Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00694540

Standard Name

IFT122 (IntraFlagellar Transport 122)

Aliases

PreTt02937 | 107.m00117 | 3753.m00409 | IFT122A

Description

intraflagellar transporter; Intraflagelar transport protein; plays a role in returning IFT proteins from the ciliary tip to the cell body during ciliary regeneration

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External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01787 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A
  • ( SD01788 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A and of IFT172
  • ( SD01789 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A and of IFT172
  • ( SD01790 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A and of IFT172
  • ( SD01791 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A
  • ( SD01792 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A

Homologs

Source Identifier Score
Stentor Coeruleus SteCoe_28414 0
Description: None
Tetrahymena borealis EI9_18435.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1253 aa)
Oxytricha Contig19231.0.g39 9.997093137033517e-262
Description: WD domain, G-beta repeat
WormBase WBGene00000906 7.998663834726165e-156
Description: locus:daf-10 status:Confirmed UniProt:G5EFW7 protein_id:CAB05177.4
DictyBase DDB_G0293070 0.0000007997233352734267
Description: DDB_G0293070 on chromosome: 6 position 2426564 to 2433958
SGD YBR198C 0.000019995566179747357
Description: TAF5 Subunit (90 kDa) of TFIID and SAGA complexes, involved in RNA polymerase II transcription initiation and in chromatin modification

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:18199688: Tsao CC, Gorovsky MA (2008) Different effects of Tetrahymena IFT172 domains on anterograde and retrograde intraflagellar transport. Molecular biology of the cell 19(4):1450-61
  2. Ref:18211962: Tsao CC, Gorovsky MA (2008) Tetrahymena IFT122A is not essential for cilia assembly but plays a role in returning IFT proteins from the ciliary tip to the cell body. Journal of cell science 121(Pt 4):428-36

