Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00683180

Standard Name

CHL1 (CHromosome Loss 1)

Aliases

PreTt16155 | 103.m00146 | 3734.m00058

Description

DNA repair helicase (rad3); DNA repair helicase; involved in nuclear excision repair; localizes to the micronucleus

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_17807.2 9.997093137033517e-262
Description: DNA repair helicase (559 aa)
WormBase WBGene00010839 4.9995060293141384e-98
Description: locus:chl-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q21489 protein_id:CAA88959.2
SGD YPL008W 1.999022616705709e-90
Description: CHL1 Probable DNA helicase involved in sister-chromatid cohesion and genome integrity; interacts with ECO1 and CTF18; mutants are defective in silencing, rDNA recombination, aging and the heat shock response; FANCJ-like helicase family member
Oxytricha Contig5554.0.g99 5.9988196117913e-83
Description: Helicase C-terminal domain
Stentor Coeruleus SteCoe_25318 2.7487850079102147e-43
Description: None
DictyBase DDB_G0286621 6.0018235484001396e-36
Description: fncJ on chromosome: 4 position 4729555 to 4732791

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00683180(coding)
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>TTHERM_00683180(gene)
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CCTTATTTATATAAAATATTAAAAACTTGTGTTTAGACCTGCTTAAATTCATCAAAGCAG
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AGCTACTTCTCAAGCTCAATATGGACAGGATTGATTTCTTTTAAATTAAAAAATTTACTC
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AATCAATTAAGTTGGAAAGAATAACTTTAAACACTTCTCATGTGGTCACATAATTGATGA
AGAAAATTGTTCTGTATTTTGTGTAAGCACTTTAGTTGAACAGTCTGATAAACCACTGAT
TTTCAATTACCAAAATAAAAAAGATGATTAATTATTTTAAAACTCAATAGATATTATTCA
TTAATTAGCTCAAACAATTCCTGACGGTCTAGTTATTTTTGTATAAAGCTATACGTTTCT
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TAAAAAAATATATATGGACGATAAAGATAATTCAAACAACACAATACTCGAAAAATACTA
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TTATAAAATTTACTTTATAGATCTAACTCTAATTTTTTTTAAAGGGATAAATTTTAGTGA
TTAACTTGCAAGGTGCGTTGTAGTATTTGGAATGCCCTATTCAAATATTAAAAGTGCCGA
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TGGAAATGATTATTATGAAAATTTGTGTATGAAATCTGTGAACTAAGCAATTGGCAGGTC
TATAAGACACAAAGATGATTATTCAGTTATACTCTTAATTGATTAGAGATTTTCTCAAGA
AAAAAATATCAATAGATTATCAAGTTGGATTAAAAAAAGAGTAAAGCCAGCTCATTCTTT
TGAAAGTACCAAAAAAAATATTAAAATTTTTTTCGAAAAAAAACAACAACATAAGATTTG
A


>TTHERM_00683180(protein)
MNNRSTNNDLKDKIKQSFPYNPYDIQLEFSLNLYESLNVKKLCIFESPTGTGKSLSLICG
AFNWFKDNQENYDLIKGFKERRDKILLGEVNIDSKKEESNSLPAWLTNINDINRSIFYEK
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NHYDSISKKNNFSFSGNDYYENLCMKSVNQAIGRSIRHKDDYSVILLIDQRFSQEKNINR
LSSWIKKRVKPAHSFESTKKNIKIFFEKKQQHKI