Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00694540

Standard Name

IFT122 (IntraFlagellar Transport 122)

Aliases

PreTt02937 | 107.m00117 | 3753.m00409 | IFT122A

Description

IFT122 intraflagellar transporter; Intraflagelar transport protein; plays a role in returning IFT proteins from the ciliary tip to the cell body during ciliary regeneration; Intraflagellar transport protein 122/121 homolog

Genome Browser (Macronucleus)



Genome Browser (Micronucleus)

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Biological Process

Domains

  • ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01787 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A
  • ( SD01788 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A and of IFT172
  • ( SD01789 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A and of IFT172
  • ( SD01790 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A and of IFT172
  • ( SD01791 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A
  • ( SD01792 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:18199688: Tsao CC, Gorovsky MA (2008) Different effects of Tetrahymena IFT172 domains on anterograde and retrograde intraflagellar transport. Molecular biology of the cell 19(4):1450-61
  2. Ref:18211962: Tsao CC, Gorovsky MA (2008) Tetrahymena IFT122A is not essential for cilia assembly but plays a role in returning IFT proteins from the ciliary tip to the cell body. Journal of cell science 121(Pt 4):428-36

Sequences

>TTHERM_00694540(coding)
ATGAAGTGTTCAGAACTATGGACGGAAATCATTCCCAAGAATGACCCCAATTCTAATATA
ACAAATCAAGTATGGAGTTGTAGCTTCAATAATGATGGCTCTATATTATTAGCTTGTGTA
GGAGATGCTATTCTTGTATACGATTCATTTACTGGCAATTTAGTAAATAAAGCAATTAGA
GGAGGATAAAAGGAATAAATTAATTGCATCAAGTTCTCAAAAGATGGAAAAAGGTTTGCA
ACTGCTAGTAATGATAAAACTGTTTGGGTCTGGTCATTCGATGTAAATAAAAATCCCAAA
TTAGCACCTGAAGTAAAATATTCTCATACAGATAAGGTTTTATGTCTTGCTTTTAATCCA
TTGACGCATCAAATTTTCTCTGGAGGTGCTTAGGACTATGCTTTATGGACTCCAGATCAA
CAAAGTATAGAAAAATCTAAATTTAAAGATAAAATAATAACTTGTGCATGGAGTTGGGAT
GGTTTATATTTAGGTTTTGGTACTATGGGAGGTATTATTGGAATAAGAAACAGAGCTCTC
GAATAGTTAGCAGAAATTTAAAGGTCATTCCCTATATGGTGTATGGATTGGACGCCAATT
ACTCCTGACTATTAAAACAGTGTTCTCGTAGTAGGTGTTTGGGAATAGTCAATAGCTCAC
TATAATATTTAAGGTCAATAATTAGGTTCGGATAAAAAGCTTACATATGATCCTATAGAT
ATCAATTTTAGCACTCAAGGAGAATTCCTTTTAGTAAGTGGAACTAATAACAAATGCACT
CTATACACCAGAGAAGGTGGCTTTTTAATAGATGTTGCAACAAAAAATGATTGGGTTTGG
AATAATAAATTGAAACCTGTAATTAAAGAAGCTGGATCTGTTGCTGTTTAAGATTAGTTA
CACGTTGCTTTAACTACAAATGATGGCGAAATCAGTATGTTTAAAATTCAATAACTAACA
GTGCATGCACTTGAAGGTGATAAATATGCTTATAGAGATAATTTAACAGATATTGTTGTT
TAGAGCATGAGCTCAAATTAAAGAATTCGTTTGAAATGCAAAGAACTAGTTAAGAACATT
AGTATATATAAAGATAAGCTTGCTGCTCATTTAACAGAAAGAATTTTGATTTATGGAACT