Sequences 

>TTHERM_00694540(coding)
ATGAAGTGTTCAGAACTATGGACGGAAATCATTCCCAAGAATGACCCCAATTCTAATATA
ACAAATCAAGTATGGAGTTGTAGCTTCAATAATGATGGCTCTATATTATTAGCTTGTGTA
GGAGATGCTATTCTTGTATACGATTCATTTACTGGCAATTTAGTAAATAAAGCAATTAGA
GGAGGATAAAAGGAATAAATTAATTGCATCAAGTTCTCAAAAGATGGAAAAAGGTTTGCA
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GGTTTATATTTAGGTTTTGGTACTATGGGAGGTATTATTGGAATAAGAAACAGAGCTCTC
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TATAATATTTAAGGTCAATAATTAGGTTCGGATAAAAAGCTTACATATGATCCTATAGAT
ATCAATTTTAGCACTCAAGGAGAATTCCTTTTAGTAAGTGGAACTAATAACAAATGCACT
CTATACACCAGAGAAGGTGGCTTTTTAATAGATGTTGCAACAAAAAATGATTGGGTTTGG
AATAATAAATTGAAACCTGTAATTAAAGAAGCTGGATCTGTTGCTGTTTAAGATTAGTTA
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GTGCATGCACTTGAAGGTGATAAATATGCTTATAGAGATAATTTAACAGATATTGTTGTT
TAGAGCATGAGCTCAAATTAAAGAATTCGTTTGAAATGCAAAGAACTAGTTAAGAACATT
AGTATATATAAAGATAAGCTTGCTGCTCATTTAACAGAAAGAATTTTGATTTATGGAACT
TCTTCAGAAGATAGCTAAATGAAATATAAGTTGCATAAGAGAATAGTTAAAAAAGTTGAA
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TAAATTTTCAAAATATTTGTTGATAACAGTTTCCCTATTCCTATATTAAACCACAATATT
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GTTTCTTGCGCTTTCAACAATAATTTTGATGACTTGCTTGCTTTTTCATCAACTGACACA
ACATTTATCAGGTGCTCTAATCATCCACCTCTATCTCAAAAAATATCAGGATAAGTTGTA
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ATATCTTTATTAGGAGTAACTGATTAAGATTTCTTATATTTAGGTAATGAAGCATTAATC
GCAACACAATTTGCTATTGCTAGAAAATGCTACACAAGAATAAAAAAATTAGACTTCATC
TATCTCCTTGAAAAGGCAGAAAAAGATTTTAAAAAGAATACATTTGTTGAGGGATTCTAT
TAAGGTGAGATATATGCTTTATAAACTAAATTCTATGAAGCAGAAAACGCACTCACTAAG
TCAAATTTAGCTTCTTAAGCAAAAGAAATGTGGATCATTCTTAAGGAATTTGATAAGGCT
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TCTGATGCTTCTAGAAAGGACCTACTCATTTAGAGGGCAGAATGGGAAGTCAAACAAGGA
AATTGGAAAAAGGGTGGTGAATTGTACATTCAAGCTGAAGTATATAAAAAGGCTATAGAA
GTATATGTAACCAATAATTTCTCAGAAGGTATTGTTGAAGTTTGCAGAAACGCAGATGCA
GAAACTCAAAGAAAAGAAATAGAATAATGTGCTGCATACTTTAAGAAAGCAAAACTTCAT
CAATACACAAAAGAAGCTTACTTGAAGCTGTAAGATAACAAAGCTTTACTTTAATTGAAT
ATTGATCTAGAAAAATGGGATGAAGCTATGACTCTTGCAAAGGCTCATCCTGAATTCATG
GAGATAGTCAAACTGCCTTATGCCAATTGGCTTGCTAAATAAGATAGATACGAAGAATCT
TTAAAGGCATACAGAAAAATTGGTAAACATGATATGGCTACTAAGATGCTCTATAACTTA
TCTTAGAATGCTGTATTTGAAAAAAGATTCTCTGACGCTGCTTTATTTACTTGGATGATA
GCTACTGAGCACTTAGGTTTGATTCGTAATATGAAAGCTCCAACCCCTGAAGATATTGAG
AATTTAATGAAATTTTATTAGTACAGAGATGATGCTGAAATATATTTTGCATACTCCAAA
GTTTAATCTTTTGTTGATGAACCATTCTTACCTTTATCAGGTCATGCTTACATGTTAAAT
ATCTTCAATGCTGCTCGCTTCGCCATAAACAAACTAGGAAACAGGCAGTTATACGGAGTC
TAACACAGTTATCTCTATTATTCATTAGGAAAAGTAAGTAAATAGCTTGAAGGTTACAAG
ACAGCCCGTATTTGCTATGAAAAACTAGCTAGCTACAAAATTCCTACTGAATGGAGCGAA
GAAATAGAATTAAGTACACTCTTAATTAGATCTAAGCCATATAGTGATTAGGAGTCTTTA
CTTCCTATTTGCAATAGATGCTATAATTAAAACCCAGCTCTCACAGAAGGTAACAGATGT
TCTTCTTGTATGCACTAATTTTAAAACTGCTTCATAAGCTTTGAAAATCTACCTTTGGTT
GAGTTTAAATTGGATCCTAAAATCACACATAAGAGATTTATTGAATTAATCAATTCTGAT
AAATCAAAAACACAACCTAATAAAAAGAAGAAGAAAGCAAACGACGGATGGTAAGAATCT
CACTAAGGAGATTAATAAGTTCTCACCTTTAACAATTCACCTTAAAAAGGAGGAAATGAC
AATGAAAGCAGTCCTTTCTTAGATAAACTTAACGAAGTATTCGAAATTTAATAAACTACT
TAAGAATACATACCTGTTACATTAGATGAAAATATAGTATCATCTCTTAGTATAGATGAG
GTTTATTGGGTAGACTATACAAAATATTGCTACACAGCAGAAATAAAATATTACAAGAGT
ATGTTAACAGACATTCCTCTCAAGAATTGTTAAGAATGTGGAACATTCTACATTTTGGAT
GAATATGAATTTGAAATAAGTAAGACATAAAAATGTCCTTTCTGCAGATCAGTTGATGAA
AGAGCAGGACCTTAGAAGGATGTTTTTGATTTCTGA


