Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00711790

Standard Name

SLN1  (Synthetic Lethal of N-end rule )

Aliases

PreTt16839 | 112.m00083

Description

ATPase histidine kinase- DNA gyrase B

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• membrane (IEA) | GO:0016020

Molecular Function

• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• phosphorelay response regulator activity (IEA) | GO:0000156
• phosphorelay sensor kinase activity (IEA) | GO:0000155

Biological Process

• phosphorelay signal transduction system (IEA) | GO:0000160
• regulation of DNA-templated transcription (IEA) | GO:0006355
• signal transduction (IEA) | GO:0007165

Domains

• ( PF00072 ) Response regulator receiver domain
• ( PF00512 ) His Kinase A (phospho-acceptor) domain
• ( PF00904 ) Involucrin repeat
• ( PF02518 ) Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
• ( TIGR01386 ) heavy metal sensor kinase
• ( TIGR01396 ) flagellar basal-body rod protein FlgB
• ( TIGR02154 ) phosphate regulon transcriptional regulatory protein
• ( TIGR02875 ) sporulation transcription factor Spo0A
• ( TIGR02956 ) TMAO reductase sytem sensor TorS
• ( TIGR02966 ) phosphate regulon sensor kinase PhoR
• ( TIGR03033 ) putative phage-type endonuclease

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_14106.1	3.000455015819344e-150
	Description: hsp90-like protein (955 aa)
WormBase	WBGene00018877	3.000455015819344e-150
	Description: locus:aman-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q20829 protein_id:CCD67087.1
Oxytricha	Contig7986.0.g100	9.99723014177113e-33
	Description: Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
DictyBase	DDB_G0277845	9.997975313387782e-28
	Description: dhkB on chromosome: 3 position 525688 to 531677
Stentor Coeruleus	SteCoe_16553	0.000000000000012664165549094176
	Description: None
SGD	YIL147C	0.00000000000009996062864481225
	Description: SLN1 Histidine kinase osmosensor that regulates a MAP kinase cascade; transmembrane protein with an intracellular kinase domain that signals to Ypd1p and Ssk1p, thereby forming a phosphorelay system similar to bacterial two-component regulators

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,

Sequences

>TTHERM_00711790(coding)
ATGCAAGATAAATACAAAAATATTGACCTAGAAAAAGAGGATGTTTTTATTAATTGTGTG
TATAAAAACTAGAAAAACGCTAAGGCTTTAGATATACATATCGTTGAATTTCAGTGGATT
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GCATCTGAATCCTAAAAATGTTTTGATGCTGGTATGGATGCACACATTTGTAAGCCTATT
AGTAGATCTGATTGTTTTTCTGTATTATTAAATTTAAATTAATAGTGA

>TTHERM_00711790(gene)
ATGCAGTAATTTGGAATTAAGCAGAATCTAAGTTAGTTCATGTTAGGAAATTCTGTTTAT
AATTAGAACATATATGGGATGCCAATTAATGATTTCAGTGAGAATATTAATTCGCTTGTA
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TGATTTTGCAGAAATAATTTTTAACAGAATACAAAAGATTTAAAAACTACTTATTTTTGA
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GTTGTATGGTACATATGATCACAATAATGGATCAAATAAACATGGTGTAGGTTTGGGTTT
AGTAATCACTAAAAAATTAGCATCCTAAGTGGGTCCTAAAGATTCCTTAAGATTTTAAAG
CAAGGAAAAAATAGGAACTGAATTTTCTTTTCATATTTACAGAAATTTGAAATCTAAATC
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CTAATCGAATATATCTTTGAACCCAACAACAACAGATAAGCTTCAATCCAATTTTGAATA
ATAGATTTTATCACATAAAAAAGAAAGGCCCTTCTAGTTTAAAGAAAATGAATATTTAGA
AAGCTCTCCTTTATCAAATCCACTTTCAAATGATTAGAATATTTTAAGTGTTTAAAGATA
ACAATCCGATATCAAAAATTCTTAGATAATAAACACAAACGAAAATTTTGATACAGAAGT
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TTTTCAAAATAATTTTTATTTTATGCCCTCCCACTTTAAACAGTAAATACTTCTACTTTG
TTGAAATTTTTAAATAAATTTAGAAATGGGGTATTAATTAATTTTAAAAAATAATTTTAA
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AAAAAATTAGCAAAATAGCTCAAGACGTATTTCAGAAGAATTGAATAAAAATAACAATAA
CTTAGATACTTGTGTAAAAGTTACTGAAAGTTTTGAAGGTAAAGAAAATTCTAATTAAGA
AGACTTAGATAAAATACCAACAACTAATAGTAATTTTGAAGAAAAAGACCAAGAAAATAT
TTAAGATATATAAAACACATAAAACTATGATCAGCAAGAGTAATAATTAAATAAAAAATT
TACTATCAATAAAAACAGAAGGACAAAAAGCAGCTTTAGTTAGCTTCAAGATATTAAAGA
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TGAATTAATTTAGTTACCTCCTTCTTTATAATTTACTATGCCTACCAGAGTATTAATAGT
GGACGACACTTACTTCAATATAATTGCTCTCAAATTAATGCTCAAAAGCATAAAAAACTT
AACTATAGAAGAAGCCTATAATGGCTAGTAAGCCTTAGATATACTAAACTAAGCTAAGTT
ATCATATTAAAAAGGTTAAAGAAAAATCGAAGATTTATTTTAAATCATTTTTATGGACAT
AAATATGCCAATTATGGATGGAATTGAGTGCACTGTAAACATTAGAAAAGATCCATTTTA
TTAAGACGTTAAAATTATTGCAGTTACAGCATATTCTTCTGCATCTGAATCCTAAAAATG
TTTTGATGCTGGTATGGATGCACACATTTGTAAGCCTATTAGTAGATCTGATTGTTTTTC
TGTATTATTAAATTTAAATTAATAGTGA

>TTHERM_00711790(protein)
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