Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00782040

Standard Name

RSP1 (RNA Silencing Protein 1)

Aliases

PreTt25506 | 131.m00079 | 3813.m01581

Description

RSP1 RNA silencing protein; Rdn1 associated protein; RNA silencing complex component; involved in 23-24 nucleotide RNA metabolism

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

Gene Ontology Annotations

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source Identifier Score
Tetrahymena borealis EI9_11405.1 2.0001701965494945e-132
Description: hypothetical protein (791 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:22706992: Talsky KB, Collins K (2012) Strand-asymmetric endogenous Tetrahymena small RNA production requires a previously uncharacterized uridylyltransferase protein partner. RNA (New York, N.Y.) 18(8):1553-62
  2. Ref:19451546: Lee SR, Talsky KB, Collins K (2009) A single RNA-dependent RNA polymerase assembles with mutually exclusive nucleotidyl transferase subunits to direct different pathways of small RNA biogenesis. RNA (New York, N.Y.) 15(7):1363-74

Sequences 

>TTHERM_00782040(coding)
ATGGATTTGAATTTTTCTGATGATGATGATGAATAGGAAATTTAGCAATAGCAAGAACCT
CAATAGATTGAGGAACTAAATAAACAAGAGGATAATTCTTAATTAGACTAAACAATTTCT
GTCATTAACACAAAAAATTATAAGATTAAAACTTAAACACCATTTTCTGCAGATGAAGTG
TATTCATAAATATATGCCTATCTTGAGAGTAAATAATCTAAATTAGTTTGCATTGAAGTG
AAGATGGAAGTGAATAAAACTGACAAACTTGAAAAATCTAATGATGAAAGCATTTAAATA
ATCAAAGGATCAATAAGCTATGAGTTTTTTAAATTTAGAGAGATAAATGATAAACTAAAA
TTCCCTCCTCCATTAGATATTTACTAAAATAATATAATATTGGAAAACTAAGATGAAGAA
TTCGATTTTAAATTAAATCCCAAATAATATTCTAGATTCCCTTTTATAAATCCATCGAAT
GATATTTTTGAAAAATCTCAAACTTTTGATGTAACAATTTAAGGAGAAGTATTAGGATTT
GAAAAAGTTAAATTGAACGAAGTTTAAGGCTTCGAATTAGAAAAAAAAGATGGCGAAGAT
AAAATAAGCTAAACATTTATTCAATCTTTTGAGACTGCTTAAGCCATTAGTTTAGGATCA
TATGCAAGGGATTAACATAATTATTATTTTGAAAGTCTTTATAATCTTGGAGAGAAGGAG
TGTACATTTATACATCTTGAATAATGCTATGAGTATCATATGTTTACAATTTTCTTAAAC
TTTAGATCGGTTGGCTAAGTAAAAATAGTTTTAGATAAACCTATAATCTAAGTAGAGGGA
TAATATAAGTATCTCATAGCTACCTCTACACCCAAATTCTTTGCAAGCACTTAAACATAT
CACTTAATAAATTTGGTAGAAGATAAGAAGCAATGGTATCCTATACATAATATTTTGCTA
ACTTTACCTAATATTTCAACCTATATGAAAATCTACTCAGCTGAAAATTTTGCTATTAAA
TTAAGTTTAAAAGAAAAAGAAATTAAATAAACAAACAAAGACTAACCTTTTACATAAAAT
ATTTTATAGTTTACTATTGATCTATCATTCTAAATTTAATACATGTTGTTAGTTCTTCTC