>TTHERM_00694540(gene)
ATGAAGTGTTCAGAACTATGGACGGAAATCATTGTATTTTTTTTAAACACTAGCAACCAT
TATTTATAAAGAGAATAATTTTATTCCACTCTACTTTAAAAAAATTGATTAATGATCACA
ATAAAAAATAAAAAATAGCCCAAGAATGACCCCAATTCTAATATAACAAATCAAGTATGG
AGTTGTAGCTTCAATAATGGTATTAAAATTAAACATTTGCAAAATTCATTCAGAATTTAA
AGTATGTGCAGGATATTTATTCATACTTTATCATATAAATAGATGGCTCTATATTATTAG
CTTGTGTAGGAGATGCTATTCTTGTATACGATTCATTTACTGGCAATTTAGTAAATAAAG
CAATTAGAGGAGGTAATTATAATTTTTTATAATTCATTAAATAGGGATAATTCTAATAAT
TTTTTTAGGAAAAAAGCTTTTCATTAACCATTATAATAATATAATTTATTGCTCTGCTAA
GTTAAAAATTAATGCTAATTATTTTTATGTAAATAAAGGATAAAAGGAATAAATTAATTG
CATCAAGTTCTCAAAAGATGGAAAAAGGTTTGCAACTGCTAGGTAATTAAGACTTACCAA
TAAAATATTCAAAACTACTAAATGGAGCTTGATAAATAGCTATAAATTGCTATATTATGC
AACTAATCCAATAATAAATTATTATAAATTTTTAAATTTTGATTGGATTTTGATATTAAA
ATTTTATAAATTTTTAATGTAAATTTTAGTAATGATAAAACTGTTTGGGTCTGGTCATTC
GATGTAAATAAAAATCCCAAATTAGCACCTGAAGTAAAATATTCTCATACAGATAAGGTT
TTATGTCTTGCTTTTAATCCATTGACGCATCAAGTAATTAATAAATTTTTTCAATTATAA
TTCGAGTATTCAATTTATAATAAAAAATAAAAGATTTTCTCTGGAGGTGCTTAGGACTAT
GCTTTATGGACTCCAGATCAACAAAGTATAGAAAAATCTAAATTTAAAGATAAAATAATA
ACTTGTGCATGGAGTTGGGATGGTTTATATTTAGGTTTTGGTACTATGGGAGGTATTATT
GGAATAAGAAACAGAGCTCTCGAATAGTTAGCAGAAATTTAAAGGTCATTCCCTATATGG
TGTATGGATTGGACGCCAATTACTCCTGACTATTAAAACAGTGTTCTCGTAGTAGGTGTT
TGGGAATAGTCAATAGCTCACTATAATATTTAAGGTCAATAATTAGGTTCGGATAAAAAG
CTTACATATGATCCTATAGATATCAATTTTAGCACTCAAGGAGAATTCCTTTTAGTAAGT
GGAACTAATAACAAATGCACTCTATACACCAGAGAAGGTGGCTTTTTAATAGATGTTGCA
ACAAAAAATGATTGGGTTTGGAATAATAAATTGAAACCTGTAATTAAAGAAGCTGGTAAT
TATTAACTAATTTAAATAAATTCAATAGAGATTAATTTTTGTGTAAAAAATGTGTTTTAA
TTTTTTGTATGATTTAAATTTAACAGGATCTGTTGCTGTTTAAGATTAGTTACACGTTGC
TTTAACTACAAATGATGGCGAAATCAGTATGTTTAAAATTCAATAACTAACAGTGCATGC
ACTTGAAGGTGATAAATATGCTTATAGAGATAATTTAACAGATATTGTTGTTTAGAGCAT
GAGCTCAAATTAAAGAATTCGTTTGAAATGCAAAGAACTAGTTAAGAACATTAGTATATA
TAAAGATAAGCTTGCTGCTCATTTAACAGAAAGAATTTTGATTTATGGAACTTCTTCAGA
AGATAGCTAAATGAAATATAAGTTGCATAAGAGAATAGTTAAAAAAGTTGAAGCTCATAT
CTTAGAAATAGTTTCAAATCACTTGATAGCTTGTGTAAAAAATAAAGTATAATTATATTA
ATTATCAGGAGATTTAGAAAAAGAATGGGTTTTTGACTCAAGAGTTAATTGCATTAAAAT
TATAGGTGGAATGCCTAACAAAGAAGGAGCTTATGTCGGTTTAAAGAACGGTTAAATTTT
CAAAGTAATTTTTTTTTAATGTGTAAAACTTCATTTTATTTAAATAATAAAATAAAGATA
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GATGCTTCTCAAAAAAGAAAAAGATTAGCAGTTGTTGATAAAAATAGCAACCTAACTGTT
TATGATCTTTCAAACAAAGAATAAGTCTTCTAAGAAATGAATATTGTTTCTTGCGCTTTC
AACAATAATTTTGATGACTTGCTTGCTTTTTCGTATTAATTTATTTTAATAAATATTTAA
ATTTCATCGACTCATAATTTTTGATAATAAATAAATGTATAGATCAACTGACACAACATT
TATCAGGTGCTCTAATCATCCACCTCTATCTCAAAAAATATCAGGATAAGTTGTAGGATT
TAAAGCAAATAAAGTAATAAATTATTTTCATTTAACAATTAGTTTTAATTAAATTTGTTT
TATGAAATTAGTTATTTGTTTTGAATGACAATGTTATGAGTACAATTGATGTTTCGATGA
