Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00725930

Standard Name

DRH42 (DExD/H box RNA helicase 42)

Aliases

PreTt21859 | 117.m00111

Description

DRH42 helicase carboxy-terminal domain protein

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• helicase activity (IEA) | GO:0004386
• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676

Domains

• ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
• ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
• ( PF03107 ) C1 domain
• ( PF03202 ) Putative mycoplasma lipoprotein, C-terminal region
• ( PF04297 ) Putative helix-turn-helix protein, YlxM / p13 like
• ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_04583.1	9.997093137033517e-262
	Description: helicase domain-containing protein (738 aa)
WormBase	WBGene00020557	9.997093137033517e-262
	Description: Adenine phosphoribosyltransferase status:Confirmed UniProt:P91455 protein_id:CCD62975.1
Oxytricha	Contig13621.0.g36	2.9999146385131704e-95
	Description: Mitochondrial degradasome RNA helicase subunit C terminal
DictyBase	DDB_G0278937	3.0011595823640496e-94
	Description: DDB_G0278937 on chromosome: 3 position 1214678 to 1217558
WormBase	WBGene00007444	2.0001503375893664e-79
	Description: ATP-dependent RNA helicase SUV3 homolog, mitochondrial status:Partially_confirmed UniProt:Q17828 protein_id:CAJ43433.1
Tetrahymena borealis	EI9_12488.1	2.0001503375893664e-79
	Description: eukaryotic aspartyl protease (391 aa)
SGD	YPL029W	2.999564368270328e-76
	Description: SUV3 ATP-dependent RNA helicase, component of the mitochondrial degradosome along with the RNase Dss1p; the degradosome associates with the ribosome and mediates RNA turnover; also required during splicing of the COX1 AI5_beta intron
Stentor Coeruleus	SteCoe_20130	1.368539471173853e-44
	Description: None

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00725930(coding)
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>TTHERM_00725930(gene)
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TATGAATCTCTGTATTACATTTTAGAATTATATATATGGCTTGGGAATAAATTTGGTGAA
GATAGATTCCCTGATATGCAATTAGCTCACAACAAAAAGTCAGTGATTTGTAGTATGATG
AATGAAATACATTCACATAACTAATATCAATGA

>TTHERM_00725930(protein)
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