TCAAACAAAAAGATAAGCTTGTTTGAGTTTCCTAAATTGCAGTAATGTCTTAAATAAATG
TGTTAAGGAAAGGCGTTTTTTTTCTTGAATAATTTGATGAACAGATAAGAGCACTAGAAA
ATAACTGATTTCTTAAATATTGACGAAAATTAAGTTTTACCAGGTCCAGAATACCAAATA
GTGTACAGAGTCGTTGTTAGTCCTTCTAAATTTAATTTTCTCCTTCCAAGCTCTGAGTAT
AATTCTTATTTAATAAAAGAATTAGAAACTGGAGTAAATGAAACCTAAAATATTGTTAGA
ATTATTTTTGAAGGTAATGAATCTGATTTTATATAGAGTATATATTATAGAGAAATATTA
ATGTCATTTAATATGCTTTCCAAAACTTTTTGTTATTTTGGAAAATAAAATAATGACGCC
TTATTGATTGAGGTAAAAACAATCCCTCAGAACATGCCTAATTTAAAAAAGAAAGATATA
ATGCAACATTATAATAATGAATTATGTCTCAAACTATAAAATGTTGGTGATTACTCTTCA
ATTAAAAATGTATACGAATAACAAATGACGATAAATTAAGCTCTTTGGAAATCTCTTTTT
ATTTTTGACGATAAAGATAAAATCTATAGCATGGAAAATCCTTTTTAATTTGGTTTAATA
AATGATCTTATATATATTAAAATTCTAGAGTAAATTAAACAAGAATTAAATGTTAAAATT
GAAAATATAAATTGCCTTCTGATATAATTAAATGGCTGCACTTCTTTATTCTTTCCTATG
GGCTTAGTTAAAGAGGACATAGTTTAATAATATAAAAAAAATTCCTTTATATTGCCTAGC
GTACATTGCAACCATCAAAGCAACAAGAAAAATAAATTATATTTGATTGATTACAACTAA
TTAGAAAAGGGATGGATTAGTTTAGAAATTTCAAAAAAGATATCTAATTAATTTGAAGTA
GAACATAAATAGTTTTTCAATGATTAAGATTAAATATACGAAACTATCAACTAACTGTTA
CCTTTAGACAATATATTAACTTAATGCTCTTAGAAAGTGTTTAGGAAAAATTTCAATTAA
CTTTTATCAAATAAGTATGATTTATCATAAGAATATTTTTTCATGATATTAAAAGACATC
TTAGCGAATAAAAAAAAAATGCTTTCTCTTGATAACTAAAGAATCTATCCCTAGAACTGT
TTTAGATTATATTCATTTATTGATTAATAATAAGAGCTAAAAGAAGATGAAATTTTTGTT
TAAATATAGTAAAATAATAAATTTTAAATTATTGAAGGTCCAGTTCTTCTAGTTAATGAG
ACTGATTAACAGATAATTATCAAAAAAGTGACTGCAAAATCTGATTTATTCAGTTTGGAT
AGTTATAAAAAATTTAAAAACATTGTGGCGGTGAGCTAATAAAATCTTAATTTATTCAAT
CATAAGCAAAAAATAACTTTGATTTATGGAGAAACAATAAATTAGTTAAAGTTGAATTAG
TAATTAATTTAAAAAGACAAAAAAAATGTAAAAGAATAAGAGGGTATAAATGTAAAAAAG
TCAGCTAAGATATTTTTGGAATCAAAGACAAATAGCAAAGAATCTAAAGAATTTGACTTA
GTAAGACCAAACATTATGAATTAATTCTCTCAGAATTAGTTATTTTTAAAAGCTTTTGAA
GAAGATATTAAAATTGATGAGCATGAAATTATTGAAGCAAAATAAGAAACATTTAAATAG
GCTTTAGCTAATATCGAAAAATATTCTGGAATTTTTAGCCAGTTTAACTAAAAATATGGC
TTGAGTTCAAATTTTAAAATCTATGAATTGCTTTTTGAAGGTAGAAATAATACAGATATA
TAAATTCTATAAGAATTTGAAGATATTTTAGTTAAATTTGCTGATGAAGCTTTTCAGGAA
TCAATTGATCAAGAAATTAATGATAAAAAACTGTTTTATTTAAATTTTAACAAAAAACTA
ATTAAATCTGATGATGATGAAGATTTTCAAGATACCATGTAATGCTTAAAACTTACTTCA
GGCATTTATTATTTATGCTTAATTGCTTGCTTGGCCTATGCTTAAAATAAAAATTTTAAC
GAAATAGCTCAATTAATTTAAGAATAATTCAAATTTGATATTAAAAATTACAATTAATAA
ATTCAAAAAATCTAAGTCAACGATGGTCTCCTGGGATTCTTCTGGATTCTATGTGTTAAA
TAATTCATTTGA