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TATTAGGAGTAACTGATTAAGATTTCTTATATTTAGGTAATGAAGCATTAATCGCAACAC
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TAATGCTTGATTAAATTTTTAATAAATTAGTGCTACACAAGAATAAAAAAATTAGACTTC
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TTAAGGTGAGATATATGCTTTATAAACTAAATTCTATGAAGCAGAAAACGCACTCACTAA
GTCAAATTTAGCTTCTTAAGCAAAAGAAATGTGGATCATTCTTAAGGAATTTGATAAGGC
TATGAGAATTACAGATACTGGTGCTAGTCCTATTAATAGAGGCCAGAATAAAGAAATAAA
TTGTAAATAATTCTTATTTTATTTTAGTTATTAATTTTTTAATTCCAGCTGATGCTTCTA
GAAAGGACCTACTCATTTAGAGGGCAGAATGGGAAGTCAAACAAGGAAATTGGAAAAAGG
GTGGTGAATTGTACATTCAAGCTGAAGTATATAAAAAGGCTATAGAAGTATATGTAACCA
ATAATTTCTCAGAAGGTATTGTTGAAGTTTGCAGAAACGCAGATGCAGAAACTCAAAGAA
AAGAAATAGAATAATGTGCTGCATACTTTAAGTAAGCAAAATAATTTCAAAAAATTTAAT
AACATTTTAATTTAATTTATCAGGAAAGCAAAACTTCATCAATACACAAAAGAAGCTTAC
TTGAAGCTGTAAGATAACAAAGCTTTACTTTAATTGAATATTGATCTAGAAAAATGGGAT
GAAGCTATGACTCTTGGTAAGTTTTATATAAATCAAATTTGAGAGATAGATGAATATATT
TTTGATTTTTTATTTTAGCAAAGGCTCATCCTGAATTCATGGAGATAGTCAAACTGCCTT
ATGCCAATTGGCTTGCTAAATAAGATAGATACGAAGAATCTTTAAAGGCATACAGAAAAA
TTGGTAAACATGATATGGCTACTAAGATGCTCTATAACTTATCTTAGAATGCTGTATTTG
AAAAAAGATTCTCTGACGCTGCTTTATTTACTTGGATGATAGCTACTGAGCACTTAGGTT
TGATTCGTAATATGAAAGCTCCAACCCCTGAAGATATTGAGAATTTAATGAAATTTTATT
AGTACAGAGATGATGCTGAAATATATTTTGCATACTCCAAAGTTTAATCTTTTGTTGATG
AACCATTCTTACCTTTATCAGGTCATGCTTACATGTTAAATATCTTCAATGCTGCTCGCT
TCGCCATAAACAAACTAGGAAACAGGCAGTTATACGGAGTACAATTTCTTTAAAATTTAT
TAAAAATACTTAAAATCAAAAATTATATTATAGGTCTAACACAGTTATCTCTATTATTCA
TTAGGAAAAGTAAGTAAATAGCTTGAAGGTTACAAGACAGCCCGTATTTGCTATGAAAAA
CTAGCTGTATGTTCAAATTTATTATTATTATTATTACCAAGTTAAACATTATTTTAACAA
AAAGAGCTACAAAATTCCTACTGAATGGAGCGAAGAAATAGAATTAAGTACACTCTTAAT
TAGATCTAAGCCATATAGTGATTAGGAGTCTTTACTTCCTATTTGCAATAGATGCTATAA
TTAAAACCCAGCTCTCACAGAAGGTAACAGATGTTCTTCTTGTATGCACTAATTTTAAAA
CTGCTTCATAAGCTTTGAAAATCTACCTTTGGTTGAGTTTAAATTGGATCCTAAAATCAC
ACATAAGAGATTTATTGAATTAATCAATTCTGATAAATCAAAAACACAACCTAATAAAAA
GAAGAAGAAAGCGTAATTAGATTTTAATAATTACTTGACTTACACTGACAATTCAAAATT
AATTAAATTTTTTTTCAAAATTGGATGGAAATTATTAATTTGAACTGATATTTTGATTAT
TTCATAATAATTTGATTAAATAGAAACGACGGATGGTAAGAATCTCACTAAGGAGATTAA
TAAGTTCTCACCTTTAACAATTCACCTTAAAAAGGAGGAAATGACAGTAAAAGATTTTAG
CATGATTATTTAAAATTTATTATTTAAATCTAAAAAATATTAAGATGAAAGCAGTCCTTT
CTTAGATAAACTTAACGAAGTATTCGAAATTTAATAAACTACTTAAGAATACATACCTGT
TACATTAGATGAAAATATAGTATCATCTCTTAGTATAGATGAGGTAATTTCGTTTAATTT
TTAAAGAAAGATACAACAAATAACTAATGTATCTTCTCTTAAAGGCCCATTACAATTAGC
TAATTTTTTTAATAGGTTTATTGGGTAGACTATACAAAATATTGCTACACAGCAGAAATA
AAATATTACAAGAGTATGTTAACAGACATTCCTCTCAAGAATTGTTAAGAATGTGGAACA
TTCTACATTTTGGTAATTAATATCATTTTTTTTCCATATAATTACACACAAAAAAATTTA
TCAATTAGGATGAATATGAATTTGAAATAAGTAAGACATAAAAATGTCCTTTCTGCAGAT
CAGTTGATGAAAGAGCAGGACCTTAGAAGGATGTTTTTGATTTCTGA


