Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00782040

Standard Name

RSP1 (RNA Silencing Protein 1)

Aliases

PreTt25506 | 131.m00079 | 3813.m01581

Description

RSP1 RNA silencing protein; Rdn1 associated protein; RNA silencing complex component; involved in 23-24 nucleotide RNA metabolism; hypothetical protein

Genome Browser (Macronucleus)

Full Screen View


Genome Browser (Micronucleus)

Full Screen View

External Links

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

No Data fetched for Homologs

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:22706992: Talsky KB, Collins K (2012) Strand-asymmetric endogenous Tetrahymena small RNA production requires a previously uncharacterized uridylyltransferase protein partner. RNA (New York, N.Y.) 18(8):1553-62
  2. Ref:19451546: Lee SR, Talsky KB, Collins K (2009) A single RNA-dependent RNA polymerase assembles with mutually exclusive nucleotidyl transferase subunits to direct different pathways of small RNA biogenesis. RNA (New York, N.Y.) 15(7):1363-74

Sequences 

>TTHERM_00782040(coding)
ATGGATTTGAATTTTTCTGATGATGATGATGAATAGGAAATTTAGCAATAGCAAGAACCT
CAATAGATTGAGGAACTAAATAAACAAGAGGATAATTCTTAATTAGACTAAACAATTTCT
GTCATTAACACAAAAAATTATAAGATTAAAACTTAAACACCATTTTCTGCAGATGAAGTG
TATTCATAAATATATGCCTATCTTGAGAGTAAATAATCTAAATTAGTTTGCATTGAAGTG
AAGATGGAAGTGAATAAAACTGACAAACTTGAAAAATCTAATGATGAAAGCATTTAAATA
ATCAAAGGATCAATAAGCTATGAGTTTTTTAAATTTAGAGAGATAAATGATAAACTAAAA
TTCCCTCCTCCATTAGATATTTACTAAAATAATATAATATTGGAAAACTAAGATGAAGAA
TTCGATTTTAAATTAAATCCCAAATAATATTCTAGATTCCCTTTTATAAATCCATCGAAT
GATATTTTTGAAAAATCTCAAACTTTTGATGTAACAATTTAAGGAGAAGTATTAGGATTT
GAAAAAGTTAAATTGAACGAAGTTTAAGGCTTCGAATTAGAAAAAAAAGATGGCGAAGAT
AAAATAAGCTAAACATTTATTCAATCTTTTGAGACTGCTTAAGCCATTAGTTTAGGATCA
TATGCAAGGGATTAACATAATTATTATTTTGAAAGTCTTTATAATCTTGGAGAGAAGGAG
TGTACATTTATACATCTTGAATAATGCTATGAGTATCATATGTTTACAATTTTCTTAAAC
TTTAGATCGGTTGGCTAAGTAAAAATAGTTTTAGATAAACCTATAATCTAAGTAGAGGGA
TAATATAAGTATCTCATAGCTACCTCTACACCCAAATTCTTTGCAAGCACTTAAACATAT
CACTTAATAAATTTGGTAGAAGATAAGAAGCAATGGTATCCTATACATAATATTTTGCTA
ACTTTACCTAATATTTCAACCTATATGAAAATCTACTCAGCTGAAAATTTTGCTATTAAA
TTAAGTTTAAAAGAAAAAGAAATTAAATAAACAAACAAAGACTAACCTTTTACATAAAAT
ATTTTATAGTTTACTATTGATCTATCATTCTAAATTTAATACATGTTGTTAGTTCTTCTC
