Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00763040

Standard Name

MSH5 (Homolog of budding yeast MSH5)

Aliases

PreTt03295 | 126.m00093 | 3740.m00020

Description

MSH5 MutS domain V protein; Meiotic pro-crossover factor along with MSH4; MutS domain V family protein; DNA mismatch repair MutS family

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No. Gene Name(s) Paragraph Text
2304 MSH5 Msh5 (together with Msh4) is required for normal chiasma formation
2305 MSH5 The gene model is incorrect. Transcript is annotated as gene_000007168 in TFGD

Associated Literature

  1. Ref:28100637: Shodhan A, Kataoka K, Mochizuki K, Novatchkova M, Loidl J (2017) A Zip3-like protein plays a role in crossover formation in the SC-less meiosis of the protist Tetrahymena. Molecular biology of the cell 28(6):825-833
  2. Ref:25217051: Shodhan A, Lukaszewicz A, Novatchkova M, Loidl J (2014) Msh4 and Msh5 function in SC-independent chiasma formation during the streamlined meiosis of Tetrahymena. Genetics 198(3):983-93

Sequences 

>TTHERM_00763040(coding)
ATGTGTTAAATAAGTATATTTTAAGAATAGAATAGTTTAGGTGTTAGTTATTATGATCCT
AAATAAAACAGAATATTCTGTTACTAGATAAATATACTAAATGAGGAAGAACATATATAA
AACCTTTTTTTATAGTTTGATAATATATATGCTCTAATAATACCATTAAATTTTAATGAA
AACTTAGTTTAAAGTGTAATAGAAAAATATTTTTTAACACAAAACAGACATTTGAATATT
CAAAGAGTCTTAAATTGTGAATATAATTTTGAAAGTTGCATAAATAAAATCTTGTAATTA
AATTTTGATAAAGATTTAAATTAATCGCTTTAAAATAGCCAAGAAATGACAATCAGTAAA
AACTAACAATCAATATCATTACAATGTGATGAGAACTTCAAAAATCGAAACAATAAAAAA
TATCTAACTCTTTGCTAATAAATAGACATAGAGTAAAAAAACTTAATAAAATCATTAGGT
GGGTTATTATGCTTCCTGTTCAATAATTAGATTATTAATTTGAATTATTCGTTTTTTGAC
ATAGTATTTCTTAAAAACATAAATAATTAAATACATTACAATCAATACACTCTAAGTTAT
TTGAATATATTTAAAGAAGACATTCATCCATCAATGATTAAAGGTAAAGGTTAAGCTAAA
GAAGGTTTTTCTTTGTTTTTACTATTCTCAAAATTTGTATACACTAAATTAGGACTGATT
AAATTAAAGCACCTATTTTTAACTCCTTCATTTGATTTGAAAACTCTATAATTAAGAAAT
CAGTCAATAGATTTTTTTTATTCTTAATCTGGAGAAAGCATTAAGAAAATTAAACTCAAC
CTCTAAAAGTGTTCAAATATTAAAAAAGTTCTAAGTAAATTGAAATAAGTACAAATGAAT
TTTAATGATTGGTATAGCTTTAAAATTACGCTGCAAAGCACATTAAACATAATGTAATTA