>TTHERM_00782040(gene)
ATGGATTTGAATTTTTCTGATGATGATGATGAATAGGAAATTTAGCAATAGCAAGAACCT
CAATAGATTGAGGAACTAAATAAACAAGAGGATAATTCTTAATTAGACTAAACAATTTCT
GTCATTAACACAAAAAATTATAAGATTAAAACTTAAACACCATTTTCTGCAGATGAAGTG
TATTCATAAATATATGCCTATCTTGAGAGTAAATAATCTAAATTAGTTTGCATTGAAGTG
AAGATGGAAGTGAATAAAACTGACAAACTTGAAAAATCTAATGATGAAAGCATTTAAATA
ATCAAAGGATCAATAAGCTATGAGTTTTTTAAATTTAGAGAGATAAATGATAAACTAAAA
TTCCCTCCTCCATTAGATATTTACTAAAATAATATAATATGTAATAAAGAATAAATTTAT
TGCATATTTACTAGAATATTAACTTGTATCTTGTATAAATAAAAATAGTGGAAAACTAAG
ATGAAGAATTCGATTTTAAATTAAATCCCAAATAATATTCTAGGTAATTAATAGATTATT
TCTTTTTACTCACTTTCATTATTAAAACAAAATTAGATTCCCTTTTATAAATCCATCGAA
TGATATTTTTGAAAAATCTCAAACTTTTGATGTAACAATTTAAGGAGAAGTATTAGGATT
TGAAAAAGTTAAATTGAACGAAGTTTAAGGCTTCGAATTAGAAAAAAAAGATGGCGAAGA
TGTAAAAATATATTTTTCTAAGCTTCATTTTAACTTAATTTTATTTTTATAGAAAATAAG
CTAAACATTTATTCAATCTTTTGAGACTGCTTAAGCCATTAGTTTAGGATCATATGCAAG
GGATTAACATAATTATTATTTTGAAAGTCTTTATAATCTTGTAATTTATTTTTAAAGACT
TCTAAATAAATTTTATTGTGAATAATTTAAATTAATTTAAAAAAGGGAGAGAAGGAGTGT
ACATTTATACATCTTGAATAATGCTATGAGGTAAAATAATTATTATTTTAGGAACATTAA
CTTTTTCTAATTAACAACAAACAGATAAAAATTTATGTCATTTCTGTTTTTTTATTTAGA
ATTATAAAAATAAATAATAAAATTTAATAATATCACTCAGTTTAATATAATGATTTTAGA
TTAAAATCTTAAGTAATAAAGATAAAATTACAATTTTCATGCAAAATCAATATTTTGATC
TTAAATTATTTTATAACTGCTTGGTTTAGCTCATATAGAAAAAACATAAAATAAAAAATT
TACATAATTAAAAACTAAGAATGGTTAATTTAAAATTTTTTTAAAGCTGAAATAAAGTGT
TGAGAATTATAGAAATTATTTTCTATTTAATTTAATAAAATTATCAATATTTACTTTTGT
TTTAAATAATTAGTATCATATGTTTACAATTTTCTTAAACTTTAGATCGGTTGGCTAAGT
AAAAATAGTTTTAGATAAACCTATAATCTAAGTAGAGGGATAATATAAGTATCTCATAGC
TACCTCTACACCCAAATTCTTTGCAAGCACTTAAACATATCACTTAATAAATTTGGTAGA
AGATAAGAAGCAATGGTATCCTATACATAATATTTTGCTAACTTTACCTAATATTTCAAC
CTATATGAAAATCTACTCAGCTGAAAATTTTGCTATTAAATTAAGTTTAAAAGAAAAAGA
AATTAAATAAACAAACAAAGACTAACCTTTTACATAAAATATTTTATAGTTTACTATTGA
TCTATCATTCTAAATTTAATACATGTTGTTAGTTCTTCTCTCAAACAAAAAGGTAAATTT
GATTTAAAAATAATTATGAATGTTTAAATATTTAATTATATTGAATAGATAAGCTTGTTT
GAGTTTCCTAAATTGCAGTAATGTCTTAAATAAATGTGTTAAGGAAAGGCGTTTTTTTTC
TTGAATAATTTGATGAACAGATAAGAGCACTAGAAAATAACTGATTTCTTAAATATTGTA
ATAATTCTTATTTAAAAATTATATTAAACTTTTTTAACTTTATTAAAGGACGAAAATTAA
GTTTTACCAGGTCCAGAATACCAAATAGTGTACAGAGTCGTTGTTAGTCCTTCTAAATTT
AATTTTCTCCTTCCAAGCTCTGAGTATAATTCTTATTTAATAAAAGAATTAGAAACTGGA
GTAAATGAAACCTAAAATATTGTTAGAATTATTTTTGAAGGTAATGAATCTGATTTTATA
TAGAGTATATATTATAGAGAAATATTAATGTCATTTAATATGCTTTCCAAAACTTTTTGT
TATTTTGGAAAATAAAATAATGACGCCTTATTGATTGAGGTAAAAACAATCCCTCAGAAC
