Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00857890

Standard Name

MSH4 (Homolog of budding yeast MSH4)

Aliases

PreTt09053 | 152.m00073

Description

MutS domain II family protein; Meiotic pro-crossover factor MutS domain II family protein

Genome Browser (Macronucleus)

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External Links

• Uniprot
• Alphafold

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• mismatched DNA binding (IEA) | GO:0030983

Biological Process

• mismatch repair (IEA) | GO:0006298

Domains

• ( PF00488 ) MutS domain V
• ( PF05188 ) MutS domain II
• ( PF05192 ) MutS domain III
• ( PF07966 ) A1 Propeptide
• ( PF08518 ) Spa2 homology domain (SHD) of
• ( TIGR01070 ) DNA mismatch repair protein MutS

Gene Expression Profile

Vegetative Cell Cycle (Zhang et al., 2023)

GeneMania

No results were calculated for this gene in GeneMania.

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for Tetrahymena Stock Center

Homologs

Source	Identifier	Score
Tetrahymena borealis	EI9_07185.1	4.9988663627895604e-120
	Description: hypothetical protein (487 aa)
Oxytricha	Contig848.0.g75	4.0013320766793207e-25
	Description: MutS domain V
Stentor Coeruleus	SteCoe_10997	7.095474162284704e-23
	Description: None
WormBase	WBGene00001872	2.9990241513684e-21
	Description: locus:him-14 MutS protein homolog him-14 status:Confirmed UniProt:Q23405 protein_id:CCD73725.1
DictyBase	DDB_G0283957	3.0002687256732656e-20
	Description: msh4 on chromosome: 4 position 1370478 to 1373603
SGD	YFL003C	3.9992896861436003e-19
	Description: MSH4 Protein involved in meiotic recombination, required for normal levels of crossing over, colocalizes with Zip2p to discrete foci on meiotic chromosomes, has homology to bacterial MutS protein

General Information

No.	Gene Name(s)	Paragraph Text
97	MSH4	Msh4 (together with Msh5) is required for normal chiasma formation

Associated Literature

1. Ref:28100637: Shodhan A, Kataoka K, Mochizuki K, Novatchkova M, Loidl J (2017) A Zip3-like protein plays a role in crossover formation in the SC-less meiosis of the protist Tetrahymena. Molecular biology of the cell 28(6):825-833
2. Ref:25217051: Shodhan A, Lukaszewicz A, Novatchkova M, Loidl J (2014) Msh4 and Msh5 function in SC-independent chiasma formation during the streamlined meiosis of Tetrahymena. Genetics 198(3):983-93

Sequences

>TTHERM_00857890(coding)
ATGTTGAATAGAAAAAAAAATTTTAGAGCTCATTACAGTAATAAGAGCTCGTTTTCTAAT
ACAGATGACAAAGGTCTAGAAAAAAGTATTAACTAAGATTTCATAACTCCAAAAAATGGT
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AAAATTATCAATGACATTGTTAAACAATTCGTGAGTAAGTATTGA

>TTHERM_00857890(gene)
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AAACAGATTAATTGCATGTTTAAAATAAAACTCTAAACAAAAAAATTATCAATGACATTG
TTAAACAATTCGTGAGTAAGTATTGA

>TTHERM_00857890(protein)
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