TCTTCAGAAGATAGCTAAATGAAATATAAGTTGCATAAGAGAATAGTTAAAAAAGTTGAA
GCTCATATCTTAGAAATAGTTTCAAATCACTTGATAGCTTGTGTAAAAAATAAAGTATAA
TTATATTAATTATCAGGAGATTTAGAAAAAGAATGGGTTTTTGACTCAAGAGTTAATTGC
ATTAAAATTATAGGTGGAATGCCTAACAAAGAAGGAGCTTATGTCGGTTTAAAGAACGGT
TAAATTTTCAAAATATTTGTTGATAACAGTTTCCCTATTCCTATATTAAACCACAATATT
TCTATTAAAAATATTGATGCTTCTCAAAAAAGAAAAAGATTAGCAGTTGTTGATAAAAAT
AGCAACCTAACTGTTTATGATCTTTCAAACAAAGAATAAGTCTTCTAAGAAATGAATATT
GTTTCTTGCGCTTTCAACAATAATTTTGATGACTTGCTTGCTTTTTCATCAACTGACACA
ACATTTATCAGGTGCTCTAATCATCCACCTCTATCTCAAAAAATATCAGGATAAGTTGTA
GGATTTAAAGCAAATAAATTATTTGTTTTGAATGACAATGTTATGAGTACAATTGATGTT
TCGATGACTTAGACTATGATTAAATACTTAGAAAGAAAAGAATTTTAATCTGCATATGAA
ATATCTTTATTAGGAGTAACTGATTAAGATTTCTTATATTTAGGTAATGAAGCATTAATC
GCAACACAATTTGCTATTGCTAGAAAATGCTACACAAGAATAAAAAAATTAGACTTCATC
TATCTCCTTGAAAAGGCAGAAAAAGATTTTAAAAAGAATACATTTGTTGAGGGATTCTAT
TAAGGTGAGATATATGCTTTATAAACTAAATTCTATGAAGCAGAAAACGCACTCACTAAG
TCAAATTTAGCTTCTTAAGCAAAAGAAATGTGGATCATTCTTAAGGAATTTGATAAGGCT
ATGAGAATTACAGATACTGGTGCTAGTCCTATTAATAGAGGCCAGAATAAAGAAATAAAT
TCTGATGCTTCTAGAAAGGACCTACTCATTTAGAGGGCAGAATGGGAAGTCAAACAAGGA
AATTGGAAAAAGGGTGGTGAATTGTACATTCAAGCTGAAGTATATAAAAAGGCTATAGAA
GTATATGTAACCAATAATTTCTCAGAAGGTATTGTTGAAGTTTGCAGAAACGCAGATGCA
GAAACTCAAAGAAAAGAAATAGAATAATGTGCTGCATACTTTAAGAAAGCAAAACTTCAT
CAATACACAAAAGAAGCTTACTTGAAGCTGTAAGATAACAAAGCTTTACTTTAATTGAAT
ATTGATCTAGAAAAATGGGATGAAGCTATGACTCTTGCAAAGGCTCATCCTGAATTCATG
GAGATAGTCAAACTGCCTTATGCCAATTGGCTTGCTAAATAAGATAGATACGAAGAATCT
TTAAAGGCATACAGAAAAATTGGTAAACATGATATGGCTACTAAGATGCTCTATAACTTA
TCTTAGAATGCTGTATTTGAAAAAAGATTCTCTGACGCTGCTTTATTTACTTGGATGATA
GCTACTGAGCACTTAGGTTTGATTCGTAATATGAAAGCTCCAACCCCTGAAGATATTGAG
AATTTAATGAAATTTTATTAGTACAGAGATGATGCTGAAATATATTTTGCATACTCCAAA
GTTTAATCTTTTGTTGATGAACCATTCTTACCTTTATCAGGTCATGCTTACATGTTAAAT
ATCTTCAATGCTGCTCGCTTCGCCATAAACAAACTAGGAAACAGGCAGTTATACGGAGTC
TAACACAGTTATCTCTATTATTCATTAGGAAAAGTAAGTAAATAGCTTGAAGGTTACAAG
ACAGCCCGTATTTGCTATGAAAAACTAGCTAGCTACAAAATTCCTACTGAATGGAGCGAA
GAAATAGAATTAAGTACACTCTTAATTAGATCTAAGCCATATAGTGATTAGGAGTCTTTA
CTTCCTATTTGCAATAGATGCTATAATTAAAACCCAGCTCTCACAGAAGGTAACAGATGT
TCTTCTTGTATGCACTAATTTTAAAACTGCTTCATAAGCTTTGAAAATCTACCTTTGGTT
GAGTTTAAATTGGATCCTAAAATCACACATAAGAGATTTATTGAATTAATCAATTCTGAT
AAATCAAAAACACAACCTAATAAAAAGAAGAAGAAAGCAAACGACGGATGGTAAGAATCT
CACTAAGGAGATTAATAAGTTCTCACCTTTAACAATTCACCTTAAAAAGGAGGAAATGAC
AATGAAAGCAGTCCTTTCTTAGATAAACTTAACGAAGTATTCGAAATTTAATAAACTACT
TAAGAATACATACCTGTTACATTAGATGAAAATATAGTATCATCTCTTAGTATAGATGAG
GTTTATTGGGTAGACTATACAAAATATTGCTACACAGCAGAAATAAAATATTACAAGAGT
ATGTTAACAGACATTCCTCTCAAGAATTGTTAAGAATGTGGAACATTCTACATTTTGGAT
GAATATGAATTTGAAATAAGTAAGACATAAAAATGTCCTTTCTGCAGATCAGTTGATGAA
AGAGCAGGACCTTAGAAGGATGTTTTTGATTTCTGA