TTTTTAATATAAAATGAAATACTTAAAAACCGAAAACTTTTAGTATTTCAGAATCTATCA
GATTATTTATTTTAAGAACTACAAAAATTGAATTCTTTTTTAGAAAAATATCTATTGTTC
TCACCAAAAGATGGTGAAATTATGATAAGAGAAGGTATAGTATAAGAATTAGATGATCTT
TTAAAAATATATGATAATTTAGATGAAATTTTAAGTTATTATAATAGTTAAGAAATAATT
AAACTGACTAATAATAATTCGAATTTCAACTCTTAGATGATGATTTAATATTTTCCATAA
CTAGGATTTTTCATAACTATACAAAACTCTAATTAATTCAATAATCAAGTATAGGTCGAT
GATAAGGTTAACTTCTCTTAAAATAAAAGCTATCAGGATCAGTAAAACAATTATTCATTA
GAATAAGATTGCTGTGAAAATTCAAAAGAACAAAAACAGAATGCTTTGAAAAGTGATAAA
AGTTTTTATCAGGATGGGAAATAATTAGATGACGATGAAGTTGAGGAAAAATAAAATTAA
AGCTAGTAAAATTTAAAAAGAACCAGGAGCAGTAATAGTCTTTCTTCTAAAAATTAAGGA
ATAGAAAATTCCTAGAATTTATAATAATAATACTGTTTAACTAATGACTACTCTTACTGT
TTCACACTATAAGATGCTCTTTTATTTAAAAACGATTTATGTAACTAACTAGATTTAAAA
TATGGAGATATTCAAAGCAGAATAATTGATATATAAAGAGATATAGTAAGAGAAATAGAA
CAATAAATTTTGTTATACAGTGAAGAAATAAATGCAGCTTAAGAATTTATAAGCGATCTA
GATCTTTTTTTTTGTTTGTATCAAGCTGCTGAAGTATATAATTTAAGAAAACCTAAACTT
ACAAATGATTCTTCATTAGTTTTTTAAGAAATGAGGAATATATTAACAGAAATAACAATA
GGTGAAAAATAATTTATTTCTAACAGTTTTTGTGTTCACAATTTTGCTCAATATATGAAG
AACTAAAAAATATAAACTAATAATTTTTTAGATTCCTAGTTTAGTAATAGATTTACATTT
ATAACAGGTCCTAATTATGCAGGCAAAAGTGTTTTCTTAAAAAGTATCGGAATGATTACC
TATCTTGCTCATATTGGTAGCTTTATTCCTTGCAGATTTGCCAGAATAGGAATGATAGAT
AATATTTTTGTAAATACTTGCTAACATGATTCAGTTCTAAAATTCAATGGAGAGTCAGCA
TAGCAACTTTAATTCATAAACTACATTTTAAACTAAGCTACTAATAGAACTTTAATACTC
ATAGATGAATTCGGAAAAAATTTCAGGCTTAACGATAGTTTAAATTTAAATTACTCCCTA
GTTAAGTGCTTGACAGAAGATACATTCTAAGGTTTAAATGAAAAAATAACTTAAAAATAA
CATCCTTCTTTGTAATAAGAAGATAATGATTAAAACATTTTTTATTAATATTAAACTGAT
AATTCTTAAGTGGAAAATATTGATGAAATAAAATAGTAAAATTTGAGAGGTTTGAATGAG
TTTCAGTTTATACATTAAGACATTTAAAATGTTAATTTAATGGAACAATACAATAAAATT
CCTATCACTCTGATGGCAAGCCACTTAAGTTAGCTTGTTAATTTGTGTGGACTGAGAGAA
AACTATATAATTAGATTTGCATAAATGGAAGTATTAATATAATAAGGAAAAAATGTTTGC
AAACTTAATGAATTAAAGGAGAATATTAATGCTATGCAGAAGATTGTTCATGTATATAAA
CTAAATAAAGGTTTATCCTTAAAAAGTTGCTCCTCATTAGTTGCTAAGAATATTTTCAGA
GATAATGAATATCTTATTCATAGAATTAATGAAATAAATTAATTTATTTTAGAAGGAAAA
TTTTAAGTCTCGCCATAATAAAATGTTGAATAAATTCATCTTGAAAAGGTTTAAAAAGTT
ATAAATATTTTAAATTCTTTGAAAGAGTAATAAATTTAATGA