ATGCCTAATTTAAAAAAGAAAGATATAATGCAACATTATAATAATGAATTATGTCTCAAA
CTATAAAATGTTGGTGATTACTCTTCAATTAAAAATGTATACGAATAACAAATGACGATA
AATTAAGCTCTTTGGAAATCTCTTTTTATTTTTGACGATAAAGATAAAATCTATAGCATG
GAAAATCCTTTTTAATTTGGTTTAATAAATGATCTTATATATATTAAAATTCTAGAGGTA
ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTCATTCATTATTTTTGCA
TTAAAGTTTTATTCTTAATTATAATTGAATTTTTTATTAGTTATTTTGATTTAATTATTT
ACTTTAATTAAATTAAGCTATCATATTTTTAAAGAACCTTTCTTTTTGAATTATTTATGT
TTTTTTAATAATGATTGATTTTTATTTTTATTTAAATGATAAATAAATTTATTTAGTTGA
ATTTAAAGGTTTATTTATTATTATAAAAAGTAAATTAAACAAGAATTAAATGTTAAAATT
GAAAATATAAATTGCCTTCTGATATAATTAAATGGCTGCACTTCTTTATTCTTTCCTATG
GGCTTAGTTAAAGAGGACATAGTTTAATAATATAAAAAAAATTCCTTTATATTGCCTAGC
GTACATTGCAACCATCAAAGCAACAAGAAAAATAAATTATATTTGATTGATTACAACTAA
TTAGAAAAGGGATGGATTAGTTTAGAAATTTCAAAAAAGATATCTAATTAATTTGAAGTA
GAACATAAATAGTTTTTCAATGATTAAGATTAAATATACGAAACTATCAACTAACTGTTA
CCTTTAGACAATATATTAACTTAATGCTCTTAGAAAGTGTTTAGGAAAAATTTCAATTAA
CTTTTATCAAATAAGTATGATTTATCATAAGAATATTTTTTCATGATATTAAAAGACATC
TTAGCGAATAAAGTAAATTAATTTTTTTCAAGGTAGTAAAAATTAATATAATTAATATTT
ATTTAAATCATATTTAGAAAAAAATGCTTTCTCTTGATAACTAAAGAATCTATCCCTAGA
ACTGTTTTAGATTATATTCATTTATTGATTAATAATAAGAGCTAAAAGAAGATGAAATTT
TTGTTTAAATATAGTAAAATAATAAATTTTAAATTATTGAAGGTCCAGTTCTTCTAGTTA
ATGAGACTGATTAACAGATAATTATCAAAAAAGTGACTGCAAAATCTGATTTATTCAGTT
TGGATAGTGTAATTAATTTGTAAAAATGATAATAAATATAATATTTCTTTTTATAAAAAG
TATAAAAAATTTAAAAACATTGTGGCGGTGAGCTAATAAAATCTTAATTTATTCAATCGT
AAAAATTAGACAAATGTTATTAAATTGTTTAAAAATTAATTTATAAAAAATAGATAAGCA
AAAAATAACTTTGATTTATGGAGAAACAATAAATTAGTTAAAGTTGAATTAGTAATTAAT
TTAAAAAGACAAAAAAAATGTAAAAGAATAAGAGGGTATAAATGTAAAAAAGTCAGCTAA
GATATTTTTGGAATCAAAGACAAATAGCAAAGGTTTTTTTTTATTTTTAAATTAATTATT
TCAAATAACTTAATAATAATTTAGAATCTAAAGAATTTGACTTAGTAAGACCAAACATTA
TGAATTAATTCTCTCAGAATTAGTTATTTTTAAAAGCTTTTGAAGAAGATATTAAAATTG
ATGAGCATGAAATTATTGAAGCAAAATAAGAAACATTTAAATAGGTAATCACATAATATA
ATTTAATATTAAATTTCATCAATTTTATACTTATAAAAGGCTTTAGCTAATATCGAAAAA
TATTCTGGAATTTTTAGCCAGTTTAACTAAAAATATGGCTTGAGTTCAAATTTTAAAATC
TATGAATTGCTTTTTGAAGGTAGAAATAATACAGATATATAAATTCTATAAGAATTTGAA
GATATTTTAGTTAAATTTGCTGATGAAGCTTTTCAGGAATCAATTGATCAAGAAATTAAT
GATAAAAAACTGTTTTATTTAAATTTTAACAAAAAACTAATTAAATCTGATGATGATGAA
GATGTAAATTTTTTTATTTTCAATTTTATTTTAAAATTTATTTTTAAAAGTTTCAAGATA
CCATGTAATGCTTAAAACTTACTTCAGGCATTTATTATTTATGCTTAATTGCTTGCTTGG
CCTATGCTTAAAATAAAAATTTTAACGAAATAGCTCAATTAATTTAAGAATAATTCAAAT
TTGATATTAAAAATTACAATTAATAAATTCAAAAAATCTAAGTCAACGATGGTCTCCTGG
GATTCTTCTGGATTCTATGTGTTAAATAATTCATTTGA


