Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00683350

Standard Name

JAL1

Aliases

PreTt16172 | 103.m00163 | 3734.m00075

Description

ABC transporter C family protein; ABC transporter family protein; homolog of human CFTR; expressed 4 hours and 8 hours post-conjugation

Genome Browser (Macronucleus)



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Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00005 ) ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( PF00664 ) ABC transporter transmembrane region
  • ( PF01926 ) GTPase of unknown function
  • ( PF02463 ) RecF/RecN/SMC N terminal domain
  • ( PF03205 ) Molybdopterin guanine dinucleotide synthesis protein
  • ( PF04665 ) Poxvirus A32 protein
  • ( PF07196 ) Flagellin hook IN motif
  • ( PF08477 ) Miro-like protein
  • ( TIGR00740 ) methyltransferase, putative
  • ( TIGR00954 ) Peroxysomal long chain fatty acyl
  • ( TIGR00955 ) pigment precursor permease
  • ( TIGR00957 ) multi drug resistance-associated protein (MRP)
  • ( TIGR00958 ) antigen peptide transporter 2
  • ( TIGR00960 ) Type II (General) Secretory Pathway
  • ( TIGR00968 ) sulfate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR00972 ) phosphate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01166 ) cobalt ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01184 ) nitrate ABC transporter, ATP-binding proteins
  • ( TIGR01186 ) glycine betaine/L-proline transport ATP binding
  • ( TIGR01187 ) polyamine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01188 ) daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding
  • ( TIGR01189 ) heme ABC exporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01192 ) glucan exporter ATP-binding protein
  • ( TIGR01193 ) ABC-type bacteriocin transporter
  • ( TIGR01194 ) cyclic peptide transporter
  • ( TIGR01271 ) cystic fibrosis transmembrane conductor regulator
  • ( TIGR01277 ) thiamine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01288 ) nodulation ABC transporter NodI
  • ( TIGR01842 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR01846 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR01978 ) FeS assembly ATPase SufC
  • ( TIGR02142 ) molybdate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02203 ) lipid A export permease/ATP-binding protein
  • ( TIGR02204 ) ABC transporter, permease/ATP-binding protein
  • ( TIGR02211 ) lipoprotein releasing system, ATP-binding protein
  • ( TIGR02314 ) D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02315 ) phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02323 ) phosphonate C-P lyase system protein
  • ( TIGR02324 ) phosphonate C-P lyase system protein
  • ( TIGR02633 ) D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02673 ) cell division ATP-binding protein FtsE
  • ( TIGR02769 ) nickel import ATP-binding protein NikE
  • ( TIGR02770 ) nickel import ATP-binding protein NikD
  • ( TIGR02857 ) thiol reductant ABC exporter, CydD
  • ( TIGR02868 ) thiol reductant ABC exporter, CydC
  • ( TIGR02982 ) ABC exporter ATP-binding subunit, DevA
  • ( TIGR03005 ) ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03063 ) sortase B cell surface sorting
  • ( TIGR03258 ) 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding
  • ( TIGR03265 ) putative 2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding
  • ( TIGR03269 ) methyl coenzyme M reductase system,
  • ( TIGR03375 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR03410 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03411 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03415 ) choline ABC transporter, ATP-binding protein

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_17824.1 9.997093137033517e-262
Description: ABC transporter (1470 aa)
DictyBase DDB_G0280977 2.0008287304234426e-177
Description: abcC10 on chromosome: 3 position 4347748 to 4352153
WormBase WBGene00003407 9.996149531968772e-161
Description: locus:mrp-1 status:Confirmed UniProt:Q3S1M2 protein_id:CCD69453.1
SGD YDR135C 8.998247049188826e-159
Description: YCF1 Vacuolar glutathione S-conjugate transporter of the ATP-binding cassette family, has a role in detoxifying metals such as cadmium, mercury, and arsenite; also transports unconjugated bilirubin; similar to human cystic fibrosis protein CFTR
Oxytricha Contig7364.0.0.g83 7.00255097081577e-156
Description: ABC transporter
Stentor Coeruleus SteCoe_24888 1.3485799642996046e-77
Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00683350(coding)
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TTAAATGAAGTAGGTGTTTTAGATAATGATAGCTAGTACTAAGATGAGGCTAATTAATAA
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GAATAAGGATCTCAAATTATTTTTGATGACTAAGATACAGCTAAACTCGGTTTGCATACT
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GTAGCAGAATGTGACGAACCTTACAATTTATTAGCTGAAAGTGTTGAAGACACATTTATA
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ATTTTCAGCAATGCTAAGAGTAAGTACTTGCAAATGCATAACATTGAAGAATTCTGA


>TTHERM_00683350(gene)
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TTAAATGAAGTAGGTGTTTTAGATAATGATAGCTAGTACTAAGATGAGGCTAATTAATAA
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TCCTTGCCAATTAGATAAGACAGTGAAAACTAATAGCTTTAAAAATAGGAAAGCAATGGA
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TAAAATAAATCGCAGCCAGAAGATCTCAGATTTGATGACATGGATTACGATTAGAATGTC
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GCTATTGTGAAGGGATGCAATTTAGGCTTGTAGCATCTCCCAAAGATAAAAGAAAATCAT
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ATAAAGTTATAGTAATGGATTAAGGTGTTGTAGCAGAATGTGACGAACCTTACAATTTAT
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>TTHERM_00683350(protein)
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