Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00715810Standard Name
Brop-1 (Bromodomain containing protein 1)Aliases
PreTt19055 | 113.m00094 | 3673.m00018Description
bromodomain proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
External Links
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)
GeneMania
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for Tetrahymena Stock Center
Homologs
Source Identifier Score Tetrahymena borealis EI9_16850.1 9.997093137033517e-262 Description: hypothetical protein (1370 aa) Oxytricha Contig18584.0.g108 1.999598840915195e-17 Description: Bromodomain DictyBase DDB_G0270170 0.0000000000000700196834671948 Description: DDB_G0270170 on chromosome: 1 position 4360881 to 4366105 WormBase WBGene00022473 0.000000000003001226732525078 Description: locus:bet-1 status:Partially_confirmed UniProt:Q95Y80 protein_id:CCD68309.1 WormBase WBGene00011612 0.000000000003001226732525078 Description: status:Partially_confirmed UniProt:A4F324 protein_id:CCD74403.1 SGD YDL070W 0.00000000030007160092483236 Description: BDF2 Protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters; associates with the basal transcription factor TFIID; contains two bromodomains; corresponds to the C-terminal region of mammalian TAF1; redundant with Bdf1p
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10
Sequences
>TTHERM_00715810(coding)
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AAAAATATTAGTGAAAAGCTATACAGAATTGGTTCTAGAGCTATTGTATACAAAACTCCA
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GAAATGAAGCTGTTCCGTCGTATGCTTAGCAGAGATATCTAGAAATACTAAGAACCAGAT
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GGTAATGATAACGATTAGTAAGGAGGATATATGAATGGTGGTTAAGGTTATGACGATTCA
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AATTAAGTAGAAATTCTTTAATACTTCAAAAAAAAGAGAAAAATTTCTGAACATACATCT
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TTTAACTTCAATCTTGACTCTAAGAAAGAAGATGAAGAAGGAAAAGAAAACACTTTCATA
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GGAAAAAATATAAGTGATATAAATATTTCCAACGTAATCAACCCAGAGTTTGACTATTTC
GGAGTGAAAAAACTCAATTAAATGATTAATAACAAAGTTATAAACAAAAAATTCTGCCAA
AATATAAACTCATTTATAAAATAGAAATTTTAAATTGTTGAAATCAACAAAATAAAATGC
AAAAATGCTATTATTTACTAAAAAATGAAAACAAATGATGATCTAGTTAAAAATTTATAT
TAAAAATAGTAATTATTAGAGCCAAAGATAAATATTAAAATAGCTCCTCCGTTTTTGGAT
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TATCAGATTTAACAAAAGCAAATTTAACAACAACAACAACAACAATTGTAATAACAACAA
AAAAAATATATCTAAAATCAATCACAATGA>TTHERM_00715810(gene)
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AAAAAGCCAATGGACATATCCACTCTCAAAGTCGGTGCTTTTTTTATCCTCCTTATATAT
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TTATTCAGTTTAGGAAGTAAGTGCACAAAGAAATTTTTGATTTGAAATTTAGACAAAAGA
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