>TTHERM_00782040(protein)
MDLNFSDDDDEQEIQQQQEPQQIEELNKQEDNSQLDQTISVINTKNYKIKTQTPFSADEV
YSQIYAYLESKQSKLVCIEVKMEVNKTDKLEKSNDESIQIIKGSISYEFFKFREINDKLK
FPPPLDIYQNNIILENQDEEFDFKLNPKQYSRFPFINPSNDIFEKSQTFDVTIQGEVLGF
EKVKLNEVQGFELEKKDGEDKISQTFIQSFETAQAISLGSYARDQHNYYFESLYNLGEKE
CTFIHLEQCYEYHMFTIFLNFRSVGQVKIVLDKPIIQVEGQYKYLIATSTPKFFASTQTY
HLINLVEDKKQWYPIHNILLTLPNISTYMKIYSAENFAIKLSLKEKEIKQTNKDQPFTQN
ILQFTIDLSFQIQYMLLVLLSNKKISLFEFPKLQQCLKQMCQGKAFFFLNNLMNRQEHQK
ITDFLNIDENQVLPGPEYQIVYRVVVSPSKFNFLLPSSEYNSYLIKELETGVNETQNIVR
IIFEGNESDFIQSIYYREILMSFNMLSKTFCYFGKQNNDALLIEVKTIPQNMPNLKKKDI
MQHYNNELCLKLQNVGDYSSIKNVYEQQMTINQALWKSLFIFDDKDKIYSMENPFQFGLI
NDLIYIKILEQIKQELNVKIENINCLLIQLNGCTSLFFPMGLVKEDIVQQYKKNSFILPS
VHCNHQSNKKNKLYLIDYNQLEKGWISLEISKKISNQFEVEHKQFFNDQDQIYETINQLL
PLDNILTQCSQKVFRKNFNQLLSNKYDLSQEYFFMILKDILANKKKMLSLDNQRIYPQNC
FRLYSFIDQQQELKEDEIFVQIQQNNKFQIIEGPVLLVNETDQQIIIKKVTAKSDLFSLD
SYKKFKNIVAVSQQNLNLFNHKQKITLIYGETINQLKLNQQLIQKDKKNVKEQEGINVKK
SAKIFLESKTNSKESKEFDLVRPNIMNQFSQNQLFLKAFEEDIKIDEHEIIEAKQETFKQ
ALANIEKYSGIFSQFNQKYGLSSNFKIYELLFEGRNNTDIQILQEFEDILVKFADEAFQE
SIDQEINDKKLFYLNFNKKLIKSDDDEDFQDTMQCLKLTSGIYYLCLIACLAYAQNKNFN
EIAQLIQEQFKFDIKNYNQQIQKIQVNDGLLGFFWILCVKQFI