>TTHERM_00694540(gene)
TATAATCTTAATAGTAAAAATTATAGATATATTATTTGTTTAATATCTTCATATTAAAAT
AATAAGCAGAATAGAAAGCAAATTTTAGGTTTCCATAGCACAAAACTTAAATTTTGAAGC
AGGAATAAAAGTTTATATCAGTTTAAATTAGCAATTATGAAGTGTTCAGAACTATGGACG
GAAATCATTCCCAAGAATGACCCCAATTCTAATATAACAAATCAAGTATGGAGTTGTAGC
TTCAATAATGATGGCTCTATATTATTAGCTTGTGTAGGAGATGCTATTCTTGTATACGAT
TCATTTACTGGCAATTTAGTAAATAAAGCAATTAGAGGAGGATAAAAGGAATAAATTAAT
TGCATCAAGTTCTCAAAAGATGGAAAAAGGTTTGCAACTGCTAGTAATGATAAAACTGTT
TGGGTCTGGTCATTCGATGTAAATAAAAATCCCAAATTAGCACCTGAAGTAAAATATTCT
CATACAGATAAGGTTTTATGTCTTGCTTTTAATCCATTGACGCATCAAATTTTCTCTGGA
GGTGCTTAGGACTATGCTTTATGGACTCCAGATCAACAAAGTATAGAAAAATCTAAATTT
AAAGATAAAATAATAACTTGTGCATGGAGTTGGGATGGTTTATATTTAGGTTTTGGTACT
ATGGGAGGTATTATTGGAATAAGAAACAGAGCTCTCGAATAGTTAGCAGAAATTTAAAGG
TCATTCCCTATATGGTGTATGGATTGGACGCCAATTACTCCTGACTATTAAAACAGTGTT
CTCGTAGTAGGTGTTTGGGAATAGTCAATAGCTCACTATAATATTTAAGGTCAATAATTA
GGTTCGGATAAAAAGCTTACATATGATCCTATAGATATCAATTTTAGCACTCAAGGAGAA
TTCCTTTTAGTAAGTGGAACTAATAACAAATGCACTCTATACACCAGAGAAGGTGGCTTT
TTAATAGATGTTGCAACAAAAAATGATTGGGTTTGGAATAATAAATTGAAACCTGTAATT
AAAGAAGCTGGATCTGTTGCTGTTTAAGATTAGTTACACGTTGCTTTAACTACAAATGAT
GGCGAAATCAGTATGTTTAAAATTCAATAACTAACAGTGCATGCACTTGAAGGTGATAAA
TATGCTTATAGAGATAATTTAACAGATATTGTTGTTTAGAGCATGAGCTCAAATTAAAGA
ATTCGTTTGAAATGCAAAGAACTAGTTAAGAACATTAGTATATATAAAGATAAGCTTGCT
GCTCATTTAACAGAAAGAATTTTGATTTATGGAACTTCTTCAGAAGATAGCTAAATGAAA
TATAAGTTGCATAAGAGAATAGTTAAAAAAGTTGAAGCTCATATCTTAGAAATAGTTTCA
AATCACTTGATAGCTTGTGTAAAAAATAAAGTATAATTATATTAATTATCAGGAGATTTA
GAAAAAGAATGGGTTTTTGACTCAAGAGTTAATTGCATTAAAATTATAGGTGGAATGCCT
AACAAAGAAGGAGCTTATGTCGGTTTAAAGAACGGTTAAATTTTCAAAATATTTGTTGAT
AACAGTTTCCCTATTCCTATATTAAACCACAATATTTCTATTAAAAATATTGATGCTTCT
CAAAAAAGAAAAAGATTAGCAGTTGTTGATAAAAATAGCAACCTAACTGTTTATGATCTT
TCAAACAAAGAATAAGTCTTCTAAGAAATGAATATTGTTTCTTGCGCTTTCAACAATAAT
TTTGATGACTTGCTTGCTTTTTCATCAACTGACACAACATTTATCAGGTGCTCTAATCAT
CCACCTCTATCTCAAAAAATATCAGGATAAGTTGTAGGATTTAAAGCAAATAAATTATTT
GTTTTGAATGACAATGTTATGAGTACAATTGATGTTTCGATGACTTAGACTATGATTAAA
TACTTAGAAAGAAAAGAATTTTAATCTGCATATGAAATATCTTTATTAGGAGTAACTGAT