>TTHERM_00763040(gene)
TTTAATTTAAAATCCACACTATTTTTTAGTAAATAAAAAGAAAGAATAATTTCACTAAAA
ATTAGTAAGTATTTTTAACTTCTAATTACTAACTTTGTAGATATGAGAAAGAAATAATAT
TTATTTGAAAAATATCAAACTTTTTGTACAATATGTGTTAAATAAGTATATTTTAAGAAT
AGAATAGTTTAGGTGTTAGTTATTATGATCCTAAATAAAACAGAATATTCTGTTACTAGA
TAAATATACTAAATGAGGAAGAACATATATAAAACCTTTTTTTATAGTTTGATAATATAT
ATGCTCTAATAATACCATTAAATTTTAATGAAAACTTAGTTTAAAGTGTAATAGAAAAAT
ATTTTTTAACACAAAACAGACATTTGAATATTCAAAGAGTCTTAAATTGTGAATATAATT
TTGAAAGTTGCATAAATAAAATCTTGTAATTAAATTTTGATAAAGATTTAAATTAATCGC
TTTAAAATAGCCAAGAAATGACAATCAGTAAAAACTAACAATCAATATCATTACAATGTG
ATGAGAACTTCAAAAATCGAAACAATAAAAAATATCTAACTCTTTGCTAATAAATAGACA
TAGAGTAAAAAAACTTAATAAAATCATTAGGTGGGTTATTATGCTTCCTGTTCAATAATT
AGATTATTAATTTGAATTATTCGTTTTTTGACATAGTATTTCTTAAAAACATAAATAATT
AAATACATTACAATCAATACACTCTAAGTTATTTGAATATATTTAAAGAAGACATTCATC
CATCAATGATTAAAGGTAAAGGTTAAGCTAAAGAAGGTTTTTCTTTGTTTTTACTATTCT
CAAAATTTGTATACACTAAATTAGGACTGATTAAATTAAAGCACCTATTTTTAACTCCTT
CATTTGATTTGAAAACTCTATAATTAAGAAATCAGTCAATAGATTTTTTTTATTCTTAAT
CTGGAGAAAGCATTAAGAAAATTAAACTCAACCTCTAAAAGTGTTCAAATATTAAAAAAG
TTCTAAGTAAATTGAAATAAGTACAAATGAATTTTAATGATTGGTATAGCTTTAAAATTA
CGCTGCAAAGCACATTAAACATAATGTAATTATTTTTAATATAAAATGAAATACTTAAAA
ACCGAAAACTTTTAGTATTTCAGAATCTATCAGATTATTTATTTTAAGAACTACAAAAAT
TGAATTCTTTTTTAGAAAAATATCTATTGTTCTCACCAAAAGATGGTGAAATTATGATAA
GAGAAGGTATAGTATAAGAATTAGATGATCTTTTAAAAATATATGATAATTTAGATGAAA
TTTTAAGTTATTATAATAGTTAAGAAATAATTAAACTGACTAATAATAATTCGAATTTCA
ACTCTTAGATGATGATTTAATATTTTCCATAACTAGGATTTTTCATAACTATACAAAACT
CTAATTAATTCAATAATCAAGTATAGGTCGATGATAAGGTTAACTTCTCTTAAAATAAAA
GCTATCAGGATCAGTAAAACAATTATTCATTAGAATAAGATTGCTGTGAAAATTCAAAAG
AACAAAAACAGAATGCTTTGAAAAGTGATAAAAGTTTTTATCAGGATGGGAAATAATTAG
ATGACGATGAAGTTGAGGAAAAATAAAATTAAAGCTAGTAAAATTTAAAAAGAACCAGGA
GCAGTAATAGTCTTTCTTCTAAAAATTAAGGAATAGAAAATTCCTAGAATTTATAATAAT
AATACTGTTTAACTAATGACTACTCTTACTGTTTCACACTATAAGATGCTCTTTTATTTA
AAAACGATTTATGTAACTAACTAGATTTAAAATATGGAGATATTCAAAGCAGAATAATTG
ATATATAAAGAGATATAGTAAGAGAAATAGAACAATAAATTTTGTTATACAGTGAAGAAA
TAAATGCAGCTTAAGAATTTATAAGCGATCTAGATCTTTTTTTTTGTTTGTATCAAGCTG
CTGAAGTATATAATTTAAGAAAACCTAAACTTACAAATGATTCTTCATTAGTTTTTTAAG
AAATGAGGAATATATTAACAGAAATAACAATAGGTGAAAAATAATTTATTTCTAACAGTT
TTTGTGTTCACAATTTTGCTCAATATATGAAGAACTAAAAAATATAAACTAATAATTTTT
TAGATTCCTAGTTTAGTAATAGATTTACATTTATAACAGGTCCTAATTATGCAGGCAAAA
GTGTTTTCTTAAAAAGTATCGGAATGATTACCTATCTTGCTCATATTGGTAGCTTTATTC
CTTGCAGATTTGCCAGAATAGGAATGATAGATAATATTTTTGTAAATACTTGCTAACATG
ATTCAGTTCTAAAATTCAATGGAGAGTCAGCATAGCAACTTTAATTCATAAACTACATTT
TAAACTAAGCTACTAATAGAACTTTAATACTCATAGATGAATTCGGAAAAAATTTCAGGC
TTAACGATAGTTTAAATTTAAATTACTCCCTAGTTAAGTGCTTGACAGAAGATACATTCT
AAGGTTTAAATGAAAAAATAACTTAAAAATAACATCCTTCTTTGTAATAAGAAGATAATG
ATTAAAACATTTTTTATTAATATTAAACTGATAATTCTTAAGTGGAAAATATTGATGAAA
TAAAATAGTAAAATTTGAGAGGTTTGAATGAGTTTCAGTTTATACATTAAGACATTTAAA
ATGTTAATTTAATGGAACAATACAATAAAATTCCTATCACTCTGATGGCAAGCCACTTAA
GTTAGCTTGTTAATTTGTGTGGACTGAGAGAAAACTATATAATTAGATTTGCATAAATGG
AAGTATTAATATAATAAGGAAAAAATGTTTGCAAACTTAATGAATTAAAGGAGAATATTA
ATGCTATGCAGAAGATTGTTCATGTATATAAACTAAATAAAGGTTTATCCTTAAAAAGTT
GCTCCTCATTAGTTGCTAAGAATATTTTCAGAGATAATGAATATCTTATTCATAGAATTA
ATGAAATAAATTAATTTATTTTAGAAGGAAAATTTTAAGTCTCGCCATAATAAAATGTTG
AATAAATTCATCTTGAAAAGGTTTAAAAAGTTATAAATATTTTAAATTCTTTGAAAGAGT
AATAAATTTAATGAATTTATAAATTATTTTTTTGTTGAATATCCTTTTTTGTAATTGTTT
TATTATTTCATTTTTTAACACTATTATAAATATTATTTAATTAATTAAATAATATTAAAT
TTGTAGCTATA