TCAAACAAAAAGATAAGCTTGTTTGAGTTTCCTAAATTGCAGTAATGTCTTAAATAAATG
TGTTAAGGAAAGGCGTTTTTTTTCTTGAATAATTTGATGAACAGATAAGAGCACTAGAAA
ATAACTGATTTCTTAAATATTGACGAAAATTAAGTTTTACCAGGTCCAGAATACCAAATA
GTGTACAGAGTCGTTGTTAGTCCTTCTAAATTTAATTTTCTCCTTCCAAGCTCTGAGTAT
AATTCTTATTTAATAAAAGAATTAGAAACTGGAGTAAATGAAACCTAAAATATTGTTAGA
ATTATTTTTGAAGGTAATGAATCTGATTTTATATAGAGTATATATTATAGAGAAATATTA
ATGTCATTTAATATGCTTTCCAAAACTTTTTGTTATTTTGGAAAATAAAATAATGACGCC
TTATTGATTGAGGTAAAAACAATCCCTCAGAACATGCCTAATTTAAAAAAGAAAGATATA
ATGCAACATTATAATAATGAATTATGTCTCAAACTATAAAATGTTGGTGATTACTCTTCA
ATTAAAAATGTATACGAATAACAAATGACGATAAATTAAGCTCTTTGGAAATCTCTTTTT
ATTTTTGACGATAAAGATAAAATCTATAGCATGGAAAATCCTTTTTAATTTGGTTTAATA
AATGATCTTATATATATTAAAATTCTAGAGTAAATTAAACAAGAATTAAATGTTAAAATT
GAAAATATAAATTGCCTTCTGATATAATTAAATGGCTGCACTTCTTTATTCTTTCCTATG
GGCTTAGTTAAAGAGGACATAGTTTAATAATATAAAAAAAATTCCTTTATATTGCCTAGC
GTACATTGCAACCATCAAAGCAACAAGAAAAATAAATTATATTTGATTGATTACAACTAA
TTAGAAAAGGGATGGATTAGTTTAGAAATTTCAAAAAAGATATCTAATTAATTTGAAGTA
GAACATAAATAGTTTTTCAATGATTAAGATTAAATATACGAAACTATCAACTAACTGTTA
CCTTTAGACAATATATTAACTTAATGCTCTTAGAAAGTGTTTAGGAAAAATTTCAATTAA
CTTTTATCAAATAAGTATGATTTATCATAAGAATATTTTTTCATGATATTAAAAGACATC
TTAGCGAATAAAAAAAAAATGCTTTCTCTTGATAACTAAAGAATCTATCCCTAGAACTGT
TTTAGATTATATTCATTTATTGATTAATAATAAGAGCTAAAAGAAGATGAAATTTTTGTT
TAAATATAGTAAAATAATAAATTTTAAATTATTGAAGGTCCAGTTCTTCTAGTTAATGAG
ACTGATTAACAGATAATTATCAAAAAAGTGACTGCAAAATCTGATTTATTCAGTTTGGAT
AGTTATAAAAAATTTAAAAACATTGTGGCGGTGAGCTAATAAAATCTTAATTTATTCAAT
CATAAGCAAAAAATAACTTTGATTTATGGAGAAACAATAAATTAGTTAAAGTTGAATTAG
TAATTAATTTAAAAAGACAAAAAAAATGTAAAAGAATAAGAGGGTATAAATGTAAAAAAG
TCAGCTAAGATATTTTTGGAATCAAAGACAAATAGCAAAGAATCTAAAGAATTTGACTTA
GTAAGACCAAACATTATGAATTAATTCTCTCAGAATTAGTTATTTTTAAAAGCTTTTGAA
GAAGATATTAAAATTGATGAGCATGAAATTATTGAAGCAAAATAAGAAACATTTAAATAG
GCTTTAGCTAATATCGAAAAATATTCTGGAATTTTTAGCCAGTTTAACTAAAAATATGGC
TTGAGTTCAAATTTTAAAATCTATGAATTGCTTTTTGAAGGTAGAAATAATACAGATATA
TAAATTCTATAAGAATTTGAAGATATTTTAGTTAAATTTGCTGATGAAGCTTTTCAGGAA
TCAATTGATCAAGAAATTAATGATAAAAAACTGTTTTATTTAAATTTTAACAAAAAACTA
ATTAAATCTGATGATGATGAAGATTTTCAAGATACCATGTAATGCTTAAAACTTACTTCA
GGCATTTATTATTTATGCTTAATTGCTTGCTTGGCCTATGCTTAAAATAAAAATTTTAAC
GAAATAGCTCAATTAATTTAAGAATAATTCAAATTTGATATTAAAAATTACAATTAATAA
ATTCAAAAAATCTAAGTCAACGATGGTCTCCTGGGATTCTTCTGGATTCTATGTGTTAAA
TAATTCATTTGA