TAAGATTTCTTATATTTAGGTAATGAAGCATTAATCGCAACACAATTTGCTATTGCTAGA
AAATGCTACACAAGAATAAAAAAATTAGACTTCATCTATCTCCTTGAAAAGGCAGAAAAA
GATTTTAAAAAGAATACATTTGTTGAGGGATTCTATTAAGGTGAGATATATGCTTTATAA
ACTAAATTCTATGAAGCAGAAAACGCACTCACTAAGTCAAATTTAGCTTCTTAAGCAAAA
GAAATGTGGATCATTCTTAAGGAATTTGATAAGGCTATGAGAATTACAGATACTGGTGCT
AGTCCTATTAATAGAGGCCAGAATAAAGAAATAAATTCTGATGCTTCTAGAAAGGACCTA
CTCATTTAGAGGGCAGAATGGGAAGTCAAACAAGGAAATTGGAAAAAGGGTGGTGAATTG
TACATTCAAGCTGAAGTATATAAAAAGGCTATAGAAGTATATGTAACCAATAATTTCTCA
GAAGGTATTGTTGAAGTTTGCAGAAACGCAGATGCAGAAACTCAAAGAAAAGAAATAGAA
TAATGTGCTGCATACTTTAAGAAAGCAAAACTTCATCAATACACAAAAGAAGCTTACTTG
AAGCTGTAAGATAACAAAGCTTTACTTTAATTGAATATTGATCTAGAAAAATGGGATGAA
GCTATGACTCTTGCAAAGGCTCATCCTGAATTCATGGAGATAGTCAAACTGCCTTATGCC
AATTGGCTTGCTAAATAAGATAGATACGAAGAATCTTTAAAGGCATACAGAAAAATTGGT
AAACATGATATGGCTACTAAGATGCTCTATAACTTATCTTAGAATGCTGTATTTGAAAAA
AGATTCTCTGACGCTGCTTTATTTACTTGGATGATAGCTACTGAGCACTTAGGTTTGATT
CGTAATATGAAAGCTCCAACCCCTGAAGATATTGAGAATTTAATGAAATTTTATTAGTAC
AGAGATGATGCTGAAATATATTTTGCATACTCCAAAGTTTAATCTTTTGTTGATGAACCA
TTCTTACCTTTATCAGGTCATGCTTACATGTTAAATATCTTCAATGCTGCTCGCTTCGCC
ATAAACAAACTAGGAAACAGGCAGTTATACGGAGTCTAACACAGTTATCTCTATTATTCA
TTAGGAAAAGTAAGTAAATAGCTTGAAGGTTACAAGACAGCCCGTATTTGCTATGAAAAA
CTAGCTAGCTACAAAATTCCTACTGAATGGAGCGAAGAAATAGAATTAAGTACACTCTTA
ATTAGATCTAAGCCATATAGTGATTAGGAGTCTTTACTTCCTATTTGCAATAGATGCTAT
AATTAAAACCCAGCTCTCACAGAAGGTAACAGATGTTCTTCTTGTATGCACTAATTTTAA
AACTGCTTCATAAGCTTTGAAAATCTACCTTTGGTTGAGTTTAAATTGGATCCTAAAATC
ACACATAAGAGATTTATTGAATTAATCAATTCTGATAAATCAAAAACACAACCTAATAAA
AAGAAGAAGAAAGCAAACGACGGATGGTAAGAATCTCACTAAGGAGATTAATAAGTTCTC
ACCTTTAACAATTCACCTTAAAAAGGAGGAAATGACAATGAAAGCAGTCCTTTCTTAGAT
AAACTTAACGAAGTATTCGAAATTTAATAAACTACTTAAGAATACATACCTGTTACATTA
GATGAAAATATAGTATCATCTCTTAGTATAGATGAGGTTTATTGGGTAGACTATACAAAA
TATTGCTACACAGCAGAAATAAAATATTACAAGAGTATGTTAACAGACATTCCTCTCAAG
AATTGTTAAGAATGTGGAACATTCTACATTTTGGATGAATATGAATTTGAAATAAGTAAG
ACATAAAAATGTCCTTTCTGCAGATCAGTTGATGAAAGAGCAGGACCTTAGAAGGATGTT
TTTGATTTCTGAGCAAAAGCCTACAAATAATTAAAAGAAAATTAATATAGTTAATAAAAC
ACAATTATAATTTAAATTTTATTTTT