>TTHERM_00763040(protein)
MCQISIFQEQNSLGVSYYDPKQNRIFCYQINILNEEEHIQNLFLQFDNIYALIIPLNFNE
NLVQSVIEKYFLTQNRHLNIQRVLNCEYNFESCINKILQLNFDKDLNQSLQNSQEMTISK
NQQSISLQCDENFKNRNNKKYLTLCQQIDIEQKNLIKSLGGLLCFLFNNQIINLNYSFFD
IVFLKNINNQIHYNQYTLSYLNIFKEDIHPSMIKGKGQAKEGFSLFLLFSKFVYTKLGLI
KLKHLFLTPSFDLKTLQLRNQSIDFFYSQSGESIKKIKLNLQKCSNIKKVLSKLKQVQMN
FNDWYSFKITLQSTLNIMQLFLIQNEILKNRKLLVFQNLSDYLFQELQKLNSFLEKYLLF
SPKDGEIMIREGIVQELDDLLKIYDNLDEILSYYNSQEIIKLTNNNSNFNSQMMIQYFPQ
LGFFITIQNSNQFNNQVQVDDKVNFSQNKSYQDQQNNYSLEQDCCENSKEQKQNALKSDK
SFYQDGKQLDDDEVEEKQNQSQQNLKRTRSSNSLSSKNQGIENSQNLQQQYCLTNDYSYC
FTLQDALLFKNDLCNQLDLKYGDIQSRIIDIQRDIVREIEQQILLYSEEINAAQEFISDL
DLFFCLYQAAEVYNLRKPKLTNDSSLVFQEMRNILTEITIGEKQFISNSFCVHNFAQYMK
NQKIQTNNFLDSQFSNRFTFITGPNYAGKSVFLKSIGMITYLAHIGSFIPCRFARIGMID
NIFVNTCQHDSVLKFNGESAQQLQFINYILNQATNRTLILIDEFGKNFRLNDSLNLNYSL
VKCLTEDTFQGLNEKITQKQHPSLQQEDNDQNIFYQYQTDNSQVENIDEIKQQNLRGLNE
FQFIHQDIQNVNLMEQYNKIPITLMASHLSQLVNLCGLRENYIIRFAQMEVLIQQGKNVC
KLNELKENINAMQKIVHVYKLNKGLSLKSCSSLVAKNIFRDNEYLIHRINEINQFILEGK
FQVSPQQNVEQIHLEKVQKVINILNSLKEQQIQ