Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00683350

Standard Name

JAL1

Aliases

PreTt16172 | 103.m00163 | 3734.m00075

Description

ABC transporter C family protein; ABC transporter family protein; homolog of human CFTR; expressed 4 hours and 8 hours post-conjugation

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• cytoplasm (IDA) | GO:0005737
• integral component of membrane (IEA) | GO:0016021

Molecular Function

• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• ATP hydrolysis activity (IEA) | GO:0016887
• ATPase-coupled transmembrane transporter activity (IEA) | GO:0042626

Biological Process

• transport (IEA) | GO:0006810

Domains

• ( PF00005 ) ABC transporter
• ( PF00664 ) ABC transporter transmembrane region
• ( PF01926 ) 50S ribosome-binding GTPase
• ( PF02463 ) RecF/RecN/SMC N terminal domain
• ( PF03205 ) Molybdopterin guanine dinucleotide synthesis protein B
• ( PF04665 ) Poxvirus A32 protein
• ( PF07196 ) Flagellin hook IN motif
• ( PF08477 ) Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
• ( TIGR00740 ) methyltransferase, putative
• ( TIGR00954 ) Peroxysomal long chain fatty acyl
• ( TIGR00955 ) pigment precursor permease
• ( TIGR00957 ) multi drug resistance-associated protein (MRP)
• ( TIGR00958 ) antigen peptide transporter 2
• ( TIGR00960 ) Type II (General) Secretory Pathway
• ( TIGR00968 ) sulfate ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR00972 ) phosphate ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR01166 ) cobalt ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR01184 ) nitrate ABC transporter, ATP-binding proteins
• ( TIGR01186 ) glycine betaine/L-proline transport ATP binding
• ( TIGR01187 ) polyamine ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR01188 ) daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding
• ( TIGR01189 ) heme ABC exporter, ATP-binding protein
• ( TIGR01192 ) glucan exporter ATP-binding protein
• ( TIGR01193 ) ABC-type bacteriocin transporter
• ( TIGR01194 ) cyclic peptide transporter
• ( TIGR01271 ) cystic fibrosis transmembrane conductor regulator
• ( TIGR01277 ) thiamine ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR01288 ) nodulation ABC transporter NodI
• ( TIGR01842 ) type I secretion system ATPase
• ( TIGR01846 ) type I secretion system ATPase
• ( TIGR01978 ) FeS assembly ATPase SufC
• ( TIGR02142 ) molybdate ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR02203 ) lipid A export permease/ATP-binding protein
• ( TIGR02204 ) ABC transporter, permease/ATP-binding protein
• ( TIGR02211 ) lipoprotein releasing system, ATP-binding protein
• ( TIGR02314 ) D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR02315 ) phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR02323 ) phosphonate C-P lyase system protein
• ( TIGR02324 ) phosphonate C-P lyase system protein
• ( TIGR02633 ) D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR02673 ) cell division ATP-binding protein FtsE
• ( TIGR02769 ) nickel import ATP-binding protein NikE
• ( TIGR02770 ) nickel import ATP-binding protein NikD
• ( TIGR02857 ) thiol reductant ABC exporter, CydD
• ( TIGR02868 ) thiol reductant ABC exporter, CydC
• ( TIGR02982 ) ABC exporter ATP-binding subunit, DevA
• ( TIGR03005 ) ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR03063 ) sortase B cell surface sorting
• ( TIGR03258 ) 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding
• ( TIGR03265 ) putative 2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding
• ( TIGR03269 ) methyl coenzyme M reductase system,
• ( TIGR03375 ) type I secretion system ATPase
• ( TIGR03410 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR03411 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
• ( TIGR03415 ) choline ABC transporter, ATP-binding protein

