Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00691590

Standard Name

VPS8E (vacuolar protein sorting 8E)

Aliases

PreTt02997 | 106.m00137 | 3674.m00050

Description

corvet complex core vacuolar protein; early phagosome-associated

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_17585.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1787 aa)
Tetrahymena borealis EI9_05350.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (940 aa)
Oxytricha Contig1064.1.g34 0.0000007997233352734267
Description: Ring finger domain
DictyBase DDB_G0291606 0.0000020007268868677913
Description: vps8 on chromosome: 6 position 397697 to 403037
SGD YAL002W 0.000050024383570459175
Description: VPS8 Membrane-associated protein that interacts with Vps21p to facilitate soluble vacuolar protein localization; component of the CORVET complex; required for localization and trafficking of the CPY sorting receptor; contains RING finger motif

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:31964712: Sparvoli D, Zoltner M, Cheng CY, Field MC, Turkewitz AP (2020) Diversification of CORVET tethers facilitates transport complexity in . Journal of cell science 133:
  2. Ref:29478853: Sparvoli D, Richardson E, Osakada H, Lan X, Iwamoto M, Bowman GR, Kontur C, Bourland WA, Lynn DH, Pritchard JK, Haraguchi T, Dacks JB, Turkewitz AP (2018) Remodeling the Specificity of an Endosomal CORVET Tether Underlies Formation of Regulated Secretory Vesicles in the Ciliate Tetrahymena thermophila. Current biology : CB 28(5):697-710.e13

Sequences

>TTHERM_00691590(coding)
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GAAAAAGTTGTTGATATAGTTTTCTATTTGTCTTAGTACCCTAAAACCTTAGATAGATTG
GAATTTCCTTAAGAAGAGTTACAAAAGTAAGCTAAAATATATTCTGAAGGTAGAGATGAT
AAAGTTGATTTTAGAGAGCTTTCATAGCTATTGAGAAGTGAATTTTTACTTAGTTTAATT
AAATATATTTTAGATGTGATTGGAAAAGATAATGGTTAGATGTAGCTTTTATCTTAACTC
CTTGACCTAACTGAATTTGCTACAGCCAGAAGTCATATTTTATTTTTAAGAGGACACTAT
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GACTGGATGTGGTAAAATTTGACAGAAAGTAGAAGCGAAGATCCTAAAAAATATGAAATG
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CACCAGCTCTTTCAAAAGTTTTTGAATGATGCAGAGCACGATATCATTTCTTAACTTGAG
AACAATCCTAATTTACAACTTCTTTACATTTAGAATGTGATTAAGCAATACAAATTGAAA
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GAAGTGTGCACCTTTATATATTTGAGAATGGGTCTATAAGAATAGGCTTTAAAGTCACAA
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GGAGAAATTCGCTAGACTGGAGTAAGCATTTCTATTTAAAGAACGGAATCATAAACTTTT
AACTAATCTTACAATATTTCAGACGTAAATTAAATGCAAATGAATGCTAATGCTTCAAAC
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CTATACTTTTTGATTATATCAAGATAGGATATTGACATTAACAAACTTAATTTATTCATT
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ACTTCTTGA


>TTHERM_00691590(gene)
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CTTTGGGAAAAACTGCGCCAAGATTTTTAATAAGGTAGATTCCTAGAGATAGGTTAGAAA
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GGAAAAGATAATGGTTAGATGTAGCTTTTATCTTAACTCCTTGACCTAACTGAATTTGCT
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GAAGTACTATAATGCAAATTGCAGATAATGTAGATATGGATAGGTTTTTAGATAAGCTGA
GAAGCAGCTATTCTGATATCAGCATAACAGATCTAAAGGATACTTTTAGATAGCTATTAT
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TAACAAATTAGATGTAATCTGGATCAGAAAAGTTTTTAAAAGGAACTTTCTCGTTTAGCC
ACTGCTCAACTTGTTTTGATTAACTCAACTCAATGGATAAAGTTAAAAGAAAAATAAGGA
AATAAATTATTTAAAAAAGCGAGCTTCAAACATCCAGTTCTGCTAATTCAAGCTTATCTA
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TGAGAATTTGCTTGGAATGCATAAGAGCTAAGAATTAGCTATACTTTTTGATTATATCAA
GATAGGATATTGACATTAACAAACTTAATTTATTCATTAGAAAATAACTAGAATTATTAT
AAGAAAGATTAGAATCGAATAGAAGATCTTCAGATTTAAGTTTGAGCAGGAACAATAGCT
ACTTTGAAACTGTTAAAAGCGTTGTGGAAGAAGAAACAAAAGAAATTTAAAAGTTCAACA
AATTAAGAAGAATTAAAAAATTAAAAAATTTTGATAAAATGATTGAATAAAAATATTCTT
TATTTGAAAAAGACCCTGTTGTTAAAAAATAAAAATACACTTCTTGA


