Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00675560

Standard Name

HCF2 (HeteroChromatin Factor 2)

Aliases

PreTt10997 | 101.m00152

Description

HCF2 Tc5 transposase DNA-binding domain protein; Heterochromatin formation protein; associated with DNA rearrangement in macronucleus; hypothetical protein

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00675560(coding)
ATGTATATGAAATCACTAAAAAACAAAATCCATACTAAATACATAGCTAAAAAAAGGCGC
TTTTAAATTTAAAAATTTTATCAGGAATTATTTCTTATCAAAAAGGTGTGTCTGATCACA
AAATAATATCAAACTATTTATCTTGCTACTTAAGATTTTTTAATATTTGATGAAATTTAG
TAAAGGAAAGAATAAAAAGTAGAACTAAATCATTTAATATAGATGCACAGTGAAAAAAAA
GATTTTAAACTTAATTCTGCTGCCACTTCAGATTTATTTTACAATAGACAGTAATTTATT
TAACTCGTTAATGAGCAAATTTAACTTTTGGAGACATCTGTAGATAGTTAGAATCTTAAT
GAGCAGTATAAATTCTTATCTGGTTTCTTAAGAGAGAGTAGTAGCTTAGTTATTTTTTTG
CAGCAACAAATGTAAACTCTTTACAAGTTAAGAATTTATCAATTATCTGCTGTTTCGGTT
GAAAGAAATCAGCTAACTCCACCAAAATATGATTATTTGAGTAATACTGAATGTACATTT
TAAGATTTGTTTAGTAGAAACGAGCAGCTTAAAAGTCAATCTTCCTTTCAAAGGGCTTTT
GATAAATCTGTTTAGTAAAGCGATTCTAATTTTTACATTTACCCGAAGCAACTAGCTGAA
GAAAATAATAGTTAAAACAATAATAAGTATTTTGATTATATGAACAATATTACTCCTCAA
CAATATTAATAAAAGTATTAACTTTACAACAACTCTTCTTTTTTTAATGATAAAAACGAA
GATTTATTTCCTGTAAATCTTAGTGAGTCCTTTAAGAAAATTAAGAACTACTCAGATTTT
TTCGATAACCAAAATAACAAGCAATCTACTAACTTTTCTGAATACTTTGATACTAAGAAT
AGATACAGAATACTTAAGCAATAAAACCTTGAGCTAGATTTCATCAAAGTTAAACAACCA
ACCATCACAGATGAGGCTAAAGAAAATTATGTCAGCTAATTTGGCAATTAAAGTTAGGGC
AAGCAAATAAAAATTGTAAAAAAGAATACCTGTAGTAACAATAATTTGGCTATATTTTCT
TCTCCACAGCAAGCGATGGCTCAAGAAGAAAAGATACAGTCTAAGAACTTCTCGTTTGAA
GACATGGATGTTTATGAAGAAAAAAATACAGATAAAAATTATAACTAAAAGTTTTTAAGA
CAAGAAATTCCCGTTTAAGAGTTTTAACTTTTAAATTTGCCTGGTTCTTCTCCCAAGCAG
CAGAATGGTGGCACTCCTTATAAAACATTTAAAGAAAAGTAGCTCTATTAAAAACCAATA
AATTCTAATTAAACCAAACAAATATAGAAATTCAATTAAAATAATAGCTATCTAGACTAT
GATTTTGACATACAAGAAGGAAGTGTTTTAAAAAATTGTTAAAAATTGAATATTTTAAAT
AATTAGGTTACAAATAATTAAAATGAGAAGAAGTCTTTTAACATGGATAATTCTAAATAA
ATTAATGTATTAGGTACTTTGCAAAAAAATATTTAAGAAAATGGCTAAATTGATTCATCT
CAATTTAAGTAAAATCACTACAAAAATGATATTTCAAATACATAAGAAAGGAATACTTAA
AACAATTTGCTTGGAGGAGCTTAAAACATTTTACAGACAAATAATTAATGCAATTTATTG
AATAATTCTAATTAAAAATTAAATATTTAAAATAGTTAAATATCAAAGATTTCTAATAAT
CAATAAAGTAATAAATAAAACTAATAAAGTAATTTAAGTAGTTAATAAGGTCAAGTTTCT
TACAGTTAATAAAGTTCTCACTTAAATACTTAATAAAGCTCAAATGAAAAATAAAATTCT
AATTTATTTTAAGGAAAAATAAGCTAAAAACCACAACGAAAGAAAAAAGAAAGAGCAAAA
AAAATCTTGAAAGCATACTATCAGCAGAACAGCGATGAATCCTTAAGCAGCAATCCAATT
GATAAGAAGAAAAAAATATCTAAAACCAATAACAAGCTTGCTACCTCAATGAGAAGTAAA
ATATAAGAAAATGATAAAATAAAGACAAAATTAAGTAAAAGAGATTCAAATTATGGTGAT
AGTAATTTAGAAGAATCTCTATTTGAAAATGATACTAGCGAAGAAAGCAGCAATTCTGAC
TTATATTATGATTAAGAAAGTGAAAATGATGATAATGATAGCTTAAAGCAAGAGTCAGAT
AAAAGTTTCGATGAAGATTAGTCTTTTTCATACTCAGATGAAGAGAATTTAGACGACAAA
GGTTTTATAGAAACATAGCAAGCAAATAACTCTAGTAAACTGAATTTGACAACAAAATCA
AAAAGAGGGCATTACAAAAAATATTCTGTGAAACTAAAGAAAAAATTGGTTAATCTACTT
CTGGAAGGAGAATAGCCAAAGGATCTCTCTTAAAAATATAATATTCCTATGAAAAATTTA
TAAAGATGGAAAATTTATGGTGCTGAAAGAAGGGAAGGAGGAGGAAGAAAGATCATGGAT
TTAAATATGGAAGTTATTCTTTTAGAGTATTGTATTGATTATACATTAAGAGGAAGGTGT
AGATGTCCTAGAAAATTAATTATGCAAAAAGCAAGAGATTTTACTAAAGAGGCTAATAAG
TTTAAAGGATCAAAAGGTTGGCTTGATAAATACTCTACTAGAACTGGTCTGTCAAAGATA
ATGTCAGAGTATAAACAATTAAAGATTAGTAATGAGAGAGAAATCTTCAAATATGTTAAA
TGTAAATCAATTGAGCATATTAAATAAAAGATAAAATAGGTAAATCCTCTAAACATATTT
ACAAGTTAGCAATACATTAAATTTTTAGAAGGGCAACTTTCTGTTTATTAGAATTTTTGG
GAAATTGAATTACCTTGCTATAAAAACATTTCTAGTTAATATTGGCAGTATTATGAAAAT
AGAAACACAATTTAACTAATTTAAAATAACATCTTTAGTGATGTTATAACTGAATATAAA
AAATTTAATAAGTGTTCTAAATTAAATGACCTTAACTATTACTTTGGTATTCCATCTGAA
TATTTCTTAAAATGTCTTTGCCTTTAAAATTGCTCTGAGAAAAGCAAGCAACCAAACGAT
TAAACAATACAACATTAAAATTTGAAAGAACAGTCTTAGATAGTTTAAGAAGCAAATTCA
GAATATTTAAAGCAGGATCTCATAAAATAAGTAAAAAAAGAAGCAGTTGAAGAGAGAATG
CAAAGCTCAGCAGTTTTGGTAGATGATAATTAAAATTTTGTTTTTAGTCCTTTGATAATA
AGAAGTAAAAATGTACCAAAATATAACATTAAACAATCTTATGATTTAAAAGATAAACAA
ACTGAGTTAAATAATTTAATTGAAGGATAAAATTAAACTGATCAAAATGACTAAATATTC
AATAAATAAGATAAATAAATTAATCACTTCAGCTAACAAAAATACAAATATGCTCAATTA
ATTAGTGATGACGATAGTTCGATTGAAGAGATTTTCAGGAATTATGAAAATAATATTGAC
TGA


