Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00715810

Standard Name

Brop-1 (Bromodomain containing protein 1)

Aliases

PreTt19055 | 113.m00094 | 3673.m00018

Description

bromodomain protein

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Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

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Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_16850.1 9.997093137033517e-262
Description: hypothetical protein (1370 aa)
Oxytricha Contig18584.0.g108 1.999598840915195e-17
Description: Bromodomain
DictyBase DDB_G0270170 0.0000000000000700196834671948
Description: DDB_G0270170 on chromosome: 1 position 4360881 to 4366105
WormBase WBGene00022473 0.000000000003001226732525078
Description: locus:bet-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q95Y80 protein_id:CCD68309.1
SGD YDL070W 0.00000000030007160092483236
Description: BDF2 Protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters; associates with the basal transcription factor TFIID; contains two bromodomains; corresponds to the C-terminal region of mammalian TAF1; redundant with Bdf1p

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10

Sequences 

>TTHERM_00715810(coding)
ATGTCAAAGAAAATAGTGAAAGGAGGAGGTAGTAACACAGCAATTAAGAATACATCAAAA
CCTCTGGAAGAGAGTATTTTAGATATTATAAATGACATTAGCAAGCGTTAGTATTCGTTA
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AAAAAGCCAATGGACATATCCACTCTCAAAAATAATTTTTTGGAGGGTGTTTATAAGACA
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ATTCCAGACCACCCAATAAACCAAAAAGCTGATCAAATGAAAAGCCGTGTAGATAAAAAT
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TCTGATAAGCCAGTGAATACCAGCGAACCTCCAAAAATTATTCTTATGAAGAGTTAGAGT
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AAAAATATTAGTGAAAAGCTATACAGAATTGGTTCTAGAGCTATTGTATACAAAACTCCA
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GAAATGAAGCTGTTCCGTCGTATGCTTAGCAGAGATATCTAGAAATACTAAGAACCAGAT
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GGTAATGATAACGATTAGTAAGGAGGATATATGAATGGTGGTTAAGGTTATGACGATTCA
AAAGATGCAATTTATGGAATGGGAGATAAAGATTAGTAATAAAAGTAAAGTGAAATACTG
TCATTCTTCTTGGAGTATAACAAAAGCTTTGAAAAGCACTCCTCTAATTTGCAAAAAATC
CAACACTTTTTGGCATATTAAAATTATAGCAATATTCTAAATTAATTATAGAGCAAGAAT
CCAATAAAGAGCGACTAACTATTTGATATATGCGAGACTTTTGTTGAAGATGAAAATAAT
AATTAAGTAGAAATTCTTTAATACTTCAAAAAAAAGAGAAAAATTTCTGAACATACATCT
TCAGAAAGTATGACAAATAACAATAATGATACAAAGATTGAAGAAGAAGGTAAATAAAAA
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TTTAACTTCAATCTTGACTCTAAGAAAGAAGATGAAGAAGGAAAAGAAAACACTTTCATA
AGTAAAAGTCAAGACAATTCATTTAATAATCCAAAATAAGCAATAAATGTATTCAGTTAG
TTTGATGATGATGAAGATGATTCTACTGAAGCAATAATGGAAGAGAGAAAATATTAAGAG
TTTAAATCTAAAATAAACTAAAAAAATCTCAAAGAATGCAATAGTGGAAGTGATATTTTG
GGAAAAAATATAAGTGATATAAATATTTCCAACGTAATCAACCCAGAGTTTGACTATTTC
GGAGTGAAAAAACTCAATTAAATGATTAATAACAAAGTTATAAACAAAAAATTCTGCCAA
AATATAAACTCATTTATAAAATAGAAATTTTAAATTGTTGAAATCAACAAAATAAAATGC
AAAAATGCTATTATTTACTAAAAAATGAAAACAAATGATGATCTAGTTAAAAATTTATAT
TAAAAATAGTAATTATTAGAGCCAAAGATAAATATTAAAATAGCTCCTCCGTTTTTGGAT
GATCTCAATATTAATTGTTTGCAAACACTAATAAATTTATAAATTTAGGTTGAATTGAGA
CTTGAGAATGAATAAAATCCTAAAAGCTAAATGGATATAGAAAATAGCCAAAACAACTAA
GCTGAAAAATCTTTAGAATTTCATATTTAAAATAATGTTAACTATGCTTGTTGTGCATAC
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GAGGCAGTTTGTATAACAAAATAAAGATTAAGATAAATTGATCCTTAAAACAACAAATTT
TTGTTAGAAATTTCTCTCTGGACTCCTACTGATAATCTAGGTTATTTATCAATAAAACTA
AACAATGAAGAAATATTTTCACCACTCAATTTTATTTAAAAAATAAAAAAGTTTTAACAA
TATCAGATTTAACAAAAGCAAATTTAACAACAACAACAACAACAATTGTAATAACAACAA
AAAAAATATATCTAAAATCAATCACAATGA