>TTHERM_00782040(gene)
AACAAAATACGAAGTAGGAAAAATTATTAAAGAGATTGATAGTAATTAAAAACATGGATT
TGAATTTTTCTGATGATGATGATGAATAGGAAATTTAGCAATAGCAAGAACCTCAATAGA
TTGAGGAACTAAATAAACAAGAGGATAATTCTTAATTAGACTAAACAATTTCTGTCATTA
ACACAAAAAATTATAAGATTAAAACTTAAACACCATTTTCTGCAGATGAAGTGTATTCAT
AAATATATGCCTATCTTGAGAGTAAATAATCTAAATTAGTTTGCATTGAAGTGAAGATGG
AAGTGAATAAAACTGACAAACTTGAAAAATCTAATGATGAAAGCATTTAAATAATCAAAG
GATCAATAAGCTATGAGTTTTTTAAATTTAGAGAGATAAATGATAAACTAAAATTCCCTC
CTCCATTAGATATTTACTAAAATAATATAATATTGGAAAACTAAGATGAAGAATTCGATT
TTAAATTAAATCCCAAATAATATTCTAGATTCCCTTTTATAAATCCATCGAATGATATTT
TTGAAAAATCTCAAACTTTTGATGTAACAATTTAAGGAGAAGTATTAGGATTTGAAAAAG
TTAAATTGAACGAAGTTTAAGGCTTCGAATTAGAAAAAAAAGATGGCGAAGATAAAATAA
GCTAAACATTTATTCAATCTTTTGAGACTGCTTAAGCCATTAGTTTAGGATCATATGCAA
GGGATTAACATAATTATTATTTTGAAAGTCTTTATAATCTTGGAGAGAAGGAGTGTACAT
TTATACATCTTGAATAATGCTATGAGTATCATATGTTTACAATTTTCTTAAACTTTAGAT
CGGTTGGCTAAGTAAAAATAGTTTTAGATAAACCTATAATCTAAGTAGAGGGATAATATA
AGTATCTCATAGCTACCTCTACACCCAAATTCTTTGCAAGCACTTAAACATATCACTTAA
TAAATTTGGTAGAAGATAAGAAGCAATGGTATCCTATACATAATATTTTGCTAACTTTAC
CTAATATTTCAACCTATATGAAAATCTACTCAGCTGAAAATTTTGCTATTAAATTAAGTT
TAAAAGAAAAAGAAATTAAATAAACAAACAAAGACTAACCTTTTACATAAAATATTTTAT
AGTTTACTATTGATCTATCATTCTAAATTTAATACATGTTGTTAGTTCTTCTCTCAAACA
AAAAGATAAGCTTGTTTGAGTTTCCTAAATTGCAGTAATGTCTTAAATAAATGTGTTAAG
GAAAGGCGTTTTTTTTCTTGAATAATTTGATGAACAGATAAGAGCACTAGAAAATAACTG
ATTTCTTAAATATTGACGAAAATTAAGTTTTACCAGGTCCAGAATACCAAATAGTGTACA
GAGTCGTTGTTAGTCCTTCTAAATTTAATTTTCTCCTTCCAAGCTCTGAGTATAATTCTT
ATTTAATAAAAGAATTAGAAACTGGAGTAAATGAAACCTAAAATATTGTTAGAATTATTT
TTGAAGGTAATGAATCTGATTTTATATAGAGTATATATTATAGAGAAATATTAATGTCAT
TTAATATGCTTTCCAAAACTTTTTGTTATTTTGGAAAATAAAATAATGACGCCTTATTGA
TTGAGGTAAAAACAATCCCTCAGAACATGCCTAATTTAAAAAAGAAAGATATAATGCAAC
ATTATAATAATGAATTATGTCTCAAACTATAAAATGTTGGTGATTACTCTTCAATTAAAA
ATGTATACGAATAACAAATGACGATAAATTAAGCTCTTTGGAAATCTCTTTTTATTTTTG
ACGATAAAGATAAAATCTATAGCATGGAAAATCCTTTTTAATTTGGTTTAATAAATGATC
TTATATATATTAAAATTCTAGAGTAAATTAAACAAGAATTAAATGTTAAAATTGAAAATA
TAAATTGCCTTCTGATATAATTAAATGGCTGCACTTCTTTATTCTTTCCTATGGGCTTAG
TTAAAGAGGACATAGTTTAATAATATAAAAAAAATTCCTTTATATTGCCTAGCGTACATT
GCAACCATCAAAGCAACAAGAAAAATAAATTATATTTGATTGATTACAACTAATTAGAAA
AGGGATGGATTAGTTTAGAAATTTCAAAAAAGATATCTAATTAATTTGAAGTAGAACATA
AATAGTTTTTCAATGATTAAGATTAAATATACGAAACTATCAACTAACTGTTACCTTTAG
ACAATATATTAACTTAATGCTCTTAGAAAGTGTTTAGGAAAAATTTCAATTAACTTTTAT
CAAATAAGTATGATTTATCATAAGAATATTTTTTCATGATATTAAAAGACATCTTAGCGA
ATAAAAAAAAAATGCTTTCTCTTGATAACTAAAGAATCTATCCCTAGAACTGTTTTAGAT
TATATTCATTTATTGATTAATAATAAGAGCTAAAAGAAGATGAAATTTTTGTTTAAATAT
AGTAAAATAATAAATTTTAAATTATTGAAGGTCCAGTTCTTCTAGTTAATGAGACTGATT
AACAGATAATTATCAAAAAAGTGACTGCAAAATCTGATTTATTCAGTTTGGATAGTTATA
AAAAATTTAAAAACATTGTGGCGGTGAGCTAATAAAATCTTAATTTATTCAATCATAAGC
AAAAAATAACTTTGATTTATGGAGAAACAATAAATTAGTTAAAGTTGAATTAGTAATTAA
TTTAAAAAGACAAAAAAAATGTAAAAGAATAAGAGGGTATAAATGTAAAAAAGTCAGCTA
AGATATTTTTGGAATCAAAGACAAATAGCAAAGAATCTAAAGAATTTGACTTAGTAAGAC
CAAACATTATGAATTAATTCTCTCAGAATTAGTTATTTTTAAAAGCTTTTGAAGAAGATA
TTAAAATTGATGAGCATGAAATTATTGAAGCAAAATAAGAAACATTTAAATAGGCTTTAG
CTAATATCGAAAAATATTCTGGAATTTTTAGCCAGTTTAACTAAAAATATGGCTTGAGTT
CAAATTTTAAAATCTATGAATTGCTTTTTGAAGGTAGAAATAATACAGATATATAAATTC
TATAAGAATTTGAAGATATTTTAGTTAAATTTGCTGATGAAGCTTTTCAGGAATCAATTG
ATCAAGAAATTAATGATAAAAAACTGTTTTATTTAAATTTTAACAAAAAACTAATTAAAT
CTGATGATGATGAAGATTTTCAAGATACCATGTAATGCTTAAAACTTACTTCAGGCATTT
ATTATTTATGCTTAATTGCTTGCTTGGCCTATGCTTAAAATAAAAATTTTAACGAAATAG
CTCAATTAATTTAAGAATAATTCAAATTTGATATTAAAAATTACAATTAATAAATTCAAA
AAATCTAAGTCAACGATGGTCTCCTGGGATTCTTCTGGATTCTATGTGTTAAATAATTCA
TTTGAAATAAAATAAACTAAAAGATTTTGTTTTCAAAATTATCAATACATATTAATTAAA
TATTATTTTTTGAATTAAAATTAAACAAACTAATATTTT



