Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00723650

Standard Name

TDP1 (a member of the phospholipase D family )

Aliases

PreTt18125 | 116.m00150 | 3671.m00074

Description

TDP1 tyrosyl-DNA phosphodiesterase family protein; Tyrosyl-DNA phosphodiesterase family protein; homolog to human TDP1

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• nucleus (IEA) | GO:0005634

Molecular Function

• phosphoric diester hydrolase activity (IEA) | GO:0008081

Biological Process

• DNA repair (IEA) | GO:0006281

Domains

• ( PF00614 ) Phospholipase D Active site motif
• ( PF06087 ) Tyrosyl-DNA phosphodiesterase
• ( PF08257 ) Sulfakinin family

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_14839.1	9.997093137033517e-262
	Description: tyrosyl-DNA phosphodiesterase (580 aa)
WormBase	WBGene00000776	9.997093137033517e-262
	Description: locus:cpl-1 status:Confirmed UniProt:O45734 protein_id:CAB07275.1
Oxytricha	Contig18880.0.g20	2.99915080840225e-45
	Description: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase
Stentor Coeruleus	SteCoe_19350	7.781132241133797e-20
	Description: None
DictyBase	DDB_G0273869	0.00000000019994075865167896
	Description: DDB_G0273869 on chromosome: 2 position 3501162 to 3503366
WormBase	WBGene00018678	0.000000100009565553302
	Description: status:Confirmed UniProt:U4PRC2 protein_id:CDH93125.1
WormBase	WBGene00008008	0.000000100009565553302
	Description: status:Confirmed UniProt:Q18511 protein_id:CAA86320.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

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Sequences

>TTHERM_00723650(coding)
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AGTAAAAAACGAGATTACAAATAATATTCTCAGTAGAATGAAGCTGAAGAATTTACTTTA
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TCAGGCTCTTAAATACATGATTATGGAAAGATGAGGATCAGAAAAATTTGTTAAGTATTC
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ATAGACAGAACCTTTGTTAATGAATTTTTGTTTTGCTTTTTACCTTATCAATTTTGCAGC
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GGATCGTAAGAAATAAAAGAAGAGATTATTGAAATAATGAATTATAAATTTCCAGCTAAG
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TGA

>TTHERM_00723650(gene)
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ATGAATCAACTAGTGCATCATAAAAATCTGAAAACGAACAAGCATTTCATTAACTTTCGC
GCTCTATTTTATGAAGACCCTTTCTATAAAGGTAGCACTAATTAAATATAGATTTTAAAA
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AATATTATATGGTTTAAAGATTTTGAATTGATACCATAACAAATTTAAGTTTCTTAAAGC
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GAAAAAAATTATAGAAACATAAATGATGTAGATATGAATGAGGATTTTATAGATGTGCTT
AATGAATTTATAGATAAAATATGTCCCTATTTTGATGTTAAGGAGATGCTTGATATTAAT
TTAAGAAATTATTAAATAAAAGGAATTAATTTTATGCTTGTTTCCTCTCTTCCAGGAAAG
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ATATTTTTGTCAATAAATATTTTACTGCTTTACTTTACTTATTTATAATTTAAAAAATAT
AGATTGACTCAAAAAAAGTTCTATACTCTCAAAGCACTAGCTTAGGTACTATAGACAGAA
CCTTTGTTAATGAATTTTTGTTTTGCTTTTTACCTTATCAATTTTGCAGCGAAATAGAGC
TTAAAGATAAAGTGAAAAAAAATGACCCAGAAAAAAATGATGAAATTAGATTAATATTCC
CTTCTAAGGATTATATTTAAAATAAAACTCTAGATGGAGCTGGCTATTCTGATACTTTAT
TTTTAACTAGTAAAAGATACTAAAAAGAGTCTTTTCTTAAAAATATATTTTACTAATTTT
AATGCAAGTAAATGGATTCTTTGGGTGAATCCCAAGATAAACAAAAAGGAATTATTCCTC
ATTTTAAGACTATGATAGTCTGTGAGTAAAATGGAGAAATAAATGATGATTCAATCATTT
ATATTGGAAGGTTCAATACTTATTTTATTACTATTAAAAACTAAAAGATTAATTAATTTA
TTAAAATATCGATAAATTAGTCATAATTTTTCTGAAGCAGCATGGGGAAAGCTAAATAAA
GATAATACTCAGCTTTACATAAGTAATACAGAATTAGGAATATTAATTCCACCCTTAAAA
GGTAATGTTTAAATTTTAAATAAATAGATTGTCTTTAATTATTAAATTTAATAGCAAATG
AAATTTTTAAAAGTAATCCACCACAATTCTATAAATTAAATTAAATAAAAAGGCAACTAT
TAACATTTTTAATGCTTATTAGCTTACTCAATCATAAAAAATGCTTTAATTTAAGTAATT
TTGATATTTGAGGAATACAGTAAAAAAAATATTTTTTTAAGAATCTAAATTAATATTCAA
TTTTACGAAAGATTAAAATCAATTAGAATATTAAATTTGTAATTTGTAAAAACTAAAAGG
ATCGTAAGAAATAAAAGAAGAGATTATTGAAATAATGAATTATAAATTTCCAGCTAAGCC
GTATAGAGAAAAAGAAAAACCATATATTAGTGATATTGATCATCCAATATTTTAAAAATG
A

>TTHERM_00723650(protein)
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SIDQAHQNVSKSEYTCFPPIKFRQNEQQENQPKNKLTDFYMNQLVHHKNLKTNKHFINFR
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