCATGGAAATTGTTTGTGGATATGAATTCAATAGAAGTTGCTA
TAAAGGCTAAAAATGCGCTTGAAAACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAA
TGAAGGTTTAATTTTCGAGCCAATAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAA
ACTATAAAGATTTAAACAAGAAATTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTG
ATCCAACCTCTTCATAAAGCTAAAACTTATATTAATCAGCTCAAATTATGGATATGAACA
GGCGCCATATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGT
TACAAATGCTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGG
TTCCTCCATAAAAGGTCTAAATAATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAAT
ACATACCTTAGTAAATGGCCCCAATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGC
CTTAAGTTCCTATCTATTAAACAGGTAGAGATTCTCCACAAATGATGCAAAATTCAGGTT
TAGCTCATCCAAAAATCAATATGACAGGATCAGTTTAAATGTAATCGGGAAATTTAATTT
AAATGGCACCTTATAATTAATACGAGTAGCTTTAATAACCTTTAATGACTTATAGCTTTG
GTGGAAACCCTGTAATTCTTAAGGATGATTCTTTTTCAAATTAATAGGTTCAGCAGAATT
AGAATTAGTTATTCTAATCTTAACATTATATTGGCTAGCATTTAAATAATTAGTATTAAC
AACCTAAGTCTGAAATGACTAGCAGTTTGCAATATCCCATTAATTAAATATCTAGCTATC
ACTAAACAATAAATATGACTTAATCTATGAATATTCATAGCAATAGTATGACTTTCAGTA
AACCCTAAGAATCTATTTTTGCATTAAATAAAAATGATAATAACCCAAAAAATGAATCAG
TAGAACAACTTGATGATATCTTAGAAAGAATCCAAAATAATCAGTTTGAAAACTCTGGCG
AAATTTCTAAAGAAGACCTTAAAGACTTAGAAGAGCAAAAATCAAATTCATTTGACGATT
TTAAAGGATTTAATGATCAAAAGACAAGTATTGGTTAAGAAAATTTATAAAATAATCAAC
AATTGTTAAATAGCTCTGACAATAGGAATGGCATTAACTAATCTCCCTTTAGTCCTGAGT
AAAAAAGTATTTAACCATAATCCACCATGCAAAGATCTCATAGCAATAGTTCAGATGGGA
ATTAAATGACTGGCATCTAAAAATTAGATTAACTTATTGGATAGGCGTAAGGTTCAGATT
AATCTGATGGTGAATAATACCCACTATCAGACGATGAAGGACCTACTTTTCCTTTCTAAA
AAACTTAATAAAAATCTTAGCAATAATAACCTATTAGAGCAATATAGTAACTGGATACTC
AGCTAAAAACATAATATGGTAGTAATAATTAAGGAGCTTACTTTATAAATATGTAAGGCA
GTGCAGGATAGTAGAATTAAAGCGCAAATATTATTGGAAATTAATTAATGAGCTCATCTT
AAGGCAAGCCTATTCATGGTAGCTTAATGATGTAGCCATATATTTAAAATAATTAATTAA
ATTAAAATTAATCTCTCATGAACCAAGGATAAGTATAAATGCTACAGCAGTAAGCTAATT
CTGGAGTTTAATTTGGTCAATTTTAAAACTAAAATGCTAATAACTCGTATTAGTAAATAC
CAAATTAGTATGGATACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAACC
CAGCTTATGCCTAATCATGCATGTTAGTTAATTAGCAGTAATAATAAAATTTATAATTAT
AACAATCTGGTTAGGTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATGT
AAATTAAACCAAATTTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAAA
ATATGGGAACTTTCAATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAAC
CTTCTTTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTCT
ACAATATCTTTAGCAATTTTGGTGACATAGTTAAAATTATATTGAAAAGAAATAAATGTA
CAGCTTTCATTGAGTATACGATGTAAGAGAACGCTACAAAAGCAAAGGAATTTATGGATA
AAAAAATCTTCTTTGATAATGAGATCAGAGTATTCTATTCTCACTTTGAAACTCTCTAAA
AATAAGATGACAAATTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAAA
AAGATAGCAAAATGACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAAT
AAGAAATTTGTGATCACGAGAAAATACATGAATTGTTCCGTCCTTATGGCAAAATTGAAG
CAATCCATATTGAAAAAGTTCCTCCTAGATACATGAGCCATATAAAATTTTCTTCGTTGA
AGGAGTCTTTAATGGCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGC
TTATTTCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTA
AAAATATTCAATTCAACAATTGATTTTTAAGAAACTAAAAAATAAATAAAACAACGAATT
TTAAATACCAAATATCTAAAAATAGACAACTAGAGTTATGTAAGTTTTTATTCAATTCTC
TAATTTAAATTTGACTTTATTCTTTCCTATGTATTCTTACTCATTTCCCTCCATTACCAA
GTCCTCCTCATTTATTTCTTATTTATGTATATTTTGAGTATTCCAATAATTAATTAAATT
TTA



>TTHERM_00658770(protein)
MNPSNDTTKGQPFYIEKEDQEQGKIQNTNQMINQEQNHTNLNNNLDENCESPSDTTHSNS
NIVNEKQNLQAYLMFDSGNSSQPQNECSKEIDGLIASEKKEKSLSQEIENKQQTQSQTDL
QIIKKQEQQQDSSSQSDYQYLYYVSSNNNGNSNNDSSKNQMNNDNNSGGNNNTNKHFGIS
NNNISPQNDSSSKIDQLSKGIRPSKVLLVMVQNPQDEVIEHRIIFEKFSFFGEVEQILIF
SKKQPWKLFVDMNSIEVAIKAKNALENSSICVNNLELKMKVQFSSQQNLVLKNGNGGINY
KDLNKKFEKTQLSYSIKIDPTSSQSQNLYQSAQIMDMNRRHIASQFVSAQSMQLPNPQLQ
MLKVTDPSAVQSMTFQVGVPPQKVQIMSSSLIQQDQNQYIPQQMAPIVVTNSGMQTIQPQ
VPIYQTGRDSPQMMQNSGLAHPKINMTGSVQMQSGNLIQMAPYNQYEQLQQPLMTYSFGG
NPVILKDDSFSNQQVQQNQNQLFQSQHYIGQHLNNQYQQPKSEMTSSLQYPINQISSYHQ
TINMTQSMNIHSNSMTFSKPQESIFALNKNDNNPKNESVEQLDDILERIQNNQFENSGEI
SKEDLKDLEEQKSNSFDDFKGFNDQKTSIGQENLQNNQQLLNSSDNRNGINQSPFSPEQK
SIQPQSTMQRSHSNSSDGNQMTGIQKLDQLIGQAQGSDQSDGEQYPLSDDEGPTFPFQKT
QQKSQQQQPIRAIQQLDTQLKTQYGSNNQGAYFINMQGSAGQQNQSANIIGNQLMSSSQG
KPIHGSLMMQPYIQNNQLNQNQSLMNQGQVQMLQQQANSGVQFGQFQNQNANNSYQQIPN
QYGYNMRQNRQRMQQNSNPAYAQSCMLVNQQQQQNLQLQQSGQVNLQQFDGQNISYSMQI
KPNFHSMSTNISGMRMEENMGTFNGSTYIKQGFLEDSKPSLVIYVNHLMNKDITVTHLYN
IFSNFGDIVKIILKRNKCTAFIEYTMQENATKAKEFMDKKIFFDNEIRVFYSHFETLQKQ
DDKFQEQFIGSEQTNRFQKDSKMTLNPPSLVLHISSLKQEICDHEKIHELFRPYGKIEAI
HIEKVPPRYMSHIKFSSLKESLMAIAHMHNKEIKGRKMLISFTRKKLDTTTKNVVTYSKN
IQFNN