>TTHERM_00782040(protein)
MDLNFSDDDDEQEIQQQQEPQQIEELNKQEDNSQLDQTISVINTKNYKIKTQTPFSADEV
YSQIYAYLESKQSKLVCIEVKMEVNKTDKLEKSNDESIQIIKGSISYEFFKFREINDKLK
FPPPLDIYQNNIILENQDEEFDFKLNPKQYSRFPFINPSNDIFEKSQTFDVTIQGEVLGF
EKVKLNEVQGFELEKKDGEDKISQTFIQSFETAQAISLGSYARDQHNYYFESLYNLGEKE
CTFIHLEQCYEYHMFTIFLNFRSVGQVKIVLDKPIIQVEGQYKYLIATSTPKFFASTQTY
HLINLVEDKKQWYPIHNILLTLPNISTYMKIYSAENFAIKLSLKEKEIKQTNKDQPFTQN
ILQFTIDLSFQIQYMLLVLLSNKKISLFEFPKLQQCLKQMCQGKAFFFLNNLMNRQEHQK
ITDFLNIDENQVLPGPEYQIVYRVVVSPSKFNFLLPSSEYNSYLIKELETGVNETQNIVR
IIFEGNESDFIQSIYYREILMSFNMLSKTFCYFGKQNNDALLIEVKTIPQNMPNLKKKDI
MQHYNNELCLKLQNVGDYSSIKNVYEQQMTINQALWKSLFIFDDKDKIYSMENPFQFGLI
NDLIYIKILEQIKQELNVKIENINCLLIQLNGCTSLFFPMGLVKEDIVQQYKKNSFILPS
VHCNHQSNKKNKLYLIDYNQLEKGWISLEISKKISNQFEVEHKQFFNDQDQIYETINQLL
PLDNILTQCSQKVFRKNFNQLLSNKYDLSQEYFFMILKDILANKKKMLSLDNQRIYPQNC
FRLYSFIDQQQELKEDEIFVQIQQNNKFQIIEGPVLLVNETDQQIIIKKVTAKSDLFSLD
SYKKFKNIVAVSQQNLNLFNHKQKITLIYGETINQLKLNQQLIQKDKKNVKEQEGINVKK
SAKIFLESKTNSKESKEFDLVRPNIMNQFSQNQLFLKAFEEDIKIDEHEIIEAKQETFKQ
ALANIEKYSGIFSQFNQKYGLSSNFKIYELLFEGRNNTDIQILQEFEDILVKFADEAFQE
SIDQEINDKKLFYLNFNKKLIKSDDDEDFQDTMQCLKLTSGIYYLCLIACLAYAQNKNFN
EIAQLIQEQFKFDIKNYNQQIQKIQVNDGLLGFFWILCVKQFI