>TTHERM_00691590(protein)
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ALIKIFKGFLSFEQQVVFLMQKQLFPITSINVLSKLMQQKYFQYDYDREDDFIVGLSSPE
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NTTDFRSSFLKFISLVSISSFKMKLPQLEIKPTVYDLDSYQLKAQKTVKQQQELSIKQTA
IKDQDQLIKSQSLKNSQSEVIINESKTQIIYSNSVSFSILLQKCYILLENNKSDSKRSQF
ACINLVSWRATLEELLKQGEYLNAMSFLHIIYSGYHKFAHNGLQKFDIKDLLVPQIERTA
LNYTDKLLKQLREEQVSQNFGQSAFSVKEEKAQSSHSSFASIQMVSNQSNQSAFCDIHFL
PEHDRLIFAMEFLVNCQLQETIFYDIRQSCGKILGNMDFFIECLEPFILEGKITNIHNDV
ITDIIDYYQSRGNLRIIQQILTSLDLENLDIKPLVQLSMEKQLITALIYLSTRSTNPDFI
SPLMIFWNQFVASLRKWEEKNKGKQKSFIMDPSLLNPEEKAAAIYDPSSSLIREIDPEEN
DFLKEQLILSLLQDPLKIKCEYFGLRALWYFRLCIQQKLIDGEYINDNDYKQVVLTFESW
ISFPQNIKVCLQRWPQVFFQVLAVFFSEKPLKIIDEDQTKLKQILRDLNVQNLWEQTAEF
CTNKKVFYSEVLLRQIIAITLEIDSQFNFVTRSTLPRNTYEDVTYIQKSINTDIDGSDEQ
DLTAYQLLVEKAHPSEFDGRLNLRRSNLLSSFYLFLANMIYQSQCSYSSNYLVGLFKFKK
EKVVDIVFYLSQYPKTLDRLEFPQEELQKQAKIYSEGRDDKVDFRELSQLLRSEFLLSLI
KYILDVIGKDNGQMQLLSQLLDLTEFATARSHILFLRGHYHRAIDSYIQSSNKTMSRLIF
DWMWQNLTESRSEDPKKYEMLKDIMRVKLPDFIKIDSERTHQLFQKFLNDAEHDIISQLE
NNPNLQLLYIQNVIKQYKLKLKSNPQLIESLKVDKGILILNIKLMCQLNKPEDDVLNEIT
SLDFYPFEDILKICLEKQYLEVCTFIYLRMGLQEQALKSQIKMLDNSLYQYKKYLEDFYQ
RMQNMPTNTFINNPLNVFMSDLMGGRNQSTHFDNIENNEEGEIRQTGVSISIQRTESQTF
NQSYNISDVNQMQMNANASNEKIQQFTKQINCRMQKMFDICTLHKQTDNSDSWFLLLDLL
VQSCKKFPDIDTKDSLINLRKIFSQSIGSTIMQIADNVDMDRFLDKLRSSYSDISITDLK
DTFRQLLQNSIDSYQVLYNCLIYIQQDLTNQMQSGSEKFLKGTFSFSHCSTCFDQLNSMD
KVKRKIRKQIIQKSELQTSSSANSSLSTSVDDSSFIQNNEEDEDSGQIIIFNCGHSYHKE
CYFRQKNLRICLECIRAKNQLYFLIISRQDIDINKLNLFIRKQLELLQERLESNRRSSDL
SLSRNNSYFETVKSVVEEETKEIQKFNKLRRIKKLKNFDKMIEQKYSLFEKDPVVKKQKY
TS