>TTHERM_00694540(protein)
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SIKNIDASQKRKRLAVVDKNSNLTVYDLSNKEQVFQEMNIVSCAFNNNFDDLLAFSSTDT
TFIRCSNHPPLSQKISGQVVGFKANKLFVLNDNVMSTIDVSMTQTMIKYLERKEFQSAYE
ISLLGVTDQDFLYLGNEALIATQFAIARKCYTRIKKLDFIYLLEKAEKDFKKNTFVEGFY
QGEIYALQTKFYEAENALTKSNLASQAKEMWIILKEFDKAMRITDTGASPINRGQNKEIN
SDASRKDLLIQRAEWEVKQGNWKKGGELYIQAEVYKKAIEVYVTNNFSEGIVEVCRNADA
ETQRKEIEQCAAYFKKAKLHQYTKEAYLKLQDNKALLQLNIDLEKWDEAMTLAKAHPEFM
EIVKLPYANWLAKQDRYEESLKAYRKIGKHDMATKMLYNLSQNAVFEKRFSDAALFTWMI
ATEHLGLIRNMKAPTPEDIENLMKFYQYRDDAEIYFAYSKVQSFVDEPFLPLSGHAYMLN
IFNAARFAINKLGNRQLYGVQHSYLYYSLGKVSKQLEGYKTARICYEKLASYKIPTEWSE
EIELSTLLIRSKPYSDQESLLPICNRCYNQNPALTEGNRCSSCMHQFQNCFISFENLPLV
EFKLDPKITHKRFIELINSDKSKTQPNKKKKKANDGWQESHQGDQQVLTFNNSPQKGGND
NESSPFLDKLNEVFEIQQTTQEYIPVTLDENIVSSLSIDEVYWVDYTKYCYTAEIKYYKS
MLTDIPLKNCQECGTFYILDEYEFEISKTQKCPFCRSVDERAGPQKDVFDF