>TTHERM_00715810(gene)
ATGTCAAAGAAAATAGTGAAAGGAGGAGGTAGTAACACAGCAATTAAGAATACATCAAAA
CCTCTGGAAGAGAGTATTTTAGATATTATAAATGACATTAGCAAGCGTTAGTATTCGTTA
GATTTTAGAGAACCTGTCGATGTAAAAGCATTAGGATTGAGCGATTATTATGACATTGTT
AAAAAGCCAATGGACATATCCACTCTCAAAGTCGGTGCTTTTTTTATCCTCCTTATATAT
TCATAAAAATTATTTAAACCCATTATTGAGCAAATATATTTTTTAGTAGACTAACCATCA
CTAGATTGATACAAAAAGAGTAATTATGAAAAGCAGTTCATATTGTATTTCATTTTAAAT
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GAATTAGTTTGAAAAAATCTTAAAACAATATATTTATTTATATTTTTATTTGTAAAAATT
TCTACATTAGAATAATTTTTTGGAGGGTGTTTATAAGACAATAAAAGAAGTATGGGAAGA
TTTTGATTTAATCGTGAATAACTGCAAGGCTTATAATAGAATTCCAGACCACCCAATAAA
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TTATTCAGTTTAGGAAGTAAGTGCACAAAGAAATTTTTGATTTGAAATTTAGACAAAAGA
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AATTGCATCAATTACTCTCCATGCAATAAAGCTTTGGCTAAAAATATATTCTTTTTTGAC
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AATGATGATCTAGTTAAAAATTTATATTAAAAATAGTAATTATTAGAGCCAAAGATAAAT
ATTAAAATAGCTCCTCCGTTTTTGGATGATCTCAATATTAATTGTTTGCAAACACTAATA
AATTTATAAATTTAGGTTGAATTGAGACTTGAGAATGAATAAAATCCTAAAAGCTAAATG
GATATAGAAAATAGCCAAAACAACTAAGCTGAAAAATCTTTAGAATTTCATATTTAAAAT
AATGTTAACTATGCTTGTTGTGCATACTTTACAGAGTTACCCAATATAAAGGATGAAATA
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>TTHERM_00715810(protein)
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QKQAEAAAAAAAAALANNEVSDKPVNTSEPPKIILMKSQSLKPEEGASTGSNLIKIPFDA
SLAKMSSTQSQPNSQLDIGYNSRQIYDKIIPSKPKKTQSIQQEQNANTSNSQNLNFNKIK
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SKSQDNSFNNPKQAINVFSQFDDDEDDSTEAIMEERKYQEFKSKINQKNLKECNSGSDIL
GKNISDINISNVINPEFDYFGVKKLNQMINNKVINKKFCQNINSFIKQKFQIVEINKIKC
KNAIIYQKMKTNDDLVKNLYQKQQLLEPKINIKIAPPFLDDLNINCLQTLINLQIQVELR
LENEQNPKSQMDIENSQNNQAEKSLEFHIQNNVNYACCAYFTELPNIKDEIQLNCKENAD
FYSILCQEDVEQVVQSFKIQKQLYRLLSQDSFLTQEVINSEAVCITKQRLRQIDPQNNKF
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