>TTHERM_00675560(gene)
ATTGTTTTCTTCTGAAATTAATTTTTAATAAAGTTTTTATTCAGAAAATTGGCATTTAGG
GAATTTTTTAGTAAAAGTAGAAAATGTATATGAAATCACTAAAAAACAAAATCCATACTA
AATACATAGCTAAAAAAAGGCGCTTTTAAATTTAAAAATTTTATCAGGAATTATTTCTTA
TCAAAAAGGTGTGTCTGATCACAAAATAATATCAAACTATTTATCTTGCTACTTAAGATT
TTTTAATATTTGATGAAATTTAGTAAAGGAAAGAATAAAAAGTAGAACTAAATCATTTAA
TATAGATGCACAGTGAAAAAAAAGATTTTAAACTTAATTCTGCTGCCACTTCAGATTTAT
TTTACAATAGACAGTAATTTATTTAACTCGTTAATGAGCAAATTTAACTTTTGGAGACAT
CTGTAGATAGTTAGAATCTTAATGAGCAGTATAAATTCTTATCTGGTTTCTTAAGAGAGA
GTAGTAGCTTAGTTATTTTTTTGCAGCAACAAATGTAAACTCTTTACAAGTTAAGAATTT
ATCAATTATCTGCTGTTTCGGTTGAAAGAAATCAGCTAACTCCACCAAAATATGATTATT
TGAGTAATACTGAATGTACATTTTAAGATTTGTTTAGTAGAAACGAGCAGCTTAAAAGTC
AATCTTCCTTTCAAAGGGCTTTTGATAAATCTGTTTAGTAAAGCGATTCTAATTTTTACA
TTTACCCGAAGCAACTAGCTGAAGAAAATAATAGTTAAAACAATAATAAGTATTTTGATT
ATATGAACAATATTACTCCTCAACAATATTAATAAAAGTATTAACTTTACAACAACTCTT
CTTTTTTTAATGATAAAAACGAAGATTTATTTCCTGTAAATCTTAGTGAGTCCTTTAAGA
AAATTAAGAACTACTCAGATTTTTTCGATAACCAAAATAACAAGCAATCTACTAACTTTT
CTGAATACTTTGATACTAAGAATAGATACAGAATACTTAAGCAATAAAACCTTGAGCTAG
ATTTCATCAAAGTTAAACAACCAACCATCACAGATGAGGCTAAAGAAAATTATGTCAGCT
AATTTGGCAATTAAAGTTAGGGCAAGCAAATAAAAATTGTAAAAAAGAATACCTGTAGTA
ACAATAATTTGGCTATATTTTCTTCTCCACAGCAAGCGATGGCTCAAGAAGAAAAGATAC
AGTCTAAGAACTTCTCGTTTGAAGACATGGATGTTTATGAAGAAAAAAATACAGATAAAA
ATTATAACTAAAAGTTTTTAAGACAAGAAATTCCCGTTTAAGAGTTTTAACTTTTAAATT
TGCCTGGTTCTTCTCCCAAGCAGCAGAATGGTGGCACTCCTTATAAAACATTTAAAGAAA
AGTAGCTCTATTAAAAACCAATAAATTCTAATTAAACCAAACAAATATAGAAATTCAATT
AAAATAATAGCTATCTAGACTATGATTTTGACATACAAGAAGGAAGTGTTTTAAAAAATT
GTTAAAAATTGAATATTTTAAATAATTAGGTTACAAATAATTAAAATGAGAAGAAGTCTT
TTAACATGGATAATTCTAAATAAATTAATGTATTAGGTACTTTGCAAAAAAATATTTAAG
AAAATGGCTAAATTGATTCATCTCAATTTAAGTAAAATCACTACAAAAATGATATTTCAA
ATACATAAGAAAGGAATACTTAAAACAATTTGCTTGGAGGAGCTTAAAACATTTTACAGA
CAAATAATTAATGCAATTTATTGAATAATTCTAATTAAAAATTAAATATTTAAAATAGTT
AAATATCAAAGATTTCTAATAATCAATAAAGTAATAAATAAAACTAATAAAGTAATTTAA