>TTHERM_00694540(protein)
MKCSELWTEIIPKNDPNSNITNQVWSCSFNNDGSILLACVGDAILVYDSFTGNLVNKAIR
GGQKEQINCIKFSKDGKRFATASNDKTVWVWSFDVNKNPKLAPEVKYSHTDKVLCLAFNP
LTHQIFSGGAQDYALWTPDQQSIEKSKFKDKIITCAWSWDGLYLGFGTMGGIIGIRNRAL
EQLAEIQRSFPIWCMDWTPITPDYQNSVLVVGVWEQSIAHYNIQGQQLGSDKKLTYDPID
INFSTQGEFLLVSGTNNKCTLYTREGGFLIDVATKNDWVWNNKLKPVIKEAGSVAVQDQL
HVALTTNDGEISMFKIQQLTVHALEGDKYAYRDNLTDIVVQSMSSNQRIRLKCKELVKNI
SIYKDKLAAHLTERILIYGTSSEDSQMKYKLHKRIVKKVEAHILEIVSNHLIACVKNKVQ
LYQLSGDLEKEWVFDSRVNCIKIIGGMPNKEGAYVGLKNGQIFKIFVDNSFPIPILNHNI
SIKNIDASQKRKRLAVVDKNSNLTVYDLSNKEQVFQEMNIVSCAFNNNFDDLLAFSSTDT
TFIRCSNHPPLSQKISGQVVGFKANKLFVLNDNVMSTIDVSMTQTMIKYLERKEFQSAYE
ISLLGVTDQDFLYLGNEALIATQFAIARKCYTRIKKLDFIYLLEKAEKDFKKNTFVEGFY
QGEIYALQTKFYEAENALTKSNLASQAKEMWIILKEFDKAMRITDTGASPINRGQNKEIN
SDASRKDLLIQRAEWEVKQGNWKKGGELYIQAEVYKKAIEVYVTNNFSEGIVEVCRNADA
ETQRKEIEQCAAYFKKAKLHQYTKEAYLKLQDNKALLQLNIDLEKWDEAMTLAKAHPEFM
EIVKLPYANWLAKQDRYEESLKAYRKIGKHDMATKMLYNLSQNAVFEKRFSDAALFTWMI
ATEHLGLIRNMKAPTPEDIENLMKFYQYRDDAEIYFAYSKVQSFVDEPFLPLSGHAYMLN
IFNAARFAINKLGNRQLYGVQHSYLYYSLGKVSKQLEGYKTARICYEKLASYKIPTEWSE
EIELSTLLIRSKPYSDQESLLPICNRCYNQNPALTEGNRCSSCMHQFQNCFISFENLPLV
EFKLDPKITHKRFIELINSDKSKTQPNKKKKKANDGWQESHQGDQQVLTFNNSPQKGGND
NESSPFLDKLNEVFEIQQTTQEYIPVTLDENIVSSLSIDEVYWVDYTKYCYTAEIKYYKS
MLTDIPLKNCQECGTFYILDEYEFEISKTQKCPFCRSVDERAGPQKDVFDF