Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00728870

Standard Name

CPH1 (homolog of CAP-H, BRN1 condensin gene)

Aliases

PreTt07289 | 118.m00117 | 3739.m00039

Description

condensin complex subunit 2; condensin subunit- kleisin

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External Links

Gene Ontology Annotations

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Domains

  • ( PF04624 ) Dec-1 repeat
  • ( PF05786 ) Condensin complex subunit 2
  • ( PF06625 ) Protein of unknown function (DUF1151)

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_17942.1 4.999717172196908e-122
Description: hypothetical protein (294 aa)
Oxytricha Contig18145.0.g34 4.999245259173412e-21
Description: Condensin complex subunit 2
DictyBase DDB_G0292066 6.998542127613979e-20
Description: ncapH on chromosome: 6 position 1141212 to 1144129
SGD YBL097W 0.0000000006999585478469937
Description: BRN1 Subunit of the condensin complex; required for chromosome condensation and for clustering of tRNA genes at the nucleolus; may influence multiple aspects of chromosome transmission

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29237819: Howard-Till R, Loidl J (2018) Condensins promote chromosome individualization and segregation during mitosis, meiosis, and amitosis in Tetrahymena thermophila. Molecular biology of the cell 29(4):466-478

Sequences 

>TTHERM_00728870(coding)
ATGAATAAAAGTCACAAAGGTGGTAGATTACTTAAGAAAAAAATATTATAAGAAGTATAG
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GATAATTTTCTCATCAAAAGAAATACTATCTAAGAATAACAATTGCAAGAAATGTCTTAA
GATTGA


>TTHERM_00728870(gene)
ATGAATAAAAGTCACAAAGGTGGTAGATTACTTAAGAAAAAAATATTATAAGAAGTATAG
GAAAAAGATGATTATTATGACGACGAAGATTTATTAACTAATGAAGAATTAAAAATGATG
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ATCATTTAAGATGCTTAGTGGTTTGATTAGATCTGAGTTTATTAACAAAGATGAAGATCA
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TGATGATAGCAGCTCTAAAGGAATTCTTTTAAATAATATAAAGGTAATTTTATTCAGAAT
TCTTTAATACAAATTTTTAAAAATTATTTAGATAGACTCTAATTTAAAATTATTAATTGA
TTCAGAAAATTTTGTACACAATCTACCTTAGGATTCAAGTGCAAGATAATCTTTAGATAA
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ATATTTATTTTTTTTTATTAATTTTATAGAAATCCGACAAAAAAAAAGTTAAAGGACTAT
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CTTATTTTTACAAGATATTTAGATAAGAAGTGATTTATACGAGCTAGAGCTCTGTAGTGG
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AACTGTAATAGAAGAAAACGATGAAGAATATCAGTAAGATAATGATGATTTGAACTCCCA
TAAAAAATTAGTTGATGAACTAGTTATGAATTAAAATGAACAAGAATTAATTAATGATAT
TCAAATGATTTTAACTCAAACAGCTAAGAAAGGAAAAACTGCCATGAAAATGAGTTAAAA
GAGCATATTAAACGAATCTCAAGACAGTGCATTTCATTAAGAAAACCAAATTATCTCAAC
AAATATGAGTCCTTTTTAAGATATATAATTTAACTCTTAAAATCAAAAAAGCGAATATTT
AAGTGAAAAATTAAGATAAAGTTAATTTCTTAATAGTACCAATAATTAAATGGAAGTTAT
TAATGAAGGGATACTCTGTAATGATAACCCATAAGATTATTATTAGTAATGTGATGATGA
TGTCCCTAATTATAGCTCAAATTAATATAAATTATTGACAGATGATTTACCCAGCAAAGA
ATCATCAAATGGATTTACTAATTCATTTACTAACACAATAGGTGATTTTGAGTAACCAGA
GGACAGATTATTTTCTTTATAAAATATGGCTATTAGAATGACTTAAATTGGAAGTGGATT
ATTCTTTAATCAAATTGAGTAAATTAAATTAATTTCTTTATTTTGTTTGATAAAATTAAT
TAATTTTGATATTTATTATAGAAAAGATAAAACTTAATGGATGAATCCTATTGACTGGAA
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GATACAGAAATCACACATTTACAATTATTGAGCATAGACTACCATTACAAACCATAATGG
TAAAGAAAACGATTTAAATGAATATTTATATTTTTTTGTATAAAGGCTTTTCAAGACAAG
TTATTTTGACTTGAAAGAAATTGAAGAATAAGAAAGACTTGCTTAATAAAGATTGTAAGA
AGAGGAAGAGTAATACAAAGGATTCAATGGTGACGATGAGTATGATATAATAAACTAAAT
TGATGAATATACATTATTAGGAGCAACTCCGTTTAGAAATACCTAAATGGAGGTTATGAA
TGACAATTACGATTGCACTAATACTTAAGCTAATAATAATTTATCTCAATAAAATGTAAA
TACATAGATTACAAGTTAATATGAGCACACTCAAAGTTATCCAGAAAGCAAAAATCAATA
AAGAAAAAGTAAGAAATTTTTTAAGATAAAAGCTTTTTTATATTTCCTTAAAAAAAATAA
ATAGAATAAAATGTTAGAAAAATGAAAATATAAGAACTTAAATAGAGAATTTGGATAAAT
TTATAGGACAAGATTTAAGACCAAGTTGAGGTAATCCAAACTTTTAATTTAAAATTTAGT
TTCTTATTTTAATAAATTAAAGATATCTTATACTGACTTGATTAATCAGCTTTAACTTCA
AAAGTAAGAATAGGCCTCTATCTAAAGTTGTCTTGTTGCTATACTACACTTGTGCAATGA
AAATAATCTGCAATTATATAATAATACCTAAGATAATTTTCTCATCAAAAGAAATACTAT
CTAAGAATAACAATTGCAAGAAATGTCTTAAGATTGA


>TTHERM_00728870(protein)
MNKSHKGGRLLKKKILQEVQEKDDYYDDEDLLTNEELKMMQANAKNAKNKIQIRVKSDSL
LNEYSYKQKMLGKTNNSFYQNRNGINTKKMNNQTTYKSDKLILDEEEDEEEENVLRELNV
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