GTAGTTAATAAGGTCAAGTTTCTTACAGTTAATAAAGTTCTCACTTAAATACTTAATAAA
GCTCAAATGAAAAATAAAATTCTAATTTATTTTAAGGAAAAATAAGCTAAAAACCACAAC
GAAAGAAAAAAGAAAGAGCAAAAAAAATCTTGAAAGCATACTATCAGCAGAACAGCGATG
AATCCTTAAGCAGCAATCCAATTGATAAGAAGAAAAAAATATCTAAAACCAATAACAAGC
TTGCTACCTCAATGAGAAGTAAAATATAAGAAAATGATAAAATAAAGACAAAATTAAGTA
AAAGAGATTCAAATTATGGTGATAGTAATTTAGAAGAATCTCTATTTGAAAATGATACTA
GCGAAGAAAGCAGCAATTCTGACTTATATTATGATTAAGAAAGTGAAAATGATGATAATG
ATAGCTTAAAGCAAGAGTCAGATAAAAGTTTCGATGAAGATTAGTCTTTTTCATACTCAG
ATGAAGAGAATTTAGACGACAAAGGTTTTATAGAAACATAGCAAGCAAATAACTCTAGTA
AACTGAATTTGACAACAAAATCAAAAAGAGGGCATTACAAAAAATATTCTGTGAAACTAA
AGAAAAAATTGGTTAATCTACTTCTGGAAGGAGAATAGCCAAAGGATCTCTCTTAAAAAT
ATAATATTCCTATGAAAAATTTATAAAGATGGAAAATTTATGGTGCTGAAAGAAGGGAAG
GAGGAGGAAGAAAGATCATGGATTTAAATATGGAAGTTATTCTTTTAGAGTATTGTATTG
ATTATACATTAAGAGGAAGGTGTAGATGTCCTAGAAAATTAATTATGCAAAAAGCAAGAG
ATTTTACTAAAGAGGCTAATAAGTTTAAAGGATCAAAAGGTTGGCTTGATAAATACTCTA
CTAGAACTGGTCTGTCAAAGATAATGTCAGAGTATAAACAATTAAAGATTAGTAATGAGA
GAGAAATCTTCAAATATGTTAAATGTAAATCAATTGAGCATATTAAATAAAAGATAAAAT
AGGTAAATCCTCTAAACATATTTACAAGTTAGCAATACATTAAATTTTTAGAAGGGCAAC
TTTCTGTTTATTAGAATTTTTGGGAAATTGAATTACCTTGCTATAAAAACATTTCTAGTT
AATATTGGCAGTATTATGAAAATAGAAACACAATTTAACTAATTTAAAATAACATCTTTA
GTGATGTTATAACTGAATATAAAAAATTTAATAAGTGTTCTAAATTAAATGACCTTAACT
ATTACTTTGGTATTCCATCTGAATATTTCTTAAAATGTCTTTGCCTTTAAAATTGCTCTG
AGAAAAGCAAGCAACCAAACGATTAAACAATACAACATTAAAATTTGAAAGAACAGTCTT
AGATAGTTTAAGAAGCAAATTCAGAATATTTAAAGCAGGATCTCATAAAATAAGTAAAAA
AAGAAGCAGTTGAAGAGAGAATGCAAAGCTCAGCAGTTTTGGTAGATGATAATTAAAATT
TTGTTTTTAGTCCTTTGATAATAAGAAGTAAAAATGTACCAAAATATAACATTAAACAAT
CTTATGATTTAAAAGATAAACAAACTGAGTTAAATAATTTAATTGAAGGATAAAATTAAA
CTGATCAAAATGACTAAATATTCAATAAATAAGATAAATAAATTAATCACTTCAGCTAAC
AAAAATACAAATATGCTCAATTAATTAGTGATGACGATAGTTCGATTGAAGAGATTTTCA
GGAATTATGAAAATAATATTGACTGAATGACTGACTGACTGACAGATGATAGATTATTTT
ATTCAAAAAAATTATTATTTTATTTTTAATTTTATTTGTTTTATTTTATTTCATATTTAT
AAAAAATGAAAGATTTTGATTTTGATGTTCGCTTTTTTTAATTTTAAAATTAAATTT