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_17824.1	9.997093137033517e-262
	Description: ABC transporter (1470 aa)
WormBase	WBGene00007201	9.997093137033517e-262
	Description: locus:exos-4.1 Putative exosome complex component RRP41 status:Confirmed UniProt:Q17533 protein_id:CAA97771.3
DictyBase	DDB_G0280977	2.0008287304234426e-177
	Description: abcC10 on chromosome: 3 position 4347748 to 4352153
WormBase	WBGene00003407	9.996149531968772e-161
	Description: locus:mrp-1 status:Confirmed UniProt:Q3S1M2 protein_id:CCD69453.1
Tetrahymena borealis	EI9_00202.2	9.996149531968772e-161
	Description: protein phosphatase 2C containing protein (1265 aa)
SGD	YDR135C	8.998247049188826e-159
	Description: YCF1 Vacuolar glutathione S-conjugate transporter of the ATP-binding cassette family, has a role in detoxifying metals such as cadmium, mercury, and arsenite; also transports unconjugated bilirubin; similar to human cystic fibrosis protein CFTR
Oxytricha	Contig7364.0.0.g83	7.00255097081577e-156
	Description: ABC transporter
Stentor Coeruleus	SteCoe_24888	1.3485799642996046e-77
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00683350(coding)
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TTAAATGAAGTAGGTGTTTTAGATAATGATAGCTAGTACTAAGATGAGGCTAATTAATAA
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AATCCTTTTGTCATTATCCCTGCAGTATGCACAATCATTTTGTTGCTATTTTTCTTAAAT
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GGTGCTGGTGTCTTTATTATTATAGGTTTATCTTCAGGTAATCCAGGGTTAGCAGGGTAG
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AATGTAGATTCAGTTATGTCCTCCTGTGAAAGAGGTTACTAAATGGTAGATTAGCCTTCT
GAAGCTGAACTGATTAGCGAATACGATATAAAAAATGGTTTAGTTAATAAATAAGATTTG
CTTGAAGATAATATTAAGGTAACAAAAACAGAGCTTGCAAAACCAAATGCAATTACTTAA
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AACCCAGTATTAAAAGGTCTTAATTTTAATATCAAGTAAGGATAAAAGGTAGGATGTATT
GGCAGAACAGGTGCTGGAAAATCTTCAATTCTATAAGCCCTTTTTAGAATGACAGAAGTA
GAATAAGGATCTCAAATTATTTTTGATGACTAAGATACAGCTAAACTCGGTTTGCATACT
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AGAAATTTGGATCCACTAGGCCATCACAGTGAGAAGGAATTATGGGATTCGCTCAAAATG
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GATAAGTTGATTTAAAAAACAATACGTGAAAAATTTGAAGATAGCAGTGTTCTTACTATA
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GTAGCAGAATGTGACGAACCTTACAATTTATTAGCTGAAAGTGTTGAAGACACATTTATA
ACAAAAAACACTTTGTTTGCATAGATGGTTTTACATACAGGAAAAAACAATGCAATTAAT
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>TTHERM_00683350(gene)
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TTAAATGAAGTAGGTGTTTTAGATAATGATAGCTAGTACTAAGATGAGGCTAATTAATAA
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TCCTTGCCAATTAGATAAGACAGTGAAAACTAATAGCTTTAAAAATAGGAAAGCAATGGA
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TAAAATAAATCGCAGCCAGAAGATCTCAGATTTGATGACATGGATTACGATTAGAATGTC
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TCTTTATATTTGATCTTGAATTTCTTGAAATACATTTTGCTTTCTGTTGGTAAAAAAAAT
TACTTTTTTTGAAAAAATTTTTAAAACAAAACTTTTGAATTTAATCTGAAATTATTTTTT
TGATATTGAAAAGGTATTTTGAAAGGAAGTTAAATCCTTCATGACGATATGTTTAAATCT
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TTTTCAAATGATATTGGTCTAATGGATAATGCACTAAATTATTCTGCTAATGATGGTCTT
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GTTATGTCCTCCTGTGAAAGAGGTTACTAAATGGTAGATTAGCCTTCTGAAGCTGAACTG
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ATTAAGGTAACAAAAACAGAGCTTGCAAAACCAAATGCAATTACTTAATGGCCTAAGCAA
GGAAATTTAGAGTTCAAAAATGTTTTTATGAGATACTCCAAAGATCTTAACCCAGTATTA
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>TTHERM_00683350(protein)
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