>TTHERM_00675560(protein)
MYMKSLKNKIHTKYIAKKRRFQIQKFYQELFLIKKVCLITKQYQTIYLATQDFLIFDEIQ
QRKEQKVELNHLIQMHSEKKDFKLNSAATSDLFYNRQQFIQLVNEQIQLLETSVDSQNLN
EQYKFLSGFLRESSSLVIFLQQQMQTLYKLRIYQLSAVSVERNQLTPPKYDYLSNTECTF
QDLFSRNEQLKSQSSFQRAFDKSVQQSDSNFYIYPKQLAEENNSQNNNKYFDYMNNITPQ
QYQQKYQLYNNSSFFNDKNEDLFPVNLSESFKKIKNYSDFFDNQNNKQSTNFSEYFDTKN
RYRILKQQNLELDFIKVKQPTITDEAKENYVSQFGNQSQGKQIKIVKKNTCSNNNLAIFS
SPQQAMAQEEKIQSKNFSFEDMDVYEEKNTDKNYNQKFLRQEIPVQEFQLLNLPGSSPKQ
QNGGTPYKTFKEKQLYQKPINSNQTKQIQKFNQNNSYLDYDFDIQEGSVLKNCQKLNILN
NQVTNNQNEKKSFNMDNSKQINVLGTLQKNIQENGQIDSSQFKQNHYKNDISNTQERNTQ
NNLLGGAQNILQTNNQCNLLNNSNQKLNIQNSQISKISNNQQSNKQNQQSNLSSQQGQVS
YSQQSSHLNTQQSSNEKQNSNLFQGKISQKPQRKKKERAKKILKAYYQQNSDESLSSNPI
DKKKKISKTNNKLATSMRSKIQENDKIKTKLSKRDSNYGDSNLEESLFENDTSEESSNSD
LYYDQESENDDNDSLKQESDKSFDEDQSFSYSDEENLDDKGFIETQQANNSSKLNLTTKS
KRGHYKKYSVKLKKKLVNLLLEGEQPKDLSQKYNIPMKNLQRWKIYGAERREGGGRKIMD
LNMEVILLEYCIDYTLRGRCRCPRKLIMQKARDFTKEANKFKGSKGWLDKYSTRTGLSKI
MSEYKQLKISNEREIFKYVKCKSIEHIKQKIKQVNPLNIFTSQQYIKFLEGQLSVYQNFW
EIELPCYKNISSQYWQYYENRNTIQLIQNNIFSDVITEYKKFNKCSKLNDLNYYFGIPSE
YFLKCLCLQNCSEKSKQPNDQTIQHQNLKEQSQIVQEANSEYLKQDLIKQVKKEAVEERM
QSSAVLVDDNQNFVFSPLIIRSKNVPKYNIKQSYDLKDKQTELNNLIEGQNQTDQNDQIF
NKQDKQINHFSQQKYKYAQLISDDDSSIEEIFRNYENNID